MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 1027

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NT_187113	TTC	2	6	23150	23155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246425
502	NT_187113	TAC	2	6	23188	23193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246425
503	NT_187113	T	8	8	23211	23218	0 %	100 %	0 %	0 %	409246425
504	NT_187113	TTA	2	6	23242	23247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246425
505	NT_187113	TCA	2	6	23289	23294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246425
506	NT_187113	AAT	2	6	23324	23329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246425
507	NT_187113	CAA	2	6	23441	23446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246426
508	NT_187113	A	6	6	23467	23472	100 %	0 %	0 %	0 %	409246426
509	NT_187113	GCG	2	6	23532	23537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246426
510	NT_187113	CAA	2	6	23651	23656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246426
511	NT_187113	CTG	2	6	23702	23707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246426
512	NT_187113	GTG	2	6	23765	23770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246426
513	NT_187113	TGA	2	6	23818	23823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246426
514	NT_187113	GGC	2	6	23903	23908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246426
515	NT_187113	GC	3	6	23972	23977	0 %	0 %	50 %	50 %	409246426
516	NT_187113	CAG	2	6	23992	23997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246426
517	NT_187113	AGGA	2	8	24078	24085	50 %	0 %	50 %	0 %	409246426
518	NT_187113	CGC	2	6	24101	24106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246426
519	NT_187113	A	7	7	24184	24190	100 %	0 %	0 %	0 %	409246426
520	NT_187113	A	6	6	24225	24230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NT_187113	TCGT	2	8	24319	24326	0 %	50 %	25 %	25 %	409246427
522	NT_187113	TG	3	6	24475	24480	0 %	50 %	50 %	0 %	409246427
523	NT_187113	GCTG	2	8	24517	24524	0 %	25 %	50 %	25 %	409246427
524	NT_187113	GAA	2	6	24525	24530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246427
525	NT_187113	GAA	2	6	24540	24545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246427
526	NT_187113	CGC	2	6	24564	24569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246427
527	NT_187113	CAG	2	6	24575	24580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246427
528	NT_187113	TTA	2	6	24601	24606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246427
529	NT_187113	CAG	2	6	24684	24689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246427
530	NT_187113	GCT	2	6	24716	24721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246427
531	NT_187113	GCA	2	6	24752	24757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246427
532	NT_187113	GCT	2	6	24762	24767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246427
533	NT_187113	CAA	2	6	24816	24821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246427
534	NT_187113	CGCGC	2	10	24831	24840	0 %	0 %	40 %	60 %	409246427
535	NT_187113	GC	4	8	24837	24844	0 %	0 %	50 %	50 %	409246427
536	NT_187113	CTG	2	6	24849	24854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246427
537	NT_187113	CCAG	2	8	24961	24968	25 %	0 %	25 %	50 %	409246427
538	NT_187113	TA	3	6	25021	25026	50 %	50 %	0 %	0 %	409246427
539	NT_187113	AAC	2	6	25033	25038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246427
540	NT_187113	GGTA	2	8	25052	25059	25 %	25 %	50 %	0 %	409246427
541	NT_187113	GAA	2	6	25095	25100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246427
542	NT_187113	CTA	2	6	25102	25107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246427
543	NT_187113	GAA	2	6	25275	25280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246427
544	NT_187113	CAG	3	9	25281	25289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246427
545	NT_187113	CGA	2	6	25292	25297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246427
546	NT_187113	AACGCT	2	12	25316	25327	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	409246427
547	NT_187113	TAA	2	6	25334	25339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246427
548	NT_187113	CAA	2	6	25347	25352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246427
549	NT_187113	TGA	2	6	25481	25486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246427
550	NT_187113	CAT	2	6	25488	25493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246427
551	NT_187113	ACG	2	6	25501	25506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246427
552	NT_187113	GAC	2	6	25532	25537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246427
553	NT_187113	CG	3	6	25625	25630	0 %	0 %	50 %	50 %	409246427
554	NT_187113	CCG	3	9	25690	25698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246427
555	NT_187113	TCAC	2	8	25750	25757	25 %	25 %	0 %	50 %	409246427
556	NT_187113	CTT	2	6	25790	25795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246427
557	NT_187113	GAAGT	2	10	25891	25900	40 %	20 %	40 %	0 %	409246427
558	NT_187113	CTG	2	6	25932	25937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246427
559	NT_187113	GCG	2	6	25938	25943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246427
560	NT_187113	T	6	6	25949	25954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NT_187113	CAA	2	6	25977	25982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NT_187113	TGA	2	6	26019	26024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NT_187113	TAT	2	6	26031	26036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NT_187113	CTG	2	6	26114	26119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246428
565	NT_187113	GCA	2	6	26122	26127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246428
566	NT_187113	ATCA	2	8	26188	26195	50 %	25 %	0 %	25 %	409246428
567	NT_187113	CAA	2	6	26248	26253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246428
568	NT_187113	GAT	2	6	26280	26285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246428
569	NT_187113	CAG	2	6	26329	26334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246428
570	NT_187113	GCA	2	6	26355	26360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246428
571	NT_187113	CAG	2	6	26382	26387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246428
572	NT_187113	TGA	2	6	26449	26454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NT_187113	TCA	2	6	26463	26468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NT_187113	GC	3	6	26621	26626	0 %	0 %	50 %	50 %	409246429
575	NT_187113	GGC	2	6	26628	26633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246429
576	NT_187113	GAC	2	6	26715	26720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246429
577	NT_187113	CTC	2	6	26812	26817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409246429
578	NT_187113	GCC	2	6	27050	27055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246430
579	NT_187113	CCA	2	6	27079	27084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246430
580	NT_187113	CGT	2	6	27125	27130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246430
581	NT_187113	GCC	2	6	27168	27173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246430
582	NT_187113	AC	3	6	27213	27218	50 %	0 %	0 %	50 %	409246430
583	NT_187113	ATA	2	6	27346	27351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NT_187113	A	8	8	27368	27375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NT_187113	AGAT	2	8	27430	27437	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
586	NT_187113	TCA	2	6	27447	27452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NT_187113	GAA	2	6	27510	27515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246431
588	NT_187113	A	6	6	27514	27519	100 %	0 %	0 %	0 %	409246431
589	NT_187113	CCA	2	6	27539	27544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246431
590	NT_187113	GC	3	6	27558	27563	0 %	0 %	50 %	50 %	409246431
591	NT_187113	GAA	2	6	27583	27588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246431
592	NT_187113	GC	3	6	27636	27641	0 %	0 %	50 %	50 %	409246431
593	NT_187113	TGT	2	6	27741	27746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246431
594	NT_187113	AACCCG	2	12	27756	27767	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	409246431
595	NT_187113	TGT	2	6	27773	27778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246431
596	NT_187113	GTC	2	6	27835	27840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246431
597	NT_187113	A	6	6	27901	27906	100 %	0 %	0 %	0 %	409246431
598	NT_187113	ATA	2	6	27984	27989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246431
599	NT_187113	T	6	6	27994	27999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NT_187113	CATG	2	8	28042	28049	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
601	NT_187113	AT	3	6	28058	28063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NT_187113	AATA	2	8	28091	28098	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NT_187113	CCACA	2	10	28099	28108	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
604	NT_187113	AT	3	6	28115	28120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NT_187113	A	6	6	28130	28135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NT_187113	TAA	2	6	28147	28152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246432
607	NT_187113	A	6	6	28226	28231	100 %	0 %	0 %	0 %	409246432
608	NT_187113	AGA	2	6	28237	28242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246432
609	NT_187113	TTAAA	2	10	28243	28252	60 %	40 %	0 %	0 %	409246432
610	NT_187113	ATAA	2	8	28273	28280	75 %	25 %	0 %	0 %	409246432
611	NT_187113	A	6	6	28279	28284	100 %	0 %	0 %	0 %	409246432
612	NT_187113	CAT	2	6	28286	28291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246432
613	NT_187113	GTT	2	6	28294	28299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NT_187113	T	7	7	28387	28393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NT_187113	ATC	2	6	28402	28407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NT_187113	A	6	6	28433	28438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NT_187113	A	6	6	28484	28489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NT_187113	TC	3	6	28511	28516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
619	NT_187113	ATG	2	6	28517	28522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NT_187113	CGT	2	6	28557	28562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NT_187113	TTAA	2	8	28568	28575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NT_187113	CCA	2	6	28647	28652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246434
623	NT_187113	GGA	2	6	28714	28719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409246434
624	NT_187113	TGG	2	6	28752	28757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246434
625	NT_187113	TGG	2	6	28859	28864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246434
626	NT_187113	GCT	2	6	28918	28923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246434
627	NT_187113	CTGG	2	8	28976	28983	0 %	25 %	50 %	25 %	409246434
628	NT_187113	GGC	2	6	28990	28995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246434
629	NT_187113	GGC	2	6	28997	29002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246434
630	NT_187113	CGG	3	9	29023	29031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246434
631	NT_187113	CAT	2	6	29042	29047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246434
632	NT_187113	C	6	6	29066	29071	0 %	0 %	0 %	100 %	409246434
633	NT_187113	CGG	2	6	29116	29121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246434
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639	NT_187113	CGT	2	6	29278	29283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246434
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653	NT_187113	CGG	2	6	30144	30149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246434
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753	NT_187113	CGGG	2	8	36036	36043	0 %	0 %	75 %	25 %	409246434
754	NT_187113	ATG	2	6	36135	36140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246434
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756	NT_187113	CGA	2	6	36198	36203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246434
757	NT_187113	ACG	2	6	36213	36218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246434
758	NT_187113	GGCA	2	8	36253	36260	25 %	0 %	50 %	25 %	409246434
759	NT_187113	CCA	2	6	36273	36278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246434
760	NT_187113	TGA	2	6	36340	36345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246434
761	NT_187113	AC	3	6	36393	36398	50 %	0 %	0 %	50 %	409246434
762	NT_187113	CCG	2	6	36513	36518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246434
763	NT_187113	GCC	2	6	36554	36559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246434
764	NT_187113	GC	3	6	36627	36632	0 %	0 %	50 %	50 %	409246434
765	NT_187113	TCA	2	6	36645	36650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246434
766	NT_187113	GCAG	2	8	36686	36693	25 %	0 %	50 %	25 %	409246434
767	NT_187113	ACCGCC	2	12	36734	36745	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	409246434
768	NT_187113	CAGG	2	8	36753	36760	25 %	0 %	50 %	25 %	409246434
769	NT_187113	GCC	2	6	36846	36851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246435
770	NT_187113	CG	3	6	36871	36876	0 %	0 %	50 %	50 %	409246435
771	NT_187113	ATC	2	6	36891	36896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246435
772	NT_187113	GAT	2	6	36909	36914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246435
773	NT_187113	GGTCA	2	10	36945	36954	20 %	20 %	40 %	20 %	409246435
774	NT_187113	GGCG	2	8	36992	36999	0 %	0 %	75 %	25 %	409246435
775	NT_187113	AAC	2	6	37017	37022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246435
776	NT_187113	GCT	2	6	37028	37033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246435
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779	NT_187113	CGG	2	6	37220	37225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246435
780	NT_187113	GGCG	2	8	37274	37281	0 %	0 %	75 %	25 %	409246435
781	NT_187113	CAC	3	9	37292	37300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246435
782	NT_187113	GCA	2	6	37306	37311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246435
783	NT_187113	TC	3	6	37323	37328	0 %	50 %	0 %	50 %	409246435
784	NT_187113	ACAAA	2	10	37338	37347	80 %	0 %	0 %	20 %	409246435
785	NT_187113	GGC	2	6	37436	37441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246435
786	NT_187113	CCG	2	6	37477	37482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246435
787	NT_187113	CTG	3	9	37515	37523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246435
788	NT_187113	GC	3	6	37528	37533	0 %	0 %	50 %	50 %	409246435
789	NT_187113	GGT	2	6	37596	37601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246435
790	NT_187113	GCC	2	6	37623	37628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246435
791	NT_187113	GCT	2	6	37649	37654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246435
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795	NT_187113	ACCAG	2	10	37876	37885	40 %	0 %	20 %	40 %	409246435
796	NT_187113	TAT	2	6	37892	37897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246435
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799	NT_187113	CCAACG	2	12	37975	37986	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	409246435
800	NT_187113	GCGG	2	8	38007	38014	0 %	0 %	75 %	25 %	409246435
801	NT_187113	AG	3	6	38111	38116	50 %	0 %	50 %	0 %	409246435
802	NT_187113	CAT	2	6	38126	38131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246435
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811	NT_187113	CTG	2	6	38520	38525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246435
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814	NT_187113	ATG	2	6	38701	38706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246435
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822	NT_187113	ATG	2	6	38965	38970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246435
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830	NT_187113	ACC	2	6	39534	39539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246435
831	NT_187113	TACACC	2	12	39594	39605	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	409246435
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834	NT_187113	ACCA	2	8	39732	39739	50 %	0 %	0 %	50 %	409246435
835	NT_187113	ACC	2	6	39784	39789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246435
836	NT_187113	CGG	2	6	39812	39817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246435
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838	NT_187113	GGC	2	6	39905	39910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246435
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842	NT_187113	A	6	6	40084	40089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
843	NT_187113	ACG	2	6	40102	40107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
844	NT_187113	CAA	2	6	40115	40120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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869	NT_187113	CAA	2	6	41353	41358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246436
870	NT_187113	CCCG	2	8	41375	41382	0 %	0 %	25 %	75 %	409246436
871	NT_187113	AACTG	2	10	41468	41477	40 %	20 %	20 %	20 %	409246436
872	NT_187113	GC	3	6	41492	41497	0 %	0 %	50 %	50 %	409246436
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876	NT_187113	AGA	2	6	41576	41581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246437
877	NT_187113	GC	4	8	41594	41601	0 %	0 %	50 %	50 %	409246437
878	NT_187113	CG	3	6	41729	41734	0 %	0 %	50 %	50 %	409246437
879	NT_187113	GTTG	2	8	41801	41808	0 %	50 %	50 %	0 %	409246437
880	NT_187113	GAA	2	6	41883	41888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246437
881	NT_187113	CGC	2	6	42071	42076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246437
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