MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 2255

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NT_187111	CGC	2	6	23252	23257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251188
502	NT_187111	GCG	2	6	23317	23322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251188
503	NT_187111	GCTT	2	8	23326	23333	0 %	50 %	25 %	25 %	409251188
504	NT_187111	CGAG	2	8	23350	23357	25 %	0 %	50 %	25 %	409251188
505	NT_187111	TGG	2	6	23393	23398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251188
506	NT_187111	CTG	2	6	23409	23414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251188
507	NT_187111	T	6	6	23430	23435	0 %	100 %	0 %	0 %	409251188
508	NT_187111	CTG	2	6	23457	23462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251188
509	NT_187111	GCG	2	6	23524	23529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251188
510	NT_187111	CCG	2	6	23558	23563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251188
511	NT_187111	AGC	2	6	23589	23594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251188
512	NT_187111	CG	3	6	23596	23601	0 %	0 %	50 %	50 %	409251188
513	NT_187111	GCT	2	6	23616	23621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251188
514	NT_187111	GCCA	2	8	23630	23637	25 %	0 %	25 %	50 %	409251188
515	NT_187111	GC	3	6	23642	23647	0 %	0 %	50 %	50 %	409251188
516	NT_187111	CAGC	2	8	23669	23676	25 %	0 %	25 %	50 %	409251188
517	NT_187111	AAG	2	6	23695	23700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251188
518	NT_187111	GCG	2	6	23786	23791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251189
519	NT_187111	ACA	2	6	23843	23848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251189
520	NT_187111	GCC	3	9	23935	23943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251189
521	NT_187111	TA	3	6	24041	24046	50 %	50 %	0 %	0 %	409251189
522	NT_187111	ACA	2	6	24050	24055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251189
523	NT_187111	AACAA	2	10	24092	24101	80 %	0 %	0 %	20 %	409251189
524	NT_187111	GTT	2	6	24153	24158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251189
525	NT_187111	CCA	2	6	24159	24164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251189
526	NT_187111	ACC	2	6	24178	24183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251189
527	NT_187111	TGTT	2	8	24213	24220	0 %	75 %	25 %	0 %	409251189
528	NT_187111	GTA	2	6	24244	24249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251189
529	NT_187111	CGC	2	6	24295	24300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251189
530	NT_187111	CGT	2	6	24372	24377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251189
531	NT_187111	AGC	2	6	24380	24385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251189
532	NT_187111	T	6	6	24401	24406	0 %	100 %	0 %	0 %	409251189
533	NT_187111	GC	4	8	24573	24580	0 %	0 %	50 %	50 %	409251189
534	NT_187111	CCG	2	6	24777	24782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251189
535	NT_187111	CG	3	6	24871	24876	0 %	0 %	50 %	50 %	409251189
536	NT_187111	T	6	6	25025	25030	0 %	100 %	0 %	0 %	409251189
537	NT_187111	CGAA	2	8	25081	25088	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
538	NT_187111	GC	3	6	25123	25128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
539	NT_187111	GCA	2	6	25160	25165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251190
540	NT_187111	TCA	2	6	25183	25188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251190
541	NT_187111	CG	3	6	25203	25208	0 %	0 %	50 %	50 %	409251190
542	NT_187111	TCG	2	6	25237	25242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251190
543	NT_187111	ACGC	2	8	25260	25267	25 %	0 %	25 %	50 %	409251190
544	NT_187111	GCC	2	6	25296	25301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251190
545	NT_187111	GCCCG	2	10	25332	25341	0 %	0 %	40 %	60 %	409251190
546	NT_187111	GAT	2	6	25356	25361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251190
547	NT_187111	TGA	2	6	25379	25384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251190
548	NT_187111	GCT	2	6	25397	25402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251190
549	NT_187111	CG	5	10	25475	25484	0 %	0 %	50 %	50 %	409251190
550	NT_187111	GCC	2	6	25540	25545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251190
551	NT_187111	CAG	2	6	25584	25589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251190
552	NT_187111	CG	3	6	25624	25629	0 %	0 %	50 %	50 %	409251190
553	NT_187111	CCGC	2	8	25630	25637	0 %	0 %	25 %	75 %	409251190
554	NT_187111	GATC	2	8	25664	25671	25 %	25 %	25 %	25 %	409251190
555	NT_187111	CAA	2	6	25680	25685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251190
556	NT_187111	GAT	2	6	25763	25768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251190
557	NT_187111	CAG	2	6	25791	25796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251190
558	NT_187111	GCG	2	6	25802	25807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251190
559	NT_187111	CG	4	8	25886	25893	0 %	0 %	50 %	50 %	409251190
560	NT_187111	CCA	3	9	25898	25906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251190
561	NT_187111	TTC	2	6	25917	25922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251190
562	NT_187111	CTG	2	6	26031	26036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251190
563	NT_187111	CGG	2	6	26057	26062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251190
564	NT_187111	CGGC	2	8	26398	26405	0 %	0 %	50 %	50 %	409251191
565	NT_187111	GC	3	6	26404	26409	0 %	0 %	50 %	50 %	409251191
566	NT_187111	CTT	2	6	26483	26488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251191
567	NT_187111	TCA	2	6	26533	26538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251191
568	NT_187111	GCA	2	6	26556	26561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251191
569	NT_187111	CGC	3	9	26684	26692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251191
570	NT_187111	GCGTTT	2	12	26704	26715	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	409251191
571	NT_187111	CGC	2	6	26720	26725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251191
572	NT_187111	CGT	2	6	26771	26776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251191
573	NT_187111	ATCTGC	2	12	26831	26842	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409251191
574	NT_187111	GTTCA	2	10	26843	26852	20 %	40 %	20 %	20 %	409251191
575	NT_187111	CTG	2	6	26888	26893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251191
576	NT_187111	CCA	3	9	26909	26917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251191
577	NT_187111	CCAG	2	8	26950	26957	25 %	0 %	25 %	50 %	409251191
578	NT_187111	T	6	6	26984	26989	0 %	100 %	0 %	0 %	409251191
579	NT_187111	ACG	2	6	26990	26995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251191
580	NT_187111	GCG	2	6	27033	27038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251191
581	NT_187111	GCA	2	6	27067	27072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251191
582	NT_187111	AT	3	6	27114	27119	50 %	50 %	0 %	0 %	409251191
583	NT_187111	TCT	2	6	27159	27164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251191
584	NT_187111	CTG	2	6	27215	27220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251191
585	NT_187111	GTT	2	6	27232	27237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251191
586	NT_187111	GGT	2	6	27263	27268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251191
587	NT_187111	CGTG	2	8	27286	27293	0 %	25 %	50 %	25 %	409251191
588	NT_187111	ATTC	2	8	27302	27309	25 %	50 %	0 %	25 %	409251191
589	NT_187111	GCTACA	2	12	27310	27321	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NT_187111	CGA	2	6	27349	27354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NT_187111	GCCC	2	8	27363	27370	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
592	NT_187111	GTTA	2	8	27388	27395	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
593	NT_187111	TTG	2	6	27465	27470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NT_187111	TTA	2	6	27511	27516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NT_187111	ATT	2	6	27543	27548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NT_187111	AATG	2	8	27572	27579	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
597	NT_187111	TCA	2	6	27748	27753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251192
598	NT_187111	CGAT	2	8	27768	27775	25 %	25 %	25 %	25 %	409251192
599	NT_187111	GC	3	6	27802	27807	0 %	0 %	50 %	50 %	409251192
600	NT_187111	TAG	2	6	27857	27862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251192
601	NT_187111	CGT	2	6	27892	27897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251192
602	NT_187111	GCG	2	6	27965	27970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251192
603	NT_187111	T	6	6	28001	28006	0 %	100 %	0 %	0 %	409251192
604	NT_187111	TCG	2	6	28023	28028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251192
605	NT_187111	CAC	2	6	28106	28111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251192
606	NT_187111	CCCATC	2	12	28218	28229	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	409251192
607	NT_187111	CGA	2	6	28276	28281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251192
608	NT_187111	CGC	2	6	28286	28291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251192
609	NT_187111	CTG	2	6	28343	28348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251192
610	NT_187111	GC	3	6	28375	28380	0 %	0 %	50 %	50 %	409251192
611	NT_187111	AC	3	6	28398	28403	50 %	0 %	0 %	50 %	409251192
612	NT_187111	GTC	2	6	28415	28420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251192
613	NT_187111	GCT	2	6	28495	28500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251192
614	NT_187111	GC	3	6	28516	28521	0 %	0 %	50 %	50 %	409251192
615	NT_187111	TTG	2	6	28560	28565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251192
616	NT_187111	TCATC	2	10	28573	28582	20 %	40 %	0 %	40 %	409251192
617	NT_187111	GCA	2	6	28592	28597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251192
618	NT_187111	TCA	2	6	28615	28620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251192
619	NT_187111	A	6	6	28658	28663	100 %	0 %	0 %	0 %	409251192
620	NT_187111	CTG	2	6	28673	28678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251192
621	NT_187111	CAG	2	6	28691	28696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251192
622	NT_187111	TCGTT	2	10	28705	28714	0 %	60 %	20 %	20 %	409251192
623	NT_187111	TTA	2	6	28783	28788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NT_187111	A	6	6	28813	28818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NT_187111	ATA	2	6	28913	28918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251193
626	NT_187111	GAA	2	6	29005	29010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251194
627	NT_187111	GC	3	6	29090	29095	0 %	0 %	50 %	50 %	409251194
628	NT_187111	TGG	2	6	29124	29129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251194
629	NT_187111	CCA	2	6	29211	29216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251194
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632	NT_187111	GCA	2	6	29283	29288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251194
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742	NT_187111	CCTGG	2	10	34537	34546	0 %	20 %	40 %	40 %	409251199
743	NT_187111	CGGCG	2	10	34592	34601	0 %	0 %	60 %	40 %	409251199
744	NT_187111	GCG	2	6	34615	34620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251199
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1000	NT_187111	GC	3	6	45424	45429	0 %	0 %	50 %	50 %	409251206

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