MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 250

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187110	C	7	7	21	27	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2	NT_187110	ACAG	2	8	46	53	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NT_187110	TGA	2	6	75	80	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187110	ATT	2	6	115	120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187110	ATT	2	6	149	154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187110	TAT	2	6	207	212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187110	TTC	2	6	341	346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NT_187110	ATA	2	6	353	358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187110	GAA	2	6	364	369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187110	TCT	3	9	498	506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251171
11	NT_187110	GCA	2	6	541	546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251171
12	NT_187110	A	6	6	557	562	100 %	0 %	0 %	0 %	409251171
13	NT_187110	CAA	2	6	569	574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251171
14	NT_187110	CAC	2	6	589	594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251171
15	NT_187110	TAT	2	6	640	645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187110	TAT	2	6	726	731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187110	T	6	6	743	748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187110	A	7	7	754	760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187110	T	7	7	789	795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187110	TTA	2	6	827	832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187110	TGA	2	6	849	854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251172
22	NT_187110	A	9	9	859	867	100 %	0 %	0 %	0 %	409251172
23	NT_187110	TTTG	2	8	883	890	0 %	75 %	25 %	0 %	409251172
24	NT_187110	CGC	2	6	934	939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251172
25	NT_187110	A	7	7	1043	1049	100 %	0 %	0 %	0 %	409251172
26	NT_187110	GCGG	2	8	1085	1092	0 %	0 %	75 %	25 %	409251172
27	NT_187110	TAC	2	6	1132	1137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251172
28	NT_187110	GGC	2	6	1151	1156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251172
29	NT_187110	GCG	2	6	1172	1177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251172
30	NT_187110	AAG	2	6	1230	1235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251172
31	NT_187110	ACC	2	6	1283	1288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251172
32	NT_187110	GAA	2	6	1384	1389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251173
33	NT_187110	TCT	3	9	1436	1444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251173
34	NT_187110	GCG	2	6	1460	1465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251173
35	NT_187110	A	6	6	1489	1494	100 %	0 %	0 %	0 %	409251173
36	NT_187110	GAA	2	6	1496	1501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251173
37	NT_187110	ACAG	2	8	1503	1510	50 %	0 %	25 %	25 %	409251173
38	NT_187110	AGC	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251173
39	NT_187110	GCAA	2	8	1630	1637	50 %	0 %	25 %	25 %	409251173
40	NT_187110	GC	3	6	1667	1672	0 %	0 %	50 %	50 %	409251173
41	NT_187110	TCG	2	6	1696	1701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251173
42	NT_187110	CAGA	2	8	1802	1809	50 %	0 %	25 %	25 %	409251173
43	NT_187110	ATCT	2	8	1842	1849	25 %	50 %	0 %	25 %	409251173
44	NT_187110	CTG	2	6	1865	1870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251173
45	NT_187110	ACCTAA	2	12	1980	1991	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NT_187110	CAGG	2	8	1997	2004	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NT_187110	GTT	2	6	2023	2028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187110	AAG	2	6	2234	2239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251174
49	NT_187110	TA	3	6	2246	2251	50 %	50 %	0 %	0 %	409251174
50	NT_187110	ATG	2	6	2295	2300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251174
51	NT_187110	ATC	2	6	2325	2330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251174
52	NT_187110	TAC	2	6	2361	2366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251174
53	NT_187110	CATGG	2	10	2369	2378	20 %	20 %	40 %	20 %	409251174
54	NT_187110	TTG	2	6	2397	2402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251174
55	NT_187110	CAA	2	6	2443	2448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251174
56	NT_187110	AGC	2	6	2459	2464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251174
57	NT_187110	ATC	2	6	2499	2504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251174
58	NT_187110	TTC	2	6	2505	2510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251174
59	NT_187110	T	6	6	2554	2559	0 %	100 %	0 %	0 %	409251174
60	NT_187110	CGG	2	6	2674	2679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251174
61	NT_187110	AGGC	2	8	2718	2725	25 %	0 %	50 %	25 %	409251174
62	NT_187110	C	7	7	2758	2764	0 %	0 %	0 %	100 %	409251174
63	NT_187110	AACC	2	8	2767	2774	50 %	0 %	0 %	50 %	409251174
64	NT_187110	TTG	2	6	2784	2789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251174
65	NT_187110	A	6	6	2840	2845	100 %	0 %	0 %	0 %	409251174
66	NT_187110	TGT	2	6	2937	2942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187110	CTCG	2	8	2964	2971	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NT_187110	TG	3	6	2993	2998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187110	GCC	2	6	3038	3043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NT_187110	ATAA	2	8	3081	3088	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187110	AGGA	2	8	3144	3151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187110	GGT	2	6	3182	3187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251175
73	NT_187110	TGA	2	6	3234	3239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251175
74	NT_187110	AG	3	6	3323	3328	50 %	0 %	50 %	0 %	409251175
75	NT_187110	AACGG	2	10	3367	3376	40 %	0 %	40 %	20 %	409251175
76	NT_187110	CTGA	2	8	3400	3407	25 %	25 %	25 %	25 %	409251175
77	NT_187110	CG	3	6	3457	3462	0 %	0 %	50 %	50 %	409251175
78	NT_187110	GCA	2	6	3465	3470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251175
79	NT_187110	TTC	2	6	3485	3490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251175
80	NT_187110	GGCCC	2	10	3516	3525	0 %	0 %	40 %	60 %	409251175
81	NT_187110	GCC	2	6	3649	3654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251175
82	NT_187110	TGA	2	6	3672	3677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251175
83	NT_187110	CGC	2	6	3700	3705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251175
84	NT_187110	GCCA	2	8	3740	3747	25 %	0 %	25 %	50 %	409251175
85	NT_187110	CTT	2	6	3771	3776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251175
86	NT_187110	GAT	2	6	3805	3810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251175
87	NT_187110	CCAG	2	8	3839	3846	25 %	0 %	25 %	50 %	409251175
88	NT_187110	TCT	2	6	3863	3868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251175
89	NT_187110	CGA	2	6	3957	3962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251175
90	NT_187110	GCA	3	9	3996	4004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251175
91	NT_187110	GAA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251175
92	NT_187110	CGC	2	6	4026	4031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251175
93	NT_187110	GA	3	6	4034	4039	50 %	0 %	50 %	0 %	409251175
94	NT_187110	TCG	2	6	4055	4060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251175
95	NT_187110	GC	3	6	4078	4083	0 %	0 %	50 %	50 %	409251175
96	NT_187110	CGT	2	6	4089	4094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251175
97	NT_187110	TTC	2	6	4222	4227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251175
98	NT_187110	CGGA	2	8	4281	4288	25 %	0 %	50 %	25 %	409251175
99	NT_187110	CAG	2	6	4327	4332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251175
100	NT_187110	GC	3	6	4377	4382	0 %	0 %	50 %	50 %	409251175
101	NT_187110	GCG	2	6	4521	4526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251175
102	NT_187110	CG	4	8	4525	4532	0 %	0 %	50 %	50 %	409251175
103	NT_187110	GGT	2	6	4546	4551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251175
104	NT_187110	GCC	2	6	4561	4566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251175
105	NT_187110	AAT	2	6	4573	4578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251175
106	NT_187110	CACG	2	8	4653	4660	25 %	0 %	25 %	50 %	409251175
107	NT_187110	GC	3	6	4663	4668	0 %	0 %	50 %	50 %	409251175
108	NT_187110	GATGC	2	10	4708	4717	20 %	20 %	40 %	20 %	409251175
109	NT_187110	TAAA	2	8	4769	4776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NT_187110	GAA	2	6	4799	4804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NT_187110	CGT	2	6	4851	4856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251176
112	NT_187110	TCG	2	6	4919	4924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251176
113	NT_187110	GCC	2	6	4963	4968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251176
114	NT_187110	CTG	2	6	4972	4977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251176
115	NT_187110	CGG	2	6	5046	5051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251176
116	NT_187110	GGA	2	6	5077	5082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409251176
117	NT_187110	TTC	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251176
118	NT_187110	CCA	2	6	5193	5198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251176
119	NT_187110	GCG	2	6	5216	5221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251176
120	NT_187110	CCG	2	6	5255	5260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251176
121	NT_187110	GGT	2	6	5353	5358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251176
122	NT_187110	GCC	2	6	5446	5451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251176
123	NT_187110	GAT	2	6	5452	5457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251176
124	NT_187110	GAG	2	6	5525	5530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409251176
125	NT_187110	CAG	2	6	5536	5541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251176
126	NT_187110	GCC	2	6	5555	5560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251176
127	NT_187110	CCG	2	6	5604	5609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251176
128	NT_187110	ATC	2	6	5710	5715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251176
129	NT_187110	GTCA	2	8	5842	5849	25 %	25 %	25 %	25 %	409251176
130	NT_187110	TGA	2	6	5871	5876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251176
131	NT_187110	CCA	2	6	5880	5885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251176
132	NT_187110	CAC	2	6	5902	5907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251176
133	NT_187110	GTG	2	6	5960	5965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251176
134	NT_187110	GGTC	2	8	5985	5992	0 %	25 %	50 %	25 %	409251176
135	NT_187110	TTC	2	6	6011	6016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251176
136	NT_187110	CTT	2	6	6027	6032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251176
137	NT_187110	GCC	2	6	6076	6081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251176
138	NT_187110	GC	3	6	6106	6111	0 %	0 %	50 %	50 %	409251176
139	NT_187110	CGC	2	6	6130	6135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251176
140	NT_187110	AGG	2	6	6227	6232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409251176
141	NT_187110	CGT	2	6	6234	6239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251176
142	NT_187110	CTT	2	6	6252	6257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251176
143	NT_187110	TAA	2	6	6297	6302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NT_187110	T	7	7	6347	6353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NT_187110	CTG	2	6	6405	6410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NT_187110	GCC	2	6	6471	6476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251177
147	NT_187110	CTG	2	6	6494	6499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251177
148	NT_187110	GCG	2	6	6531	6536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251177
149	NT_187110	CCG	2	6	6634	6639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251177
150	NT_187110	CCGC	2	8	6649	6656	0 %	0 %	25 %	75 %	409251177
151	NT_187110	GCA	2	6	6664	6669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251177
152	NT_187110	CG	3	6	6705	6710	0 %	0 %	50 %	50 %	409251177
153	NT_187110	ATC	2	6	6722	6727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251177
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157	NT_187110	CAG	2	6	6818	6823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251177
158	NT_187110	TG	3	6	6854	6859	0 %	50 %	50 %	0 %	409251177
159	NT_187110	CGT	2	6	6917	6922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251177
160	NT_187110	CGG	2	6	6954	6959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251177
161	NT_187110	CGA	2	6	6967	6972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251177
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163	NT_187110	CG	4	8	7012	7019	0 %	0 %	50 %	50 %	409251177
164	NT_187110	TCG	2	6	7038	7043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251177
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173	NT_187110	ACT	2	6	7290	7295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251177
174	NT_187110	GCC	2	6	7311	7316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251177
175	NT_187110	GCAACA	2	12	7342	7353	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	409251177
176	NT_187110	CG	3	6	7508	7513	0 %	0 %	50 %	50 %	409251177
177	NT_187110	GC	3	6	7640	7645	0 %	0 %	50 %	50 %	409251177
178	NT_187110	CGA	2	6	7659	7664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251177
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180	NT_187110	GGA	2	6	7732	7737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409251177
181	NT_187110	GGCT	2	8	7739	7746	0 %	25 %	50 %	25 %	409251177
182	NT_187110	CCCG	2	8	7925	7932	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
183	NT_187110	TGC	2	6	7995	8000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251178
184	NT_187110	CTGC	2	8	8049	8056	0 %	25 %	25 %	50 %	409251178
185	NT_187110	CAT	2	6	8109	8114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251178
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187	NT_187110	CCTGCG	2	12	8313	8324	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409251178
188	NT_187110	CT	3	6	8435	8440	0 %	50 %	0 %	50 %	409251178
189	NT_187110	TGT	3	9	8445	8453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251178
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192	NT_187110	CGC	2	6	8679	8684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
193	NT_187110	AACTGG	2	12	8687	8698	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409251178
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199	NT_187110	CGC	2	6	8937	8942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
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227	NT_187110	CGT	2	6	10225	10230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251178
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230	NT_187110	GCC	2	6	10267	10272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
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233	NT_187110	GAGG	2	8	10474	10481	25 %	0 %	75 %	0 %	409251178
234	NT_187110	TCG	2	6	10577	10582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251178
235	NT_187110	GCTGTC	2	12	10600	10611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251178
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241	NT_187110	TGC	2	6	10794	10799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251178
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250	NT_187110	CGC	2	6	11070	11075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.