MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 2450

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NT_187103	TGC	2	6	49341	49346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250522
1002	NT_187103	TAAA	2	8	49460	49467	75 %	25 %	0 %	0 %	409250522
1003	NT_187103	ATC	2	6	49470	49475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250522
1004	NT_187103	TTC	2	6	49514	49519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250523
1005	NT_187103	GCTG	2	8	49553	49560	0 %	25 %	50 %	25 %	409250523
1006	NT_187103	ATT	2	6	49682	49687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250523
1007	NT_187103	GC	3	6	49731	49736	0 %	0 %	50 %	50 %	409250523
1008	NT_187103	CGC	2	6	49757	49762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250523
1009	NT_187103	TCG	2	6	49779	49784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250523
1010	NT_187103	GCA	2	6	49819	49824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250523
1011	NT_187103	GGCA	2	8	49889	49896	25 %	0 %	50 %	25 %	409250523
1012	NT_187103	CCG	2	6	50005	50010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250523
1013	NT_187103	CATG	2	8	50062	50069	25 %	25 %	25 %	25 %	409250523
1014	NT_187103	TTGCCA	2	12	50086	50097	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409250523
1015	NT_187103	CCT	2	6	50227	50232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250523
1016	NT_187103	GTC	2	6	50239	50244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250523
1017	NT_187103	C	6	6	50244	50249	0 %	0 %	0 %	100 %	409250523
1018	NT_187103	A	7	7	50270	50276	100 %	0 %	0 %	0 %	409250523
1019	NT_187103	CGCC	2	8	50325	50332	0 %	0 %	25 %	75 %	409250523
1020	NT_187103	CCA	3	9	50347	50355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250523
1021	NT_187103	GCC	2	6	50370	50375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250523
1022	NT_187103	CTC	2	6	50474	50479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250523
1023	NT_187103	TTG	2	6	50586	50591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250524
1024	NT_187103	ACC	2	6	50621	50626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250524
1025	NT_187103	CG	6	12	50695	50706	0 %	0 %	50 %	50 %	409250524
1026	NT_187103	GCC	2	6	50758	50763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250524
1027	NT_187103	TCGCCG	2	12	50779	50790	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409250524
1028	NT_187103	CGG	2	6	50819	50824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250524
1029	NT_187103	T	7	7	50896	50902	0 %	100 %	0 %	0 %	409250524
1030	NT_187103	GCC	2	6	50915	50920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250524
1031	NT_187103	GCCA	2	8	50996	51003	25 %	0 %	25 %	50 %	409250524
1032	NT_187103	GCC	2	6	51037	51042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250524
1033	NT_187103	TCG	2	6	51046	51051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250524
1034	NT_187103	A	6	6	51116	51121	100 %	0 %	0 %	0 %	409250524
1035	NT_187103	CTGG	2	8	51139	51146	0 %	25 %	50 %	25 %	409250524
1036	NT_187103	TGA	2	6	51166	51171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250524
1037	NT_187103	A	6	6	51175	51180	100 %	0 %	0 %	0 %	409250524
1038	NT_187103	TGG	2	6	51186	51191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250524
1039	NT_187103	TGA	2	6	51205	51210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250524
1040	NT_187103	GCA	2	6	51215	51220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250524
1041	NT_187103	AAT	2	6	51243	51248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250524
1042	NT_187103	CGC	2	6	51257	51262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250524
1043	NT_187103	GCG	2	6	51277	51282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250524
1044	NT_187103	CGG	2	6	51284	51289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250524
1045	NT_187103	TCG	2	6	51322	51327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250524
1046	NT_187103	CG	3	6	51326	51331	0 %	0 %	50 %	50 %	409250524
1047	NT_187103	ATT	2	6	51339	51344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250524
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1049	NT_187103	GC	3	6	51475	51480	0 %	0 %	50 %	50 %	409250525
1050	NT_187103	TGT	2	6	51536	51541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250525
1051	NT_187103	GTT	2	6	51586	51591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250525
1052	NT_187103	GCTG	2	8	51767	51774	0 %	25 %	50 %	25 %	409250525
1053	NT_187103	AGG	2	6	51841	51846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250525
1054	NT_187103	GCG	2	6	51849	51854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250525
1055	NT_187103	GTT	2	6	51864	51869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250525
1056	NT_187103	GA	3	6	51926	51931	50 %	0 %	50 %	0 %	409250525
1057	NT_187103	GCA	2	6	51944	51949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250525
1058	NT_187103	TCA	2	6	51975	51980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250525
1059	NT_187103	CTC	2	6	51988	51993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250526
1060	NT_187103	ATAAAG	2	12	51998	52009	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	409250526
1061	NT_187103	CGA	2	6	52058	52063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250526
1062	NT_187103	CG	3	6	52065	52070	0 %	0 %	50 %	50 %	409250526
1063	NT_187103	TACGC	2	10	52079	52088	20 %	20 %	20 %	40 %	409250526
1064	NT_187103	CG	3	6	52119	52124	0 %	0 %	50 %	50 %	409250526
1065	NT_187103	GGC	2	6	52224	52229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250526
1066	NT_187103	CGCC	2	8	52240	52247	0 %	0 %	25 %	75 %	409250526
1067	NT_187103	AGC	3	9	52323	52331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250526
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1069	NT_187103	CCT	2	6	52440	52445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250527
1070	NT_187103	CGC	2	6	52519	52524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250527
1071	NT_187103	ATC	2	6	52532	52537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250527
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1075	NT_187103	AAT	2	6	52696	52701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250527
1076	NT_187103	TCT	2	6	52718	52723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250527
1077	NT_187103	ACG	2	6	52727	52732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250527
1078	NT_187103	ATA	2	6	52745	52750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250527
1079	NT_187103	TTA	2	6	52840	52845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NT_187103	A	6	6	52911	52916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NT_187103	CAAG	2	8	53053	53060	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1082	NT_187103	CCG	2	6	53087	53092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250528
1083	NT_187103	CCG	2	6	53113	53118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250528
1084	NT_187103	TGCC	2	8	53158	53165	0 %	25 %	25 %	50 %	409250528
1085	NT_187103	CGA	2	6	53203	53208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250528
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1087	NT_187103	CAG	2	6	53340	53345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250528
1088	NT_187103	TGA	2	6	53365	53370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250528
1089	NT_187103	CG	3	6	53428	53433	0 %	0 %	50 %	50 %	409250528
1090	NT_187103	TGG	2	6	53455	53460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250528
1091	NT_187103	GGT	2	6	53540	53545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250528
1092	NT_187103	TGA	2	6	53563	53568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250528
1093	NT_187103	CCA	2	6	53617	53622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250528
1094	NT_187103	AGC	2	6	53671	53676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250528
1095	NT_187103	AAT	2	6	53751	53756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250528
1096	NT_187103	CTGG	2	8	53762	53769	0 %	25 %	50 %	25 %	409250528
1097	NT_187103	ACC	2	6	53829	53834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250528
1098	NT_187103	A	6	6	53860	53865	100 %	0 %	0 %	0 %	409250528
1099	NT_187103	GCA	2	6	53917	53922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250528
1100	NT_187103	CG	4	8	53937	53944	0 %	0 %	50 %	50 %	409250528
1101	NT_187103	AAC	2	6	53970	53975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250528
1102	NT_187103	ATAA	2	8	53982	53989	75 %	25 %	0 %	0 %	409250528
1103	NT_187103	TTC	2	6	53991	53996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250528
1104	NT_187103	ATG	2	6	54078	54083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250528
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1106	NT_187103	ATG	2	6	54249	54254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250528
1107	NT_187103	GGC	2	6	54258	54263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250528
1108	NT_187103	GAC	2	6	54318	54323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250528
1109	NT_187103	TAA	2	6	54656	54661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250528
1110	NT_187103	GCC	2	6	54697	54702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250528
1111	NT_187103	CAC	3	9	54704	54712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250528
1112	NT_187103	CGG	3	9	54998	55006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250528
1113	NT_187103	ACG	2	6	55041	55046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250528
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1115	NT_187103	GC	3	6	55201	55206	0 %	0 %	50 %	50 %	409250528
1116	NT_187103	A	7	7	55279	55285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NT_187103	CAT	2	6	55318	55323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NT_187103	CGA	2	6	55413	55418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250529
1119	NT_187103	TTC	2	6	55439	55444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250529
1120	NT_187103	CGC	2	6	55540	55545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250529
1121	NT_187103	TCA	2	6	55589	55594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250529
1122	NT_187103	GTA	2	6	55657	55662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250529
1123	NT_187103	CAA	2	6	55683	55688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250529
1124	NT_187103	TGC	2	6	55707	55712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250529
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1126	NT_187103	CAG	2	6	55777	55782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250529
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1234	NT_187103	CGTC	2	8	60858	60865	0 %	25 %	25 %	50 %	409250534
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1239	NT_187103	A	6	6	61404	61409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1240	NT_187103	TGTC	2	8	61437	61444	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1241	NT_187103	GCCAAA	2	12	61492	61503	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	409250535
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1245	NT_187103	GACT	2	8	61732	61739	25 %	25 %	25 %	25 %	409250535
1246	NT_187103	CGTGC	2	10	61780	61789	0 %	20 %	40 %	40 %	409250535
1247	NT_187103	CAGCG	2	10	61852	61861	20 %	0 %	40 %	40 %	409250535
1248	NT_187103	CGG	2	6	61876	61881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250535
1249	NT_187103	GCT	2	6	61903	61908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250535
1250	NT_187103	CGA	2	6	61920	61925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250535
1251	NT_187103	CAC	2	6	61944	61949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250535
1252	NT_187103	ACGG	2	8	62031	62038	25 %	0 %	50 %	25 %	409250535
1253	NT_187103	CGC	2	6	62041	62046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250535
1254	NT_187103	GC	5	10	62073	62082	0 %	0 %	50 %	50 %	409250535
1255	NT_187103	ACC	2	6	62092	62097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250535
1256	NT_187103	GCG	2	6	62106	62111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250535
1257	NT_187103	CCA	2	6	62136	62141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250535
1258	NT_187103	GAT	2	6	62164	62169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250535
1259	NT_187103	CG	3	6	62171	62176	0 %	0 %	50 %	50 %	409250535
1260	NT_187103	TCG	2	6	62283	62288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250535
1261	NT_187103	TTC	2	6	62347	62352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250535
1262	NT_187103	ACC	2	6	62365	62370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250535
1263	NT_187103	GCG	2	6	62387	62392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250535
1264	NT_187103	TGAA	2	8	62471	62478	50 %	25 %	25 %	0 %	409250535
1265	NT_187103	CATC	2	8	62481	62488	25 %	25 %	0 %	50 %	409250535
1266	NT_187103	TCA	2	6	62516	62521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250535
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1269	NT_187103	TCC	2	6	62703	62708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1270	NT_187103	AGGG	2	8	62709	62716	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1271	NT_187103	TGG	2	6	62790	62795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250536
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1273	NT_187103	CTT	2	6	62842	62847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250536
1274	NT_187103	CTT	2	6	62872	62877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250536
1275	NT_187103	TTG	2	6	62943	62948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250536
1276	NT_187103	CTT	2	6	62953	62958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250536
1277	NT_187103	TTC	2	6	63002	63007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250536
1278	NT_187103	TAA	2	6	63147	63152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1279	NT_187103	CCG	2	6	63191	63196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250537
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1283	NT_187103	TCA	2	6	63531	63536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250537
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1285	NT_187103	GAT	2	6	63572	63577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250537
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1288	NT_187103	ATT	2	6	63652	63657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250537
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1292	NT_187103	GCG	2	6	64127	64132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250538
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1294	NT_187103	TAC	2	6	64165	64170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250538
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1298	NT_187103	CGGCAG	2	12	64267	64278	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409250538
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1300	NT_187103	ACC	2	6	64349	64354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250538
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1332	NT_187103	GGC	2	6	65876	65881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1333	NT_187103	ACAG	2	8	66097	66104	50 %	0 %	25 %	25 %	409250540
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1348	NT_187103	ATA	2	6	66846	66851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250540
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1353	NT_187103	CG	3	6	67106	67111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1354	NT_187103	GTA	2	6	67140	67145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250541
1355	NT_187103	ACAG	2	8	67198	67205	50 %	0 %	25 %	25 %	409250541
1356	NT_187103	ACG	2	6	67236	67241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250541
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1359	NT_187103	CTC	2	6	67295	67300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1360	NT_187103	TTAC	2	8	67338	67345	25 %	50 %	0 %	25 %	409250542
1361	NT_187103	TCA	2	6	67390	67395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250542
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1363	NT_187103	CAG	2	6	67500	67505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250542
1364	NT_187103	TCG	2	6	67570	67575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250542
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1366	NT_187103	GC	3	6	67863	67868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1367	NT_187103	AAT	2	6	67929	67934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1368	NT_187103	CA	3	6	67938	67943	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1369	NT_187103	TCA	2	6	68026	68031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1370	NT_187103	A	6	6	68050	68055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1371	NT_187103	CG	3	6	68096	68101	0 %	0 %	50 %	50 %	409250543
1372	NT_187103	CTG	2	6	68102	68107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250543
1373	NT_187103	GCGCC	2	10	68133	68142	0 %	0 %	40 %	60 %	409250543
1374	NT_187103	TGA	2	6	68149	68154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250543
1375	NT_187103	TGC	2	6	68190	68195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250543
1376	NT_187103	TCGC	2	8	68219	68226	0 %	25 %	25 %	50 %	409250543
1377	NT_187103	CG	3	6	68227	68232	0 %	0 %	50 %	50 %	409250543
1378	NT_187103	ATT	2	6	68249	68254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250543
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