MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 8012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NT_187102	TCAT	2	8	168775	168782	25 %	50 %	0 %	25 %	409250233
3502	NT_187102	ACAGA	2	10	168883	168892	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3503	NT_187102	TCCC	2	8	168906	168913	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3504	NT_187102	GTC	2	6	168980	168985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NT_187102	AAT	2	6	168986	168991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250234
3506	NT_187102	ACCA	2	8	169075	169082	50 %	0 %	0 %	50 %	409250234
3507	NT_187102	AGA	2	6	169105	169110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250234
3508	NT_187102	GCG	2	6	169156	169161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NT_187102	G	6	6	169166	169171	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3510	NT_187102	A	8	8	169196	169203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NT_187102	TGT	2	6	169239	169244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3512	NT_187102	T	6	6	169359	169364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NT_187102	ACT	2	6	169372	169377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NT_187102	ACC	2	6	169483	169488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250235
3515	NT_187102	TGA	2	6	169505	169510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250235
3516	NT_187102	CCG	2	6	169547	169552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250235
3517	NT_187102	GGA	2	6	169569	169574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250235
3518	NT_187102	AAAG	2	8	169627	169634	75 %	0 %	25 %	0 %	409250235
3519	NT_187102	ACA	2	6	169723	169728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NT_187102	GGCT	2	8	169747	169754	0 %	25 %	50 %	25 %	409250236
3521	NT_187102	GTT	2	6	169785	169790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250236
3522	NT_187102	TTA	2	6	169807	169812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250236
3523	NT_187102	CATTT	2	10	169893	169902	20 %	60 %	0 %	20 %	409250236
3524	NT_187102	TTC	2	6	169951	169956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250236
3525	NT_187102	CATTA	2	10	169981	169990	40 %	40 %	0 %	20 %	409250236
3526	NT_187102	GCT	2	6	169995	170000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250236
3527	NT_187102	AAC	2	6	170136	170141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250236
3528	NT_187102	TAA	2	6	170155	170160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250236
3529	NT_187102	TGT	2	6	170175	170180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250236
3530	NT_187102	ATA	2	6	170201	170206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NT_187102	GGC	2	6	170207	170212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NT_187102	T	6	6	170213	170218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NT_187102	CTG	2	6	170246	170251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NT_187102	A	6	6	170330	170335	100 %	0 %	0 %	0 %	409250237
3535	NT_187102	CGA	2	6	170364	170369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250237
3536	NT_187102	TCT	2	6	170547	170552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250237
3537	NT_187102	TCA	2	6	170614	170619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250237
3538	NT_187102	TTC	2	6	170622	170627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250237
3539	NT_187102	CCG	3	9	170649	170657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250237
3540	NT_187102	GCC	2	6	170687	170692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250237
3541	NT_187102	GCCC	2	8	170722	170729	0 %	0 %	25 %	75 %	409250237
3542	NT_187102	CCG	2	6	170892	170897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250238
3543	NT_187102	GAT	2	6	170911	170916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250238
3544	NT_187102	GTT	2	6	170920	170925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250238
3545	NT_187102	A	6	6	170927	170932	100 %	0 %	0 %	0 %	409250238
3546	NT_187102	GC	3	6	171035	171040	0 %	0 %	50 %	50 %	409250238
3547	NT_187102	CGG	2	6	171042	171047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250238
3548	NT_187102	GCT	2	6	171075	171080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250238
3549	NT_187102	GAA	2	6	171109	171114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250238
3550	NT_187102	CAG	2	6	171115	171120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250238
3551	NT_187102	TGA	2	6	171150	171155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250238
3552	NT_187102	CG	3	6	171221	171226	0 %	0 %	50 %	50 %	409250238
3553	NT_187102	CAT	2	6	171366	171371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250238
3554	NT_187102	AAC	2	6	171380	171385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250238
3555	NT_187102	GGT	2	6	171437	171442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250239
3556	NT_187102	CGC	2	6	171480	171485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250239
3557	NT_187102	TGC	2	6	171618	171623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250239
3558	NT_187102	C	6	6	171663	171668	0 %	0 %	0 %	100 %	409250239
3559	NT_187102	TCA	2	6	171708	171713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250239
3560	NT_187102	TCA	2	6	171802	171807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250239
3561	NT_187102	GGC	2	6	171827	171832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250239
3562	NT_187102	GCG	3	9	171864	171872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250239
3563	NT_187102	CAC	2	6	171880	171885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250239
3564	NT_187102	TTA	2	6	171888	171893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250239
3565	NT_187102	CGG	2	6	171924	171929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250239
3566	NT_187102	TGC	2	6	172053	172058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250239
3567	NT_187102	GC	3	6	172057	172062	0 %	0 %	50 %	50 %	409250239
3568	NT_187102	CCAA	2	8	172103	172110	50 %	0 %	0 %	50 %	409250239
3569	NT_187102	CGG	2	6	172120	172125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250239
3570	NT_187102	CGG	2	6	172171	172176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250239
3571	NT_187102	CTC	2	6	172180	172185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250239
3572	NT_187102	CGT	2	6	172270	172275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250239
3573	NT_187102	CTG	2	6	172374	172379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250239
3574	NT_187102	TCA	2	6	172389	172394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250239
3575	NT_187102	GGC	2	6	172397	172402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250239
3576	NT_187102	CTGC	2	8	172459	172466	0 %	25 %	25 %	50 %	409250239
3577	NT_187102	CCTGC	2	10	172542	172551	0 %	20 %	20 %	60 %	409250239
3578	NT_187102	GCA	2	6	172564	172569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250239
3579	NT_187102	GCA	3	9	172591	172599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250239
3580	NT_187102	GCG	2	6	172641	172646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250239
3581	NT_187102	GAA	2	6	172730	172735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250239
3582	NT_187102	CGC	2	6	172741	172746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250239
3583	NT_187102	GCC	2	6	172799	172804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250239
3584	NT_187102	CGCTG	2	10	172867	172876	0 %	20 %	40 %	40 %	409250239
3585	NT_187102	GGT	2	6	172915	172920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250239
3586	NT_187102	CAGG	2	8	172925	172932	25 %	0 %	50 %	25 %	409250239
3587	NT_187102	GC	4	8	172988	172995	0 %	0 %	50 %	50 %	409250239
3588	NT_187102	CGA	2	6	173038	173043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250239
3589	NT_187102	GGC	2	6	173065	173070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250239
3590	NT_187102	AGC	2	6	173100	173105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250239
3591	NT_187102	AGC	2	6	173193	173198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250239
3592	NT_187102	TGC	2	6	173248	173253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250239
3593	NT_187102	A	7	7	173275	173281	100 %	0 %	0 %	0 %	409250239
3594	NT_187102	GCA	2	6	173282	173287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250239
3595	NT_187102	CAG	3	9	173288	173296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250239
3596	NT_187102	GTT	2	6	173297	173302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250239
3597	NT_187102	CGC	2	6	173392	173397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250240
3598	NT_187102	T	6	6	173426	173431	0 %	100 %	0 %	0 %	409250240
3599	NT_187102	GCT	2	6	173462	173467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250240
3600	NT_187102	TCG	2	6	173478	173483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250240
3601	NT_187102	ATT	2	6	173538	173543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250240
3602	NT_187102	TCC	2	6	173581	173586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250240
3603	NT_187102	TGG	2	6	173597	173602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250240
3604	NT_187102	ATT	2	6	173630	173635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250240
3605	NT_187102	GTG	2	6	173699	173704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250240
3606	NT_187102	TTTCC	2	10	173712	173721	0 %	60 %	0 %	40 %	409250240
3607	NT_187102	GCC	2	6	173743	173748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250240
3608	NT_187102	CAA	2	6	173763	173768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250240
3609	NT_187102	GAT	2	6	173794	173799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250240
3610	NT_187102	GCG	3	9	173820	173828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250240
3611	NT_187102	GCT	2	6	173836	173841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250240
3612	NT_187102	GC	3	6	173902	173907	0 %	0 %	50 %	50 %	409250240
3613	NT_187102	GCTG	2	8	173956	173963	0 %	25 %	50 %	25 %	409250240
3614	NT_187102	CGG	2	6	174001	174006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250240
3615	NT_187102	CTG	2	6	174014	174019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250240
3616	NT_187102	CTG	2	6	174059	174064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250240
3617	NT_187102	GGCT	2	8	174089	174096	0 %	25 %	50 %	25 %	409250240
3618	NT_187102	CGC	2	6	174120	174125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250240
3619	NT_187102	CTG	2	6	174134	174139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250240
3620	NT_187102	CCA	2	6	174147	174152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250240
3621	NT_187102	T	6	6	174164	174169	0 %	100 %	0 %	0 %	409250240
3622	NT_187102	GC	3	6	174225	174230	0 %	0 %	50 %	50 %	409250240
3623	NT_187102	CGG	2	6	174265	174270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250240
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3741	NT_187102	T	7	7	180063	180069	0 %	100 %	0 %	0 %	409250246
3742	NT_187102	TAA	2	6	180165	180170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250247
3743	NT_187102	GC	3	6	180395	180400	0 %	0 %	50 %	50 %	409250247
3744	NT_187102	CGC	2	6	180438	180443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250247
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3746	NT_187102	TCT	3	9	180529	180537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250247
3747	NT_187102	GAA	2	6	180573	180578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250247
3748	NT_187102	TTC	2	6	180649	180654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250247
3749	NT_187102	CCAG	2	8	180659	180666	25 %	0 %	25 %	50 %	409250247
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3752	NT_187102	CTT	2	6	180932	180937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250247
3753	NT_187102	ATC	2	6	180943	180948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250247
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3761	NT_187102	CGG	2	6	181478	181483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3762	NT_187102	CGT	2	6	181556	181561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250248
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3766	NT_187102	CG	3	6	181775	181780	0 %	0 %	50 %	50 %	409250248
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3811	NT_187102	TTAA	2	8	183922	183929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3812	NT_187102	AGA	2	6	183961	183966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3854	NT_187102	AAT	2	6	186643	186648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250254
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3870	NT_187102	CCG	2	6	187332	187337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250254
3871	NT_187102	GCG	2	6	187385	187390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250254
3872	NT_187102	GC	3	6	187436	187441	0 %	0 %	50 %	50 %	409250254
3873	NT_187102	GGC	2	6	187473	187478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250254
3874	NT_187102	TCG	2	6	187502	187507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250254
3875	NT_187102	TGC	2	6	187550	187555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250254
3876	NT_187102	GTG	2	6	187573	187578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250254
3877	NT_187102	TCAT	2	8	187720	187727	25 %	50 %	0 %	25 %	409250254
3878	NT_187102	CCG	2	6	187741	187746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250254
3879	NT_187102	ATA	2	6	187775	187780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250254
3880	NT_187102	TCG	2	6	187790	187795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250254
3881	NT_187102	CTGG	2	8	187809	187816	0 %	25 %	50 %	25 %	409250254
3882	NT_187102	GCC	3	9	187856	187864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250254
3883	NT_187102	CG	3	6	187870	187875	0 %	0 %	50 %	50 %	409250254
3884	NT_187102	TCG	2	6	187889	187894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250254
3885	NT_187102	ATC	2	6	187949	187954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250254
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3887	NT_187102	GC	3	6	187990	187995	0 %	0 %	50 %	50 %	409250254
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3889	NT_187102	CTG	2	6	188023	188028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250254
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3891	NT_187102	GC	3	6	188055	188060	0 %	0 %	50 %	50 %	409250254
3892	NT_187102	CTG	2	6	188113	188118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250254
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3901	NT_187102	CGC	2	6	188384	188389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250255
3902	NT_187102	TCA	2	6	188422	188427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250255
3903	NT_187102	CAT	2	6	188471	188476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250255
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3910	NT_187102	GCG	2	6	188996	189001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250256
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3930	NT_187102	TCG	2	6	189997	190002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250257
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3936	NT_187102	CTG	2	6	190239	190244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250258
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3944	NT_187102	GCGCC	2	10	190738	190747	0 %	0 %	40 %	60 %	409250258
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3950	NT_187102	GGTG	2	8	190893	190900	0 %	25 %	75 %	0 %	409250259
3951	NT_187102	ATC	2	6	191023	191028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250259
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3953	NT_187102	CGC	2	6	191103	191108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250259
3954	NT_187102	A	7	7	191113	191119	100 %	0 %	0 %	0 %	409250259
3955	NT_187102	GGC	2	6	191143	191148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250259
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3978	NT_187102	CAT	2	6	192350	192355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250260
3979	NT_187102	ATTG	2	8	192392	192399	25 %	50 %	25 %	0 %	409250260
3980	NT_187102	CCG	2	6	192439	192444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250260
3981	NT_187102	GTT	2	6	192464	192469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3982	NT_187102	ATA	2	6	192497	192502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3983	NT_187102	T	6	6	192512	192517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3984	NT_187102	GTC	2	6	192592	192597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250261
3985	NT_187102	GCT	2	6	192639	192644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250261
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3987	NT_187102	GGCT	2	8	192682	192689	0 %	25 %	50 %	25 %	409250261
3988	NT_187102	ACG	2	6	192700	192705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250261
3989	NT_187102	CGCGG	2	10	192793	192802	0 %	0 %	60 %	40 %	409250261
3990	NT_187102	ATG	2	6	192919	192924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250261
3991	NT_187102	GCC	2	6	192925	192930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250261
3992	NT_187102	GC	3	6	192936	192941	0 %	0 %	50 %	50 %	409250261
3993	NT_187102	GGC	2	6	193041	193046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250261
3994	NT_187102	GGC	2	6	193147	193152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250261
3995	NT_187102	AAC	2	6	193190	193195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250261
3996	NT_187102	A	6	6	193220	193225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3997	NT_187102	TAA	2	6	193307	193312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250262
3998	NT_187102	GCT	2	6	193313	193318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250262
3999	NT_187102	CCG	2	6	193360	193365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250262
4000	NT_187102	CCAC	2	8	193379	193386	25 %	0 %	0 %	75 %	409250262

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