MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 8012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NT_187102	CGC	2	6	336600	336605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250403
7002	NT_187102	CGG	2	6	336639	336644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250403
7003	NT_187102	CGG	2	6	336648	336653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250403
7004	NT_187102	TCG	2	6	336680	336685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250403
7005	NT_187102	CTG	2	6	336691	336696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250403
7006	NT_187102	GC	3	6	336700	336705	0 %	0 %	50 %	50 %	409250403
7007	NT_187102	TCT	2	6	336713	336718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250403
7008	NT_187102	CCA	2	6	336930	336935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250403
7009	NT_187102	TTCC	2	8	337071	337078	0 %	50 %	0 %	50 %	409250403
7010	NT_187102	GCACG	2	10	337099	337108	20 %	0 %	40 %	40 %	409250403
7011	NT_187102	TTTA	2	8	337393	337400	25 %	75 %	0 %	0 %	409250403
7012	NT_187102	GCGACG	2	12	337470	337481	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409250404
7013	NT_187102	CAG	2	6	337499	337504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250404
7014	NT_187102	CCG	2	6	337648	337653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250404
7015	NT_187102	ACAT	2	8	337665	337672	50 %	25 %	0 %	25 %	409250404
7016	NT_187102	AATA	2	8	337735	337742	75 %	25 %	0 %	0 %	409250404
7017	NT_187102	CAGCA	2	10	337748	337757	40 %	0 %	20 %	40 %	409250404
7018	NT_187102	TAA	2	6	337766	337771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250404
7019	NT_187102	TGG	2	6	337906	337911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250404
7020	NT_187102	TTAA	2	8	337920	337927	50 %	50 %	0 %	0 %	409250404
7021	NT_187102	TACGG	2	10	338013	338022	20 %	20 %	40 %	20 %	409250404
7022	NT_187102	CGG	2	6	338027	338032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250404
7023	NT_187102	AAC	2	6	338051	338056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250404
7024	NT_187102	CGG	2	6	338057	338062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250404
7025	NT_187102	CG	3	6	338137	338142	0 %	0 %	50 %	50 %	409250404
7026	NT_187102	CCAG	2	8	338146	338153	25 %	0 %	25 %	50 %	409250404
7027	NT_187102	ACAGC	2	10	338203	338212	40 %	0 %	20 %	40 %	409250404
7028	NT_187102	GCG	2	6	338257	338262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250404
7029	NT_187102	AAACG	2	10	338312	338321	60 %	0 %	20 %	20 %	409250404
7030	NT_187102	AGT	2	6	338388	338393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250404
7031	NT_187102	CAT	2	6	338438	338443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250404
7032	NT_187102	GCC	2	6	338537	338542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250404
7033	NT_187102	GC	3	6	338548	338553	0 %	0 %	50 %	50 %	409250404
7034	NT_187102	CCG	2	6	338566	338571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250404
7035	NT_187102	CCG	2	6	338646	338651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250404
7036	NT_187102	CGA	2	6	338686	338691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250404
7037	NT_187102	TGA	2	6	338702	338707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250404
7038	NT_187102	TCA	2	6	338804	338809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7039	NT_187102	ATG	2	6	338984	338989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250405
7040	NT_187102	GCA	2	6	339075	339080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250405
7041	NT_187102	CGA	2	6	339171	339176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250405
7042	NT_187102	ACC	2	6	339263	339268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250405
7043	NT_187102	GTT	2	6	339526	339531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250405
7044	NT_187102	CAGG	2	8	339584	339591	25 %	0 %	50 %	25 %	409250405
7045	NT_187102	CGC	2	6	339597	339602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250405
7046	NT_187102	TGT	2	6	339615	339620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250405
7047	NT_187102	TCG	2	6	339716	339721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250405
7048	NT_187102	CGC	2	6	339756	339761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250405
7049	NT_187102	CGC	3	9	339766	339774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250405
7050	NT_187102	ATCA	2	8	339823	339830	50 %	25 %	0 %	25 %	409250405
7051	NT_187102	GCC	2	6	339838	339843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250405
7052	NT_187102	TCA	2	6	339911	339916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7053	NT_187102	CCAA	2	8	339983	339990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7054	NT_187102	AAAC	2	8	340007	340014	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7055	NT_187102	CTG	2	6	340099	340104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7056	NT_187102	T	6	6	340111	340116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7057	NT_187102	CG	3	6	340178	340183	0 %	0 %	50 %	50 %	409250406
7058	NT_187102	AGA	2	6	340203	340208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250406
7059	NT_187102	GATC	2	8	340234	340241	25 %	25 %	25 %	25 %	409250407
7060	NT_187102	GCTG	2	8	340350	340357	0 %	25 %	50 %	25 %	409250407
7061	NT_187102	TGA	2	6	340398	340403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250407
7062	NT_187102	GCCTG	2	10	340460	340469	0 %	20 %	40 %	40 %	409250408
7063	NT_187102	CTG	3	9	340467	340475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250408
7064	NT_187102	CCCT	2	8	340509	340516	0 %	25 %	0 %	75 %	409250408
7065	NT_187102	GCC	2	6	340598	340603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250408
7066	NT_187102	GCA	2	6	340689	340694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7067	NT_187102	ACC	2	6	340733	340738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7068	NT_187102	GGC	2	6	340743	340748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7069	NT_187102	GCT	3	9	340825	340833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250409
7070	NT_187102	TCA	2	6	340840	340845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250409
7071	NT_187102	ATCG	2	8	340862	340869	25 %	25 %	25 %	25 %	409250409
7072	NT_187102	TTTC	2	8	340930	340937	0 %	75 %	0 %	25 %	409250409
7073	NT_187102	ACGCC	2	10	340951	340960	20 %	0 %	20 %	60 %	409250409
7074	NT_187102	CGG	2	6	340984	340989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250409
7075	NT_187102	TCA	2	6	341034	341039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250409
7076	NT_187102	ATG	2	6	341046	341051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250409
7077	NT_187102	AAT	2	6	341067	341072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250409
7078	NT_187102	T	6	6	341084	341089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7079	NT_187102	GCG	2	6	341346	341351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250410
7080	NT_187102	TAT	2	6	341388	341393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250410
7081	NT_187102	T	6	6	341464	341469	0 %	100 %	0 %	0 %	409250410
7082	NT_187102	TTC	2	6	341476	341481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250410
7083	NT_187102	GGTT	2	8	341489	341496	0 %	50 %	50 %	0 %	409250410
7084	NT_187102	GGC	2	6	341607	341612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7085	NT_187102	ATT	2	6	341636	341641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7086	NT_187102	GCG	2	6	341668	341673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7087	NT_187102	GATT	2	8	341739	341746	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7088	NT_187102	TGG	2	6	341833	341838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7089	NT_187102	AT	3	6	341840	341845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7090	NT_187102	TGC	2	6	341900	341905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250411
7091	NT_187102	A	7	7	342051	342057	100 %	0 %	0 %	0 %	409250411
7092	NT_187102	CTGA	2	8	342144	342151	25 %	25 %	25 %	25 %	409250411
7093	NT_187102	CG	3	6	342158	342163	0 %	0 %	50 %	50 %	409250411
7094	NT_187102	A	6	6	342186	342191	100 %	0 %	0 %	0 %	409250411
7095	NT_187102	ACA	2	6	342217	342222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250411
7096	NT_187102	TGTT	2	8	342229	342236	0 %	75 %	25 %	0 %	409250411
7097	NT_187102	CAC	2	6	342293	342298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250411
7098	NT_187102	CAT	2	6	342344	342349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250411
7099	NT_187102	TGA	2	6	342358	342363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250411
7100	NT_187102	GCG	2	6	342427	342432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250411
7101	NT_187102	CAT	2	6	342452	342457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250411
7102	NT_187102	GCT	2	6	342474	342479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250411
7103	NT_187102	GGTA	2	8	342485	342492	25 %	25 %	50 %	0 %	409250411
7104	NT_187102	GTT	2	6	342561	342566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250411
7105	NT_187102	CTAC	2	8	342595	342602	25 %	25 %	0 %	50 %	409250411
7106	NT_187102	GCT	2	6	342615	342620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250411
7107	NT_187102	GCT	2	6	342627	342632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250411
7108	NT_187102	GAC	2	6	342672	342677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250411
7109	NT_187102	CAA	2	6	342800	342805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250411
7110	NT_187102	T	8	8	342883	342890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7111	NT_187102	GT	3	6	342926	342931	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7112	NT_187102	ATGTCC	2	12	342992	343003	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7113	NT_187102	GTT	2	6	343024	343029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7114	NT_187102	GCCTC	2	10	343083	343092	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7115	NT_187102	ATT	2	6	343147	343152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7116	NT_187102	TAA	2	6	343179	343184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7117	NT_187102	CGT	2	6	343231	343236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250412
7118	NT_187102	TGA	2	6	343242	343247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250412
7119	NT_187102	TCG	2	6	343259	343264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250412
7120	NT_187102	GC	3	6	343304	343309	0 %	0 %	50 %	50 %	409250412
7121	NT_187102	TC	3	6	343314	343319	0 %	50 %	0 %	50 %	409250412
7122	NT_187102	TAA	2	6	343359	343364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250412
7123	NT_187102	CGG	2	6	343395	343400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250412
7124	NT_187102	CTG	2	6	343410	343415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250412
7125	NT_187102	CAA	2	6	343438	343443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250412
7126	NT_187102	GAT	2	6	343504	343509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250412
7127	NT_187102	GCT	2	6	343581	343586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250412
7128	NT_187102	ACG	2	6	343739	343744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250412
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7131	NT_187102	CGT	2	6	343887	343892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250412
7132	NT_187102	CAA	2	6	343996	344001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250412
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7135	NT_187102	GGC	2	6	344130	344135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7136	NT_187102	CAGGC	2	10	344192	344201	20 %	0 %	40 %	40 %	409250413
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7152	NT_187102	ACGTT	2	10	344990	344999	20 %	40 %	20 %	20 %	409250413
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7154	NT_187102	CAT	2	6	345080	345085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7155	NT_187102	CGA	2	6	345140	345145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250414
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7183	NT_187102	TTA	2	6	346384	346389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7184	NT_187102	T	6	6	346443	346448	0 %	100 %	0 %	0 %	409250415
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7200	NT_187102	TGA	2	6	347526	347531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7203	NT_187102	T	7	7	347663	347669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7225	NT_187102	GGC	2	6	349085	349090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250418
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7227	NT_187102	TCAGGA	2	12	349310	349321	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409250418
7228	NT_187102	A	6	6	349381	349386	100 %	0 %	0 %	0 %	409250418
7229	NT_187102	GC	3	6	349451	349456	0 %	0 %	50 %	50 %	409250418
7230	NT_187102	CAA	2	6	349463	349468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250418
7231	NT_187102	A	7	7	349524	349530	100 %	0 %	0 %	0 %	409250418
7232	NT_187102	GAC	2	6	349608	349613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250418
7233	NT_187102	GAT	2	6	349625	349630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250418
7234	NT_187102	GCGT	2	8	349684	349691	0 %	25 %	50 %	25 %	409250418
7235	NT_187102	TCG	2	6	349695	349700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250418
7236	NT_187102	GCGCTT	2	12	349719	349730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250418
7237	NT_187102	G	6	6	349817	349822	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7238	NT_187102	TAA	2	6	349939	349944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250419
7239	NT_187102	GAT	2	6	349994	349999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250419
7240	NT_187102	TCA	2	6	350017	350022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250419
7241	NT_187102	GCG	2	6	350028	350033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250419
7242	NT_187102	GGC	3	9	350108	350116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250419
7243	NT_187102	GCCA	2	8	350141	350148	25 %	0 %	25 %	50 %	409250419
7244	NT_187102	GTTT	2	8	350170	350177	0 %	75 %	25 %	0 %	409250419
7245	NT_187102	GAA	2	6	350239	350244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250419
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7247	NT_187102	GC	3	6	350351	350356	0 %	0 %	50 %	50 %	409250419
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7372	NT_187102	TGC	2	6	355801	355806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250426
7373	NT_187102	GATT	2	8	355813	355820	25 %	50 %	25 %	0 %	409250426
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7384	NT_187102	CTG	2	6	356202	356207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250426
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7391	NT_187102	GGC	2	6	356485	356490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250426
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7396	NT_187102	ATAA	2	8	356626	356633	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7397	NT_187102	TGA	2	6	356656	356661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7402	NT_187102	TGAT	2	8	356920	356927	25 %	50 %	25 %	0 %	409250427
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7432	NT_187102	T	7	7	358651	358657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7433	NT_187102	CTAT	2	8	358666	358673	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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7449	NT_187102	CG	3	6	359518	359523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7450	NT_187102	A	6	6	359540	359545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7451	NT_187102	TAC	2	6	359565	359570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7452	NT_187102	CGT	2	6	359592	359597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7453	NT_187102	CTG	2	6	359652	359657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250434
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7458	NT_187102	A	6	6	359829	359834	100 %	0 %	0 %	0 %	409250435
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7471	NT_187102	A	6	6	360537	360542	100 %	0 %	0 %	0 %	409250436
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7481	NT_187102	GCTG	2	8	361266	361273	0 %	25 %	50 %	25 %	409250437
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7488	NT_187102	GTG	2	6	361628	361633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250437
7489	NT_187102	CCT	2	6	361688	361693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250437
7490	NT_187102	TTA	2	6	361722	361727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7491	NT_187102	ATT	2	6	361743	361748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7492	NT_187102	CTTCAC	2	12	361820	361831	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
7493	NT_187102	ACA	2	6	361850	361855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7494	NT_187102	CA	3	6	361859	361864	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7495	NT_187102	T	6	6	361892	361897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7496	NT_187102	TC	3	6	361943	361948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7497	NT_187102	TATGT	2	10	362055	362064	20 %	60 %	20 %	0 %	409250438
7498	NT_187102	TTAC	2	8	362087	362094	25 %	50 %	0 %	25 %	409250438
7499	NT_187102	GCA	3	9	362109	362117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250438
7500	NT_187102	ATC	2	6	362134	362139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250438

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