MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 8012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NT_187102	A	7	7	289344	289350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NT_187102	AGC	2	6	289363	289368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NT_187102	TAAA	2	8	289454	289461	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NT_187102	AG	3	6	289462	289467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6005	NT_187102	GCT	2	6	289505	289510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NT_187102	T	6	6	289597	289602	0 %	100 %	0 %	0 %	409250356
6007	NT_187102	TGA	2	6	289611	289616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250356
6008	NT_187102	TGC	3	9	289645	289653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250356
6009	NT_187102	GAC	2	6	289698	289703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250356
6010	NT_187102	GTA	2	6	289777	289782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250356
6011	NT_187102	GGCA	2	8	289912	289919	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6012	NT_187102	ACGTTT	2	12	289974	289985	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	409250357
6013	NT_187102	T	6	6	289992	289997	0 %	100 %	0 %	0 %	409250357
6014	NT_187102	GTGCTT	2	12	290022	290033	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	409250357
6015	NT_187102	ACC	2	6	290037	290042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250357
6016	NT_187102	T	7	7	290051	290057	0 %	100 %	0 %	0 %	409250357
6017	NT_187102	AGC	2	6	290067	290072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250357
6018	NT_187102	TAA	2	6	290102	290107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250357
6019	NT_187102	TAA	2	6	290125	290130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250357
6020	NT_187102	TCT	2	6	290203	290208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NT_187102	AGCA	2	8	290213	290220	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6022	NT_187102	ATC	2	6	290226	290231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250358
6023	NT_187102	TGG	2	6	290325	290330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250358
6024	NT_187102	AATTT	2	10	290445	290454	40 %	60 %	0 %	0 %	409250358
6025	NT_187102	TCT	2	6	290482	290487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250358
6026	NT_187102	AGA	2	6	290495	290500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250358
6027	NT_187102	CGG	2	6	290549	290554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250358
6028	NT_187102	CTT	2	6	290593	290598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250358
6029	NT_187102	TC	3	6	290616	290621	0 %	50 %	0 %	50 %	409250358
6030	NT_187102	GCT	2	6	290638	290643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250358
6031	NT_187102	CTT	2	6	290668	290673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NT_187102	GC	3	6	290674	290679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6033	NT_187102	TCC	2	6	290745	290750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6034	NT_187102	GTT	2	6	290752	290757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6035	NT_187102	TTG	2	6	290780	290785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250359
6036	NT_187102	CGG	2	6	290835	290840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250359
6037	NT_187102	CAC	2	6	290878	290883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250359
6038	NT_187102	ACG	2	6	290903	290908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250359
6039	NT_187102	TCT	2	6	290938	290943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250359
6040	NT_187102	TCA	2	6	291034	291039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250359
6041	NT_187102	GAA	2	6	291071	291076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250359
6042	NT_187102	AGG	2	6	291181	291186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250359
6043	NT_187102	AGACG	2	10	291192	291201	40 %	0 %	40 %	20 %	409250359
6044	NT_187102	CTGTA	2	10	291218	291227	20 %	40 %	20 %	20 %	409250359
6045	NT_187102	ATT	2	6	291323	291328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250359
6046	NT_187102	TTC	2	6	291329	291334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250359
6047	NT_187102	GAC	2	6	291416	291421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250359
6048	NT_187102	TCT	2	6	291424	291429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250359
6049	NT_187102	AGA	2	6	291508	291513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250359
6050	NT_187102	CAT	2	6	291520	291525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250359
6051	NT_187102	GC	3	6	291562	291567	0 %	0 %	50 %	50 %	409250359
6052	NT_187102	T	6	6	291751	291756	0 %	100 %	0 %	0 %	409250359
6053	NT_187102	CAT	2	6	291773	291778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250359
6054	NT_187102	CTT	2	6	291793	291798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250359
6055	NT_187102	GAAC	2	8	291822	291829	50 %	0 %	25 %	25 %	409250359
6056	NT_187102	CGT	2	6	291862	291867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250359
6057	NT_187102	CTT	2	6	291892	291897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250359
6058	NT_187102	GCT	2	6	291919	291924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250359
6059	NT_187102	GGT	2	6	291937	291942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250359
6060	NT_187102	T	6	6	291989	291994	0 %	100 %	0 %	0 %	409250359
6061	NT_187102	CCGTA	2	10	292006	292015	20 %	20 %	20 %	40 %	409250359
6062	NT_187102	TTA	2	6	292032	292037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250359
6063	NT_187102	TCA	2	6	292072	292077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250359
6064	NT_187102	TTC	2	6	292139	292144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250359
6065	NT_187102	ATG	2	6	292145	292150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250359
6066	NT_187102	ATC	2	6	292166	292171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250359
6067	NT_187102	TCA	2	6	292185	292190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250359
6068	NT_187102	CAC	2	6	292213	292218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250359
6069	NT_187102	TCT	2	6	292258	292263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250359
6070	NT_187102	CGT	2	6	292270	292275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250359
6071	NT_187102	GC	3	6	292441	292446	0 %	0 %	50 %	50 %	409250359
6072	NT_187102	TGA	2	6	292489	292494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250359
6073	NT_187102	CAT	2	6	292507	292512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250359
6074	NT_187102	TGG	2	6	292564	292569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250359
6075	NT_187102	GCCAG	2	10	292575	292584	20 %	0 %	40 %	40 %	409250359
6076	NT_187102	CATC	2	8	292603	292610	25 %	25 %	0 %	50 %	409250359
6077	NT_187102	GGT	2	6	292621	292626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250359
6078	NT_187102	TAA	2	6	292657	292662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250359
6079	NT_187102	GTG	2	6	292688	292693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250359
6080	NT_187102	A	7	7	292841	292847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NT_187102	TGT	2	6	292965	292970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250360
6082	NT_187102	AGGCA	2	10	292995	293004	40 %	0 %	40 %	20 %	409250360
6083	NT_187102	ATA	2	6	293101	293106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250360
6084	NT_187102	CGT	2	6	293139	293144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250360
6085	NT_187102	TCT	2	6	293194	293199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250360
6086	NT_187102	GCG	2	6	293333	293338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250360
6087	NT_187102	ATAA	2	8	293348	293355	75 %	25 %	0 %	0 %	409250360
6088	NT_187102	ACG	2	6	293360	293365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250360
6089	NT_187102	CGC	2	6	293378	293383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250360
6090	NT_187102	CTGG	2	8	293520	293527	0 %	25 %	50 %	25 %	409250360
6091	NT_187102	TAT	3	9	293573	293581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250360
6092	NT_187102	TTGT	2	8	293606	293613	0 %	75 %	25 %	0 %	409250360
6093	NT_187102	TCC	2	6	293619	293624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250360
6094	NT_187102	GTT	2	6	293654	293659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250360
6095	NT_187102	TGT	2	6	293697	293702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250360
6096	NT_187102	GGA	2	6	293710	293715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250360
6097	NT_187102	GTA	2	6	293722	293727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250360
6098	NT_187102	TAA	2	6	293736	293741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250360
6099	NT_187102	TAC	2	6	293742	293747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250360
6100	NT_187102	TAA	3	9	293795	293803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250360
6101	NT_187102	TAA	2	6	293810	293815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250360
6102	NT_187102	TAA	2	6	293825	293830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250361
6103	NT_187102	TCA	2	6	293866	293871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250361
6104	NT_187102	ACA	2	6	293878	293883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250361
6105	NT_187102	TAA	2	6	293900	293905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250361
6106	NT_187102	A	6	6	293975	293980	100 %	0 %	0 %	0 %	409250361
6107	NT_187102	TAT	2	6	293986	293991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250361
6108	NT_187102	AAT	2	6	294010	294015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250361
6109	NT_187102	AAT	2	6	294053	294058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250361
6110	NT_187102	GCT	2	6	294122	294127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250361
6111	NT_187102	TAA	2	6	294156	294161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6112	NT_187102	CAT	2	6	294170	294175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NT_187102	GCT	2	6	294176	294181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NT_187102	TTA	2	6	294186	294191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NT_187102	GAT	2	6	294263	294268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250362
6116	NT_187102	GCC	2	6	294270	294275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250362
6117	NT_187102	ATG	3	9	294331	294339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250362
6118	NT_187102	CT	3	6	294456	294461	0 %	50 %	0 %	50 %	409250362
6119	NT_187102	CG	3	6	294534	294539	0 %	0 %	50 %	50 %	409250362
6120	NT_187102	TTC	2	6	294550	294555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250362
6121	NT_187102	CCA	2	6	294583	294588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250362
6122	NT_187102	AGG	2	6	294649	294654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250362
6123	NT_187102	AAT	2	6	294674	294679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250362
6124	NT_187102	CCTG	2	8	294696	294703	0 %	25 %	25 %	50 %	409250362
6125	NT_187102	CTG	2	6	294811	294816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250362
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6233	NT_187102	GGC	2	6	299851	299856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250368
6234	NT_187102	GC	3	6	299863	299868	0 %	0 %	50 %	50 %	409250368
6235	NT_187102	CAG	2	6	299880	299885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250368
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6238	NT_187102	CGG	2	6	300128	300133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6239	NT_187102	TCT	2	6	300141	300146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6240	NT_187102	T	6	6	300146	300151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6241	NT_187102	TGG	2	6	300214	300219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250369
6242	NT_187102	ATT	2	6	300223	300228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250369
6243	NT_187102	CTG	2	6	300250	300255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250369
6244	NT_187102	ACC	2	6	300266	300271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250369
6245	NT_187102	CG	3	6	300322	300327	0 %	0 %	50 %	50 %	409250369
6246	NT_187102	CTG	2	6	300355	300360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250369
6247	NT_187102	CGG	2	6	300419	300424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250369
6248	NT_187102	TCG	2	6	300464	300469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250369
6249	NT_187102	GCCT	2	8	300527	300534	0 %	25 %	25 %	50 %	409250369
6250	NT_187102	TATG	2	8	300575	300582	25 %	50 %	25 %	0 %	409250369
6251	NT_187102	GTT	2	6	300585	300590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250369
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6254	NT_187102	GATT	2	8	300702	300709	25 %	50 %	25 %	0 %	409250369
6255	NT_187102	CCATT	2	10	300744	300753	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6256	NT_187102	ATA	2	6	300822	300827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6257	NT_187102	A	7	7	300827	300833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6258	NT_187102	CTG	2	6	300890	300895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250370
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6260	NT_187102	GCT	2	6	301180	301185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250370
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6265	NT_187102	CG	3	6	301279	301284	0 %	0 %	50 %	50 %	409250370
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6284	NT_187102	CCAG	2	8	302166	302173	25 %	0 %	25 %	50 %	409250370
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6287	NT_187102	ACG	2	6	302271	302276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6288	NT_187102	TGTC	2	8	302292	302299	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6289	NT_187102	GTTTT	2	10	302328	302337	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6290	NT_187102	T	7	7	302334	302340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6291	NT_187102	GGCG	2	8	302411	302418	0 %	0 %	75 %	25 %	409250371
6292	NT_187102	CGG	2	6	302513	302518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250371
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6297	NT_187102	ACT	2	6	302755	302760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6300	NT_187102	CGC	2	6	302919	302924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250372
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6302	NT_187102	ACC	2	6	303032	303037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250372
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6322	NT_187102	CCT	2	6	304517	304522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250372
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6357	NT_187102	ATG	2	6	306195	306200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250374
6358	NT_187102	AAT	2	6	306272	306277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250374
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6362	NT_187102	ACA	2	6	306443	306448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250374
6363	NT_187102	GCA	2	6	306461	306466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250374
6364	NT_187102	AGCG	2	8	306472	306479	25 %	0 %	50 %	25 %	409250374
6365	NT_187102	AATC	2	8	306480	306487	50 %	25 %	0 %	25 %	409250374
6366	NT_187102	T	6	6	306514	306519	0 %	100 %	0 %	0 %	409250374
6367	NT_187102	ACGCC	2	10	306545	306554	20 %	0 %	20 %	60 %	409250374
6368	NT_187102	TAA	2	6	306602	306607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250374
6369	NT_187102	TCATTC	2	12	306649	306660	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	409250374
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6377	NT_187102	ATAA	2	8	307068	307075	75 %	25 %	0 %	0 %	409250374
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6452	NT_187102	ACG	2	6	310200	310205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250378
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6463	NT_187102	A	7	7	310607	310613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6468	NT_187102	T	6	6	310880	310885	0 %	100 %	0 %	0 %	409250379
6469	NT_187102	CAA	2	6	310906	310911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250379
6470	NT_187102	CCG	2	6	310963	310968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250379
6471	NT_187102	TGT	2	6	311116	311121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6472	NT_187102	GCG	2	6	311160	311165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6474	NT_187102	GCA	2	6	311229	311234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6480	NT_187102	GCG	2	6	311707	311712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250380
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6490	NT_187102	CCT	2	6	312091	312096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6491	NT_187102	CT	3	6	312095	312100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6492	NT_187102	T	6	6	312111	312116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6493	NT_187102	C	6	6	312188	312193	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6494	NT_187102	AGC	2	6	312207	312212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250381
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6496	NT_187102	TGC	2	6	312386	312391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250381
6497	NT_187102	GCG	2	6	312399	312404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250381
6498	NT_187102	TGC	2	6	312443	312448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250381
6499	NT_187102	AAC	2	6	312470	312475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250381
6500	NT_187102	CT	3	6	312519	312524	0 %	50 %	0 %	50 %	409250381

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