MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 797

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187101	GGA	2	6	9	14	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187101	TATT	2	8	15	22	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187101	T	6	6	47	52	0 %	100 %	0 %	0 %	409250028
4	NT_187101	GCAAG	2	10	86	95	40 %	0 %	40 %	20 %	409250028
5	NT_187101	CCAGCG	2	12	236	247	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409250028
6	NT_187101	CGG	2	6	268	273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250028
7	NT_187101	CCT	2	6	410	415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409250028
8	NT_187101	GC	3	6	443	448	0 %	0 %	50 %	50 %	409250028
9	NT_187101	CAT	3	9	483	491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250028
10	NT_187101	GCG	2	6	557	562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250028
11	NT_187101	GCC	2	6	579	584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250028
12	NT_187101	CCAGAA	2	12	608	619	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	409250028
13	NT_187101	CGC	2	6	689	694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250028
14	NT_187101	GATT	2	8	705	712	25 %	50 %	25 %	0 %	409250028
15	NT_187101	GCG	2	6	784	789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250028
16	NT_187101	CCG	2	6	845	850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250028
17	NT_187101	CG	3	6	887	892	0 %	0 %	50 %	50 %	409250028
18	NT_187101	GGT	2	6	990	995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250028
19	NT_187101	CCG	2	6	1018	1023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250028
20	NT_187101	CAG	2	6	1083	1088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250028
21	NT_187101	CAC	2	6	1106	1111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250028
22	NT_187101	GCG	2	6	1142	1147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250028
23	NT_187101	TAA	2	6	1148	1153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250028
24	NT_187101	TGC	2	6	1187	1192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250028
25	NT_187101	GAA	2	6	1215	1220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250028
26	NT_187101	TCT	2	6	1237	1242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250028
27	NT_187101	CAT	2	6	1263	1268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250028
28	NT_187101	GCA	2	6	1361	1366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250028
29	NT_187101	CTGG	2	8	1417	1424	0 %	25 %	50 %	25 %	409250028
30	NT_187101	GGC	2	6	1482	1487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250028
31	NT_187101	GTG	2	6	1567	1572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250028
32	NT_187101	TCCG	2	8	1587	1594	0 %	25 %	25 %	50 %	409250028
33	NT_187101	GGC	2	6	1641	1646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250028
34	NT_187101	CGGCG	2	10	1668	1677	0 %	0 %	60 %	40 %	409250028
35	NT_187101	GAC	2	6	1683	1688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250028
36	NT_187101	CGG	2	6	1689	1694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250028
37	NT_187101	GC	3	6	1700	1705	0 %	0 %	50 %	50 %	409250028
38	NT_187101	TGCC	2	8	1764	1771	0 %	25 %	25 %	50 %	409250028
39	NT_187101	TGC	2	6	1799	1804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250028
40	NT_187101	GAA	2	6	1856	1861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250028
41	NT_187101	GAA	2	6	1875	1880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250028
42	NT_187101	CGC	2	6	1938	1943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250028
43	NT_187101	CTT	2	6	1991	1996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250028
44	NT_187101	TCG	2	6	2017	2022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250028
45	NT_187101	CCG	2	6	2053	2058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250028
46	NT_187101	TAAG	2	8	2136	2143	50 %	25 %	25 %	0 %	409250028
47	NT_187101	T	6	6	2199	2204	0 %	100 %	0 %	0 %	409250028
48	NT_187101	ATT	2	6	2265	2270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250028
49	NT_187101	TCA	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250028
50	NT_187101	CG	3	6	2418	2423	0 %	0 %	50 %	50 %	409250028
51	NT_187101	ACGC	2	8	2449	2456	25 %	0 %	25 %	50 %	409250028
52	NT_187101	GAT	2	6	2473	2478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250028
53	NT_187101	GCC	2	6	2490	2495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250028
54	NT_187101	ATT	2	6	2526	2531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250028
55	NT_187101	TCA	2	6	2552	2557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250028
56	NT_187101	GC	3	6	2582	2587	0 %	0 %	50 %	50 %	409250028
57	NT_187101	CAT	2	6	2760	2765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250028
58	NT_187101	ATG	2	6	2767	2772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250028
59	NT_187101	ATA	2	6	2796	2801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250028
60	NT_187101	GC	3	6	2966	2971	0 %	0 %	50 %	50 %	409250028
61	NT_187101	TTG	2	6	3043	3048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250028
62	NT_187101	A	7	7	3075	3081	100 %	0 %	0 %	0 %	409250028
63	NT_187101	TG	3	6	3116	3121	0 %	50 %	50 %	0 %	409250028
64	NT_187101	GGC	2	6	3156	3161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250028
65	NT_187101	GT	3	6	3231	3236	0 %	50 %	50 %	0 %	409250028
66	NT_187101	GC	3	6	3246	3251	0 %	0 %	50 %	50 %	409250028
67	NT_187101	ATC	2	6	3307	3312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250028
68	NT_187101	AGC	3	9	3313	3321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250028
69	NT_187101	GAT	2	6	3328	3333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250028
70	NT_187101	CGG	2	6	3377	3382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250028
71	NT_187101	CGC	2	6	3389	3394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250028
72	NT_187101	TTG	2	6	3482	3487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250028
73	NT_187101	A	6	6	3596	3601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NT_187101	TTTTA	2	10	3642	3651	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187101	GAG	2	6	3696	3701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187101	A	6	6	3729	3734	100 %	0 %	0 %	0 %	409250029
77	NT_187101	GC	3	6	3766	3771	0 %	0 %	50 %	50 %	409250029
78	NT_187101	CTG	2	6	3795	3800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250029
79	NT_187101	TAT	2	6	3803	3808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250029
80	NT_187101	GA	3	6	3844	3849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187101	GC	3	6	3853	3858	0 %	0 %	50 %	50 %	409250030
82	NT_187101	TGGG	2	8	3866	3873	0 %	25 %	75 %	0 %	409250030
83	NT_187101	TTA	2	6	3884	3889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250030
84	NT_187101	CAG	2	6	3917	3922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250030
85	NT_187101	GCG	2	6	3956	3961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250030
86	NT_187101	GCGAA	2	10	3975	3984	40 %	0 %	40 %	20 %	409250030
87	NT_187101	GC	3	6	4050	4055	0 %	0 %	50 %	50 %	409250030
88	NT_187101	GCC	2	6	4091	4096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250030
89	NT_187101	GCG	2	6	4120	4125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NT_187101	GTT	2	6	4195	4200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250031
91	NT_187101	CAT	2	6	4308	4313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250031
92	NT_187101	ATTG	2	8	4376	4383	25 %	50 %	25 %	0 %	409250031
93	NT_187101	GGT	2	6	4472	4477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250031
94	NT_187101	CA	3	6	4518	4523	50 %	0 %	0 %	50 %	409250031
95	NT_187101	ATG	2	6	4534	4539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250031
96	NT_187101	TTC	2	6	4564	4569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250031
97	NT_187101	CGG	2	6	4824	4829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250032
98	NT_187101	CAT	2	6	4834	4839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250032
99	NT_187101	CGTT	2	8	4881	4888	0 %	50 %	25 %	25 %	409250032
100	NT_187101	CATC	2	8	4897	4904	25 %	25 %	0 %	50 %	409250032
101	NT_187101	TTC	2	6	4926	4931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250032
102	NT_187101	GCC	2	6	4944	4949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250032
103	NT_187101	AATC	2	8	4954	4961	50 %	25 %	0 %	25 %	409250032
104	NT_187101	GC	3	6	4963	4968	0 %	0 %	50 %	50 %	409250032
105	NT_187101	AAC	2	6	5088	5093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250032
106	NT_187101	GCG	2	6	5130	5135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250032
107	NT_187101	GCG	2	6	5196	5201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250032
108	NT_187101	CGG	2	6	5316	5321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250032
109	NT_187101	TCA	3	9	5329	5337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250032
110	NT_187101	ACC	2	6	5388	5393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250032
111	NT_187101	ATT	2	6	5429	5434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250032
112	NT_187101	T	6	6	5474	5479	0 %	100 %	0 %	0 %	409250032
113	NT_187101	CGT	2	6	5506	5511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250032
114	NT_187101	CAG	2	6	5570	5575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250032
115	NT_187101	A	6	6	5582	5587	100 %	0 %	0 %	0 %	409250032
116	NT_187101	CA	3	6	5698	5703	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NT_187101	A	6	6	5726	5731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NT_187101	AAT	2	6	5737	5742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NT_187101	CATA	2	8	5750	5757	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NT_187101	AAT	2	6	5763	5768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NT_187101	GCC	2	6	5956	5961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250033
122	NT_187101	CTG	2	6	5977	5982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250033
123	NT_187101	TGA	2	6	6005	6010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250033
124	NT_187101	GTTG	2	8	6188	6195	0 %	50 %	50 %	0 %	409250033
125	NT_187101	CTGC	2	8	6241	6248	0 %	25 %	25 %	50 %	409250033
126	NT_187101	CGC	2	6	6264	6269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250033
127	NT_187101	TGC	2	6	6299	6304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250033
128	NT_187101	CAG	2	6	6394	6399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250033
129	NT_187101	CGC	2	6	6477	6482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250033
130	NT_187101	TGG	2	6	6602	6607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250033
131	NT_187101	GCCGG	2	10	6799	6808	0 %	0 %	60 %	40 %	409250033
132	NT_187101	CG	3	6	7046	7051	0 %	0 %	50 %	50 %	409250033
133	NT_187101	TGAT	2	8	7058	7065	25 %	50 %	25 %	0 %	409250033
134	NT_187101	TGA	2	6	7077	7082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250033
135	NT_187101	GGCG	2	8	7098	7105	0 %	0 %	75 %	25 %	409250033
136	NT_187101	CGC	2	6	7115	7120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250033
137	NT_187101	GCG	2	6	7121	7126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250033
138	NT_187101	TTC	2	6	7184	7189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250033
139	NT_187101	GC	3	6	7275	7280	0 %	0 %	50 %	50 %	409250033
140	NT_187101	GC	3	6	7454	7459	0 %	0 %	50 %	50 %	409250033
141	NT_187101	TGC	2	6	7502	7507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250033
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143	NT_187101	TGG	2	6	7645	7650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250033
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161	NT_187101	GC	3	6	8851	8856	0 %	0 %	50 %	50 %	409250035
162	NT_187101	TGG	2	6	8894	8899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250035
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164	NT_187101	CGC	2	6	8953	8958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250035
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169	NT_187101	ATT	2	6	9216	9221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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194	NT_187101	ATT	2	6	10398	10403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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255	NT_187101	A	7	7	12942	12948	100 %	0 %	0 %	0 %	409250038
256	NT_187101	A	6	6	12982	12987	100 %	0 %	0 %	0 %	409250038
257	NT_187101	AAG	2	6	13000	13005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250038
258	NT_187101	A	6	6	13012	13017	100 %	0 %	0 %	0 %	409250038
259	NT_187101	CGC	2	6	13288	13293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250038
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263	NT_187101	CGG	2	6	13504	13509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250038
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267	NT_187101	CGG	2	6	13862	13867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250038
268	NT_187101	TGG	2	6	13936	13941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250038
269	NT_187101	GAC	2	6	13970	13975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250038
270	NT_187101	TCAATA	2	12	13981	13992	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	409250038
271	NT_187101	CAG	2	6	14211	14216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250038
272	NT_187101	CAA	2	6	14223	14228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250038
273	NT_187101	ATAA	2	8	14232	14239	75 %	25 %	0 %	0 %	409250038
274	NT_187101	GAT	3	9	14262	14270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250038
275	NT_187101	GAT	2	6	14288	14293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250038
276	NT_187101	GAA	2	6	14295	14300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250038
277	NT_187101	CGA	2	6	14403	14408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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291	NT_187101	CGG	2	6	15026	15031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250039
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293	NT_187101	TAC	2	6	15215	15220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250039
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295	NT_187101	ACC	2	6	15294	15299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
296	NT_187101	TGA	2	6	15312	15317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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299	NT_187101	TTCA	2	8	15357	15364	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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369	NT_187101	TGGG	2	8	18352	18359	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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371	NT_187101	AGCG	2	8	18393	18400	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
372	NT_187101	GCG	2	6	18466	18471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
373	NT_187101	GCCA	2	8	18505	18512	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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381	NT_187101	ACA	2	6	18932	18937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
382	NT_187101	TGT	2	6	18956	18961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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385	NT_187101	GTT	2	6	19032	19037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
386	NT_187101	TAA	2	6	19075	19080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
387	NT_187101	TAA	2	6	19094	19099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
388	NT_187101	AACA	2	8	19127	19134	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
389	NT_187101	TTC	2	6	19148	19153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
390	NT_187101	GGT	2	6	19179	19184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
391	NT_187101	A	7	7	19292	19298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
392	NT_187101	ATT	2	6	19351	19356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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397	NT_187101	CAA	2	6	19595	19600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250044
398	NT_187101	AGC	2	6	19623	19628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250044
399	NT_187101	GCA	2	6	19750	19755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
400	NT_187101	CAT	2	6	19763	19768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
401	NT_187101	AAT	2	6	19849	19854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250045
402	NT_187101	ATG	2	6	19892	19897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250045
403	NT_187101	TGGA	2	8	19910	19917	25 %	25 %	50 %	0 %	409250045
404	NT_187101	AT	3	6	19945	19950	50 %	50 %	0 %	0 %	409250045
405	NT_187101	GTG	2	6	19991	19996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250045
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430	NT_187101	TTA	2	6	21080	21085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
431	NT_187101	ATTA	2	8	21104	21111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NT_187101	TAT	2	6	21207	21212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250046
433	NT_187101	CAT	2	6	21231	21236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250046
434	NT_187101	CAA	2	6	21237	21242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250046
435	NT_187101	ATT	2	6	21283	21288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250046
436	NT_187101	A	6	6	21318	21323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
437	NT_187101	ATC	2	6	21397	21402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
438	NT_187101	TAT	2	6	21407	21412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NT_187101	AATG	2	8	21489	21496	50 %	25 %	25 %	0 %	409250047
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461	NT_187101	TTAT	2	8	22498	22505	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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463	NT_187101	TGA	3	9	22650	22658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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