MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 2219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187100	CAC	2	6	22	27	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NT_187100	TGC	2	6	43	48	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NT_187100	ATT	2	6	70	75	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187100	CTC	2	6	87	92	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NT_187100	TC	3	6	122	127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NT_187100	CAT	2	6	256	261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NT_187100	CGC	2	6	273	278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NT_187100	AAT	2	6	372	377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249915
9	NT_187100	GC	3	6	425	430	0 %	0 %	50 %	50 %	409249915
10	NT_187100	CAT	2	6	468	473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249915
11	NT_187100	TCT	2	6	475	480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249915
12	NT_187100	GAT	2	6	570	575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249915
13	NT_187100	CGC	2	6	581	586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249915
14	NT_187100	TGA	2	6	598	603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249915
15	NT_187100	CG	3	6	610	615	0 %	0 %	50 %	50 %	409249915
16	NT_187100	GTG	2	6	639	644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249915
17	NT_187100	GC	3	6	669	674	0 %	0 %	50 %	50 %	409249915
18	NT_187100	CAC	2	6	714	719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249915
19	NT_187100	AGCG	2	8	829	836	25 %	0 %	50 %	25 %	409249915
20	NT_187100	TCA	2	6	899	904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249915
21	NT_187100	CGG	2	6	962	967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249915
22	NT_187100	AGA	2	6	1018	1023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249915
23	NT_187100	A	6	6	1062	1067	100 %	0 %	0 %	0 %	409249915
24	NT_187100	CG	3	6	1144	1149	0 %	0 %	50 %	50 %	409249915
25	NT_187100	ATTGC	2	10	1202	1211	20 %	40 %	20 %	20 %	409249915
26	NT_187100	GCA	2	6	1268	1273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249916
27	NT_187100	T	6	6	1283	1288	0 %	100 %	0 %	0 %	409249916
28	NT_187100	GCGG	2	8	1327	1334	0 %	0 %	75 %	25 %	409249916
29	NT_187100	ATA	2	6	1346	1351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249916
30	NT_187100	CG	3	6	1422	1427	0 %	0 %	50 %	50 %	409249916
31	NT_187100	GAT	2	6	1517	1522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249916
32	NT_187100	ATC	2	6	1523	1528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249916
33	NT_187100	TTAA	2	8	1566	1573	50 %	50 %	0 %	0 %	409249916
34	NT_187100	TCA	2	6	1588	1593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249916
35	NT_187100	AAT	2	6	1718	1723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249916
36	NT_187100	A	6	6	1736	1741	100 %	0 %	0 %	0 %	409249916
37	NT_187100	TCA	2	6	1895	1900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249917
38	NT_187100	ATTGAT	2	12	1921	1932	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	409249917
39	NT_187100	TAA	2	6	1983	1988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249917
40	NT_187100	GATG	2	8	2046	2053	25 %	25 %	50 %	0 %	409249917
41	NT_187100	AGG	2	6	2067	2072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249917
42	NT_187100	CGA	2	6	2165	2170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249917
43	NT_187100	CG	3	6	2227	2232	0 %	0 %	50 %	50 %	409249917
44	NT_187100	CTGG	2	8	2280	2287	0 %	25 %	50 %	25 %	409249917
45	NT_187100	ATG	2	6	2372	2377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249917
46	NT_187100	GCA	2	6	2388	2393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249917
47	NT_187100	CT	3	6	2401	2406	0 %	50 %	0 %	50 %	409249917
48	NT_187100	AG	3	6	2430	2435	50 %	0 %	50 %	0 %	409249917
49	NT_187100	GAT	2	6	2437	2442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249917
50	NT_187100	TGGC	2	8	2579	2586	0 %	25 %	50 %	25 %	409249917
51	NT_187100	GCG	2	6	2665	2670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249917
52	NT_187100	GA	3	6	2816	2821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187100	TTG	2	6	2858	2863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249918
54	NT_187100	TCGC	2	8	2880	2887	0 %	25 %	25 %	50 %	409249918
55	NT_187100	GCTT	2	8	3187	3194	0 %	50 %	25 %	25 %	409249918
56	NT_187100	GAA	4	12	3223	3234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249918
57	NT_187100	CCG	2	6	3275	3280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249918
58	NT_187100	TTG	2	6	3289	3294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249918
59	NT_187100	CAG	2	6	3316	3321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249918
60	NT_187100	ATTA	2	8	3340	3347	50 %	50 %	0 %	0 %	409249918
61	NT_187100	CCG	2	6	3362	3367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249918
62	NT_187100	CGGG	2	8	3442	3449	0 %	0 %	75 %	25 %	409249918
63	NT_187100	TTG	2	6	3472	3477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249918
64	NT_187100	CAA	2	6	3520	3525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249918
65	NT_187100	ATC	2	6	3569	3574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249918
66	NT_187100	CTA	2	6	3621	3626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249918
67	NT_187100	CCG	2	6	3659	3664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249918
68	NT_187100	TCA	2	6	3693	3698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249918
69	NT_187100	AGC	2	6	3709	3714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249918
70	NT_187100	AGG	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249918
71	NT_187100	TGT	2	6	3821	3826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249918
72	NT_187100	CGA	2	6	3880	3885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NT_187100	A	6	6	4064	4069	100 %	0 %	0 %	0 %	409249919
74	NT_187100	TGC	2	6	4104	4109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249919
75	NT_187100	TGC	2	6	4137	4142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249919
76	NT_187100	CGT	2	6	4171	4176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249919
77	NT_187100	GCT	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249919
78	NT_187100	GGA	2	6	4312	4317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249919
79	NT_187100	TAT	2	6	4348	4353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249919
80	NT_187100	GC	3	6	4401	4406	0 %	0 %	50 %	50 %	409249919
81	NT_187100	CCG	2	6	4507	4512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249919
82	NT_187100	CGA	2	6	4516	4521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249919
83	NT_187100	AGA	2	6	4555	4560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249919
84	NT_187100	TAA	2	6	4840	4845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249919
85	NT_187100	AT	3	6	4852	4857	50 %	50 %	0 %	0 %	409249919
86	NT_187100	GAA	3	9	4922	4930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249919
87	NT_187100	AAG	2	6	4940	4945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249919
88	NT_187100	T	6	6	4963	4968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187100	T	7	7	4995	5001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NT_187100	GTC	2	6	5011	5016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NT_187100	A	8	8	5033	5040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187100	GCG	2	6	5049	5054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NT_187100	ATT	2	6	5079	5084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249920
94	NT_187100	TTC	2	6	5119	5124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249920
95	NT_187100	T	6	6	5131	5136	0 %	100 %	0 %	0 %	409249920
96	NT_187100	CAG	2	6	5266	5271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249920
97	NT_187100	TTC	2	6	5335	5340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249920
98	NT_187100	CAG	4	12	5346	5357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249920
99	NT_187100	TCT	2	6	5363	5368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249920
100	NT_187100	ACG	2	6	5371	5376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249920
101	NT_187100	TTC	2	6	5410	5415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249920
102	NT_187100	TGT	2	6	5463	5468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249920
103	NT_187100	GTA	2	6	5495	5500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187100	GGT	2	6	5519	5524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NT_187100	TTG	2	6	5525	5530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187100	TAA	2	6	5534	5539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187100	TTA	2	6	5598	5603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187100	A	6	6	5653	5658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NT_187100	G	6	6	5672	5677	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
110	NT_187100	ATG	2	6	5727	5732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NT_187100	TGA	2	6	5856	5861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NT_187100	TTG	2	6	5868	5873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NT_187100	TA	3	6	5909	5914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NT_187100	CGCT	2	8	5949	5956	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NT_187100	ACTC	2	8	5991	5998	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NT_187100	GCC	2	6	6003	6008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NT_187100	ATT	2	6	6023	6028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NT_187100	CGTCG	2	10	6088	6097	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
119	NT_187100	CTA	2	6	6173	6178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249921
120	NT_187100	AATG	2	8	6185	6192	50 %	25 %	25 %	0 %	409249921
121	NT_187100	ACTGC	2	10	6204	6213	20 %	20 %	20 %	40 %	409249921
122	NT_187100	CGT	2	6	6254	6259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249921
123	NT_187100	CGG	2	6	6265	6270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249921
124	NT_187100	CGA	2	6	6275	6280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249921
125	NT_187100	GTC	2	6	6320	6325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249921
126	NT_187100	GAGC	2	8	6380	6387	25 %	0 %	50 %	25 %	409249921
127	NT_187100	CGA	2	6	6413	6418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249921
128	NT_187100	CAG	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249921
129	NT_187100	TGG	2	6	6568	6573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249921
130	NT_187100	TGC	2	6	6616	6621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249921
131	NT_187100	GGT	2	6	6662	6667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249921
132	NT_187100	GGA	2	6	6725	6730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249921
133	NT_187100	ATT	2	6	6825	6830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NT_187100	CCT	2	6	6835	6840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NT_187100	GAT	2	6	6872	6877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NT_187100	A	7	7	6917	6923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NT_187100	T	6	6	6979	6984	0 %	100 %	0 %	0 %	409249922
138	NT_187100	T	6	6	6988	6993	0 %	100 %	0 %	0 %	409249922
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272	NT_187100	GAA	2	6	12772	12777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249925
273	NT_187100	TCA	2	6	12838	12843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249925
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280	NT_187100	ATA	2	6	13140	13145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249925
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282	NT_187100	T	6	6	13220	13225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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392	NT_187100	AAC	2	6	18275	18280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249931
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398	NT_187100	ATC	2	6	18604	18609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249932
399	NT_187100	CGCC	2	8	18744	18751	0 %	0 %	25 %	75 %	409249932
400	NT_187100	CGA	2	6	18789	18794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249932
401	NT_187100	ATA	2	6	18821	18826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249932
402	NT_187100	CGC	2	6	18837	18842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249932
403	NT_187100	GCA	2	6	18867	18872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249932
404	NT_187100	TCG	2	6	18875	18880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249932
405	NT_187100	CG	3	6	18918	18923	0 %	0 %	50 %	50 %	409249932
406	NT_187100	ATA	2	6	19028	19033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249932
407	NT_187100	A	6	6	19178	19183	100 %	0 %	0 %	0 %	409249932
408	NT_187100	CCA	2	6	19191	19196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249932
409	NT_187100	ATC	2	6	19232	19237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249932
410	NT_187100	CAT	2	6	19333	19338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249932
411	NT_187100	GCC	2	6	19340	19345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249932
412	NT_187100	GAA	2	6	19357	19362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249932
413	NT_187100	CGG	2	6	19409	19414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249932
414	NT_187100	GCG	2	6	19415	19420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249932
415	NT_187100	GCC	2	6	19453	19458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249932
416	NT_187100	CAT	2	6	19533	19538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249932
417	NT_187100	CGT	2	6	19592	19597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249932
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419	NT_187100	GAT	2	6	19789	19794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249932
420	NT_187100	AAC	2	6	19796	19801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249932
421	NT_187100	GC	3	6	19823	19828	0 %	0 %	50 %	50 %	409249932
422	NT_187100	CAC	2	6	19897	19902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249932
423	NT_187100	GTT	2	6	19947	19952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
424	NT_187100	GTA	2	6	20070	20075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249933
425	NT_187100	GCC	2	6	20115	20120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249933
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427	NT_187100	TCT	2	6	20288	20293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249934
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429	NT_187100	TCA	2	6	20476	20481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249934
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431	NT_187100	TG	3	6	20676	20681	0 %	50 %	50 %	0 %	409249935
432	NT_187100	ATC	2	6	20697	20702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249935
433	NT_187100	TCG	2	6	20817	20822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249936
434	NT_187100	GCC	2	6	20967	20972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249936
435	NT_187100	GCC	3	9	20985	20993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249936
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439	NT_187100	AAACCG	2	12	21100	21111	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	409249936
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442	NT_187100	CAA	2	6	21209	21214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249936
443	NT_187100	GCA	2	6	21215	21220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249936
444	NT_187100	CGG	2	6	21242	21247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249936
445	NT_187100	GCT	2	6	21358	21363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249936
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449	NT_187100	GCC	2	6	21537	21542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
450	NT_187100	CTG	2	6	21563	21568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
451	NT_187100	GCG	2	6	21569	21574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
452	NT_187100	ATAA	2	8	21639	21646	75 %	25 %	0 %	0 %	409249937
453	NT_187100	T	6	6	21696	21701	0 %	100 %	0 %	0 %	409249937
454	NT_187100	CGT	2	6	21732	21737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249937
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456	NT_187100	TTCC	2	8	21806	21813	0 %	50 %	0 %	50 %	409249937
457	NT_187100	CGC	2	6	21863	21868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249937
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459	NT_187100	GGCA	2	8	21927	21934	25 %	0 %	50 %	25 %	409249937
460	NT_187100	GAG	2	6	21965	21970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249937
461	NT_187100	TAT	2	6	21971	21976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249937
462	NT_187100	TTG	2	6	21980	21985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249937
463	NT_187100	A	6	6	22008	22013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NT_187100	CTA	2	6	22028	22033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
465	NT_187100	TG	3	6	22041	22046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
466	NT_187100	GAT	2	6	22130	22135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
467	NT_187100	CGC	2	6	22191	22196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249938
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469	NT_187100	CGCA	2	8	22299	22306	25 %	0 %	25 %	50 %	409249938
470	NT_187100	A	6	6	22309	22314	100 %	0 %	0 %	0 %	409249938
471	NT_187100	CTG	2	6	22348	22353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249938
472	NT_187100	T	6	6	22396	22401	0 %	100 %	0 %	0 %	409249938
473	NT_187100	TTA	2	6	22416	22421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249938
474	NT_187100	GC	3	6	22425	22430	0 %	0 %	50 %	50 %	409249938
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476	NT_187100	TAA	2	6	22467	22472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249938
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480	NT_187100	CGC	2	6	22615	22620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249938
481	NT_187100	A	6	6	22648	22653	100 %	0 %	0 %	0 %	409249938
482	NT_187100	A	6	6	22667	22672	100 %	0 %	0 %	0 %	409249938
483	NT_187100	TTC	2	6	22689	22694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249938
484	NT_187100	CAT	2	6	22700	22705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
485	NT_187100	ATT	2	6	22745	22750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249939
486	NT_187100	AGCAAT	2	12	22873	22884	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	409249939
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488	NT_187100	CAAC	2	8	22991	22998	50 %	0 %	0 %	50 %	409249939
489	NT_187100	ATA	2	6	23029	23034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249939
490	NT_187100	GC	3	6	23137	23142	0 %	0 %	50 %	50 %	409249939
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492	NT_187100	ATC	2	6	23179	23184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249939
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497	NT_187100	CTG	3	9	23262	23270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249939
498	NT_187100	CTGC	2	8	23311	23318	0 %	25 %	25 %	50 %	409249939
499	NT_187100	ACC	2	6	23383	23388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249939
500	NT_187100	TAA	2	6	23426	23431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249939

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