MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187097	CCAG	2	8	56	63	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NT_187097	CGAT	2	8	233	240	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NT_187097	CA	3	6	422	427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NT_187097	GCC	2	6	440	445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NT_187097	GTT	2	6	530	535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187097	TTC	2	6	537	542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NT_187097	T	6	6	684	689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NT_187097	CGT	2	6	746	751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NT_187097	CAG	2	6	838	843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NT_187097	GCA	2	6	871	876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NT_187097	TCAT	2	8	905	912	25 %	50 %	0 %	25 %	409249770
12	NT_187097	GACCA	2	10	992	1001	40 %	0 %	20 %	40 %	409249770
13	NT_187097	GAT	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249770
14	NT_187097	TCG	2	6	1104	1109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249770
15	NT_187097	CCT	2	6	1233	1238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249770
16	NT_187097	ACC	2	6	1383	1388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249771
17	NT_187097	GTGG	2	8	1433	1440	0 %	25 %	75 %	0 %	409249771
18	NT_187097	CAC	2	6	1536	1541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249771
19	NT_187097	CGG	2	6	1585	1590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249771
20	NT_187097	ACC	2	6	1609	1614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249771
21	NT_187097	TTC	2	6	1619	1624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249771
22	NT_187097	CAA	2	6	1694	1699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249772
23	NT_187097	TGG	2	6	1710	1715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249772
24	NT_187097	TGGC	2	8	1800	1807	0 %	25 %	50 %	25 %	409249772
25	NT_187097	TAT	2	6	1828	1833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249772
26	NT_187097	GCT	2	6	1836	1841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249772
27	NT_187097	CGA	2	6	1918	1923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249772
28	NT_187097	TCT	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249772
29	NT_187097	GTCA	2	8	1993	2000	25 %	25 %	25 %	25 %	409249772
30	NT_187097	GCC	2	6	2002	2007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249772
31	NT_187097	AAT	2	6	2032	2037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249772
32	NT_187097	TGCGC	2	10	2059	2068	0 %	20 %	40 %	40 %	409249772
33	NT_187097	A	6	6	2072	2077	100 %	0 %	0 %	0 %	409249772
34	NT_187097	GC	3	6	2118	2123	0 %	0 %	50 %	50 %	409249772
35	NT_187097	CTGT	2	8	2313	2320	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NT_187097	TAAT	2	8	2377	2384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187097	TAA	2	6	2394	2399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187097	GTT	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187097	GGAAA	2	10	2480	2489	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187097	TTA	2	6	2504	2509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187097	GAA	2	6	2534	2539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187097	ATTT	2	8	2589	2596	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187097	ATA	2	6	2597	2602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NT_187097	TGC	2	6	2625	2630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NT_187097	CTT	2	6	2631	2636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NT_187097	TGTC	2	8	2689	2696	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NT_187097	AAT	2	6	2732	2737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187097	GTA	2	6	2742	2747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187097	TGAA	2	8	2780	2787	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187097	A	6	6	2820	2825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187097	TAG	2	6	2834	2839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187097	CCAT	2	8	2934	2941	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NT_187097	CTGG	2	8	2947	2954	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NT_187097	TCG	2	6	2960	2965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NT_187097	GGC	2	6	3030	3035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249773
56	NT_187097	TCA	2	6	3081	3086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249773
57	NT_187097	AAG	2	6	3110	3115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249773
58	NT_187097	CAT	2	6	3134	3139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249773
59	NT_187097	TTA	2	6	3147	3152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249773
60	NT_187097	GGA	2	6	3166	3171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249773
61	NT_187097	AGA	2	6	3190	3195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249773
62	NT_187097	TAA	2	6	3216	3221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249773
63	NT_187097	CAT	2	6	3286	3291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249773
64	NT_187097	ACC	2	6	3353	3358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249773
65	NT_187097	AAC	2	6	3365	3370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249773
66	NT_187097	GAA	2	6	3468	3473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249773
67	NT_187097	TCT	2	6	3488	3493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249773
68	NT_187097	TCCC	2	8	3511	3518	0 %	25 %	0 %	75 %	409249773
69	NT_187097	CTG	2	6	3538	3543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249773
70	NT_187097	ATATCA	2	12	3624	3635	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	409249773
71	NT_187097	ATTT	2	8	3646	3653	25 %	75 %	0 %	0 %	409249773
72	NT_187097	TGTT	2	8	3654	3661	0 %	75 %	25 %	0 %	409249773
73	NT_187097	CTTT	2	8	3714	3721	0 %	75 %	0 %	25 %	409249773
74	NT_187097	GAAT	2	8	3750	3757	50 %	25 %	25 %	0 %	409249773
75	NT_187097	ACA	2	6	3769	3774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249773
76	NT_187097	AACA	2	8	3779	3786	75 %	0 %	0 %	25 %	409249773
77	NT_187097	T	6	6	3797	3802	0 %	100 %	0 %	0 %	409249773
78	NT_187097	TCT	2	6	3850	3855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NT_187097	AAT	2	6	3894	3899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187097	TGATG	2	10	4013	4022	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187097	GTT	2	6	4038	4043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187097	CTGC	2	8	4066	4073	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NT_187097	ACTG	2	8	4086	4093	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NT_187097	CGT	2	6	4136	4141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NT_187097	CAG	2	6	4150	4155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NT_187097	AGTT	2	8	4233	4240	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187097	TTA	2	6	4262	4267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187097	AAT	3	9	4268	4276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187097	CAG	2	6	4329	4334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NT_187097	ATT	2	6	4341	4346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187097	ATG	2	6	4348	4353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187097	TA	3	6	4454	4459	50 %	50 %	0 %	0 %	409249774
93	NT_187097	TCA	2	6	4487	4492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249774
94	NT_187097	TA	3	6	4503	4508	50 %	50 %	0 %	0 %	409249774
95	NT_187097	TA	3	6	4537	4542	50 %	50 %	0 %	0 %	409249774
96	NT_187097	AT	3	6	4604	4609	50 %	50 %	0 %	0 %	409249774
97	NT_187097	GC	3	6	4660	4665	0 %	0 %	50 %	50 %	409249774
98	NT_187097	TA	3	6	4684	4689	50 %	50 %	0 %	0 %	409249774
99	NT_187097	A	7	7	4721	4727	100 %	0 %	0 %	0 %	409249774
100	NT_187097	CCT	2	6	4742	4747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249774
101	NT_187097	TAT	2	6	4755	4760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249774
102	NT_187097	ATT	2	6	4795	4800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249774
103	NT_187097	TA	3	6	4834	4839	50 %	50 %	0 %	0 %	409249774
104	NT_187097	AAT	2	6	4846	4851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249774
105	NT_187097	GAA	2	6	4913	4918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249774
106	NT_187097	CGT	2	6	5034	5039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249774
107	NT_187097	CAT	2	6	5082	5087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249774
108	NT_187097	TAT	2	6	5104	5109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249774
109	NT_187097	AGC	2	6	5137	5142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249774
110	NT_187097	TAA	2	6	5145	5150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249774
111	NT_187097	AGG	2	6	5154	5159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249774
112	NT_187097	GTTG	2	8	5181	5188	0 %	50 %	50 %	0 %	409249774
113	NT_187097	GACT	2	8	5312	5319	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NT_187097	ATT	2	6	5344	5349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NT_187097	TGA	2	6	5358	5363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NT_187097	CTC	2	6	5404	5409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NT_187097	ACTTA	2	10	5421	5430	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NT_187097	GCA	2	6	5489	5494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NT_187097	AGG	2	6	5498	5503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NT_187097	GAC	2	6	5584	5589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NT_187097	CGT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NT_187097	CGG	2	6	5690	5695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NT_187097	TTG	2	6	5772	5777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NT_187097	CCA	2	6	5825	5830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NT_187097	AT	3	6	5848	5853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.