MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187086	GC	3	6	6	11	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NT_187086	ACTG	2	8	82	89	25 %	25 %	25 %	25 %	409249434
3	NT_187086	GTTG	2	8	175	182	0 %	50 %	50 %	0 %	409249434
4	NT_187086	CCA	2	6	252	257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249434
5	NT_187086	AGC	2	6	282	287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249434
6	NT_187086	GCC	2	6	374	379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249434
7	NT_187086	CGG	2	6	403	408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249434
8	NT_187086	CAG	2	6	531	536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249434
9	NT_187086	CTT	2	6	666	671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249434
10	NT_187086	TA	3	6	795	800	50 %	50 %	0 %	0 %	409249434
11	NT_187086	ATG	2	6	872	877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249434
12	NT_187086	GGA	2	6	917	922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249434
13	NT_187086	AATTT	2	10	1161	1170	40 %	60 %	0 %	0 %	409249434
14	NT_187086	GAC	2	6	1211	1216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249434
15	NT_187086	CAGC	2	8	1234	1241	25 %	0 %	25 %	50 %	409249434
16	NT_187086	TGT	2	6	1267	1272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249434
17	NT_187086	TA	3	6	1338	1343	50 %	50 %	0 %	0 %	409249434
18	NT_187086	CTG	2	6	1440	1445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249434
19	NT_187086	CAA	2	6	1476	1481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249434
20	NT_187086	TGGG	2	8	1523	1530	0 %	25 %	75 %	0 %	409249434
21	NT_187086	TGGC	2	8	1534	1541	0 %	25 %	50 %	25 %	409249434
22	NT_187086	GAT	2	6	1554	1559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249434
23	NT_187086	A	6	6	1581	1586	100 %	0 %	0 %	0 %	409249435
24	NT_187086	TGA	2	6	1605	1610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249435
25	NT_187086	AAC	2	6	1624	1629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249435
26	NT_187086	A	6	6	1690	1695	100 %	0 %	0 %	0 %	409249435
27	NT_187086	TCCGT	2	10	1727	1736	0 %	40 %	20 %	40 %	409249435
28	NT_187086	AGA	2	6	1740	1745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249435
29	NT_187086	TC	3	6	1748	1753	0 %	50 %	0 %	50 %	409249435
30	NT_187086	GTT	2	6	1777	1782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249435
31	NT_187086	TGT	2	6	1845	1850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249435
32	NT_187086	CGAAC	2	10	1936	1945	40 %	0 %	20 %	40 %	409249435
33	NT_187086	CGA	2	6	1965	1970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249435
34	NT_187086	ATGG	2	8	1992	1999	25 %	25 %	50 %	0 %	409249435
35	NT_187086	TAA	2	6	2089	2094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249435
36	NT_187086	CTGG	2	8	2098	2105	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NT_187086	AGG	2	6	2112	2117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187086	A	6	6	2151	2156	100 %	0 %	0 %	0 %	409249436
39	NT_187086	TAA	2	6	2168	2173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249436
40	NT_187086	TTCAG	2	10	2196	2205	20 %	40 %	20 %	20 %	409249436
41	NT_187086	TGA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249436
42	NT_187086	ATA	2	6	2222	2227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249436
43	NT_187086	GTT	2	6	2255	2260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249436
44	NT_187086	AAC	2	6	2280	2285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249436
45	NT_187086	GGT	2	6	2306	2311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187086	TGG	2	6	2323	2328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187086	G	6	6	2344	2349	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187086	GGC	2	6	2372	2377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NT_187086	TAT	2	6	2400	2405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187086	TGG	2	6	2407	2412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187086	G	6	6	2411	2416	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187086	ACA	2	6	2464	2469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NT_187086	ATA	2	6	2502	2507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187086	CTTC	2	8	2543	2550	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NT_187086	TCATTG	2	12	2572	2583	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NT_187086	AAC	2	6	2588	2593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NT_187086	A	6	6	2624	2629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187086	TAA	2	6	2630	2635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187086	GAAT	2	8	2670	2677	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187086	GT	3	6	2678	2683	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187086	ATG	2	6	2697	2702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NT_187086	GCT	2	6	2840	2845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NT_187086	TCA	2	6	2852	2857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NT_187086	CTGC	2	8	2940	2947	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NT_187086	GAT	2	6	2976	2981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187086	A	6	6	3007	3012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NT_187086	TCA	2	6	3051	3056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NT_187086	TCT	2	6	3068	3073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NT_187086	GAC	2	6	3100	3105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NT_187086	CCG	2	6	3113	3118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NT_187086	GAT	2	6	3151	3156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187086	T	6	6	3194	3199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187086	CAT	2	6	3238	3243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249437
74	NT_187086	CCG	2	6	3250	3255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249437
75	NT_187086	C	7	7	3282	3288	0 %	0 %	0 %	100 %	409249437
76	NT_187086	A	6	6	3306	3311	100 %	0 %	0 %	0 %	409249437
77	NT_187086	T	7	7	3320	3326	0 %	100 %	0 %	0 %	409249437
78	NT_187086	GCCG	2	8	3379	3386	0 %	0 %	50 %	50 %	409249437
79	NT_187086	ACG	2	6	3389	3394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249437
80	NT_187086	GGA	2	6	3397	3402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249437
81	NT_187086	CAG	2	6	3409	3414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249437
82	NT_187086	GGA	2	6	3451	3456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249437
83	NT_187086	CATT	2	8	3460	3467	25 %	50 %	0 %	25 %	409249437
84	NT_187086	ACT	2	6	3486	3491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249437
85	NT_187086	TAT	2	6	3522	3527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249437
86	NT_187086	TGC	2	6	3661	3666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249437
87	NT_187086	GGA	2	6	3676	3681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249437
88	NT_187086	ATA	2	6	3705	3710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249437
89	NT_187086	AAT	2	6	3712	3717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249437
90	NT_187086	ATGA	2	8	3767	3774	50 %	25 %	25 %	0 %	409249437
91	NT_187086	ATA	2	6	3786	3791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249437
92	NT_187086	CAA	2	6	3840	3845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249437
93	NT_187086	AAG	2	6	3870	3875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249437
94	NT_187086	CAG	2	6	3957	3962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249437
95	NT_187086	CAA	2	6	3990	3995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249437
96	NT_187086	TTAT	2	8	4005	4012	25 %	75 %	0 %	0 %	409249437
97	NT_187086	AGC	2	6	4039	4044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249437
98	NT_187086	ATG	2	6	4053	4058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249437
99	NT_187086	AGAATC	2	12	4075	4086	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	409249437
100	NT_187086	GGA	2	6	4181	4186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187086	GAT	2	6	4214	4219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187086	CTG	2	6	4423	4428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NT_187086	ACA	3	9	4449	4457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249438
104	NT_187086	TTC	2	6	4508	4513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249438
105	NT_187086	GCG	2	6	4527	4532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249438
106	NT_187086	GCG	2	6	4538	4543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249438
107	NT_187086	ATC	2	6	4544	4549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249438
108	NT_187086	CTG	2	6	4556	4561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249438
109	NT_187086	ACG	2	6	4578	4583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249438
110	NT_187086	CTG	2	6	4655	4660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249438
111	NT_187086	AAT	2	6	4683	4688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249438
112	NT_187086	GGT	2	6	4736	4741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NT_187086	TGA	2	6	4747	4752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NT_187086	CAT	2	6	4846	4851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249439
115	NT_187086	CGA	2	6	4958	4963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249439
116	NT_187086	TCA	2	6	5024	5029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249439
117	NT_187086	TGAA	2	8	5090	5097	50 %	25 %	25 %	0 %	409249439
118	NT_187086	T	6	6	5107	5112	0 %	100 %	0 %	0 %	409249439
119	NT_187086	CCTT	2	8	5117	5124	0 %	50 %	0 %	50 %	409249439
120	NT_187086	TGC	2	6	5168	5173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249439
121	NT_187086	CTG	2	6	5192	5197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249439
122	NT_187086	TAA	2	6	5223	5228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249439
123	NT_187086	CCA	2	6	5242	5247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249439
124	NT_187086	TCG	2	6	5291	5296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249439
125	NT_187086	TCG	2	6	5384	5389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249439
126	NT_187086	TTC	2	6	5407	5412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249439
127	NT_187086	CA	3	6	5439	5444	50 %	0 %	0 %	50 %	409249439
128	NT_187086	GTC	2	6	5458	5463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NT_187086	GC	3	6	5496	5501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NT_187086	TGA	2	6	5558	5563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NT_187086	TGA	2	6	5590	5595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NT_187086	A	8	8	5677	5684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NT_187086	C	6	6	5748	5753	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
134	NT_187086	AAT	2	6	5771	5776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NT_187086	AGG	3	9	5824	5832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249440
136	NT_187086	T	6	6	5993	5998	0 %	100 %	0 %	0 %	409249440

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.