MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 144

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187085	GT	3	6	97	102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187085	CGAT	2	8	217	224	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NT_187085	T	6	6	303	308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187085	CGG	2	6	371	376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NT_187085	AGC	2	6	379	384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NT_187085	T	6	6	435	440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187085	TCACCT	2	12	469	480	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NT_187085	ACA	2	6	523	528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NT_187085	GGGCTG	2	12	539	550	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NT_187085	GGC	2	6	660	665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NT_187085	GAT	2	6	670	675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187085	ATA	2	6	729	734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187085	CGG	2	6	765	770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NT_187085	GC	4	8	877	884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NT_187085	TAC	2	6	945	950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NT_187085	T	6	6	977	982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187085	T	6	6	1032	1037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NT_187085	GGT	2	6	1050	1055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187085	GCC	2	6	1084	1089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NT_187085	GC	3	6	1180	1185	0 %	0 %	50 %	50 %	409249424
21	NT_187085	T	6	6	1206	1211	0 %	100 %	0 %	0 %	409249424
22	NT_187085	CTT	2	6	1213	1218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249424
23	NT_187085	CA	3	6	1240	1245	50 %	0 %	0 %	50 %	409249424
24	NT_187085	GGT	2	6	1246	1251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249424
25	NT_187085	CAG	2	6	1296	1301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249425
26	NT_187085	GGC	2	6	1310	1315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249425
27	NT_187085	CTG	2	6	1350	1355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NT_187085	ATCA	2	8	1377	1384	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NT_187085	TTG	2	6	1447	1452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187085	T	6	6	1582	1587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187085	GTT	2	6	1612	1617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187085	CAG	2	6	1621	1626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NT_187085	GGA	2	6	1638	1643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NT_187085	GGA	2	6	1656	1661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187085	TTGA	2	8	1690	1697	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187085	TCT	2	6	1715	1720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NT_187085	TCA	2	6	1724	1729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NT_187085	GAA	2	6	1786	1791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187085	CCG	2	6	1815	1820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NT_187085	TG	3	6	1882	1887	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187085	GATT	2	8	2036	2043	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187085	TTG	2	6	2045	2050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NT_187085	AAAATC	2	12	2124	2135	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	409249426
44	NT_187085	TCC	2	6	2222	2227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249426
45	NT_187085	CTC	2	6	2272	2277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249426
46	NT_187085	CAG	2	6	2290	2295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249426
47	NT_187085	ACCCAA	2	12	2299	2310	50 %	0 %	0 %	50 %	409249426
48	NT_187085	CCAAG	2	10	2322	2331	40 %	0 %	20 %	40 %	409249426
49	NT_187085	CCA	2	6	2398	2403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NT_187085	AG	3	6	2424	2429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187085	CAG	2	6	2505	2510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NT_187085	CAG	2	6	2615	2620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NT_187085	GCA	2	6	2694	2699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NT_187085	GGTA	2	8	2756	2763	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187085	A	6	6	2971	2976	100 %	0 %	0 %	0 %	409249427
56	NT_187085	ACA	2	6	3013	3018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249427
57	NT_187085	CAT	2	6	3069	3074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249427
58	NT_187085	TGA	3	9	3180	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249427
59	NT_187085	ATT	2	6	3202	3207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249427
60	NT_187085	ATT	2	6	3388	3393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249427
61	NT_187085	TGC	2	6	3489	3494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249427
62	NT_187085	TCA	2	6	3620	3625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249427
63	NT_187085	CCAG	2	8	3813	3820	25 %	0 %	25 %	50 %	409249428
64	NT_187085	CTG	2	6	3841	3846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249428
65	NT_187085	GGT	2	6	4083	4088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249428
66	NT_187085	GCG	2	6	4113	4118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249428
67	NT_187085	ATC	2	6	4129	4134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249428
68	NT_187085	CGG	2	6	4142	4147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249428
69	NT_187085	TGG	2	6	4159	4164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249428
70	NT_187085	CCTGA	2	10	4173	4182	20 %	20 %	20 %	40 %	409249428
71	NT_187085	ACG	2	6	4204	4209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249428
72	NT_187085	TGA	2	6	4235	4240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249428
73	NT_187085	CTG	2	6	4257	4262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249428
74	NT_187085	GTG	2	6	4297	4302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249428
75	NT_187085	ATCG	2	8	4326	4333	25 %	25 %	25 %	25 %	409249428
76	NT_187085	TC	3	6	4337	4342	0 %	50 %	0 %	50 %	409249428
77	NT_187085	ATCG	2	8	4416	4423	25 %	25 %	25 %	25 %	409249428
78	NT_187085	GAT	2	6	4548	4553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249429
79	NT_187085	ACG	2	6	4600	4605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249429
80	NT_187085	ACG	2	6	4607	4612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249429
81	NT_187085	CGG	2	6	4643	4648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249429
82	NT_187085	GGC	2	6	4678	4683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249429
83	NT_187085	TGAT	2	8	4730	4737	25 %	50 %	25 %	0 %	409249429
84	NT_187085	CAG	2	6	4755	4760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249429
85	NT_187085	CAA	2	6	4845	4850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249429
86	NT_187085	G	6	6	4851	4856	0 %	0 %	100 %	0 %	409249429
87	NT_187085	TCA	2	6	4935	4940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249430
88	NT_187085	GAA	2	6	4983	4988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249430
89	NT_187085	GCC	2	6	5034	5039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249430
90	NT_187085	GCT	2	6	5063	5068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249430
91	NT_187085	GCA	2	6	5151	5156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249430
92	NT_187085	CAG	2	6	5160	5165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249430
93	NT_187085	CAG	2	6	5191	5196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NT_187085	AAAGCA	2	12	5197	5208	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NT_187085	TTA	2	6	5209	5214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NT_187085	TGT	2	6	5236	5241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187085	ATT	2	6	5244	5249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187085	TGA	2	6	5250	5255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187085	GAA	2	6	5294	5299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187085	TAA	2	6	5356	5361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187085	T	6	6	5418	5423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187085	A	6	6	5450	5455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NT_187085	TGA	2	6	5485	5490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187085	GCA	2	6	5563	5568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NT_187085	AT	3	6	5605	5610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187085	AAG	2	6	5633	5638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187085	TGAA	2	8	5650	5657	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187085	CCG	2	6	5665	5670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NT_187085	GCG	2	6	5701	5706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NT_187085	T	6	6	5709	5714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NT_187085	ACA	2	6	5734	5739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NT_187085	TTCT	2	8	5779	5786	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NT_187085	TA	3	6	5804	5809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NT_187085	AATT	2	8	5904	5911	50 %	50 %	0 %	0 %	409249431
115	NT_187085	TCG	2	6	5982	5987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249431
116	NT_187085	TGC	2	6	5989	5994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249431
117	NT_187085	A	6	6	6005	6010	100 %	0 %	0 %	0 %	409249431
118	NT_187085	GAC	2	6	6050	6055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249431
119	NT_187085	TTA	2	6	6061	6066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249431
120	NT_187085	GC	3	6	6085	6090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NT_187085	TGC	3	9	6127	6135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NT_187085	GT	3	6	6157	6162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NT_187085	G	6	6	6169	6174	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
124	NT_187085	GAT	2	6	6335	6340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NT_187085	AG	3	6	6377	6382	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NT_187085	TAA	2	6	6391	6396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NT_187085	AAC	2	6	6442	6447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NT_187085	TCA	2	6	6502	6507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249432
129	NT_187085	TGG	2	6	6589	6594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249432
130	NT_187085	CGC	2	6	6630	6635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249432
131	NT_187085	CGG	2	6	6680	6685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249432
132	NT_187085	CCG	2	6	6806	6811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249432
133	NT_187085	GCA	2	6	6931	6936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249432
134	NT_187085	CAG	2	6	6969	6974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249432
135	NT_187085	CGC	3	9	7052	7060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249432
136	NT_187085	CAT	2	6	7109	7114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NT_187085	CAAA	2	8	7322	7329	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NT_187085	GCC	2	6	7334	7339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NT_187085	GC	3	6	7461	7466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NT_187085	A	6	6	7474	7479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NT_187085	CGC	2	6	7485	7490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NT_187085	TTGAC	2	10	7535	7544	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NT_187085	GC	3	6	7548	7553	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NT_187085	GCATG	2	10	7630	7639	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.