MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 277

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187082	G	7	7	16	22	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2	NT_187082	GC	3	6	63	68	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NT_187082	C	6	6	123	128	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4	NT_187082	A	8	8	148	155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187082	G	7	7	198	204	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187082	AC	3	6	232	237	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NT_187082	TGC	2	6	286	291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NT_187082	G	6	6	302	307	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187082	CTA	2	6	318	323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NT_187082	GTT	2	6	449	454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249358
11	NT_187082	CAC	2	6	458	463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249358
12	NT_187082	CAG	2	6	491	496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249358
13	NT_187082	CGG	2	6	538	543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249358
14	NT_187082	ACG	2	6	603	608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249358
15	NT_187082	GC	3	6	833	838	0 %	0 %	50 %	50 %	409249358
16	NT_187082	CGC	2	6	959	964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249358
17	NT_187082	TGA	2	6	1023	1028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249358
18	NT_187082	TTCA	2	8	1218	1225	25 %	50 %	0 %	25 %	409249359
19	NT_187082	GCT	2	6	1260	1265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249359
20	NT_187082	ACC	2	6	1303	1308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249359
21	NT_187082	CGT	2	6	1329	1334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249359
22	NT_187082	ACC	2	6	1363	1368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249359
23	NT_187082	GCG	2	6	1445	1450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249359
24	NT_187082	GGT	2	6	1572	1577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249359
25	NT_187082	CGC	2	6	1628	1633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249359
26	NT_187082	GCCTGC	2	12	1677	1688	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409249359
27	NT_187082	CGC	3	9	1721	1729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249359
28	NT_187082	CGC	2	6	1811	1816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249359
29	NT_187082	TG	3	6	1839	1844	0 %	50 %	50 %	0 %	409249359
30	NT_187082	CAG	3	9	1860	1868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249359
31	NT_187082	CTG	2	6	1881	1886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249359
32	NT_187082	GAAC	2	8	1912	1919	50 %	0 %	25 %	25 %	409249359
33	NT_187082	GGGT	2	8	2144	2151	0 %	25 %	75 %	0 %	409249360
34	NT_187082	CGG	2	6	2158	2163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249360
35	NT_187082	TGA	2	6	2174	2179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249360
36	NT_187082	GGA	2	6	2216	2221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249360
37	NT_187082	GATT	2	8	2236	2243	25 %	50 %	25 %	0 %	409249360
38	NT_187082	ACC	2	6	2250	2255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249360
39	NT_187082	TGG	2	6	2314	2319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249360
40	NT_187082	GGC	2	6	2327	2332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249360
41	NT_187082	GCT	2	6	2399	2404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249360
42	NT_187082	TCG	2	6	2483	2488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249360
43	NT_187082	CGT	2	6	2495	2500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249360
44	NT_187082	AGGGG	2	10	2501	2510	20 %	0 %	80 %	0 %	409249360
45	NT_187082	GC	3	6	2725	2730	0 %	0 %	50 %	50 %	409249360
46	NT_187082	TAC	2	6	2762	2767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249360
47	NT_187082	GGC	2	6	2789	2794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249360
48	NT_187082	GGCG	2	8	2798	2805	0 %	0 %	75 %	25 %	409249360
49	NT_187082	AAC	2	6	2842	2847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249360
50	NT_187082	GCC	2	6	2850	2855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249360
51	NT_187082	CGG	2	6	2892	2897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249360
52	NT_187082	ATT	2	6	2933	2938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249360
53	NT_187082	CG	3	6	2949	2954	0 %	0 %	50 %	50 %	409249360
54	NT_187082	T	6	6	2963	2968	0 %	100 %	0 %	0 %	409249360
55	NT_187082	AGA	2	6	2972	2977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249360
56	NT_187082	TGG	2	6	2989	2994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249360
57	NT_187082	TCAT	2	8	3011	3018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NT_187082	A	6	6	3034	3039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187082	GCC	2	6	3066	3071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NT_187082	GAG	2	6	3083	3088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187082	TG	3	6	3206	3211	0 %	50 %	50 %	0 %	409249361
62	NT_187082	TCT	2	6	3298	3303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249361
63	NT_187082	CTT	2	6	3365	3370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NT_187082	AC	3	6	3433	3438	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NT_187082	CGC	2	6	3444	3449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NT_187082	TAC	2	6	3470	3475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NT_187082	GCA	2	6	3581	3586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NT_187082	A	6	6	3603	3608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187082	AAT	2	6	3639	3644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249362
70	NT_187082	ACG	2	6	3713	3718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249362
71	NT_187082	CGAG	2	8	3736	3743	25 %	0 %	50 %	25 %	409249362
72	NT_187082	CAAT	2	8	3768	3775	50 %	25 %	0 %	25 %	409249362
73	NT_187082	CCG	2	6	3783	3788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249362
74	NT_187082	A	6	6	3808	3813	100 %	0 %	0 %	0 %	409249362
75	NT_187082	CAG	2	6	3815	3820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249362
76	NT_187082	GGC	2	6	3844	3849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249362
77	NT_187082	CGC	2	6	3862	3867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249362
78	NT_187082	CCG	2	6	3900	3905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249362
79	NT_187082	CATC	2	8	4023	4030	25 %	25 %	0 %	50 %	409249362
80	NT_187082	TGC	2	6	4096	4101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249362
81	NT_187082	GC	3	6	4134	4139	0 %	0 %	50 %	50 %	409249362
82	NT_187082	ACC	2	6	4150	4155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249362
83	NT_187082	AAC	2	6	4212	4217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249362
84	NT_187082	CGC	2	6	4234	4239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249362
85	NT_187082	GAAGG	2	10	4284	4293	40 %	0 %	60 %	0 %	409249362
86	NT_187082	AAT	2	6	4363	4368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187082	GTT	2	6	4380	4385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249363
88	NT_187082	ATA	2	6	4393	4398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249363
89	NT_187082	ATG	2	6	4442	4447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249363
90	NT_187082	CGT	2	6	4452	4457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249363
91	NT_187082	GAT	2	6	4465	4470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249363
92	NT_187082	GGT	2	6	4567	4572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249363
93	NT_187082	CAT	2	6	4617	4622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249363
94	NT_187082	GC	3	6	4629	4634	0 %	0 %	50 %	50 %	409249363
95	NT_187082	GAC	2	6	4647	4652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249363
96	NT_187082	CGC	2	6	4659	4664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249363
97	NT_187082	CGACG	2	10	4734	4743	20 %	0 %	40 %	40 %	409249363
98	NT_187082	TCG	2	6	4763	4768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249363
99	NT_187082	GCC	2	6	4781	4786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249363
100	NT_187082	TAA	2	6	4789	4794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249363
101	NT_187082	CAC	2	6	4837	4842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249363
102	NT_187082	TTG	2	6	4912	4917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249363
103	NT_187082	AACGA	2	10	5052	5061	60 %	0 %	20 %	20 %	409249363
104	NT_187082	CTGC	2	8	5106	5113	0 %	25 %	25 %	50 %	409249363
105	NT_187082	GCC	2	6	5225	5230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249363
106	NT_187082	GC	3	6	5232	5237	0 %	0 %	50 %	50 %	409249363
107	NT_187082	AGA	2	6	5238	5243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249363
108	NT_187082	GC	3	6	5259	5264	0 %	0 %	50 %	50 %	409249363
109	NT_187082	GCC	2	6	5278	5283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249363
110	NT_187082	CGC	2	6	5286	5291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249363
111	NT_187082	GC	3	6	5325	5330	0 %	0 %	50 %	50 %	409249363
112	NT_187082	CAG	2	6	5335	5340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249363
113	NT_187082	GCT	2	6	5487	5492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249363
114	NT_187082	CGG	2	6	5557	5562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249363
115	NT_187082	ATA	2	6	5564	5569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249363
116	NT_187082	GCC	2	6	5590	5595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249363
117	NT_187082	CAG	2	6	5734	5739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249363
118	NT_187082	GCA	2	6	5817	5822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249363
119	NT_187082	CGG	2	6	5868	5873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249363
120	NT_187082	GCCGC	2	10	5885	5894	0 %	0 %	40 %	60 %	409249363
121	NT_187082	GCCG	2	8	5899	5906	0 %	0 %	50 %	50 %	409249363
122	NT_187082	GCGGAC	2	12	5954	5965	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	409249363
123	NT_187082	CAG	2	6	5986	5991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249363
124	NT_187082	GC	4	8	6084	6091	0 %	0 %	50 %	50 %	409249363
125	NT_187082	TCC	2	6	6101	6106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249364
126	NT_187082	GGC	2	6	6142	6147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249364
127	NT_187082	CGC	2	6	6268	6273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249364
128	NT_187082	GCC	2	6	6320	6325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249364
129	NT_187082	CAG	2	6	6334	6339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249364
130	NT_187082	CTG	2	6	6407	6412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249364
131	NT_187082	GCA	2	6	6447	6452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249364
132	NT_187082	GCG	2	6	6476	6481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249364
133	NT_187082	GC	3	6	6520	6525	0 %	0 %	50 %	50 %	409249364
134	NT_187082	CGC	2	6	6550	6555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249364
135	NT_187082	GA	3	6	6584	6589	50 %	0 %	50 %	0 %	409249364
136	NT_187082	GA	3	6	6611	6616	50 %	0 %	50 %	0 %	409249364
137	NT_187082	GA	3	6	6659	6664	50 %	0 %	50 %	0 %	409249364
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263	NT_187082	GCA	2	6	11799	11804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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265	NT_187082	CGG	2	6	11843	11848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
266	NT_187082	CGC	2	6	11851	11856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
267	NT_187082	CCGAC	2	10	11916	11925	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
268	NT_187082	AGA	2	6	11972	11977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
269	NT_187082	GC	3	6	12016	12021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
270	NT_187082	GAA	2	6	12033	12038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
271	NT_187082	ATGCA	2	10	12043	12052	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
272	NT_187082	GCA	3	9	12086	12094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
273	NT_187082	AGA	2	6	12134	12139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
274	NT_187082	CAG	2	6	12192	12197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
275	NT_187082	GC	3	6	12223	12228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
276	NT_187082	TGA	2	6	12278	12283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
277	NT_187082	CAG	2	6	12375	12380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.