MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 3340

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NT_187081	TCA	2	6	141658	141663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249344
3002	NT_187081	T	6	6	141722	141727	0 %	100 %	0 %	0 %	409249344
3003	NT_187081	CCA	2	6	141731	141736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249344
3004	NT_187081	GCA	2	6	141740	141745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249344
3005	NT_187081	CCA	2	6	141773	141778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249344
3006	NT_187081	GC	3	6	141800	141805	0 %	0 %	50 %	50 %	409249344
3007	NT_187081	TCA	2	6	141908	141913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249344
3008	NT_187081	AGA	2	6	141927	141932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249344
3009	NT_187081	CAT	2	6	141959	141964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249344
3010	NT_187081	GCC	2	6	142030	142035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249344
3011	NT_187081	CTC	2	6	142047	142052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249344
3012	NT_187081	GC	3	6	142055	142060	0 %	0 %	50 %	50 %	409249344
3013	NT_187081	GCA	2	6	142106	142111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249344
3014	NT_187081	T	6	6	142122	142127	0 %	100 %	0 %	0 %	409249344
3015	NT_187081	TCC	2	6	142135	142140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249344
3016	NT_187081	GAC	2	6	142149	142154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249344
3017	NT_187081	CGC	2	6	142241	142246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249344
3018	NT_187081	AAC	2	6	142339	142344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249344
3019	NT_187081	GGGT	2	8	142351	142358	0 %	25 %	75 %	0 %	409249344
3020	NT_187081	GCG	2	6	142402	142407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249344
3021	NT_187081	CGG	2	6	142529	142534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249344
3022	NT_187081	GCG	2	6	142540	142545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249344
3023	NT_187081	AGC	2	6	142680	142685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249344
3024	NT_187081	GTTT	2	8	142690	142697	0 %	75 %	25 %	0 %	409249344
3025	NT_187081	GATGAC	2	12	142748	142759	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3026	NT_187081	AG	3	6	142775	142780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3027	NT_187081	AGCG	2	8	142795	142802	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3028	NT_187081	ATG	2	6	142839	142844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3029	NT_187081	CAG	2	6	142985	142990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249345
3030	NT_187081	TTA	2	6	143030	143035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249345
3031	NT_187081	CGT	2	6	143056	143061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249345
3032	NT_187081	GCTG	2	8	143087	143094	0 %	25 %	50 %	25 %	409249345
3033	NT_187081	GAA	2	6	143143	143148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249345
3034	NT_187081	AAG	2	6	143159	143164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249345
3035	NT_187081	CGA	2	6	143196	143201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249345
3036	NT_187081	ATG	2	6	143231	143236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249345
3037	NT_187081	TCG	2	6	143351	143356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249345
3038	NT_187081	CAT	2	6	143367	143372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249345
3039	NT_187081	GCGG	2	8	143412	143419	0 %	0 %	75 %	25 %	409249345
3040	NT_187081	GCCA	2	8	143426	143433	25 %	0 %	25 %	50 %	409249345
3041	NT_187081	CGG	2	6	143469	143474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249345
3042	NT_187081	AGC	2	6	143477	143482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249345
3043	NT_187081	TCT	2	6	143492	143497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249345
3044	NT_187081	CGC	2	6	143550	143555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249345
3045	NT_187081	CGA	2	6	143603	143608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249345
3046	NT_187081	AT	3	6	143621	143626	50 %	50 %	0 %	0 %	409249345
3047	NT_187081	GC	3	6	143660	143665	0 %	0 %	50 %	50 %	409249345
3048	NT_187081	ACGC	2	8	143683	143690	25 %	0 %	25 %	50 %	409249345
3049	NT_187081	GTA	2	6	143722	143727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249345
3050	NT_187081	ATA	2	6	143736	143741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249345
3051	NT_187081	TCA	2	6	143823	143828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249345
3052	NT_187081	CCT	2	6	143833	143838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3053	NT_187081	TCT	2	6	143863	143868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249346
3054	NT_187081	GGT	2	6	143874	143879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249346
3055	NT_187081	CAG	2	6	143916	143921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249346
3056	NT_187081	GAA	2	6	143931	143936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249346
3057	NT_187081	CAG	2	6	143982	143987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249346
3058	NT_187081	CAG	2	6	143991	143996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249346
3059	NT_187081	CGC	2	6	144056	144061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249346
3060	NT_187081	TTG	2	6	144172	144177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249346
3061	NT_187081	TGG	2	6	144230	144235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249346
3062	NT_187081	AGT	2	6	144248	144253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249346
3063	NT_187081	CGC	2	6	144260	144265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249346
3064	NT_187081	GC	4	8	144264	144271	0 %	0 %	50 %	50 %	409249346
3065	NT_187081	GCC	2	6	144279	144284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249346
3066	NT_187081	TGA	2	6	144377	144382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249346
3067	NT_187081	TGC	2	6	144418	144423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249346
3068	NT_187081	CGA	2	6	144482	144487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249346
3069	NT_187081	GTC	2	6	144507	144512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249346
3070	NT_187081	GGTCG	2	10	144525	144534	0 %	20 %	60 %	20 %	409249346
3071	NT_187081	TCA	2	6	144551	144556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249346
3072	NT_187081	CTG	2	6	144588	144593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249346
3073	NT_187081	GCA	2	6	144665	144670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249346
3074	NT_187081	CAG	2	6	144717	144722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249346
3075	NT_187081	TGG	2	6	144818	144823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249346
3076	NT_187081	TCA	2	6	144845	144850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249346
3077	NT_187081	CAG	2	6	144888	144893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249346
3078	NT_187081	CAG	2	6	144905	144910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249346
3079	NT_187081	CCAG	2	8	144920	144927	25 %	0 %	25 %	50 %	409249346
3080	NT_187081	TGTCGT	2	12	144956	144967	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	409249346
3081	NT_187081	CGC	3	9	144999	145007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249346
3082	NT_187081	CAG	2	6	145029	145034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249346
3083	NT_187081	GGC	2	6	145062	145067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249346
3084	NT_187081	CCG	2	6	145091	145096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249346
3085	NT_187081	TCG	2	6	145120	145125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249346
3086	NT_187081	CGA	2	6	145235	145240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249346
3087	NT_187081	CG	4	8	145284	145291	0 %	0 %	50 %	50 %	409249346
3088	NT_187081	CGT	2	6	145307	145312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249346
3089	NT_187081	ATG	2	6	145318	145323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249346
3090	NT_187081	CAG	2	6	145377	145382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249346
3091	NT_187081	AGC	2	6	145436	145441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249346
3092	NT_187081	CA	3	6	145479	145484	50 %	0 %	0 %	50 %	409249346
3093	NT_187081	GATT	2	8	145585	145592	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3094	NT_187081	GGC	2	6	145605	145610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NT_187081	ACC	2	6	145619	145624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3096	NT_187081	GAA	2	6	145643	145648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249347
3097	NT_187081	CAG	2	6	145667	145672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249347
3098	NT_187081	GCC	2	6	145698	145703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249347
3099	NT_187081	CGC	2	6	145717	145722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249347
3100	NT_187081	GCG	2	6	145796	145801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249347
3101	NT_187081	A	6	6	145853	145858	100 %	0 %	0 %	0 %	409249347
3102	NT_187081	AG	3	6	145911	145916	50 %	0 %	50 %	0 %	409249347
3103	NT_187081	CGC	2	6	145987	145992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249347
3104	NT_187081	CAT	2	6	146027	146032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249347
3105	NT_187081	CGG	2	6	146037	146042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249347
3106	NT_187081	CCA	2	6	146092	146097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249347
3107	NT_187081	AG	3	6	146153	146158	50 %	0 %	50 %	0 %	409249347
3108	NT_187081	CGC	2	6	146194	146199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249347
3109	NT_187081	CTG	2	6	146249	146254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249347
3110	NT_187081	ATG	2	6	146255	146260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249347
3111	NT_187081	GGA	2	6	146272	146277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249347
3112	NT_187081	GGC	2	6	146297	146302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249347
3113	NT_187081	AATAA	2	10	146313	146322	80 %	20 %	0 %	0 %	409249347
3114	NT_187081	CGG	2	6	146335	146340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249347
3115	NT_187081	AAT	2	6	146341	146346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249347
3116	NT_187081	CCA	2	6	146356	146361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249347
3117	NT_187081	A	6	6	146405	146410	100 %	0 %	0 %	0 %	409249347
3118	NT_187081	T	6	6	146548	146553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NT_187081	G	7	7	146650	146656	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3120	NT_187081	TGA	2	6	146711	146716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3320	NT_187081	AT	3	6	156205	156210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3321	NT_187081	TTGG	2	8	156217	156224	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3322	NT_187081	ATA	2	6	156297	156302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3323	NT_187081	ATT	2	6	156330	156335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3332	NT_187081	TAC	2	6	156772	156777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3333	NT_187081	GA	3	6	156779	156784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3334	NT_187081	TAGG	2	8	156813	156820	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3335	NT_187081	TCA	2	6	156891	156896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3338	NT_187081	CTT	2	6	156953	156958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3339	NT_187081	GCA	2	6	156962	156967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3340	NT_187081	GATT	2	8	157004	157011	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.