MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 290

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187080	CCA	2	6	23	28	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NT_187080	A	6	6	33	38	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187080	T	6	6	54	59	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187080	GGCGA	2	10	149	158	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NT_187080	CCA	2	6	180	185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NT_187080	GGC	2	6	203	208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NT_187080	TGCGC	2	10	270	279	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NT_187080	CGC	2	6	329	334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NT_187080	ATT	2	6	355	360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187080	TTA	2	6	426	431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NT_187080	T	6	6	445	450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187080	CCG	2	6	521	526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249196
13	NT_187080	ACG	3	9	543	551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249196
14	NT_187080	TGG	2	6	609	614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249196
15	NT_187080	ACT	2	6	618	623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249196
16	NT_187080	AGA	2	6	652	657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249196
17	NT_187080	CGG	2	6	661	666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249196
18	NT_187080	CGC	2	6	712	717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249196
19	NT_187080	GGC	2	6	805	810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249196
20	NT_187080	GCT	2	6	908	913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249196
21	NT_187080	A	6	6	990	995	100 %	0 %	0 %	0 %	409249196
22	NT_187080	GACA	2	8	1010	1017	50 %	0 %	25 %	25 %	409249196
23	NT_187080	A	8	8	1120	1127	100 %	0 %	0 %	0 %	409249196
24	NT_187080	CGC	2	6	1164	1169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249196
25	NT_187080	CCA	2	6	1203	1208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249196
26	NT_187080	TTA	2	6	1215	1220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249196
27	NT_187080	GGC	2	6	1222	1227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249196
28	NT_187080	TCT	2	6	1275	1280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249196
29	NT_187080	GCA	2	6	1288	1293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249196
30	NT_187080	GCT	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249196
31	NT_187080	GC	3	6	1359	1364	0 %	0 %	50 %	50 %	409249196
32	NT_187080	GGCGC	2	10	1424	1433	0 %	0 %	60 %	40 %	409249196
33	NT_187080	GCG	2	6	1451	1456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249196
34	NT_187080	G	6	6	1537	1542	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35	NT_187080	T	7	7	1553	1559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187080	TC	3	6	1610	1615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NT_187080	ACT	2	6	1687	1692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NT_187080	T	6	6	1692	1697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187080	ATT	2	6	1725	1730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NT_187080	TGC	2	6	1762	1767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NT_187080	GCC	2	6	1782	1787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NT_187080	CAAA	2	8	1818	1825	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NT_187080	GCTG	2	8	1852	1859	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NT_187080	ATGGC	2	10	1875	1884	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NT_187080	TG	3	6	1893	1898	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187080	TGA	2	6	1912	1917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187080	AT	3	6	1922	1927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187080	CG	3	6	1951	1956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NT_187080	ATG	2	6	2043	2048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187080	GAT	2	6	2066	2071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187080	TGA	2	6	2074	2079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NT_187080	GTG	2	6	2133	2138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NT_187080	TTTGC	2	10	2142	2151	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NT_187080	GC	3	6	2230	2235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NT_187080	CG	4	8	2248	2255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NT_187080	TGA	2	6	2271	2276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249197
57	NT_187080	AC	3	6	2321	2326	50 %	0 %	0 %	50 %	409249197
58	NT_187080	CAG	2	6	2396	2401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249197
59	NT_187080	CAT	2	6	2404	2409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249197
60	NT_187080	GC	3	6	2554	2559	0 %	0 %	50 %	50 %	409249197
61	NT_187080	AG	3	6	2633	2638	50 %	0 %	50 %	0 %	409249197
62	NT_187080	GC	3	6	2739	2744	0 %	0 %	50 %	50 %	409249197
63	NT_187080	T	7	7	2754	2760	0 %	100 %	0 %	0 %	409249197
64	NT_187080	CAG	2	6	2804	2809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249197
65	NT_187080	CAT	2	6	2828	2833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249197
66	NT_187080	ACC	2	6	2904	2909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249197
67	NT_187080	GCC	2	6	2931	2936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249197
68	NT_187080	GTG	2	6	2940	2945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249197
69	NT_187080	AGCC	2	8	2952	2959	25 %	0 %	25 %	50 %	409249197
70	NT_187080	GAC	2	6	2983	2988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249197
71	NT_187080	CAG	2	6	3005	3010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249197
72	NT_187080	GCC	2	6	3024	3029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249197
73	NT_187080	CAA	2	6	3059	3064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249197
74	NT_187080	AG	3	6	3069	3074	50 %	0 %	50 %	0 %	409249197
75	NT_187080	CAC	2	6	3092	3097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249197
76	NT_187080	CGA	2	6	3144	3149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249197
77	NT_187080	ATT	2	6	3152	3157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249197
78	NT_187080	TCA	2	6	3224	3229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NT_187080	CAT	2	6	3240	3245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NT_187080	T	6	6	3302	3307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187080	TG	3	6	3317	3322	0 %	50 %	50 %	0 %	409249198
82	NT_187080	ATT	2	6	3349	3354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249198
83	NT_187080	T	6	6	3376	3381	0 %	100 %	0 %	0 %	409249198
84	NT_187080	TGC	2	6	3476	3481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249198
85	NT_187080	GTT	2	6	3517	3522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249198
86	NT_187080	CAT	2	6	3528	3533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249198
87	NT_187080	GGCG	2	8	3549	3556	0 %	0 %	75 %	25 %	409249198
88	NT_187080	GCC	2	6	3581	3586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249198
89	NT_187080	CAG	2	6	3624	3629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249198
90	NT_187080	TGG	2	6	3715	3720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187080	GTCA	2	8	3754	3761	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NT_187080	CGC	3	9	3790	3798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NT_187080	GCA	2	6	3807	3812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NT_187080	AAT	2	6	3824	3829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187080	T	7	7	3895	3901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NT_187080	ATT	2	6	3915	3920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187080	AGAT	2	8	3963	3970	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187080	CATT	2	8	3982	3989	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NT_187080	ACG	2	6	4032	4037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249199
100	NT_187080	TTA	2	6	4064	4069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249199
101	NT_187080	GCT	2	6	4081	4086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249199
102	NT_187080	GCA	2	6	4112	4117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249199
103	NT_187080	CACG	2	8	4130	4137	25 %	0 %	25 %	50 %	409249199
104	NT_187080	CCAT	2	8	4143	4150	25 %	25 %	0 %	50 %	409249199
105	NT_187080	CTG	2	6	4178	4183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249199
106	NT_187080	GTG	2	6	4184	4189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249199
107	NT_187080	GCG	2	6	4220	4225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249199
108	NT_187080	GCC	2	6	4235	4240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249199
109	NT_187080	ACC	2	6	4316	4321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249199
110	NT_187080	ACG	2	6	4377	4382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249199
111	NT_187080	GC	3	6	4394	4399	0 %	0 %	50 %	50 %	409249199
112	NT_187080	CTG	3	9	4403	4411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249199
113	NT_187080	GCCT	2	8	4428	4435	0 %	25 %	25 %	50 %	409249199
114	NT_187080	GCC	2	6	4436	4441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249199
115	NT_187080	CGC	2	6	4464	4469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249199
116	NT_187080	TGA	2	6	4485	4490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249199
117	NT_187080	GC	3	6	4506	4511	0 %	0 %	50 %	50 %	409249199
118	NT_187080	ACT	2	6	4514	4519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249199
119	NT_187080	CT	3	6	4553	4558	0 %	50 %	0 %	50 %	409249199
120	NT_187080	CGGT	2	8	4563	4570	0 %	25 %	50 %	25 %	409249199
121	NT_187080	CGC	2	6	4621	4626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249199
122	NT_187080	GC	3	6	4629	4634	0 %	0 %	50 %	50 %	409249199
123	NT_187080	GCG	2	6	4719	4724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249199
124	NT_187080	GC	3	6	4743	4748	0 %	0 %	50 %	50 %	409249199
125	NT_187080	AAG	2	6	4767	4772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249199
126	NT_187080	TCA	2	6	4776	4781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249199
127	NT_187080	CGC	2	6	4794	4799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249199
128	NT_187080	TGTC	2	8	4870	4877	0 %	50 %	25 %	25 %	409249199
129	NT_187080	ATT	2	6	4904	4909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249199
130	NT_187080	AG	3	6	4921	4926	50 %	0 %	50 %	0 %	409249199
131	NT_187080	TGG	2	6	4932	4937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249199
132	NT_187080	GCT	2	6	5026	5031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249199
133	NT_187080	AGTTT	2	10	5071	5080	20 %	60 %	20 %	0 %	409249199
134	NT_187080	TAT	2	6	5160	5165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249200
135	NT_187080	TTCC	2	8	5206	5213	0 %	50 %	0 %	50 %	409249200
136	NT_187080	CTT	2	6	5255	5260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249200
137	NT_187080	TTC	2	6	5279	5284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249200
138	NT_187080	CAA	2	6	5290	5295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249200
139	NT_187080	CTC	2	6	5335	5340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249200
140	NT_187080	T	6	6	5369	5374	0 %	100 %	0 %	0 %	409249200
141	NT_187080	TTG	2	6	5432	5437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249200
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274	NT_187080	TGC	3	9	10606	10614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
275	NT_187080	GTG	2	6	10656	10661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
276	NT_187080	CG	3	6	10677	10682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
277	NT_187080	GCC	2	6	10746	10751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
278	NT_187080	CT	3	6	10794	10799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
279	NT_187080	ACC	2	6	10803	10808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
280	NT_187080	CA	3	6	10816	10821	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
281	NT_187080	CTGG	2	8	10832	10839	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
282	NT_187080	GCT	2	6	10853	10858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
283	NT_187080	GGC	2	6	10916	10921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
284	NT_187080	A	6	6	10944	10949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NT_187080	CCTGCA	2	12	10964	10975	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
286	NT_187080	CCA	2	6	10984	10989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
287	NT_187080	GCT	2	6	11009	11014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
288	NT_187080	TCC	2	6	11058	11063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
289	NT_187080	TGG	2	6	11101	11106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
290	NT_187080	CGC	2	6	11165	11170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.