MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 1836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187073	ACT	2	6	71	76	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NT_187073	AG	3	6	81	86	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187073	CCTG	2	8	250	257	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NT_187073	CCGT	2	8	285	292	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NT_187073	TTA	2	6	301	306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187073	ATT	2	6	353	358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187073	GAC	2	6	506	511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248676
8	NT_187073	GCG	2	6	618	623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248676
9	NT_187073	CAC	2	6	646	651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248676
10	NT_187073	AG	3	6	703	708	50 %	0 %	50 %	0 %	409248676
11	NT_187073	A	6	6	713	718	100 %	0 %	0 %	0 %	409248676
12	NT_187073	GAA	2	6	785	790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248676
13	NT_187073	A	6	6	815	820	100 %	0 %	0 %	0 %	409248676
14	NT_187073	CCA	2	6	909	914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248676
15	NT_187073	GGT	2	6	952	957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248676
16	NT_187073	CCA	2	6	1128	1133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248676
17	NT_187073	GCAA	2	8	1148	1155	50 %	0 %	25 %	25 %	409248676
18	NT_187073	CTG	2	6	1157	1162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248676
19	NT_187073	AGC	2	6	1195	1200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248676
20	NT_187073	TA	3	6	1325	1330	50 %	50 %	0 %	0 %	409248677
21	NT_187073	GTA	2	6	1385	1390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248677
22	NT_187073	CAG	2	6	1433	1438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248677
23	NT_187073	CCA	2	6	1441	1446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248677
24	NT_187073	CG	3	6	1455	1460	0 %	0 %	50 %	50 %	409248677
25	NT_187073	ATCA	2	8	1469	1476	50 %	25 %	0 %	25 %	409248677
26	NT_187073	GTT	2	6	1519	1524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248677
27	NT_187073	GAA	2	6	1545	1550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248677
28	NT_187073	CG	4	8	1734	1741	0 %	0 %	50 %	50 %	409248677
29	NT_187073	TGA	2	6	1804	1809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248677
30	NT_187073	GAG	2	6	1818	1823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248677
31	NT_187073	GCA	2	6	1888	1893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248677
32	NT_187073	CG	3	6	1927	1932	0 %	0 %	50 %	50 %	409248677
33	NT_187073	GCG	2	6	1965	1970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248677
34	NT_187073	GTA	2	6	1981	1986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248677
35	NT_187073	CTG	2	6	1988	1993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248677
36	NT_187073	CTT	2	6	2017	2022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248677
37	NT_187073	GCT	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248677
38	NT_187073	GCC	2	6	2133	2138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248677
39	NT_187073	TTC	2	6	2183	2188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248677
40	NT_187073	AAATT	2	10	2220	2229	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187073	CTG	2	6	2288	2293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NT_187073	TATG	2	8	2303	2310	25 %	50 %	25 %	0 %	409248678
43	NT_187073	CAA	2	6	2398	2403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248678
44	NT_187073	CCG	2	6	2423	2428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248678
45	NT_187073	GC	3	6	2468	2473	0 %	0 %	50 %	50 %	409248678
46	NT_187073	CGG	2	6	2543	2548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248678
47	NT_187073	TGGCA	2	10	2558	2567	20 %	20 %	40 %	20 %	409248678
48	NT_187073	TCG	2	6	2591	2596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248678
49	NT_187073	CTG	2	6	2602	2607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248678
50	NT_187073	TTC	2	6	2629	2634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248678
51	NT_187073	TAT	2	6	2697	2702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248678
52	NT_187073	TGG	2	6	2706	2711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248678
53	NT_187073	TGGC	2	8	2769	2776	0 %	25 %	50 %	25 %	409248678
54	NT_187073	CCTT	2	8	2783	2790	0 %	50 %	0 %	50 %	409248678
55	NT_187073	TGA	2	6	2819	2824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248678
56	NT_187073	CTG	2	6	2833	2838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248678
57	NT_187073	GCC	2	6	2866	2871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248678
58	NT_187073	CGG	2	6	2946	2951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248678
59	NT_187073	GAT	2	6	2982	2987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248678
60	NT_187073	GCA	2	6	3013	3018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248678
61	NT_187073	GTGCC	2	10	3098	3107	0 %	20 %	40 %	40 %	409248678
62	NT_187073	CGC	2	6	3126	3131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248678
63	NT_187073	TGTT	2	8	3134	3141	0 %	75 %	25 %	0 %	409248678
64	NT_187073	CTG	2	6	3142	3147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248678
65	NT_187073	GCG	2	6	3313	3318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248678
66	NT_187073	CGG	2	6	3351	3356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248678
67	NT_187073	TGG	2	6	3416	3421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248678
68	NT_187073	CTG	2	6	3427	3432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248678
69	NT_187073	ATT	2	6	3484	3489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187073	ACAAA	2	10	3507	3516	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NT_187073	AGTG	2	8	3535	3542	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187073	AGA	2	6	3559	3564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187073	A	6	6	3620	3625	100 %	0 %	0 %	0 %	409248679
74	NT_187073	ATGCG	2	10	3631	3640	20 %	20 %	40 %	20 %	409248679
75	NT_187073	CCG	2	6	3658	3663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248679
76	NT_187073	GCC	2	6	3674	3679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248679
77	NT_187073	CCG	2	6	3712	3717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248679
78	NT_187073	AT	3	6	3763	3768	50 %	50 %	0 %	0 %	409248679
79	NT_187073	AGC	3	9	3772	3780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248679
80	NT_187073	GAA	2	6	3803	3808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248679
81	NT_187073	AGG	2	6	3841	3846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248679
82	NT_187073	GAC	2	6	3851	3856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248679
83	NT_187073	GCC	2	6	3894	3899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248679
84	NT_187073	GCC	2	6	3957	3962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248679
85	NT_187073	CTG	2	6	3974	3979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248679
86	NT_187073	TTA	2	6	4059	4064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248679
87	NT_187073	GTA	2	6	4068	4073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248679
88	NT_187073	GCC	2	6	4198	4203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248679
89	NT_187073	CGT	2	6	4278	4283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248679
90	NT_187073	GAC	2	6	4291	4296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248679
91	NT_187073	T	6	6	4309	4314	0 %	100 %	0 %	0 %	409248679
92	NT_187073	TGAA	2	8	4330	4337	50 %	25 %	25 %	0 %	409248679
93	NT_187073	CG	3	6	4354	4359	0 %	0 %	50 %	50 %	409248679
94	NT_187073	TGC	2	6	4454	4459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NT_187073	CAT	2	6	4508	4513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248680
96	NT_187073	GCG	2	6	4745	4750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248680
97	NT_187073	GAA	2	6	4751	4756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248680
98	NT_187073	GGT	2	6	4828	4833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248680
99	NT_187073	ACG	2	6	4863	4868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248680
100	NT_187073	CGG	2	6	4909	4914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248680
101	NT_187073	ATGTC	2	10	4932	4941	20 %	40 %	20 %	20 %	409248680
102	NT_187073	TGGC	2	8	5030	5037	0 %	25 %	50 %	25 %	409248680
103	NT_187073	AAT	2	6	5045	5050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248680
104	NT_187073	GTTG	2	8	5137	5144	0 %	50 %	50 %	0 %	409248680
105	NT_187073	CGATT	2	10	5148	5157	20 %	40 %	20 %	20 %	409248680
106	NT_187073	AGC	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248680
107	NT_187073	GCG	2	6	5287	5292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NT_187073	TCG	2	6	5306	5311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NT_187073	AAC	2	6	5350	5355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248681
110	NT_187073	GCT	2	6	5511	5516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248681
111	NT_187073	GTT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248681
112	NT_187073	CTG	2	6	5577	5582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248681
113	NT_187073	TGT	2	6	5916	5921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248681
114	NT_187073	GTTTC	2	10	5993	6002	0 %	60 %	20 %	20 %	409248681
115	NT_187073	AAAG	2	8	6010	6017	75 %	0 %	25 %	0 %	409248681
116	NT_187073	TTTG	2	8	6048	6055	0 %	75 %	25 %	0 %	409248681
117	NT_187073	CGC	2	6	6083	6088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248681
118	NT_187073	CAT	2	6	6147	6152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248681
119	NT_187073	CGG	2	6	6161	6166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248681
120	NT_187073	ACA	2	6	6178	6183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248681
121	NT_187073	CG	3	6	6190	6195	0 %	0 %	50 %	50 %	409248681
122	NT_187073	GTA	3	9	6314	6322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248681
123	NT_187073	TTCTGT	2	12	6430	6441	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	409248681
124	NT_187073	TCG	2	6	6481	6486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248681
125	NT_187073	CGT	2	6	6530	6535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248681
126	NT_187073	CCAT	2	8	6536	6543	25 %	25 %	0 %	50 %	409248681
127	NT_187073	GTGC	2	8	6599	6606	0 %	25 %	50 %	25 %	409248681
128	NT_187073	TG	4	8	6686	6693	0 %	50 %	50 %	0 %	409248681
129	NT_187073	GAC	2	6	6711	6716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NT_187073	TCTT	2	8	6768	6775	0 %	75 %	0 %	25 %	409248682
131	NT_187073	GTT	2	6	6805	6810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248682
132	NT_187073	TTAA	2	8	6837	6844	50 %	50 %	0 %	0 %	409248682
133	NT_187073	A	7	7	6864	6870	100 %	0 %	0 %	0 %	409248682
134	NT_187073	T	7	7	6917	6923	0 %	100 %	0 %	0 %	409248682
135	NT_187073	ATA	2	6	6947	6952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248682
136	NT_187073	GCA	2	6	7025	7030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248682
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138	NT_187073	AG	3	6	7050	7055	50 %	0 %	50 %	0 %	409248682
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141	NT_187073	TAAG	2	8	7145	7152	50 %	25 %	25 %	0 %	409248682
142	NT_187073	ATCGCC	2	12	7235	7246	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409248682
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146	NT_187073	TCA	2	6	7452	7457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248682
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149	NT_187073	CT	3	6	7563	7568	0 %	50 %	0 %	50 %	409248683
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159	NT_187073	ATA	2	6	8200	8205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248683
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261	NT_187073	CGG	2	6	13541	13546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248688
262	NT_187073	CGG	2	6	13549	13554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248688
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397	NT_187073	TGA	2	6	19193	19198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248692
398	NT_187073	CAA	2	6	19334	19339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248693
399	NT_187073	GC	3	6	19342	19347	0 %	0 %	50 %	50 %	409248693
400	NT_187073	CG	3	6	19358	19363	0 %	0 %	50 %	50 %	409248693
401	NT_187073	CG	3	6	19368	19373	0 %	0 %	50 %	50 %	409248693
402	NT_187073	CG	3	6	19375	19380	0 %	0 %	50 %	50 %	409248693
403	NT_187073	A	7	7	19419	19425	100 %	0 %	0 %	0 %	409248693
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462	NT_187073	GATG	2	8	22535	22542	25 %	25 %	50 %	0 %	409248698
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