MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 1836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NT_187073	CTT	2	6	67338	67343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248736
1502	NT_187073	CTG	2	6	67456	67461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248736
1503	NT_187073	CG	3	6	67563	67568	0 %	0 %	50 %	50 %	409248736
1504	NT_187073	TTC	2	6	67589	67594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248736
1505	NT_187073	TGC	2	6	67613	67618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248736
1506	NT_187073	AAC	2	6	67619	67624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248736
1507	NT_187073	GAGT	2	8	67636	67643	25 %	25 %	50 %	0 %	409248736
1508	NT_187073	CCG	2	6	67733	67738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248736
1509	NT_187073	T	6	6	67744	67749	0 %	100 %	0 %	0 %	409248736
1510	NT_187073	ATC	2	6	67754	67759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248736
1511	NT_187073	A	7	7	67762	67768	100 %	0 %	0 %	0 %	409248736
1512	NT_187073	CGG	2	6	67798	67803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248736
1513	NT_187073	CTT	2	6	67854	67859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248736
1514	NT_187073	GTTGCG	2	12	67899	67910	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	409248736
1515	NT_187073	T	6	6	67924	67929	0 %	100 %	0 %	0 %	409248736
1516	NT_187073	CCA	2	6	67963	67968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248736
1517	NT_187073	CTT	2	6	67989	67994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248736
1518	NT_187073	CGG	2	6	68011	68016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248736
1519	NT_187073	GCG	2	6	68150	68155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248736
1520	NT_187073	GCT	2	6	68176	68181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248736
1521	NT_187073	AAC	2	6	68224	68229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248736
1522	NT_187073	ATA	2	6	68237	68242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248736
1523	NT_187073	ATC	2	6	68249	68254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248736
1524	NT_187073	CTTG	2	8	68270	68277	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1525	NT_187073	AGG	2	6	68279	68284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1526	NT_187073	TGA	2	6	68297	68302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NT_187073	ACA	2	6	68354	68359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NT_187073	TTG	2	6	68369	68374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NT_187073	GCG	2	6	68532	68537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248737
1530	NT_187073	T	6	6	68552	68557	0 %	100 %	0 %	0 %	409248737
1531	NT_187073	GC	3	6	68588	68593	0 %	0 %	50 %	50 %	409248737
1532	NT_187073	GGT	2	6	68625	68630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248737
1533	NT_187073	CGG	2	6	68651	68656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248737
1534	NT_187073	TGCGA	2	10	68664	68673	20 %	20 %	40 %	20 %	409248737
1535	NT_187073	AT	3	6	68755	68760	50 %	50 %	0 %	0 %	409248737
1536	NT_187073	TC	3	6	68797	68802	0 %	50 %	0 %	50 %	409248737
1537	NT_187073	CGG	2	6	68939	68944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248737
1538	NT_187073	CGG	2	6	68959	68964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248737
1539	NT_187073	GTTG	2	8	69106	69113	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1540	NT_187073	TCC	2	6	69159	69164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NT_187073	ATT	2	6	69188	69193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NT_187073	ATGT	2	8	69283	69290	25 %	50 %	25 %	0 %	409248738
1543	NT_187073	GGC	2	6	69362	69367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248738
1544	NT_187073	AC	3	6	69557	69562	50 %	0 %	0 %	50 %	409248738
1545	NT_187073	AT	3	6	69757	69762	50 %	50 %	0 %	0 %	409248738
1546	NT_187073	TGC	2	6	69807	69812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248738
1547	NT_187073	TGG	2	6	69897	69902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248738
1548	NT_187073	ACG	2	6	70098	70103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248739
1549	NT_187073	GGC	2	6	70131	70136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248739
1550	NT_187073	AAT	2	6	70153	70158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248739
1551	NT_187073	GCG	2	6	70284	70289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248739
1552	NT_187073	TCA	2	6	70308	70313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248739
1553	NT_187073	AGC	2	6	70336	70341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248739
1554	NT_187073	ATC	2	6	70365	70370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248739
1555	NT_187073	CAT	2	6	70381	70386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248739
1556	NT_187073	GC	3	6	70393	70398	0 %	0 %	50 %	50 %	409248739
1557	NT_187073	CCG	2	6	70530	70535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248739
1558	NT_187073	CTT	2	6	70612	70617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248739
1559	NT_187073	CTG	2	6	70652	70657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248739
1560	NT_187073	GCT	4	12	70688	70699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248739
1561	NT_187073	A	6	6	70745	70750	100 %	0 %	0 %	0 %	409248739
1562	NT_187073	AC	3	6	70792	70797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1563	NT_187073	CAC	2	6	70858	70863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1564	NT_187073	GT	3	6	70885	70890	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1565	NT_187073	CGC	2	6	70907	70912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1566	NT_187073	TCG	2	6	70915	70920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NT_187073	GC	3	6	70965	70970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1568	NT_187073	GCGA	2	8	71008	71015	25 %	0 %	50 %	25 %	409248740
1569	NT_187073	T	7	7	71047	71053	0 %	100 %	0 %	0 %	409248740
1570	NT_187073	CCATTG	2	12	71097	71108	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409248740
1571	NT_187073	GC	3	6	71156	71161	0 %	0 %	50 %	50 %	409248740
1572	NT_187073	CGTA	2	8	71170	71177	25 %	25 %	25 %	25 %	409248740
1573	NT_187073	CTGG	2	8	71329	71336	0 %	25 %	50 %	25 %	409248740
1574	NT_187073	TGAC	2	8	71340	71347	25 %	25 %	25 %	25 %	409248740
1575	NT_187073	CCG	2	6	71430	71435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248740
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1577	NT_187073	CCG	2	6	71577	71582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248740
1578	NT_187073	TAT	2	6	71676	71681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248740
1579	NT_187073	GGA	2	6	71764	71769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248740
1580	NT_187073	ATT	2	6	71798	71803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248740
1581	NT_187073	CGT	2	6	71828	71833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248740
1582	NT_187073	TTAAA	2	10	71877	71886	60 %	40 %	0 %	0 %	409248740
1583	NT_187073	TAAA	2	8	71934	71941	75 %	25 %	0 %	0 %	409248740
1584	NT_187073	ACC	2	6	71954	71959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248740
1585	NT_187073	GCG	2	6	71994	71999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248740
1586	NT_187073	TGG	2	6	72006	72011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248740
1587	NT_187073	GCT	2	6	72025	72030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248740
1588	NT_187073	TTCTCA	2	12	72141	72152	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NT_187073	AGG	2	6	72163	72168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1590	NT_187073	TCA	2	6	72170	72175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NT_187073	T	6	6	72262	72267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NT_187073	AT	3	6	72273	72278	50 %	50 %	0 %	0 %	409248741
1593	NT_187073	CAA	2	6	72370	72375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248741
1594	NT_187073	TA	3	6	72377	72382	50 %	50 %	0 %	0 %	409248741
1595	NT_187073	CTGA	2	8	72595	72602	25 %	25 %	25 %	25 %	409248741
1596	NT_187073	GGA	2	6	72624	72629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248741
1597	NT_187073	CGC	2	6	72639	72644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248741
1598	NT_187073	GCA	2	6	72648	72653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248741
1599	NT_187073	GGC	3	9	72685	72693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248741
1600	NT_187073	TCG	2	6	72728	72733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248741
1601	NT_187073	TTCG	2	8	72741	72748	0 %	50 %	25 %	25 %	409248741
1602	NT_187073	A	6	6	72764	72769	100 %	0 %	0 %	0 %	409248741
1603	NT_187073	TTA	2	6	72775	72780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248741
1604	NT_187073	CTG	2	6	72781	72786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248741
1605	NT_187073	CGT	2	6	72826	72831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248741
1606	NT_187073	CGA	2	6	72873	72878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248741
1607	NT_187073	GC	3	6	72880	72885	0 %	0 %	50 %	50 %	409248741
1608	NT_187073	CG	3	6	72934	72939	0 %	0 %	50 %	50 %	409248741
1609	NT_187073	CCG	2	6	72948	72953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248741
1610	NT_187073	CG	3	6	73103	73108	0 %	0 %	50 %	50 %	409248741
1611	NT_187073	GCTG	2	8	73118	73125	0 %	25 %	50 %	25 %	409248741
1612	NT_187073	CGT	2	6	73134	73139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248741
1613	NT_187073	GAG	2	6	73144	73149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248741
1614	NT_187073	GAA	2	6	73297	73302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248741
1615	NT_187073	TGCC	2	8	73374	73381	0 %	25 %	25 %	50 %	409248741
1616	NT_187073	TCT	2	6	73443	73448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248742
1617	NT_187073	A	7	7	73481	73487	100 %	0 %	0 %	0 %	409248742
1618	NT_187073	GCC	2	6	73512	73517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248742
1619	NT_187073	A	6	6	73688	73693	100 %	0 %	0 %	0 %	409248742
1620	NT_187073	CCG	2	6	73720	73725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248742
1621	NT_187073	TGA	2	6	73742	73747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248742
1622	NT_187073	GCA	2	6	73787	73792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248742
1623	NT_187073	TAA	2	6	73796	73801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248742
1624	NT_187073	GCT	2	6	73898	73903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248742
1625	NT_187073	GGC	2	6	73912	73917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248742
1626	NT_187073	GCG	2	6	73944	73949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248742
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.