MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis T15

Total Repeats: 45446

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_022665	TGA	2	6	539583	539588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556588120
11003	NC_022665	CA	3	6	539633	539638	50 %	0 %	0 %	50 %	556588120
11004	NC_022665	AGA	2	6	539673	539678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556588120
11005	NC_022665	TTC	2	6	539698	539703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556588120
11006	NC_022665	TCAA	2	8	539752	539759	50 %	25 %	0 %	25 %	556588120
11007	NC_022665	TAC	2	6	539847	539852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556588120
11008	NC_022665	CT	3	6	539968	539973	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11009	NC_022665	AG	3	6	539984	539989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_022665	AATA	2	8	540066	540073	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_022665	AGA	2	6	540075	540080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_022665	AAG	2	6	540143	540148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556588121
11013	NC_022665	AGC	2	6	540204	540209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556588121
11014	NC_022665	CT	3	6	540239	540244	0 %	50 %	0 %	50 %	556588121
11015	NC_022665	TGC	2	6	540276	540281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556588121
11016	NC_022665	TGT	2	6	540363	540368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556588121
11017	NC_022665	CGT	2	6	540385	540390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556588121
11018	NC_022665	TGA	2	6	540408	540413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556588121
11019	NC_022665	TAA	2	6	540420	540425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556588121
11020	NC_022665	A	6	6	540424	540429	100 %	0 %	0 %	0 %	556588121
11021	NC_022665	ATC	2	6	540463	540468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556588121
11022	NC_022665	TGT	2	6	540469	540474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556588121
11023	NC_022665	CTG	2	6	540557	540562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556588121
11024	NC_022665	CTA	2	6	540626	540631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556588121
11025	NC_022665	GTT	2	6	540670	540675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556588121
11026	NC_022665	GCT	2	6	540676	540681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556588121
11027	NC_022665	AAG	2	6	540692	540697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556588121
11028	NC_022665	GGT	2	6	540724	540729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556588121
11029	NC_022665	TTG	2	6	540788	540793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556588121
11030	NC_022665	GTG	2	6	540794	540799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556588121
11031	NC_022665	CTT	2	6	540819	540824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556588121
11032	NC_022665	TTG	2	6	540829	540834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556588121
11033	NC_022665	TAA	2	6	540841	540846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556588121
11034	NC_022665	T	6	6	540876	540881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_022665	TCA	2	6	540939	540944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556588122
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11038	NC_022665	CAA	2	6	541015	541020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556588122
11039	NC_022665	TAGT	2	8	541075	541082	25 %	50 %	25 %	0 %	556588122
11040	NC_022665	ATGA	2	8	541100	541107	50 %	25 %	25 %	0 %	556588122
11041	NC_022665	AGC	2	6	541211	541216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556588122
11042	NC_022665	TCA	2	6	541233	541238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556588122
11043	NC_022665	CAT	2	6	541241	541246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556588122
11044	NC_022665	TGA	2	6	541252	541257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556588122
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11047	NC_022665	GCAT	2	8	541380	541387	25 %	25 %	25 %	25 %	556588122
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11050	NC_022665	TGA	2	6	541504	541509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556588122
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11052	NC_022665	T	7	7	541604	541610	0 %	100 %	0 %	0 %	556588122
11053	NC_022665	CTT	2	6	541612	541617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556588122
11054	NC_022665	TAG	2	6	541661	541666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556588122
11055	NC_022665	TATG	2	8	541733	541740	25 %	50 %	25 %	0 %	556588123
11056	NC_022665	TCT	2	6	541783	541788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556588123
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11058	NC_022665	TTTCT	2	10	541917	541926	0 %	80 %	0 %	20 %	556588123
11059	NC_022665	TCGG	2	8	541931	541938	0 %	25 %	50 %	25 %	556588123
11060	NC_022665	AGTAT	2	10	541977	541986	40 %	40 %	20 %	0 %	556588123
11061	NC_022665	CTT	2	6	542042	542047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556588123
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11063	NC_022665	AGTA	2	8	542144	542151	50 %	25 %	25 %	0 %	556588123
11064	NC_022665	CAT	2	6	542162	542167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556588123
11065	NC_022665	A	7	7	542205	542211	100 %	0 %	0 %	0 %	556588123
11066	NC_022665	A	6	6	542238	542243	100 %	0 %	0 %	0 %	556588123
11067	NC_022665	TA	3	6	542258	542263	50 %	50 %	0 %	0 %	556588123
11068	NC_022665	TCT	2	6	542368	542373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556588123
11069	NC_022665	TGCA	2	8	542376	542383	25 %	25 %	25 %	25 %	556588123
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11072	NC_022665	CAT	2	6	542723	542728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556588123
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11074	NC_022665	CCA	2	6	542863	542868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556588123
11075	NC_022665	AGT	2	6	542883	542888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556588123
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11077	NC_022665	A	6	6	543023	543028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11078	NC_022665	AAT	2	6	543110	543115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556588124
11079	NC_022665	TTA	2	6	543125	543130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556588124
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11085	NC_022665	GCA	2	6	543446	543451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556588124
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11089	NC_022665	TGG	2	6	543657	543662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556588124
11090	NC_022665	TGA	2	6	543669	543674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556588124
11091	NC_022665	TCT	2	6	543711	543716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556588124
11092	NC_022665	ATG	2	6	543755	543760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556588124
11093	NC_022665	TGC	2	6	543766	543771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556588124
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11098	NC_022665	TAG	2	6	543992	543997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556588124
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11102	NC_022665	TAT	2	6	544197	544202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556588125
11103	NC_022665	AAG	2	6	544220	544225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556588125
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11106	NC_022665	ATA	2	6	544440	544445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_022665	TAGC	2	8	544464	544471	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11108	NC_022665	GTC	2	6	544490	544495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11109	NC_022665	AT	3	6	544516	544521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_022665	TAA	2	6	544541	544546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_022665	T	6	6	544557	544562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_022665	A	6	6	544574	544579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_022665	GAGAAG	2	12	544586	544597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_022665	TCT	2	6	544671	544676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556588126
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11117	NC_022665	TGA	2	6	544795	544800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556588126
11118	NC_022665	GCA	3	9	544815	544823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556588126
11119	NC_022665	ATC	2	6	544872	544877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556588126
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11121	NC_022665	CTTG	2	8	545042	545049	0 %	50 %	25 %	25 %	556588126
11122	NC_022665	TGT	2	6	545060	545065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556588126
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11124	NC_022665	TTAC	2	8	545224	545231	25 %	50 %	0 %	25 %	556588126
11125	NC_022665	TGCT	2	8	545296	545303	0 %	50 %	25 %	25 %	556588126
11126	NC_022665	GTG	2	6	545419	545424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556588126
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11227	NC_022665	ATAA	2	8	550183	550190	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11228	NC_022665	A	6	6	550189	550194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11231	NC_022665	A	6	6	550247	550252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11232	NC_022665	CTT	2	6	550257	550262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11233	NC_022665	GAA	2	6	550293	550298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11237	NC_022665	AGA	2	6	550466	550471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556588131
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11241	NC_022665	CGT	2	6	550830	550835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556588131
11242	NC_022665	ATTGAA	2	12	550884	550895	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	556588131
11243	NC_022665	GAT	2	6	550902	550907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556588131
11244	NC_022665	GGT	2	6	550935	550940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556588131
11245	NC_022665	TGG	2	6	550943	550948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556588131
11246	NC_022665	CAA	2	6	550958	550963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556588131
11247	NC_022665	GAA	2	6	551099	551104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556588131
11248	NC_022665	AAGA	2	8	551136	551143	75 %	0 %	25 %	0 %	556588131
11249	NC_022665	ACC	2	6	551203	551208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556588131
11250	NC_022665	AAGTG	2	10	551315	551324	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11251	NC_022665	TCA	2	6	551351	551356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11252	NC_022665	T	7	7	551363	551369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11253	NC_022665	A	6	6	551392	551397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11254	NC_022665	AAAG	2	8	551411	551418	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11255	NC_022665	AAT	2	6	551447	551452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556588132
11256	NC_022665	GGA	2	6	551597	551602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556588132
11257	NC_022665	AG	3	6	551659	551664	50 %	0 %	50 %	0 %	556588132
11258	NC_022665	CGT	2	6	551679	551684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556588132
11259	NC_022665	GGT	2	6	551865	551870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556588132
11260	NC_022665	AAT	2	6	551907	551912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556588132
11261	NC_022665	ATTG	2	8	551921	551928	25 %	50 %	25 %	0 %	556588132
11262	NC_022665	TGA	2	6	551930	551935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556588132
11263	NC_022665	ATA	2	6	552031	552036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556588132
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11266	NC_022665	GAT	2	6	552126	552131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556588132
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11268	NC_022665	TGGT	2	8	552233	552240	0 %	50 %	50 %	0 %	556588133
11269	NC_022665	GCTT	2	8	552273	552280	0 %	50 %	25 %	25 %	556588133
11270	NC_022665	GA	3	6	552365	552370	50 %	0 %	50 %	0 %	556588133
11271	NC_022665	TCT	2	6	552716	552721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556588133
11272	NC_022665	ATT	2	6	552748	552753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556588133
11273	NC_022665	TGGT	2	8	552785	552792	0 %	50 %	50 %	0 %	556588133
11274	NC_022665	GAT	2	6	552894	552899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556588133
11275	NC_022665	TAT	3	9	552999	553007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556588133
11276	NC_022665	AAT	2	6	553087	553092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11277	NC_022665	TCCTTT	2	12	553184	553195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556588134
11278	NC_022665	GAT	2	6	553232	553237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11279	NC_022665	T	6	6	553318	553323	0 %	100 %	0 %	0 %	556588135
11280	NC_022665	GATA	2	8	553416	553423	50 %	25 %	25 %	0 %	556588135
11281	NC_022665	ACT	2	6	553429	553434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556588135
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11284	NC_022665	TTG	2	6	553585	553590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556588135
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11287	NC_022665	CTG	2	6	553817	553822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556588135
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11298	NC_022665	GTCG	2	8	554583	554590	0 %	25 %	50 %	25 %	556588135
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11300	NC_022665	TGA	2	6	554822	554827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556588135
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11327	NC_022665	TTAT	2	8	556065	556072	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11328	NC_022665	CAA	2	6	556081	556086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11340	NC_022665	AGAAA	2	10	556564	556573	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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11350	NC_022665	ACCT	2	8	557115	557122	25 %	25 %	0 %	50 %	556588138
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11356	NC_022665	A	6	6	557305	557310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11357	NC_022665	CAG	2	6	557413	557418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11358	NC_022665	A	7	7	557443	557449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11359	NC_022665	T	8	8	557460	557467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11360	NC_022665	AAAAAG	2	12	557472	557483	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11361	NC_022665	AG	3	6	557482	557487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11362	NC_022665	AAGT	2	8	557503	557510	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11363	NC_022665	AAGT	2	8	557513	557520	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11364	NC_022665	A	6	6	557559	557564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11365	NC_022665	TATT	2	8	557580	557587	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11491	NC_022665	AGG	2	6	563711	563716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11493	NC_022665	A	7	7	563982	563988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11494	NC_022665	A	7	7	564003	564009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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