MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium DT104 main chromosome

Total Repeats: 103989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_022569	GC	3	6	913974	913979	0 %	0 %	50 %	50 %	550900239
19503	NC_022569	A	7	7	914002	914008	100 %	0 %	0 %	0 %	550900239
19504	NC_022569	GACG	2	8	914020	914027	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19505	NC_022569	AACA	2	8	914041	914048	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19506	NC_022569	ACA	2	6	914117	914122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19507	NC_022569	ATT	2	6	914158	914163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550900240
19508	NC_022569	CGG	2	6	914203	914208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900240
19509	NC_022569	CAG	2	6	914233	914238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900240
19510	NC_022569	CGG	2	6	914239	914244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900240
19511	NC_022569	GTG	2	6	914280	914285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550900240
19512	NC_022569	AAAG	2	8	914367	914374	75 %	0 %	25 %	0 %	550900240
19513	NC_022569	TC	3	6	914426	914431	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19514	NC_022569	TGA	2	6	914470	914475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19515	NC_022569	T	6	6	914485	914490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19516	NC_022569	ATT	2	6	914558	914563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19517	NC_022569	AATT	2	8	914564	914571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19518	NC_022569	ATA	2	6	914675	914680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19519	NC_022569	CGC	2	6	914819	914824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900241
19520	NC_022569	CGC	2	6	914841	914846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900241
19521	NC_022569	CGC	2	6	914886	914891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900241
19522	NC_022569	TTG	2	6	914921	914926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550900241
19523	NC_022569	TTCA	2	8	914932	914939	25 %	50 %	0 %	25 %	550900241
19524	NC_022569	CGT	2	6	914943	914948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900241
19525	NC_022569	A	6	6	915023	915028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19526	NC_022569	CG	3	6	915035	915040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19527	NC_022569	AG	3	6	915076	915081	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19528	NC_022569	CGAG	2	8	915091	915098	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19529	NC_022569	GGT	2	6	915112	915117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19530	NC_022569	CGC	2	6	915151	915156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19531	NC_022569	CGC	2	6	915234	915239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900242
19532	NC_022569	CGCC	2	8	915284	915291	0 %	0 %	25 %	75 %	550900242
19533	NC_022569	CA	3	6	915372	915377	50 %	0 %	0 %	50 %	550900242
19534	NC_022569	CCG	2	6	915406	915411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900242
19535	NC_022569	CAT	2	6	915436	915441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550900242
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19538	NC_022569	GC	3	6	915599	915604	0 %	0 %	50 %	50 %	550900242
19539	NC_022569	CGG	2	6	915668	915673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900242
19540	NC_022569	TCAT	2	8	915689	915696	25 %	50 %	0 %	25 %	550900242
19541	NC_022569	CCG	3	9	915746	915754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900242
19542	NC_022569	CG	3	6	915760	915765	0 %	0 %	50 %	50 %	550900242
19543	NC_022569	AGCG	2	8	915769	915776	25 %	0 %	50 %	25 %	550900242
19544	NC_022569	GAT	2	6	915805	915810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550900242
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19546	NC_022569	GGC	2	6	915853	915858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900242
19547	NC_022569	A	7	7	915874	915880	100 %	0 %	0 %	0 %	550900242
19548	NC_022569	CCG	2	6	915903	915908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900242
19549	NC_022569	ACG	2	6	915925	915930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900242
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19551	NC_022569	CCG	2	6	915955	915960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900242
19552	NC_022569	GTG	2	6	915997	916002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550900242
19553	NC_022569	A	6	6	916003	916008	100 %	0 %	0 %	0 %	550900242
19554	NC_022569	AAAGC	2	10	916026	916035	60 %	0 %	20 %	20 %	550900242
19555	NC_022569	GAC	2	6	916063	916068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900242
19556	NC_022569	TCG	2	6	916103	916108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900243
19557	NC_022569	CG	3	6	916112	916117	0 %	0 %	50 %	50 %	550900243
19558	NC_022569	GCC	2	6	916140	916145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900243
19559	NC_022569	GGGC	2	8	916151	916158	0 %	0 %	75 %	25 %	550900243
19560	NC_022569	GC	4	8	916181	916188	0 %	0 %	50 %	50 %	550900243
19561	NC_022569	GTG	2	6	916264	916269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550900243
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19563	NC_022569	TCC	2	6	916354	916359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	550900243
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19587	NC_022569	ATAA	2	8	917716	917723	75 %	25 %	0 %	0 %	550900243
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19600	NC_022569	A	6	6	918293	918298	100 %	0 %	0 %	0 %	550900243
19601	NC_022569	CTC	2	6	918323	918328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19602	NC_022569	GGGA	2	8	918372	918379	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19603	NC_022569	AAATG	2	10	918380	918389	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19604	NC_022569	ATG	2	6	918400	918405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19605	NC_022569	GTGA	2	8	918580	918587	25 %	25 %	50 %	0 %	550900244
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19614	NC_022569	TGGG	2	8	919118	919125	0 %	25 %	75 %	0 %	550900244
19615	NC_022569	CTT	2	6	919174	919179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550900245
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19621	NC_022569	GCA	2	6	919373	919378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900245
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19623	NC_022569	AAT	2	6	919632	919637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550900245
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19993	NC_022569	T	7	7	937739	937745	0 %	100 %	0 %	0 %	550900259
19994	NC_022569	CGG	2	6	937751	937756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900259
19995	NC_022569	TGGC	2	8	937936	937943	0 %	25 %	50 %	25 %	550900259
19996	NC_022569	GCC	2	6	937957	937962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900259
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