MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium DT104 main chromosome

Total Repeats: 103989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_022569	AGA	2	6	890721	890726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19002	NC_022569	AATAA	2	10	890734	890743	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19003	NC_022569	AGA	2	6	890826	890831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19004	NC_022569	ATA	2	6	890885	890890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19005	NC_022569	TAG	2	6	890898	890903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19006	NC_022569	AGG	2	6	890904	890909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19007	NC_022569	GAGG	2	8	890989	890996	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19008	NC_022569	AGTC	2	8	891002	891009	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19009	NC_022569	GCA	2	6	891124	891129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19010	NC_022569	GAA	2	6	891136	891141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19011	NC_022569	ATA	2	6	891173	891178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19012	NC_022569	ACT	2	6	891244	891249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19013	NC_022569	ATA	2	6	891452	891457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19014	NC_022569	GCC	2	6	891609	891614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19015	NC_022569	ACC	2	6	891672	891677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19016	NC_022569	GTAA	2	8	891697	891704	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19017	NC_022569	TCC	2	6	891735	891740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19018	NC_022569	AAC	2	6	891747	891752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19019	NC_022569	CGG	2	6	891800	891805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19020	NC_022569	AAT	2	6	891813	891818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19021	NC_022569	GTG	2	6	891872	891877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19022	NC_022569	AAT	2	6	891897	891902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19023	NC_022569	GAAC	2	8	891925	891932	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19024	NC_022569	GAG	2	6	892069	892074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19025	NC_022569	GGCG	2	8	892091	892098	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19026	NC_022569	GAGGCA	2	12	892102	892113	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19027	NC_022569	CGG	2	6	892118	892123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19028	NC_022569	TATT	2	8	892244	892251	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19029	NC_022569	ACC	2	6	892301	892306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19030	NC_022569	ATG	2	6	892331	892336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19031	NC_022569	TCGC	2	8	892417	892424	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19032	NC_022569	T	6	6	892447	892452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19033	NC_022569	CGAAGT	2	12	892458	892469	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19034	NC_022569	GTCGCT	2	12	892500	892511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19035	NC_022569	ACA	2	6	892513	892518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19036	NC_022569	AGA	2	6	892674	892679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19037	NC_022569	ATG	2	6	892690	892695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19038	NC_022569	GAC	2	6	892774	892779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19039	NC_022569	TAC	2	6	892794	892799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19040	NC_022569	GATG	2	8	892809	892816	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19041	NC_022569	AAT	2	6	892839	892844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19042	NC_022569	ATCA	2	8	892852	892859	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19043	NC_022569	AT	3	6	892886	892891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19044	NC_022569	A	6	6	892897	892902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19045	NC_022569	GCTC	2	8	892910	892917	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19046	NC_022569	AGA	2	6	892955	892960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19047	NC_022569	GA	3	6	892963	892968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19048	NC_022569	CGT	2	6	893012	893017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19049	NC_022569	TAA	2	6	893069	893074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550900218
19050	NC_022569	ACT	2	6	893172	893177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550900218
19051	NC_022569	T	6	6	893189	893194	0 %	100 %	0 %	0 %	550900218
19052	NC_022569	AT	3	6	893199	893204	50 %	50 %	0 %	0 %	550900218
19053	NC_022569	CAT	2	6	893210	893215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550900218
19054	NC_022569	GGC	2	6	893243	893248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900218
19055	NC_022569	CAG	3	9	893330	893338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900218
19056	NC_022569	AATCAG	2	12	893375	893386	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	550900218
19057	NC_022569	GCG	3	9	893455	893463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900218
19058	NC_022569	AATTA	2	10	893585	893594	60 %	40 %	0 %	0 %	550900218
19059	NC_022569	GACGC	2	10	893706	893715	20 %	0 %	40 %	40 %	550900218
19060	NC_022569	GCG	2	6	893780	893785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900218
19061	NC_022569	C	6	6	893801	893806	0 %	0 %	0 %	100 %	550900218
19062	NC_022569	GAA	2	6	893850	893855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550900218
19063	NC_022569	GAG	2	6	893859	893864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550900218
19064	NC_022569	CCG	2	6	893889	893894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900218
19065	NC_022569	CAGC	2	8	893917	893924	25 %	0 %	25 %	50 %	550900218
19066	NC_022569	AGC	2	6	893960	893965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19067	NC_022569	AATT	2	8	894020	894027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19068	NC_022569	AT	4	8	894074	894081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19069	NC_022569	TA	3	6	894150	894155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19070	NC_022569	CCA	2	6	894282	894287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19071	NC_022569	GAA	2	6	894296	894301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19072	NC_022569	CG	3	6	894361	894366	0 %	0 %	50 %	50 %	550900219
19073	NC_022569	TAC	2	6	894374	894379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550900219
19074	NC_022569	TG	3	6	894400	894405	0 %	50 %	50 %	0 %	550900219
19075	NC_022569	GGC	2	6	894449	894454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900219
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19077	NC_022569	TCG	2	6	894490	894495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900219
19078	NC_022569	CG	3	6	894501	894506	0 %	0 %	50 %	50 %	550900219
19079	NC_022569	CGG	2	6	894544	894549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900219
19080	NC_022569	CGC	2	6	894563	894568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900219
19081	NC_022569	CAT	2	6	894580	894585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550900219
19082	NC_022569	GCC	2	6	894587	894592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900219
19083	NC_022569	ATG	2	6	894603	894608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550900219
19084	NC_022569	GC	3	6	894650	894655	0 %	0 %	50 %	50 %	550900219
19085	NC_022569	GCC	2	6	894782	894787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900219
19086	NC_022569	CCTT	2	8	894861	894868	0 %	50 %	0 %	50 %	550900219
19087	NC_022569	CAT	2	6	894950	894955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550900219
19088	NC_022569	CGA	2	6	894976	894981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900219
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19090	NC_022569	CAGCG	2	10	895016	895025	20 %	0 %	40 %	40 %	550900219
19091	NC_022569	T	6	6	895041	895046	0 %	100 %	0 %	0 %	550900219
19092	NC_022569	CGTC	2	8	895131	895138	0 %	25 %	25 %	50 %	550900219
19093	NC_022569	CGG	2	6	895168	895173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900219
19094	NC_022569	GCA	2	6	895207	895212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900219
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19096	NC_022569	TAA	2	6	895329	895334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19097	NC_022569	GTCAG	2	10	895350	895359	20 %	20 %	40 %	20 %	550900220
19098	NC_022569	GAA	2	6	895415	895420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550900220
19099	NC_022569	GAC	2	6	895421	895426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900220
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19101	NC_022569	GTG	2	6	895475	895480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550900220
19102	NC_022569	TGA	2	6	895546	895551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550900220
19103	NC_022569	TGG	2	6	895573	895578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550900220
19104	NC_022569	CG	4	8	895707	895714	0 %	0 %	50 %	50 %	550900220
19105	NC_022569	TGGCG	2	10	895720	895729	0 %	20 %	60 %	20 %	550900220
19106	NC_022569	CGC	2	6	895884	895889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900221
19107	NC_022569	TGG	2	6	895904	895909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550900221
19108	NC_022569	GAT	2	6	895986	895991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550900221
19109	NC_022569	GCC	2	6	896053	896058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900221
19110	NC_022569	CGTC	2	8	896216	896223	0 %	25 %	25 %	50 %	550900221
19111	NC_022569	GCG	2	6	896224	896229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900221
19112	NC_022569	CTG	2	6	896290	896295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900221
19113	NC_022569	GCG	2	6	896303	896308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900221
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19115	NC_022569	CAG	2	6	896403	896408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900222
19116	NC_022569	GCGCTG	2	12	896465	896476	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	550900222
19117	NC_022569	GGC	2	6	896494	896499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900222
19118	NC_022569	CGG	2	6	896538	896543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900222
19119	NC_022569	G	6	6	896575	896580	0 %	0 %	100 %	0 %	550900222
19120	NC_022569	GGA	2	6	896633	896638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550900223
19121	NC_022569	CTGG	2	8	896645	896652	0 %	25 %	50 %	25 %	550900223
19122	NC_022569	GC	3	6	896655	896660	0 %	0 %	50 %	50 %	550900223
19123	NC_022569	GTC	2	6	896676	896681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900223
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19248	NC_022569	TGAA	2	8	902775	902782	50 %	25 %	25 %	0 %	550900230
19249	NC_022569	GT	3	6	902792	902797	0 %	50 %	50 %	0 %	550900230
19250	NC_022569	TTC	2	6	902807	902812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19251	NC_022569	GTC	3	9	902847	902855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19252	NC_022569	AAT	2	6	902904	902909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19253	NC_022569	GA	3	6	902910	902915	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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19369	NC_022569	TCA	2	6	908198	908203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550900235
19370	NC_022569	GCC	2	6	908224	908229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900235
19371	NC_022569	ACC	2	6	908307	908312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550900235
19372	NC_022569	CGA	2	6	908334	908339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900235
19373	NC_022569	T	6	6	908371	908376	0 %	100 %	0 %	0 %	550900235
19374	NC_022569	TCA	2	6	908464	908469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550900236
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19376	NC_022569	GCT	2	6	908675	908680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900236
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19378	NC_022569	CAG	2	6	908724	908729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900236
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19380	NC_022569	AGTA	2	8	908903	908910	50 %	25 %	25 %	0 %	550900236
19381	NC_022569	GGC	2	6	908913	908918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900236
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19383	NC_022569	CG	3	6	908948	908953	0 %	0 %	50 %	50 %	550900236
19384	NC_022569	TGG	2	6	908954	908959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550900236
19385	NC_022569	GCG	2	6	908992	908997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900236
19386	NC_022569	TGG	2	6	909029	909034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550900236
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19390	NC_022569	GATT	2	8	909079	909086	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19391	NC_022569	AGT	2	6	909276	909281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19432	NC_022569	A	6	6	910785	910790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19433	NC_022569	CGCTG	2	10	910866	910875	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19434	NC_022569	CGC	2	6	910887	910892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19435	NC_022569	GAT	2	6	910953	910958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550900238
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19469	NC_022569	CAT	2	6	912454	912459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550900238
19470	NC_022569	GCGG	2	8	912482	912489	0 %	0 %	75 %	25 %	550900238
19471	NC_022569	CTC	2	6	912532	912537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	550900238
19472	NC_022569	GCG	2	6	912599	912604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900238
19473	NC_022569	GCT	2	6	912663	912668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900238
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19476	NC_022569	TAATT	2	10	912798	912807	40 %	60 %	0 %	0 %	550900238
19477	NC_022569	CAG	2	6	912808	912813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900238
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19479	NC_022569	AGC	2	6	912932	912937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900238
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19482	NC_022569	GATCTG	2	12	913083	913094	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	550900239
19483	NC_022569	CG	4	8	913100	913107	0 %	0 %	50 %	50 %	550900239
19484	NC_022569	AGGCGA	2	12	913184	913195	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	550900239
19485	NC_022569	CCGC	2	8	913251	913258	0 %	0 %	25 %	75 %	550900239
19486	NC_022569	GC	3	6	913297	913302	0 %	0 %	50 %	50 %	550900239
19487	NC_022569	CTG	2	6	913338	913343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900239
19488	NC_022569	GTA	2	6	913365	913370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550900239
19489	NC_022569	GC	3	6	913504	913509	0 %	0 %	50 %	50 %	550900239
19490	NC_022569	CGC	2	6	913516	913521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900239
19491	NC_022569	GCGT	2	8	913555	913562	0 %	25 %	50 %	25 %	550900239
19492	NC_022569	GC	3	6	913567	913572	0 %	0 %	50 %	50 %	550900239
19493	NC_022569	T	6	6	913668	913673	0 %	100 %	0 %	0 %	550900239
19494	NC_022569	GGCG	2	8	913683	913690	0 %	0 %	75 %	25 %	550900239
19495	NC_022569	TGAT	2	8	913759	913766	25 %	50 %	25 %	0 %	550900239
19496	NC_022569	ACG	2	6	913810	913815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900239
19497	NC_022569	CTGC	2	8	913827	913834	0 %	25 %	25 %	50 %	550900239
19498	NC_022569	CG	3	6	913856	913861	0 %	0 %	50 %	50 %	550900239
19499	NC_022569	TGT	2	6	913926	913931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550900239
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