MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium DT104 main chromosome

Total Repeats: 103989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_022569	GAT	2	6	753878	753883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16002	NC_022569	AGC	2	6	753910	753915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16003	NC_022569	AGG	2	6	753971	753976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16004	NC_022569	GA	3	6	754016	754021	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_022569	CGT	2	6	754029	754034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900099
16006	NC_022569	TCA	2	6	754045	754050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550900099
16007	NC_022569	TGG	2	6	754144	754149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550900099
16008	NC_022569	ATC	2	6	754176	754181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550900099
16009	NC_022569	CCG	2	6	754210	754215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900099
16010	NC_022569	TTA	2	6	754224	754229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550900099
16011	NC_022569	GCA	2	6	754237	754242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900099
16012	NC_022569	CGT	2	6	754321	754326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900099
16013	NC_022569	CAG	2	6	754337	754342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900099
16014	NC_022569	AAT	2	6	754388	754393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550900099
16015	NC_022569	GCC	2	6	754407	754412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900099
16016	NC_022569	AGG	2	6	754468	754473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550900099
16017	NC_022569	GAA	2	6	754487	754492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550900099
16018	NC_022569	GAAC	2	8	754525	754532	50 %	0 %	25 %	25 %	550900099
16019	NC_022569	TAA	2	6	754609	754614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550900099
16020	NC_022569	T	7	7	754686	754692	0 %	100 %	0 %	0 %	550900099
16021	NC_022569	CGAA	2	8	754712	754719	50 %	0 %	25 %	25 %	550900099
16022	NC_022569	GCT	2	6	754726	754731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900099
16023	NC_022569	GATT	2	8	754732	754739	25 %	50 %	25 %	0 %	550900099
16024	NC_022569	ATA	2	6	754770	754775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550900099
16025	NC_022569	GCAAA	2	10	754948	754957	60 %	0 %	20 %	20 %	550900099
16026	NC_022569	CAGC	2	8	754972	754979	25 %	0 %	25 %	50 %	550900099
16027	NC_022569	CAT	2	6	755027	755032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550900099
16028	NC_022569	CAG	2	6	755033	755038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900099
16029	NC_022569	GCG	2	6	755178	755183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900099
16030	NC_022569	GA	3	6	755256	755261	50 %	0 %	50 %	0 %	550900099
16031	NC_022569	AGC	2	6	755271	755276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900099
16032	NC_022569	ACC	2	6	755277	755282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550900099
16033	NC_022569	GCC	2	6	755309	755314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900099
16034	NC_022569	GGC	2	6	755387	755392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900099
16035	NC_022569	GCGG	2	8	755401	755408	0 %	0 %	75 %	25 %	550900099
16036	NC_022569	GA	3	6	755473	755478	50 %	0 %	50 %	0 %	550900099
16037	NC_022569	AAT	2	6	755502	755507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550900099
16038	NC_022569	CAG	3	9	755513	755521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900099
16039	NC_022569	AAT	2	6	755634	755639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550900100
16040	NC_022569	ACG	2	6	755640	755645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900100
16041	NC_022569	TCAATG	2	12	755680	755691	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	550900100
16042	NC_022569	CGC	2	6	755696	755701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900100
16043	NC_022569	CCG	2	6	755737	755742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900100
16044	NC_022569	GC	3	6	755810	755815	0 %	0 %	50 %	50 %	550900100
16045	NC_022569	GGC	2	6	755831	755836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900100
16046	NC_022569	TCT	2	6	755860	755865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550900100
16047	NC_022569	CGC	2	6	755936	755941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900100
16048	NC_022569	GCA	2	6	756089	756094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900100
16049	NC_022569	GAT	2	6	756171	756176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550900100
16050	NC_022569	ATC	2	6	756220	756225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550900100
16051	NC_022569	ATA	2	6	756241	756246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550900100
16052	NC_022569	CG	3	6	756293	756298	0 %	0 %	50 %	50 %	550900100
16053	NC_022569	TCA	2	6	756352	756357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550900100
16054	NC_022569	GCTG	2	8	756383	756390	0 %	25 %	50 %	25 %	550900100
16055	NC_022569	A	7	7	756401	756407	100 %	0 %	0 %	0 %	550900100
16056	NC_022569	ACT	2	6	756432	756437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550900100
16057	NC_022569	GTC	2	6	756447	756452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900100
16058	NC_022569	CGT	2	6	756461	756466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16059	NC_022569	GTTA	2	8	756479	756486	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_022569	GCC	2	6	756597	756602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16061	NC_022569	CTA	2	6	756613	756618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550900101
16062	NC_022569	TCT	2	6	756627	756632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550900101
16063	NC_022569	AGCA	2	8	756661	756668	50 %	0 %	25 %	25 %	550900101
16064	NC_022569	GA	3	6	756682	756687	50 %	0 %	50 %	0 %	550900101
16065	NC_022569	TCG	2	6	756710	756715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900101
16066	NC_022569	AAT	2	6	756826	756831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550900101
16067	NC_022569	CGG	2	6	756861	756866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900101
16068	NC_022569	GA	3	6	756884	756889	50 %	0 %	50 %	0 %	550900101
16069	NC_022569	CCA	2	6	756951	756956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550900101
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16073	NC_022569	CAC	2	6	757209	757214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550900102
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16079	NC_022569	GCG	2	6	757669	757674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900102
16080	NC_022569	CCG	2	6	757700	757705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900102
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16082	NC_022569	CTT	2	6	757859	757864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550900102
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16086	NC_022569	GAC	2	6	758027	758032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900102
16087	NC_022569	TCA	2	6	758053	758058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550900102
16088	NC_022569	ATT	2	6	758190	758195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16089	NC_022569	AG	3	6	758243	758248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16090	NC_022569	ATT	2	6	758316	758321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16091	NC_022569	CAG	2	6	758329	758334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16092	NC_022569	TACGGG	2	12	758375	758386	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	550900103
16093	NC_022569	CAC	2	6	758442	758447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550900103
16094	NC_022569	ATC	2	6	758506	758511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550900103
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16096	NC_022569	CCA	2	6	758594	758599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550900103
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16098	NC_022569	CTG	2	6	758646	758651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900103
16099	NC_022569	GCT	2	6	758681	758686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900103
16100	NC_022569	TCT	2	6	758687	758692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550900103
16101	NC_022569	CTT	2	6	758693	758698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550900103
16102	NC_022569	TCA	2	6	758707	758712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550900103
16103	NC_022569	AGA	2	6	758747	758752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550900103
16104	NC_022569	T	6	6	758801	758806	0 %	100 %	0 %	0 %	550900103
16105	NC_022569	ATC	2	6	758811	758816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550900103
16106	NC_022569	CGA	2	6	758837	758842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900103
16107	NC_022569	GCCGC	2	10	758870	758879	0 %	0 %	40 %	60 %	550900103
16108	NC_022569	GC	3	6	758878	758883	0 %	0 %	50 %	50 %	550900103
16109	NC_022569	GAT	2	6	758892	758897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550900103
16110	NC_022569	ATA	2	6	759016	759021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550900103
16111	NC_022569	TCG	2	6	759022	759027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900103
16112	NC_022569	TGG	2	6	759047	759052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550900103
16113	NC_022569	GGC	2	6	759081	759086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900103
16114	NC_022569	GCA	2	6	759095	759100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900103
16115	NC_022569	GGT	2	6	759117	759122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550900103
16116	NC_022569	CGT	2	6	759125	759130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900103
16117	NC_022569	CAG	2	6	759165	759170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900103
16118	NC_022569	CACG	2	8	759179	759186	25 %	0 %	25 %	50 %	550900103
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16120	NC_022569	CA	3	6	759267	759272	50 %	0 %	0 %	50 %	550900103
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16243	NC_022569	GCA	2	6	765562	765567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900108
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16352	NC_022569	GTT	2	6	771245	771250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16491	NC_022569	TCA	2	6	778021	778026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550900117
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