MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium DT104 main chromosome

Total Repeats: 103989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_022569	AGC	2	6	731799	731804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900079
15502	NC_022569	GCGCCA	2	12	731824	731835	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	550900079
15503	NC_022569	ATAGCA	2	12	731849	731860	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	550900079
15504	NC_022569	CAG	2	6	731861	731866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900079
15505	NC_022569	GGC	2	6	731912	731917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900079
15506	NC_022569	GGC	2	6	731996	732001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900079
15507	NC_022569	TAA	2	6	732041	732046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550900079
15508	NC_022569	GTC	2	6	732050	732055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900079
15509	NC_022569	GCA	2	6	732058	732063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900079
15510	NC_022569	GCTC	2	8	732064	732071	0 %	25 %	25 %	50 %	550900079
15511	NC_022569	TCAT	2	8	732087	732094	25 %	50 %	0 %	25 %	550900079
15512	NC_022569	GCA	2	6	732124	732129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900079
15513	NC_022569	GTG	2	6	732218	732223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550900079
15514	NC_022569	GCC	2	6	732246	732251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900079
15515	NC_022569	GCA	3	9	732277	732285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900079
15516	NC_022569	CGCA	2	8	732314	732321	25 %	0 %	25 %	50 %	550900079
15517	NC_022569	GC	3	6	732337	732342	0 %	0 %	50 %	50 %	550900079
15518	NC_022569	GTT	2	6	732346	732351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550900079
15519	NC_022569	GGCG	2	8	732409	732416	0 %	0 %	75 %	25 %	550900080
15520	NC_022569	CCG	2	6	732417	732422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900080
15521	NC_022569	CGG	2	6	732432	732437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900080
15522	NC_022569	CCT	2	6	732441	732446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	550900080
15523	NC_022569	TCG	2	6	732450	732455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900080
15524	NC_022569	CCG	2	6	732465	732470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900080
15525	NC_022569	CG	3	6	732469	732474	0 %	0 %	50 %	50 %	550900080
15526	NC_022569	GAA	2	6	732580	732585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550900080
15527	NC_022569	GATAG	2	10	732607	732616	40 %	20 %	40 %	0 %	550900080
15528	NC_022569	TCA	2	6	732654	732659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550900080
15529	NC_022569	CCG	2	6	732672	732677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900080
15530	NC_022569	ATC	2	6	732851	732856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550900080
15531	NC_022569	CGG	2	6	732909	732914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900080
15532	NC_022569	AAC	2	6	732935	732940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550900080
15533	NC_022569	TCC	2	6	732964	732969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15534	NC_022569	CAA	2	6	732980	732985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550900081
15535	NC_022569	GAG	2	6	732993	732998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550900081
15536	NC_022569	CCA	2	6	733052	733057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550900081
15537	NC_022569	TTC	2	6	733089	733094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550900081
15538	NC_022569	GTG	2	6	733159	733164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550900081
15539	NC_022569	CCA	2	6	733169	733174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550900081
15540	NC_022569	TCG	2	6	733183	733188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900081
15541	NC_022569	CGC	2	6	733223	733228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900081
15542	NC_022569	GCG	2	6	733259	733264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900081
15543	NC_022569	ACG	2	6	733285	733290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900081
15544	NC_022569	TCA	2	6	733358	733363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550900081
15545	NC_022569	CGC	2	6	733374	733379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900081
15546	NC_022569	CGG	2	6	733402	733407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900081
15547	NC_022569	ATC	2	6	733413	733418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550900081
15548	NC_022569	GT	3	6	733516	733521	0 %	50 %	50 %	0 %	550900081
15549	NC_022569	TAA	2	6	733547	733552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550900081
15550	NC_022569	CCG	2	6	733601	733606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900081
15551	NC_022569	CAT	2	6	733617	733622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550900081
15552	NC_022569	CGA	2	6	733778	733783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900081
15553	NC_022569	ATA	2	6	733830	733835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550900081
15554	NC_022569	GAA	2	6	733926	733931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550900081
15555	NC_022569	ATG	2	6	733951	733956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550900081
15556	NC_022569	CCG	2	6	733969	733974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900081
15557	NC_022569	AGT	2	6	733997	734002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550900081
15558	NC_022569	TTCC	2	8	734024	734031	0 %	50 %	0 %	50 %	550900081
15559	NC_022569	CG	3	6	734053	734058	0 %	0 %	50 %	50 %	550900081
15560	NC_022569	GGT	2	6	734127	734132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550900081
15561	NC_022569	GAC	2	6	734181	734186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900081
15562	NC_022569	GCA	2	6	734228	734233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900081
15563	NC_022569	GC	3	6	734267	734272	0 %	0 %	50 %	50 %	550900081
15564	NC_022569	CGC	2	6	734373	734378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900081
15565	NC_022569	AGGCC	2	10	734384	734393	20 %	0 %	40 %	40 %	550900081
15566	NC_022569	CGG	2	6	734468	734473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900081
15567	NC_022569	GCC	2	6	734590	734595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900081
15568	NC_022569	T	6	6	734655	734660	0 %	100 %	0 %	0 %	550900081
15569	NC_022569	TTCGGC	2	12	734676	734687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900081
15570	NC_022569	TCG	2	6	734707	734712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900081
15571	NC_022569	CGC	2	6	734718	734723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900081
15572	NC_022569	GTT	2	6	734733	734738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550900081
15573	NC_022569	CGC	3	9	734739	734747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900081
15574	NC_022569	CGG	2	6	734768	734773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900081
15575	NC_022569	GGT	2	6	734814	734819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550900081
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15577	NC_022569	TCT	2	6	735101	735106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550900081
15578	NC_022569	T	6	6	735120	735125	0 %	100 %	0 %	0 %	550900081
15579	NC_022569	GAA	2	6	735138	735143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550900081
15580	NC_022569	GTA	2	6	735159	735164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550900081
15581	NC_022569	TGT	2	6	735245	735250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550900081
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15583	NC_022569	GTT	2	6	735276	735281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550900081
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15585	NC_022569	CCG	2	6	735299	735304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900081
15586	NC_022569	GCA	2	6	735335	735340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900081
15587	NC_022569	TACG	2	8	735395	735402	25 %	25 %	25 %	25 %	550900081
15588	NC_022569	AGT	2	6	735565	735570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550900081
15589	NC_022569	GGT	2	6	735606	735611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550900081
15590	NC_022569	GCATA	2	10	735622	735631	40 %	20 %	20 %	20 %	550900081
15591	NC_022569	GAG	2	6	735688	735693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550900081
15592	NC_022569	A	6	6	735789	735794	100 %	0 %	0 %	0 %	550900081
15593	NC_022569	A	8	8	735848	735855	100 %	0 %	0 %	0 %	550900082
15594	NC_022569	GTG	2	6	735860	735865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550900082
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15596	NC_022569	ATA	2	6	736132	736137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550900082
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15598	NC_022569	CCG	2	6	736184	736189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900083
15599	NC_022569	TACC	2	8	736231	736238	25 %	25 %	0 %	50 %	550900083
15600	NC_022569	GCT	2	6	736315	736320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900083
15601	NC_022569	AAT	2	6	736374	736379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550900083
15602	NC_022569	TTGTGG	2	12	736396	736407	0 %	50 %	50 %	0 %	550900083
15603	NC_022569	AGA	2	6	736445	736450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550900083
15604	NC_022569	CCT	2	6	736474	736479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	550900083
15605	NC_022569	GGC	2	6	736500	736505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900083
15606	NC_022569	CAA	2	6	736554	736559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550900083
15607	NC_022569	GCA	2	6	736577	736582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900083
15608	NC_022569	GCT	3	9	736598	736606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900083
15609	NC_022569	GCG	2	6	736618	736623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900083
15610	NC_022569	GCG	2	6	736693	736698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900083
15611	NC_022569	TTCT	2	8	736708	736715	0 %	75 %	0 %	25 %	550900083
15612	NC_022569	ACG	2	6	736719	736724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900083
15613	NC_022569	CG	3	6	736758	736763	0 %	0 %	50 %	50 %	550900083
15614	NC_022569	GAA	2	6	736896	736901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550900083
15615	NC_022569	TGG	2	6	737035	737040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550900083
15616	NC_022569	G	6	6	737042	737047	0 %	0 %	100 %	0 %	550900083
15617	NC_022569	TAC	2	6	737066	737071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550900083
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15619	NC_022569	TAA	2	6	737126	737131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550900083
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