MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium DT104 main chromosome

Total Repeats: 103989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_022569	GCG	2	6	708893	708898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900054
15003	NC_022569	CGC	3	9	708989	708997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900054
15004	NC_022569	GTG	2	6	709005	709010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550900054
15005	NC_022569	CGG	2	6	709045	709050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900054
15006	NC_022569	CG	3	6	709085	709090	0 %	0 %	50 %	50 %	550900054
15007	NC_022569	GCT	2	6	709165	709170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900054
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15010	NC_022569	ACG	2	6	709312	709317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900055
15011	NC_022569	GCG	2	6	709333	709338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900055
15012	NC_022569	GCA	2	6	709406	709411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900055
15013	NC_022569	CTT	2	6	709475	709480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550900055
15014	NC_022569	GTT	2	6	709497	709502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550900055
15015	NC_022569	CGG	2	6	709538	709543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900055
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15017	NC_022569	CAG	2	6	709578	709583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900055
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15019	NC_022569	GCG	2	6	709703	709708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900055
15020	NC_022569	CGG	2	6	709715	709720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900055
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15024	NC_022569	CGC	2	6	710049	710054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900055
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15030	NC_022569	GC	3	6	710190	710195	0 %	0 %	50 %	50 %	550900056
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15042	NC_022569	CCAG	2	8	710655	710662	25 %	0 %	25 %	50 %	550900057
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15061	NC_022569	TCAG	2	8	711575	711582	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15062	NC_022569	T	7	7	711591	711597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_022569	TTAT	2	8	711606	711613	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_022569	TC	3	6	711617	711622	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15065	NC_022569	TGG	2	6	711649	711654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15069	NC_022569	CGG	2	6	711740	711745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15071	NC_022569	TTA	2	6	711828	711833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15109	NC_022569	A	8	8	713497	713504	100 %	0 %	0 %	0 %	550900058
15110	NC_022569	GCT	2	6	713548	713553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900059
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15123	NC_022569	ATT	2	6	714137	714142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550900059
15124	NC_022569	CGG	2	6	714178	714183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900059
15125	NC_022569	GCC	2	6	714244	714249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900060
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15127	NC_022569	CAC	2	6	714340	714345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550900060
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15131	NC_022569	GGA	2	6	714469	714474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550900060
15132	NC_022569	ATC	2	6	714491	714496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550900060
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15138	NC_022569	CGG	2	6	714780	714785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900060
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15154	NC_022569	ATC	2	6	715379	715384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550900060
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15158	NC_022569	ATA	2	6	715505	715510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15159	NC_022569	CCG	2	6	715523	715528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15160	NC_022569	ATG	2	6	715562	715567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15161	NC_022569	GC	3	6	715570	715575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15162	NC_022569	ACG	2	6	715589	715594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15164	NC_022569	TTATT	2	10	715812	715821	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15165	NC_022569	TGT	2	6	715830	715835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15166	NC_022569	TTTGT	2	10	715838	715847	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
15167	NC_022569	T	6	6	715849	715854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15168	NC_022569	TTA	2	6	715863	715868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15169	NC_022569	CT	3	6	715919	715924	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15170	NC_022569	ATT	2	6	715928	715933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15171	NC_022569	TGT	2	6	715971	715976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15172	NC_022569	TAT	2	6	715977	715982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15173	NC_022569	GTAT	2	8	716003	716010	25 %	50 %	25 %	0 %	550900061
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15186	NC_022569	TAGA	2	8	716630	716637	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15187	NC_022569	TTG	2	6	716706	716711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15223	NC_022569	TG	3	6	718340	718345	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15224	NC_022569	CG	3	6	718346	718351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15225	NC_022569	GAA	2	6	718410	718415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15226	NC_022569	CTG	2	6	718447	718452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900065
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15230	NC_022569	TACG	2	8	718496	718503	25 %	25 %	25 %	25 %	550900065
15231	NC_022569	AAGA	2	8	718573	718580	75 %	0 %	25 %	0 %	550900065
15232	NC_022569	A	7	7	718654	718660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15233	NC_022569	T	8	8	718676	718683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15234	NC_022569	GAA	2	6	718755	718760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550900066
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15239	NC_022569	CGG	2	6	719114	719119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900066
15240	NC_022569	GC	3	6	719140	719145	0 %	0 %	50 %	50 %	550900066
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15242	NC_022569	TGA	2	6	719278	719283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550900066
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15245	NC_022569	GCG	2	6	719387	719392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900066
15246	NC_022569	CAGA	2	8	719475	719482	50 %	0 %	25 %	25 %	550900066
15247	NC_022569	CCG	2	6	719536	719541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900066
15248	NC_022569	GTA	2	6	719572	719577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550900066
15249	NC_022569	GCGT	2	8	719679	719686	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15250	NC_022569	TTCAA	2	10	719717	719726	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15251	NC_022569	AGC	2	6	719795	719800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15252	NC_022569	GTT	3	9	719827	719835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15253	NC_022569	GAT	2	6	719898	719903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550900067
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15259	NC_022569	TGT	2	6	720169	720174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550900067
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15270	NC_022569	ATTC	2	8	720850	720857	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15271	NC_022569	TAT	2	6	720859	720864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15272	NC_022569	AAT	2	6	720866	720871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15273	NC_022569	GGTT	2	8	720900	720907	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15274	NC_022569	ATAAG	2	10	720946	720955	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15275	NC_022569	TCA	2	6	720993	720998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15277	NC_022569	GGC	2	6	721025	721030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15278	NC_022569	CAG	2	6	721033	721038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15279	NC_022569	G	6	6	721063	721068	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15280	NC_022569	AT	3	6	721089	721094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15281	NC_022569	AGC	2	6	721141	721146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900068
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15283	NC_022569	ATT	2	6	721165	721170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550900068
15284	NC_022569	CTTC	2	8	721227	721234	0 %	50 %	0 %	50 %	550900068
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15287	NC_022569	GC	3	6	721409	721414	0 %	0 %	50 %	50 %	550900068
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15297	NC_022569	A	6	6	721802	721807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15303	NC_022569	AAC	2	6	722171	722176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15304	NC_022569	TTAAT	2	10	722274	722283	40 %	60 %	0 %	0 %	550900070
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15489	NC_022569	TTC	2	6	731053	731058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550900078
15490	NC_022569	AT	3	6	731162	731167	50 %	50 %	0 %	0 %	550900078
15491	NC_022569	GC	3	6	731175	731180	0 %	0 %	50 %	50 %	550900078
15492	NC_022569	GCG	2	6	731205	731210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900078
15493	NC_022569	ATA	2	6	731225	731230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550900078
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