MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium DT104 main chromosome

Total Repeats: 103989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_022569	GCT	3	9	685942	685950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900033
14503	NC_022569	CGC	2	6	685953	685958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900033
14504	NC_022569	CT	3	6	685967	685972	0 %	50 %	0 %	50 %	550900033
14505	NC_022569	TTG	2	6	686061	686066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550900033
14506	NC_022569	ACCGG	2	10	686072	686081	20 %	0 %	40 %	40 %	550900033
14507	NC_022569	TTA	2	6	686112	686117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550900033
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14509	NC_022569	TCC	2	6	686159	686164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	550900033
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14511	NC_022569	AGGCC	2	10	686194	686203	20 %	0 %	40 %	40 %	550900033
14512	NC_022569	CGG	2	6	686218	686223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900033
14513	NC_022569	TCG	2	6	686241	686246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900033
14514	NC_022569	TAT	2	6	686272	686277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550900033
14515	NC_022569	GGT	2	6	686365	686370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550900033
14516	NC_022569	AGT	2	6	686372	686377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550900033
14517	NC_022569	ATG	2	6	686516	686521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550900033
14518	NC_022569	CGG	2	6	686577	686582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900033
14519	NC_022569	GCG	2	6	686600	686605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900033
14520	NC_022569	TTG	2	6	686624	686629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550900033
14521	NC_022569	TGCT	2	8	686679	686686	0 %	50 %	25 %	25 %	550900033
14522	NC_022569	TCC	2	6	686718	686723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	550900033
14523	NC_022569	GCT	2	6	686887	686892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900033
14524	NC_022569	CGG	2	6	686907	686912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900033
14525	NC_022569	GAT	2	6	686980	686985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550900033
14526	NC_022569	CCG	2	6	687002	687007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900033
14527	NC_022569	TCT	2	6	687072	687077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550900033
14528	NC_022569	TGG	3	9	687081	687089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550900033
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14530	NC_022569	TCT	2	6	687105	687110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550900033
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14535	NC_022569	TGG	2	6	687460	687465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550900034
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14538	NC_022569	TGC	2	6	687482	687487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900034
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14541	NC_022569	CGG	2	6	687648	687653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900035
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14543	NC_022569	GC	3	6	687753	687758	0 %	0 %	50 %	50 %	550900035
14544	NC_022569	GCG	3	9	687848	687856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900035
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14560	NC_022569	CGC	3	9	688326	688334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900035
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14565	NC_022569	GCCGG	2	10	688577	688586	0 %	0 %	60 %	40 %	550900035
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14569	NC_022569	GTT	2	6	688643	688648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14570	NC_022569	GT	3	6	688703	688708	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14571	NC_022569	CAA	2	6	688709	688714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14572	NC_022569	GC	3	6	688811	688816	0 %	0 %	50 %	50 %	550900036
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14582	NC_022569	TCA	2	6	689523	689528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550900036
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14585	NC_022569	GCGCC	2	10	689585	689594	0 %	0 %	40 %	60 %	550900036
14586	NC_022569	CG	3	6	689605	689610	0 %	0 %	50 %	50 %	550900036
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14592	NC_022569	GCC	2	6	689809	689814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900036
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14602	NC_022569	CGG	2	6	690319	690324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900037
14603	NC_022569	GGC	2	6	690448	690453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550900037
14604	NC_022569	TCCTC	2	10	690456	690465	0 %	40 %	0 %	60 %	550900037
14605	NC_022569	AG	3	6	690478	690483	50 %	0 %	50 %	0 %	550900037
14606	NC_022569	CGTT	2	8	690553	690560	0 %	50 %	25 %	25 %	550900038
14607	NC_022569	ACG	2	6	690653	690658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900038
14608	NC_022569	CG	3	6	690665	690670	0 %	0 %	50 %	50 %	550900038
14609	NC_022569	TGC	2	6	690685	690690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550900038
14610	NC_022569	T	6	6	690714	690719	0 %	100 %	0 %	0 %	550900038
14611	NC_022569	TTA	2	6	690748	690753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550900038
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14987	NC_022569	TGG	2	6	708281	708286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550900054
14988	NC_022569	CCG	2	6	708373	708378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900054
14989	NC_022569	CCG	2	6	708434	708439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900054
14990	NC_022569	CAG	2	6	708453	708458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900054
14991	NC_022569	TTTG	2	8	708501	708508	0 %	75 %	25 %	0 %	550900054
14992	NC_022569	CTT	2	6	708518	708523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550900054
14993	NC_022569	GATCA	2	10	708534	708543	40 %	20 %	20 %	20 %	550900054
14994	NC_022569	GCA	2	6	708584	708589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550900054
14995	NC_022569	CCA	2	6	708632	708637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550900054
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14997	NC_022569	CGC	2	6	708743	708748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900054
14998	NC_022569	CCG	2	6	708769	708774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550900054
14999	NC_022569	CAGC	2	8	708797	708804	25 %	0 %	25 %	50 %	550900054
15000	NC_022569	TTC	2	6	708819	708824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550900054

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