MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium DT104 main chromosome

Total Repeats: 103989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_022569	TCT	2	6	594379	594384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550899946
12503	NC_022569	CCG	2	6	594402	594407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899946
12504	NC_022569	GTG	2	6	594420	594425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550899946
12505	NC_022569	CCA	2	6	594433	594438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550899946
12506	NC_022569	T	6	6	594485	594490	0 %	100 %	0 %	0 %	550899946
12507	NC_022569	CAC	2	6	594605	594610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550899946
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12509	NC_022569	GATCGT	2	12	594637	594648	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	550899946
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12511	NC_022569	TAACT	2	10	594686	594695	40 %	40 %	0 %	20 %	550899946
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12513	NC_022569	A	6	6	594764	594769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_022569	ATA	3	9	594851	594859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12515	NC_022569	T	7	7	594903	594909	0 %	100 %	0 %	0 %	550899947
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12540	NC_022569	TTA	2	6	596214	596219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12543	NC_022569	GTT	2	6	596394	596399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12552	NC_022569	TA	3	6	596697	596702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12593	NC_022569	AGCC	2	8	598612	598619	25 %	0 %	25 %	50 %	550899948
12594	NC_022569	GTC	2	6	598633	598638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899948
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12608	NC_022569	TCA	2	6	599295	599300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12622	NC_022569	ACGCG	2	10	600015	600024	20 %	0 %	40 %	40 %	550899950
12623	NC_022569	CCAG	2	8	600025	600032	25 %	0 %	25 %	50 %	550899950
12624	NC_022569	CCA	2	6	600035	600040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550899950
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12643	NC_022569	TGG	2	6	600723	600728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550899951
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12654	NC_022569	C	6	6	601247	601252	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12655	NC_022569	TTA	2	6	601253	601258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12657	NC_022569	CGA	2	6	601363	601368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899952
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12726	NC_022569	CGTT	2	8	604600	604607	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12727	NC_022569	GCC	2	6	604654	604659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12728	NC_022569	GA	3	6	604683	604688	50 %	0 %	50 %	0 %	550899956
12729	NC_022569	A	6	6	604799	604804	100 %	0 %	0 %	0 %	550899956
12730	NC_022569	CGG	2	6	604924	604929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899956
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12734	NC_022569	CGAC	2	8	605107	605114	25 %	0 %	25 %	50 %	550899956
12735	NC_022569	GTTTT	2	10	605115	605124	0 %	80 %	20 %	0 %	550899956
12736	NC_022569	GGC	2	6	605162	605167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899956
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12739	NC_022569	GCT	2	6	605416	605421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899957
12740	NC_022569	GTTTT	2	10	605535	605544	0 %	80 %	20 %	0 %	550899957
12741	NC_022569	GCT	2	6	605650	605655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899957
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12864	NC_022569	CGG	2	6	611615	611620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899961
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12867	NC_022569	TGG	2	6	611720	611725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550899961
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12952	NC_022569	T	6	6	616235	616240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12985	NC_022569	GCG	2	6	617877	617882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899968
12986	NC_022569	CCG	2	6	617984	617989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899968
12987	NC_022569	CGC	2	6	618010	618015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899968
12988	NC_022569	CCGT	2	8	618073	618080	0 %	25 %	25 %	50 %	550899968
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