MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium DT104 main chromosome

Total Repeats: 103989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12005	NC_022569	GGT	2	6	571624	571629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550899929
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12118	NC_022569	TTC	2	6	576937	576942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550899932
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12120	NC_022569	GTT	2	6	576966	576971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550899932
12121	NC_022569	GCG	2	6	576981	576986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899932
12122	NC_022569	GCG	2	6	577025	577030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899932
12123	NC_022569	CGTC	2	8	577074	577081	0 %	25 %	25 %	50 %	550899932
12124	NC_022569	CCG	2	6	577177	577182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899932
12125	NC_022569	TGC	2	6	577184	577189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899932
12126	NC_022569	GTC	2	6	577211	577216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899932
12127	NC_022569	A	6	6	577326	577331	100 %	0 %	0 %	0 %	550899932
12128	NC_022569	ACC	2	6	577340	577345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550899932
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12130	NC_022569	AG	3	6	577490	577495	50 %	0 %	50 %	0 %	550899932
12131	NC_022569	CAA	2	6	577533	577538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550899932
12132	NC_022569	TCT	2	6	577589	577594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550899932
12133	NC_022569	GCG	2	6	577665	577670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899932
12134	NC_022569	TGG	2	6	577671	577676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550899932
12135	NC_022569	TTG	2	6	577700	577705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550899932
12136	NC_022569	GTC	2	6	577774	577779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899932
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12138	NC_022569	AGC	2	6	577868	577873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899932
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12142	NC_022569	GCG	3	9	578163	578171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899933
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12144	NC_022569	GCCA	2	8	578241	578248	25 %	0 %	25 %	50 %	550899933
12145	NC_022569	CGA	2	6	578293	578298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899933
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12148	NC_022569	GCG	2	6	578398	578403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899933
12149	NC_022569	CT	3	6	578430	578435	0 %	50 %	0 %	50 %	550899933
12150	NC_022569	TTCAA	2	10	578463	578472	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12151	NC_022569	ATC	2	6	578554	578559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12152	NC_022569	TGGC	3	12	578562	578573	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12153	NC_022569	GTA	2	6	578575	578580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12154	NC_022569	GGC	2	6	578637	578642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12155	NC_022569	TCG	2	6	578659	578664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12156	NC_022569	GTT	2	6	578682	578687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550899934
12157	NC_022569	GCC	2	6	578742	578747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899934
12158	NC_022569	ATG	2	6	578815	578820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550899934
12159	NC_022569	GGGTGC	2	12	578822	578833	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	550899934
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12161	NC_022569	TGAT	2	8	578885	578892	25 %	50 %	25 %	0 %	550899934
12162	NC_022569	CAA	2	6	578899	578904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550899934
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12164	NC_022569	AT	3	6	579058	579063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12165	NC_022569	CAG	2	6	579081	579086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899935
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12168	NC_022569	TGGGC	2	10	579293	579302	0 %	20 %	60 %	20 %	550899935
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12177	NC_022569	CGT	2	6	579781	579786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899936
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12213	NC_022569	GC	3	6	581102	581107	0 %	0 %	50 %	50 %	550899936
12214	NC_022569	AAAG	2	8	581140	581147	75 %	0 %	25 %	0 %	550899936
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12222	NC_022569	CTTT	2	8	581315	581322	0 %	75 %	0 %	25 %	550899936
12223	NC_022569	TGG	2	6	581331	581336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550899936
12224	NC_022569	GCG	2	6	581424	581429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899936
12225	NC_022569	GCA	2	6	581431	581436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899936
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12227	NC_022569	GAT	2	6	581498	581503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550899936
12228	NC_022569	CGC	2	6	581520	581525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899936
12229	NC_022569	ATT	2	6	581579	581584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550899936
12230	NC_022569	ATA	2	6	581589	581594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550899936
12231	NC_022569	TTC	2	6	581615	581620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550899936
12232	NC_022569	AG	3	6	581638	581643	50 %	0 %	50 %	0 %	550899936
12233	NC_022569	AG	5	10	581692	581701	50 %	0 %	50 %	0 %	550899937
12234	NC_022569	TGA	2	6	581733	581738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550899937
12235	NC_022569	CAG	2	6	581747	581752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899937
12236	NC_022569	A	6	6	581760	581765	100 %	0 %	0 %	0 %	550899937
12237	NC_022569	GC	3	6	581847	581852	0 %	0 %	50 %	50 %	550899937
12238	NC_022569	GCC	2	6	581859	581864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899937
12239	NC_022569	CTG	2	6	581885	581890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899937
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12241	NC_022569	CGC	2	6	581948	581953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899937
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12486	NC_022569	CTT	2	6	593565	593570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12487	NC_022569	CG	3	6	593639	593644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12488	NC_022569	TGA	2	6	593665	593670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12489	NC_022569	GCG	3	9	593671	593679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12490	NC_022569	GGT	2	6	593783	593788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12491	NC_022569	CCG	2	6	593800	593805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12492	NC_022569	GCG	2	6	593962	593967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12493	NC_022569	GCG	3	9	594069	594077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12494	NC_022569	GGTGA	2	10	594090	594099	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12495	NC_022569	GCTG	2	8	594100	594107	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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12497	NC_022569	CTG	2	6	594169	594174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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