MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium DT104 main chromosome

Total Repeats: 103989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_022569	CGA	2	6	549138	549143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899906
11502	NC_022569	TGGCG	2	10	549160	549169	0 %	20 %	60 %	20 %	550899906
11503	NC_022569	CGT	2	6	549187	549192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899906
11504	NC_022569	CTG	2	6	549194	549199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899906
11505	NC_022569	A	6	6	549242	549247	100 %	0 %	0 %	0 %	550899906
11506	NC_022569	TGA	2	6	549300	549305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550899906
11507	NC_022569	AAAATC	2	12	549326	549337	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	550899906
11508	NC_022569	CAG	2	6	549353	549358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899906
11509	NC_022569	TCG	2	6	549362	549367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11510	NC_022569	A	6	6	549379	549384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_022569	AACA	2	8	549490	549497	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11512	NC_022569	TTA	2	6	549536	549541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550899907
11513	NC_022569	CTTT	2	8	549544	549551	0 %	75 %	0 %	25 %	550899907
11514	NC_022569	GC	3	6	549575	549580	0 %	0 %	50 %	50 %	550899907
11515	NC_022569	GGC	2	6	549582	549587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899907
11516	NC_022569	A	6	6	549600	549605	100 %	0 %	0 %	0 %	550899907
11517	NC_022569	CTT	2	6	549635	549640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550899907
11518	NC_022569	TCC	2	6	549643	549648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	550899907
11519	NC_022569	GAT	2	6	549679	549684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550899907
11520	NC_022569	GGA	2	6	549720	549725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550899907
11521	NC_022569	TGA	2	6	549737	549742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550899907
11522	NC_022569	A	6	6	549757	549762	100 %	0 %	0 %	0 %	550899907
11523	NC_022569	GAG	2	6	549787	549792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550899907
11524	NC_022569	GAT	2	6	549814	549819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550899907
11525	NC_022569	GC	3	6	549845	549850	0 %	0 %	50 %	50 %	550899907
11526	NC_022569	TGG	2	6	549851	549856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550899907
11527	NC_022569	AAC	3	9	549964	549972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11528	NC_022569	ATC	2	6	550017	550022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550899908
11529	NC_022569	TAA	2	6	550042	550047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550899908
11530	NC_022569	GAA	2	6	550070	550075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550899908
11531	NC_022569	TGG	2	6	550143	550148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550899908
11532	NC_022569	CGG	2	6	550176	550181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899908
11533	NC_022569	CCAG	2	8	550206	550213	25 %	0 %	25 %	50 %	550899908
11534	NC_022569	ACA	2	6	550216	550221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550899908
11535	NC_022569	GCG	2	6	550236	550241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899908
11536	NC_022569	GGT	2	6	550279	550284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550899908
11537	NC_022569	TCA	2	6	550296	550301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550899908
11538	NC_022569	GTTT	2	8	550303	550310	0 %	75 %	25 %	0 %	550899908
11539	NC_022569	GTGC	2	8	550465	550472	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11540	NC_022569	GCC	2	6	550473	550478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11541	NC_022569	T	6	6	550507	550512	0 %	100 %	0 %	0 %	550899909
11542	NC_022569	TGC	2	6	550520	550525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899909
11543	NC_022569	CCG	2	6	550531	550536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899909
11544	NC_022569	GC	3	6	550569	550574	0 %	0 %	50 %	50 %	550899909
11545	NC_022569	AAT	2	6	550666	550671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550899909
11546	NC_022569	CGC	2	6	550865	550870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899909
11547	NC_022569	GCT	2	6	550970	550975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899909
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11549	NC_022569	GC	3	6	551017	551022	0 %	0 %	50 %	50 %	550899909
11550	NC_022569	CG	3	6	551049	551054	0 %	0 %	50 %	50 %	550899909
11551	NC_022569	TCA	2	6	551109	551114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550899909
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11553	NC_022569	ACA	2	6	551169	551174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550899909
11554	NC_022569	CTT	2	6	551248	551253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550899910
11555	NC_022569	GGC	2	6	551263	551268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899910
11556	NC_022569	CATC	2	8	551384	551391	25 %	25 %	0 %	50 %	550899910
11557	NC_022569	TTG	2	6	551406	551411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550899910
11558	NC_022569	GCGCG	2	10	551414	551423	0 %	0 %	60 %	40 %	550899910
11559	NC_022569	CAT	2	6	551577	551582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550899910
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11561	NC_022569	TCA	2	6	551752	551757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550899910
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11564	NC_022569	ATG	2	6	551853	551858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550899910
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11566	NC_022569	CGC	2	6	551875	551880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899910
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11579	NC_022569	TAG	2	6	552571	552576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550899910
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11585	NC_022569	CGG	2	6	552899	552904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11586	NC_022569	AAC	2	6	553017	553022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11587	NC_022569	GCA	2	6	553066	553071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899911
11588	NC_022569	ATGG	2	8	553078	553085	25 %	25 %	50 %	0 %	550899911
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11591	NC_022569	CTTAT	2	10	553232	553241	20 %	60 %	0 %	20 %	550899911
11592	NC_022569	TGC	2	6	553283	553288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899911
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11596	NC_022569	CGGG	2	8	553722	553729	0 %	0 %	75 %	25 %	550899911
11597	NC_022569	ATGCC	2	10	553745	553754	20 %	20 %	20 %	40 %	550899911
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11600	NC_022569	T	8	8	553909	553916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11609	NC_022569	TCG	2	6	554389	554394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899912
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11611	NC_022569	GTTCA	2	10	554549	554558	20 %	40 %	20 %	20 %	550899912
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11619	NC_022569	CCG	2	6	554911	554916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899912
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11984	NC_022569	ACC	2	6	570558	570563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550899928
11985	NC_022569	CGCAT	2	10	570667	570676	20 %	20 %	20 %	40 %	550899928
11986	NC_022569	GGC	2	6	570741	570746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899928
11987	NC_022569	TCC	2	6	570763	570768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	550899928
11988	NC_022569	CTGAAC	2	12	570897	570908	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	550899928
11989	NC_022569	GGA	2	6	570981	570986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550899928
11990	NC_022569	CTG	2	6	571094	571099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899928
11991	NC_022569	TCG	2	6	571109	571114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899928
11992	NC_022569	C	6	6	571149	571154	0 %	0 %	0 %	100 %	550899928
11993	NC_022569	ATG	4	12	571162	571173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550899928
11994	NC_022569	CGAT	2	8	571198	571205	25 %	25 %	25 %	25 %	550899928
11995	NC_022569	TTAAG	2	10	571238	571247	40 %	40 %	20 %	0 %	550899929
11996	NC_022569	TGTT	2	8	571286	571293	0 %	75 %	25 %	0 %	550899929
11997	NC_022569	GAC	2	6	571354	571359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899929
11998	NC_022569	GTCA	2	8	571384	571391	25 %	25 %	25 %	25 %	550899929
11999	NC_022569	CGA	2	6	571422	571427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899929
12000	NC_022569	ACC	2	6	571460	571465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550899929

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