MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium DT104 main chromosome

Total Repeats: 103989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10504	NC_022569	GAA	2	6	502320	502325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550899862
10505	NC_022569	CGAA	2	8	502393	502400	50 %	0 %	25 %	25 %	550899862
10506	NC_022569	GTT	2	6	502415	502420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550899862
10507	NC_022569	TGCG	2	8	502423	502430	0 %	25 %	50 %	25 %	550899862
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10511	NC_022569	AACG	2	8	502725	502732	50 %	0 %	25 %	25 %	550899862
10512	NC_022569	AGA	2	6	502739	502744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550899862
10513	NC_022569	CAG	2	6	502767	502772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899862
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10517	NC_022569	GAG	2	6	502999	503004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550899862
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10539	NC_022569	ATGG	2	8	504232	504239	25 %	25 %	50 %	0 %	550899864
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10610	NC_022569	ATC	2	6	508192	508197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10618	NC_022569	A	6	6	508561	508566	100 %	0 %	0 %	0 %	550899870
10619	NC_022569	GAA	2	6	508636	508641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550899870
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10622	NC_022569	ACCCTA	2	12	508730	508741	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	550899871
10623	NC_022569	TCG	2	6	508775	508780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899871
10624	NC_022569	GGCG	2	8	508839	508846	0 %	0 %	75 %	25 %	550899871
10625	NC_022569	CAT	2	6	508894	508899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550899871
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10627	NC_022569	CGGC	2	8	508934	508941	0 %	0 %	50 %	50 %	550899871
10628	NC_022569	CG	4	8	508944	508951	0 %	0 %	50 %	50 %	550899871
10629	NC_022569	CGC	2	6	508956	508961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899871
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10634	NC_022569	TGCG	2	8	509213	509220	0 %	25 %	50 %	25 %	550899871
10635	NC_022569	GCA	2	6	509400	509405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899871
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10637	NC_022569	CG	3	6	509446	509451	0 %	0 %	50 %	50 %	550899871
10638	NC_022569	TGA	2	6	509516	509521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550899871
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10641	NC_022569	TGC	2	6	509588	509593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899871
10642	NC_022569	TGG	2	6	509603	509608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550899871
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10647	NC_022569	C	6	6	509820	509825	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10648	NC_022569	AG	3	6	509849	509854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10743	NC_022569	TTC	2	6	514622	514627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550899877
10744	NC_022569	T	6	6	514674	514679	0 %	100 %	0 %	0 %	550899877
10745	NC_022569	AGA	2	6	514694	514699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550899877
10746	NC_022569	GTT	2	6	514733	514738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550899877
10747	NC_022569	GC	3	6	514741	514746	0 %	0 %	50 %	50 %	550899877
10748	NC_022569	CGG	2	6	514843	514848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899877
10749	NC_022569	CA	3	6	514868	514873	50 %	0 %	0 %	50 %	550899877
10750	NC_022569	GCG	2	6	514880	514885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899877
10751	NC_022569	CTT	2	6	514894	514899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550899877
10752	NC_022569	CCG	2	6	514903	514908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899877
10753	NC_022569	ATACCG	2	12	514917	514928	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	550899877
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10755	NC_022569	CGA	2	6	515040	515045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899877
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10757	NC_022569	GCG	2	6	515204	515209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899877
10758	NC_022569	TCG	2	6	515214	515219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899877
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10760	NC_022569	AGGGT	2	10	515283	515292	20 %	20 %	60 %	0 %	550899877
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10863	NC_022569	CCA	2	6	520390	520395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550899883
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10865	NC_022569	CG	3	6	520450	520455	0 %	0 %	50 %	50 %	550899883
10866	NC_022569	CG	3	6	520469	520474	0 %	0 %	50 %	50 %	550899883
10867	NC_022569	TGC	2	6	520491	520496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899883
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