MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium DT104 main chromosome

Total Repeats: 103989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_022569	CTG	2	6	479873	479878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_022569	ACG	2	6	479943	479948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10003	NC_022569	TAA	2	6	479952	479957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_022569	CGT	2	6	479977	479982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899844
10005	NC_022569	CGA	2	6	480047	480052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899844
10006	NC_022569	ACA	2	6	480053	480058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550899844
10007	NC_022569	CAT	2	6	480066	480071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550899844
10008	NC_022569	CTG	2	6	480075	480080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899844
10009	NC_022569	CGA	2	6	480131	480136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899844
10010	NC_022569	TGA	2	6	480256	480261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550899844
10011	NC_022569	TAT	2	6	480320	480325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550899844
10012	NC_022569	TGGA	2	8	480349	480356	25 %	25 %	50 %	0 %	550899844
10013	NC_022569	GGC	2	6	480395	480400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899844
10014	NC_022569	A	6	6	480408	480413	100 %	0 %	0 %	0 %	550899844
10015	NC_022569	GCC	2	6	480431	480436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899844
10016	NC_022569	TCA	2	6	480548	480553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550899844
10017	NC_022569	CAG	2	6	480573	480578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899844
10018	NC_022569	CT	3	6	480600	480605	0 %	50 %	0 %	50 %	550899844
10019	NC_022569	TTAAT	2	10	480689	480698	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_022569	CAG	2	6	480771	480776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899845
10021	NC_022569	CCGG	2	8	480782	480789	0 %	0 %	50 %	50 %	550899845
10022	NC_022569	CCG	2	6	480833	480838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899845
10023	NC_022569	GCG	2	6	480863	480868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899845
10024	NC_022569	CGG	2	6	481019	481024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_022569	GCGCT	2	10	481043	481052	0 %	20 %	40 %	40 %	550899846
10026	NC_022569	CGC	2	6	481054	481059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899846
10027	NC_022569	CCA	2	6	481069	481074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550899846
10028	NC_022569	GCC	2	6	481089	481094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899846
10029	NC_022569	TCA	2	6	481105	481110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550899846
10030	NC_022569	GCT	2	6	481237	481242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899846
10031	NC_022569	TCG	2	6	481299	481304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899846
10032	NC_022569	CG	3	6	481325	481330	0 %	0 %	50 %	50 %	550899846
10033	NC_022569	CGC	2	6	481336	481341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899846
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10037	NC_022569	CAT	2	6	481568	481573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550899846
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10039	NC_022569	CG	4	8	481595	481602	0 %	0 %	50 %	50 %	550899846
10040	NC_022569	GCA	2	6	481603	481608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899846
10041	NC_022569	TCT	2	6	481648	481653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550899846
10042	NC_022569	TCT	2	6	481737	481742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550899846
10043	NC_022569	GC	4	8	481745	481752	0 %	0 %	50 %	50 %	550899846
10044	NC_022569	ATA	2	6	481755	481760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550899846
10045	NC_022569	CGG	2	6	481808	481813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899846
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10047	NC_022569	A	6	6	482058	482063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_022569	GAG	2	6	482065	482070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_022569	GGC	2	6	482098	482103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899847
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10052	NC_022569	CGC	2	6	482168	482173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899847
10053	NC_022569	GGA	2	6	482175	482180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550899847
10054	NC_022569	GGCATT	2	12	482257	482268	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	550899847
10055	NC_022569	TC	4	8	482275	482282	0 %	50 %	0 %	50 %	550899847
10056	NC_022569	GTG	2	6	482296	482301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550899847
10057	NC_022569	CGT	2	6	482356	482361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899847
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10059	NC_022569	CGG	2	6	482514	482519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899847
10060	NC_022569	TGGA	2	8	482560	482567	25 %	25 %	50 %	0 %	550899847
10061	NC_022569	GAA	2	6	482590	482595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	550899847
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10064	NC_022569	TGA	2	6	482876	482881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550899847
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10068	NC_022569	GCGCG	2	10	482952	482961	0 %	0 %	60 %	40 %	550899847
10069	NC_022569	GTT	2	6	482987	482992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10091	NC_022569	A	6	6	483853	483858	100 %	0 %	0 %	0 %	550899848
10092	NC_022569	ACA	2	6	483963	483968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550899848
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10099	NC_022569	GC	3	6	484209	484214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10100	NC_022569	ATT	2	6	484302	484307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_022569	T	7	7	484402	484408	0 %	100 %	0 %	0 %	550899849
10102	NC_022569	GCG	2	6	484509	484514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899849
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10109	NC_022569	CTT	2	6	484825	484830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	550899849
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10113	NC_022569	CGTGT	2	10	484965	484974	0 %	40 %	40 %	20 %	550899849
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10118	NC_022569	CAGC	2	8	485071	485078	25 %	0 %	25 %	50 %	550899849
10119	NC_022569	GC	3	6	485092	485097	0 %	0 %	50 %	50 %	550899849
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10121	NC_022569	TGT	3	9	485136	485144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550899849
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10233	NC_022569	T	6	6	490023	490028	0 %	100 %	0 %	0 %	550899852
10234	NC_022569	GGC	2	6	490179	490184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899852
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10237	NC_022569	CG	3	6	490236	490241	0 %	0 %	50 %	50 %	550899852
10238	NC_022569	ATG	2	6	490346	490351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550899852
10239	NC_022569	GA	3	6	490380	490385	50 %	0 %	50 %	0 %	550899852
10240	NC_022569	CGTAT	2	10	490413	490422	20 %	40 %	20 %	20 %	550899852
10241	NC_022569	AAC	2	6	490437	490442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550899852
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10246	NC_022569	CGA	2	6	490579	490584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899852
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10263	NC_022569	AG	3	6	491671	491676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10264	NC_022569	GGA	2	6	491713	491718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10265	NC_022569	TATT	2	8	491719	491726	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10266	NC_022569	TGG	2	6	491763	491768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10267	NC_022569	T	6	6	491769	491774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10272	NC_022569	ACA	2	6	492048	492053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10273	NC_022569	CG	3	6	492099	492104	0 %	0 %	50 %	50 %	550899854
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10363	NC_022569	GCA	2	6	495796	495801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899856
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10483	NC_022569	CGC	2	6	501478	501483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899862
10484	NC_022569	GGC	2	6	501491	501496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899862
10485	NC_022569	CCGAT	2	10	501505	501514	20 %	20 %	20 %	40 %	550899862
10486	NC_022569	GCG	3	9	501535	501543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899862
10487	NC_022569	TGGATA	2	12	501562	501573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550899862
10488	NC_022569	ACC	2	6	501648	501653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550899862
10489	NC_022569	AAT	2	6	501666	501671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550899862
10490	NC_022569	TGA	2	6	501710	501715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550899862
10491	NC_022569	CGC	2	6	501733	501738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899862
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