MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium DT104 main chromosome

Total Repeats: 103989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_022569	GCG	2	6	328208	328213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899700
7002	NC_022569	GGC	2	6	328216	328221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899700
7003	NC_022569	GTG	2	6	328268	328273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550899700
7004	NC_022569	ACG	2	6	328295	328300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899700
7005	NC_022569	GTA	2	6	328350	328355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550899700
7006	NC_022569	GCGT	2	8	328366	328373	0 %	25 %	50 %	25 %	550899700
7007	NC_022569	GGCA	2	8	328411	328418	25 %	0 %	50 %	25 %	550899700
7008	NC_022569	GCA	2	6	328442	328447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899700
7009	NC_022569	TGG	2	6	328483	328488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550899700
7010	NC_022569	A	7	7	328492	328498	100 %	0 %	0 %	0 %	550899700
7011	NC_022569	GT	3	6	328624	328629	0 %	50 %	50 %	0 %	550899701
7012	NC_022569	ATCC	2	8	328634	328641	25 %	25 %	0 %	50 %	550899701
7013	NC_022569	AAC	2	6	328681	328686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550899701
7014	NC_022569	A	7	7	328697	328703	100 %	0 %	0 %	0 %	550899701
7015	NC_022569	AGG	2	6	328803	328808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	550899701
7016	NC_022569	TAT	2	6	328857	328862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	550899701
7017	NC_022569	ACC	2	6	328918	328923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550899701
7018	NC_022569	GAT	2	6	328953	328958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550899702
7019	NC_022569	GACT	2	8	328967	328974	25 %	25 %	25 %	25 %	550899702
7020	NC_022569	GT	3	6	329061	329066	0 %	50 %	50 %	0 %	550899702
7021	NC_022569	GCG	2	6	329074	329079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899702
7022	NC_022569	TGC	2	6	329139	329144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899702
7023	NC_022569	CAT	2	6	329162	329167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550899702
7024	NC_022569	GGT	2	6	329299	329304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550899702
7025	NC_022569	CCA	2	6	329321	329326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550899702
7026	NC_022569	TGG	2	6	329457	329462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550899702
7027	NC_022569	AACAA	2	10	329463	329472	80 %	0 %	0 %	20 %	550899702
7028	NC_022569	TGG	2	6	329537	329542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_022569	TTA	2	6	329595	329600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_022569	AATGC	2	10	329616	329625	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7031	NC_022569	TAA	2	6	329640	329645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_022569	ATA	2	6	329656	329661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_022569	TTAT	2	8	329679	329686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_022569	TATGT	2	10	329700	329709	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_022569	TTC	2	6	329760	329765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7036	NC_022569	TATT	2	8	329836	329843	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_022569	ATA	2	6	329891	329896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550899704
7038	NC_022569	GAC	2	6	329916	329921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899704
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7040	NC_022569	GCG	2	6	329992	329997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899704
7041	NC_022569	CCG	2	6	330002	330007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899704
7042	NC_022569	AGC	2	6	330075	330080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	550899704
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7044	NC_022569	CTG	2	6	330137	330142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899704
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7046	NC_022569	CGG	2	6	330225	330230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899704
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7048	NC_022569	TGG	2	6	330335	330340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550899704
7049	NC_022569	TGG	2	6	330372	330377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550899704
7050	NC_022569	CGG	2	6	330407	330412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899704
7051	NC_022569	GTG	2	6	330418	330423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550899704
7052	NC_022569	CTG	2	6	330478	330483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899704
7053	NC_022569	GTG	2	6	330523	330528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550899704
7054	NC_022569	TGG	2	6	330581	330586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550899704
7055	NC_022569	TGATTT	2	12	330630	330641	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	550899704
7056	NC_022569	TGG	2	6	330676	330681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550899704
7057	NC_022569	CGC	2	6	330755	330760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899704
7058	NC_022569	GAT	2	6	330856	330861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550899704
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7061	NC_022569	G	6	6	331038	331043	0 %	0 %	100 %	0 %	550899704
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7063	NC_022569	CTG	2	6	331123	331128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899704
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7067	NC_022569	CCGGC	2	10	331292	331301	0 %	0 %	40 %	60 %	550899704
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7070	NC_022569	CTG	2	6	331389	331394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899704
7071	NC_022569	GGGC	2	8	331415	331422	0 %	0 %	75 %	25 %	550899704
7072	NC_022569	GAT	2	6	331434	331439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550899704
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7087	NC_022569	GGC	2	6	332008	332013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899704
7088	NC_022569	CCG	2	6	332024	332029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	550899704
7089	NC_022569	C	6	6	332039	332044	0 %	0 %	0 %	100 %	550899704
7090	NC_022569	CCTG	2	8	332123	332130	0 %	25 %	25 %	50 %	550899705
7091	NC_022569	GAAC	2	8	332178	332185	50 %	0 %	25 %	25 %	550899705
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7094	NC_022569	A	8	8	332271	332278	100 %	0 %	0 %	0 %	550899705
7095	NC_022569	ATG	2	6	332332	332337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550899705
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7098	NC_022569	CTGG	2	8	332495	332502	0 %	25 %	50 %	25 %	550899705
7099	NC_022569	AAT	2	6	332527	332532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	550899705
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7102	NC_022569	GC	3	6	332593	332598	0 %	0 %	50 %	50 %	550899706
7103	NC_022569	ATC	2	6	332622	332627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550899706
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7107	NC_022569	CGG	2	6	332821	332826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899706
7108	NC_022569	CG	4	8	332827	332834	0 %	0 %	50 %	50 %	550899706
7109	NC_022569	CAGC	2	8	332912	332919	25 %	0 %	25 %	50 %	550899706
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7115	NC_022569	CGG	2	6	333086	333091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899706
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7119	NC_022569	ACC	2	6	333234	333239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550899706
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7121	NC_022569	GCCA	2	8	333315	333322	25 %	0 %	25 %	50 %	550899706
7122	NC_022569	GGC	2	6	333355	333360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899706
7123	NC_022569	CGATGA	2	12	333383	333394	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	550899706
7124	NC_022569	CCA	2	6	333461	333466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	550899706
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7138	NC_022569	TGA	2	6	333856	333861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550899706
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7141	NC_022569	CGG	3	9	333953	333961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899706
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7145	NC_022569	G	7	7	334164	334170	0 %	0 %	100 %	0 %	550899707
7146	NC_022569	GATC	2	8	334209	334216	25 %	25 %	25 %	25 %	550899707
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7173	NC_022569	GGA	2	6	335498	335503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7229	NC_022569	TGA	2	6	337789	337794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7232	NC_022569	TCA	2	6	338012	338017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7235	NC_022569	GTCA	2	8	338400	338407	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7236	NC_022569	TAA	2	6	338508	338513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7237	NC_022569	ATGT	2	8	338534	338541	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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7239	NC_022569	GTA	2	6	338614	338619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7241	NC_022569	T	7	7	338744	338750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7242	NC_022569	AT	3	6	338770	338775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7243	NC_022569	TTA	2	6	338833	338838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7244	NC_022569	T	6	6	338850	338855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7245	NC_022569	ATT	2	6	338903	338908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7246	NC_022569	A	6	6	338921	338926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7247	NC_022569	GGT	2	6	338927	338932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	550899714
7248	NC_022569	A	7	7	338951	338957	100 %	0 %	0 %	0 %	550899714
7249	NC_022569	ATG	2	6	338982	338987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	550899714
7250	NC_022569	GCT	2	6	338988	338993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899714
7251	NC_022569	GTT	2	6	338995	339000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	550899714
7252	NC_022569	CAA	2	6	339030	339035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	550899714
7253	NC_022569	CTA	2	6	339157	339162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	550899714
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7259	NC_022569	ATC	2	6	339494	339499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7495	NC_022569	CGG	2	6	351515	351520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899724
7496	NC_022569	GCG	2	6	351654	351659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	550899724
7497	NC_022569	GCT	2	6	351680	351685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	550899724
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