MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 101759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022544	G	6	6	139956	139961	0 %	0 %	100 %	0 %	549722844
3002	NC_022544	CATC	2	8	140065	140072	25 %	25 %	0 %	50 %	549722844
3003	NC_022544	CTG	2	6	140081	140086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722844
3004	NC_022544	CCTG	2	8	140095	140102	0 %	25 %	25 %	50 %	549722844
3005	NC_022544	ATT	2	6	140111	140116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722844
3006	NC_022544	GATG	2	8	140203	140210	25 %	25 %	50 %	0 %	549722844
3007	NC_022544	AAG	2	6	140265	140270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722844
3008	NC_022544	CAA	2	6	140290	140295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722844
3009	NC_022544	GAT	2	6	140408	140413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722845
3010	NC_022544	AC	3	6	140426	140431	50 %	0 %	0 %	50 %	549722845
3011	NC_022544	CGG	2	6	140510	140515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722845
3012	NC_022544	CGAT	2	8	140566	140573	25 %	25 %	25 %	25 %	549722845
3013	NC_022544	CAT	2	6	140627	140632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722845
3014	NC_022544	GCTG	2	8	140651	140658	0 %	25 %	50 %	25 %	549722845
3015	NC_022544	TCT	2	6	140721	140726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722845
3016	NC_022544	CG	3	6	140800	140805	0 %	0 %	50 %	50 %	549722845
3017	NC_022544	GCC	2	6	140814	140819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722845
3018	NC_022544	CGG	2	6	140833	140838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722845
3019	NC_022544	GAG	2	6	140877	140882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549722845
3020	NC_022544	TTG	2	6	140911	140916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722845
3021	NC_022544	GCG	3	9	140970	140978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722845
3022	NC_022544	GGA	2	6	141056	141061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549722845
3023	NC_022544	GCTC	2	8	141082	141089	0 %	25 %	25 %	50 %	549722845
3024	NC_022544	GGCG	2	8	141105	141112	0 %	0 %	75 %	25 %	549722845
3025	NC_022544	ATC	2	6	141120	141125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722845
3026	NC_022544	CGG	2	6	141196	141201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722845
3027	NC_022544	A	6	6	141228	141233	100 %	0 %	0 %	0 %	549722845
3028	NC_022544	AGTTC	2	10	141312	141321	20 %	40 %	20 %	20 %	549722845
3029	NC_022544	AG	3	6	141332	141337	50 %	0 %	50 %	0 %	549722845
3030	NC_022544	CAG	2	6	141352	141357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722846
3031	NC_022544	TGCCT	2	10	141412	141421	0 %	40 %	20 %	40 %	549722846
3032	NC_022544	CAT	2	6	141481	141486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722846
3033	NC_022544	CGG	2	6	141492	141497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722846
3034	NC_022544	GGT	2	6	141502	141507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722846
3035	NC_022544	ACG	2	6	141509	141514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722846
3036	NC_022544	GAA	2	6	141605	141610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722846
3037	NC_022544	GCA	2	6	141667	141672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722846
3038	NC_022544	AGC	2	6	141733	141738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722847
3039	NC_022544	GAA	2	6	141767	141772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722847
3040	NC_022544	TCA	2	6	141783	141788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722847
3041	NC_022544	T	7	7	141834	141840	0 %	100 %	0 %	0 %	549722847
3042	NC_022544	CG	3	6	141848	141853	0 %	0 %	50 %	50 %	549722847
3043	NC_022544	ACCG	2	8	141950	141957	25 %	0 %	25 %	50 %	549722847
3044	NC_022544	AAG	2	6	142014	142019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722847
3045	NC_022544	CGG	2	6	142030	142035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722847
3046	NC_022544	TTTA	2	8	142133	142140	25 %	75 %	0 %	0 %	549722847
3047	NC_022544	GC	3	6	142145	142150	0 %	0 %	50 %	50 %	549722847
3048	NC_022544	A	6	6	142181	142186	100 %	0 %	0 %	0 %	549722847
3049	NC_022544	CGC	2	6	142223	142228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722847
3050	NC_022544	TAC	2	6	142229	142234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722847
3051	NC_022544	GCGA	2	8	142341	142348	25 %	0 %	50 %	25 %	549722847
3052	NC_022544	TCC	2	6	142391	142396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549722847
3053	NC_022544	TGA	2	6	142435	142440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722847
3054	NC_022544	AAC	2	6	142472	142477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722847
3055	NC_022544	TGGCGA	2	12	142545	142556	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549722847
3056	NC_022544	CAA	2	6	142576	142581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722847
3057	NC_022544	TGG	2	6	142662	142667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722847
3058	NC_022544	TGA	2	6	142668	142673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722847
3059	NC_022544	GC	3	6	142760	142765	0 %	0 %	50 %	50 %	549722847
3060	NC_022544	TAG	2	6	142854	142859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722847
3061	NC_022544	TACT	2	8	142861	142868	25 %	50 %	0 %	25 %	549722847
3062	NC_022544	GGT	2	6	142944	142949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722847
3063	NC_022544	AG	3	6	142957	142962	50 %	0 %	50 %	0 %	549722847
3064	NC_022544	GTG	2	6	143126	143131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722847
3065	NC_022544	ATG	2	6	143135	143140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722847
3066	NC_022544	GCG	4	12	143160	143171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722847
3067	NC_022544	A	6	6	143222	143227	100 %	0 %	0 %	0 %	549722847
3068	NC_022544	CAA	2	6	143251	143256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722847
3069	NC_022544	TGG	2	6	143310	143315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722847
3070	NC_022544	TCA	2	6	143319	143324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722847
3071	NC_022544	TAC	2	6	143345	143350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722847
3072	NC_022544	GGC	2	6	143351	143356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722847
3073	NC_022544	CAT	2	6	143383	143388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722847
3074	NC_022544	GCG	2	6	143391	143396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722847
3075	NC_022544	A	7	7	143442	143448	100 %	0 %	0 %	0 %	549722847
3076	NC_022544	TAAT	2	8	143457	143464	50 %	50 %	0 %	0 %	549722847
3077	NC_022544	CTT	2	6	143505	143510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722848
3078	NC_022544	GTGG	2	8	143516	143523	0 %	25 %	75 %	0 %	549722848
3079	NC_022544	CG	3	6	143534	143539	0 %	0 %	50 %	50 %	549722848
3080	NC_022544	GA	3	6	143548	143553	50 %	0 %	50 %	0 %	549722848
3081	NC_022544	GCG	2	6	143577	143582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722848
3082	NC_022544	GTG	2	6	143601	143606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722848
3083	NC_022544	TCA	2	6	143609	143614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722848
3084	NC_022544	AT	3	6	143630	143635	50 %	50 %	0 %	0 %	549722848
3085	NC_022544	ATT	2	6	143667	143672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722848
3086	NC_022544	GCGA	2	8	143691	143698	25 %	0 %	50 %	25 %	549722848
3087	NC_022544	GTC	2	6	143730	143735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722848
3088	NC_022544	CAGC	2	8	143741	143748	25 %	0 %	25 %	50 %	549722848
3089	NC_022544	TGG	2	6	143812	143817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722848
3090	NC_022544	ACC	4	12	143841	143852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722848
3091	NC_022544	ACT	2	6	143855	143860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722848
3092	NC_022544	TCT	2	6	144033	144038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722848
3093	NC_022544	GCA	2	6	144050	144055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722848
3094	NC_022544	GGC	2	6	144062	144067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722848
3095	NC_022544	GCC	2	6	144078	144083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722848
3096	NC_022544	GGC	2	6	144146	144151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722848
3097	NC_022544	CCAC	2	8	144169	144176	25 %	0 %	0 %	75 %	549722848
3098	NC_022544	CAT	2	6	144177	144182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722848
3099	NC_022544	GAT	2	6	144204	144209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722848
3100	NC_022544	CGC	2	6	144219	144224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722848
3101	NC_022544	TGGC	2	8	144225	144232	0 %	25 %	50 %	25 %	549722848
3102	NC_022544	CGA	2	6	144337	144342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722848
3103	NC_022544	CTG	2	6	144417	144422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722848
3104	NC_022544	CCG	2	6	144475	144480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722848
3105	NC_022544	CG	3	6	144479	144484	0 %	0 %	50 %	50 %	549722848
3106	NC_022544	GGT	3	9	144539	144547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722848
3107	NC_022544	GGC	2	6	144590	144595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722848
3108	NC_022544	GAA	2	6	144687	144692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722848
3109	NC_022544	TCG	2	6	144703	144708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722848
3110	NC_022544	TGAC	2	8	144712	144719	25 %	25 %	25 %	25 %	549722848
3111	NC_022544	GAG	2	6	144735	144740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549722848
3112	NC_022544	CG	3	6	144742	144747	0 %	0 %	50 %	50 %	549722848
3113	NC_022544	CGT	2	6	144857	144862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722848
3114	NC_022544	ATT	2	6	144919	144924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722848
3115	NC_022544	AC	3	6	145053	145058	50 %	0 %	0 %	50 %	549722849
3116	NC_022544	CTG	2	6	145157	145162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722849
3117	NC_022544	GTC	2	6	145167	145172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722849
3118	NC_022544	GCC	2	6	145235	145240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722849
3119	NC_022544	GTG	2	6	145268	145273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722849
3120	NC_022544	CCG	2	6	145317	145322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722849
3121	NC_022544	AAC	2	6	145370	145375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722849
3122	NC_022544	GCT	2	6	145396	145401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722849
3123	NC_022544	GCG	2	6	145496	145501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722849
3124	NC_022544	GGC	3	9	145516	145524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722849
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3126	NC_022544	ATA	2	6	145623	145628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549722849
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3131	NC_022544	GGC	2	6	145825	145830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722849
3132	NC_022544	GCT	2	6	145832	145837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722849
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3140	NC_022544	ATG	2	6	146240	146245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722849
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3142	NC_022544	ATT	2	6	146351	146356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722850
3143	NC_022544	ATGG	2	8	146430	146437	25 %	25 %	50 %	0 %	549722850
3144	NC_022544	CT	3	6	146467	146472	0 %	50 %	0 %	50 %	549722850
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3149	NC_022544	TGG	2	6	146621	146626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722850
3150	NC_022544	GTG	2	6	146674	146679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722850
3151	NC_022544	GC	3	6	146704	146709	0 %	0 %	50 %	50 %	549722850
3152	NC_022544	TCG	2	6	146765	146770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722850
3153	NC_022544	TGG	2	6	146795	146800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722850
3154	NC_022544	CTG	2	6	146848	146853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722850
3155	NC_022544	TCG	2	6	146867	146872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722850
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3159	NC_022544	CTG	2	6	147181	147186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722850
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3166	NC_022544	ATT	2	6	147432	147437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722851
3167	NC_022544	CT	3	6	147456	147461	0 %	50 %	0 %	50 %	549722851
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3176	NC_022544	GCC	2	6	147654	147659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722851
3177	NC_022544	AAGCGC	2	12	147706	147717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722851
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3187	NC_022544	CTGGCG	2	12	148230	148241	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	549722851
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3189	NC_022544	CAG	2	6	148265	148270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722851
3190	NC_022544	GAC	2	6	148283	148288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722851
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3192	NC_022544	CTG	3	9	148425	148433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722851
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3195	NC_022544	CG	3	6	148600	148605	0 %	0 %	50 %	50 %	549722851
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3198	NC_022544	CG	3	6	148749	148754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3199	NC_022544	CCT	2	6	148768	148773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3200	NC_022544	GCG	2	6	148787	148792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3201	NC_022544	CG	3	6	148815	148820	0 %	0 %	50 %	50 %	549722852
3202	NC_022544	GCT	2	6	148858	148863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722852
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3208	NC_022544	TGA	2	6	149221	149226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722852
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3213	NC_022544	CGTAT	2	10	149439	149448	20 %	40 %	20 %	20 %	549722852
3214	NC_022544	TCG	2	6	149449	149454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722852
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3219	NC_022544	ACC	2	6	149727	149732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722852
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3222	NC_022544	GGCG	2	8	149991	149998	0 %	0 %	75 %	25 %	549722853
3223	NC_022544	CGG	2	6	150003	150008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722853
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3226	NC_022544	CCG	2	6	150080	150085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722853
3227	NC_022544	GGC	2	6	150180	150185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722853
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3229	NC_022544	CGG	2	6	150285	150290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722853
3230	NC_022544	GTC	2	6	150319	150324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722853
3231	NC_022544	TGGC	2	8	150364	150371	0 %	25 %	50 %	25 %	549722853
3232	NC_022544	GTG	2	6	150427	150432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722853
3233	NC_022544	CGTTGC	2	12	150461	150472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722853
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3235	NC_022544	CGG	2	6	150522	150527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722853
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3237	NC_022544	GC	3	6	150620	150625	0 %	0 %	50 %	50 %	549722853
3238	NC_022544	GCA	2	6	150666	150671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722853
3239	NC_022544	GCC	3	9	150700	150708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722853
3240	NC_022544	CGC	3	9	150765	150773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722853
3241	NC_022544	GCA	2	6	150816	150821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722853
3242	NC_022544	AGC	2	6	150872	150877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722853
3243	NC_022544	CG	3	6	150923	150928	0 %	0 %	50 %	50 %	549722853
3244	NC_022544	GTT	2	6	150933	150938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722853
3245	NC_022544	CG	3	6	150958	150963	0 %	0 %	50 %	50 %	549722853
3246	NC_022544	AAT	2	6	151069	151074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3247	NC_022544	GAAT	2	8	151143	151150	50 %	25 %	25 %	0 %	549722854
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3357	NC_022544	ACG	2	6	156592	156597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722858
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3362	NC_022544	GGC	2	6	156776	156781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722858
3363	NC_022544	AAGC	2	8	156822	156829	50 %	0 %	25 %	25 %	549722858
3364	NC_022544	CCG	2	6	156883	156888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3365	NC_022544	GAT	2	6	156936	156941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722859
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3386	NC_022544	T	8	8	157923	157930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3470	NC_022544	ATT	2	6	162217	162222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3487	NC_022544	A	6	6	163080	163085	100 %	0 %	0 %	0 %	549722864
3488	NC_022544	TCT	2	6	163168	163173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722864
3489	NC_022544	TTA	2	6	163304	163309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722865
3490	NC_022544	GC	3	6	163336	163341	0 %	0 %	50 %	50 %	549722865
3491	NC_022544	CG	3	6	163383	163388	0 %	0 %	50 %	50 %	549722865
3492	NC_022544	CAT	2	6	163392	163397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722865
3493	NC_022544	CGTCA	2	10	163432	163441	20 %	20 %	20 %	40 %	549722865
3494	NC_022544	ACC	2	6	163442	163447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722865
3495	NC_022544	CAG	2	6	163486	163491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722865
3496	NC_022544	CTG	2	6	163525	163530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722865
3497	NC_022544	CTG	2	6	163549	163554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722865
3498	NC_022544	TTC	2	6	163591	163596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722865
3499	NC_022544	A	6	6	163605	163610	100 %	0 %	0 %	0 %	549722865
3500	NC_022544	CGG	2	6	163647	163652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722865

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