MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 101759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_022544	TAAT	2	8	116597	116604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_022544	ATA	2	6	116654	116659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_022544	TAAA	2	8	116680	116687	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_022544	TCG	2	6	116707	116712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_022544	CT	3	6	116717	116722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2506	NC_022544	TAATT	2	10	116726	116735	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_022544	ATTTT	2	10	116752	116761	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_022544	CGGGTG	2	12	116768	116779	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2509	NC_022544	T	6	6	116914	116919	0 %	100 %	0 %	0 %	549722825
2510	NC_022544	ACAGA	2	10	116935	116944	60 %	0 %	20 %	20 %	549722825
2511	NC_022544	ATT	2	6	116959	116964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722825
2512	NC_022544	T	7	7	116979	116985	0 %	100 %	0 %	0 %	549722825
2513	NC_022544	A	6	6	117006	117011	100 %	0 %	0 %	0 %	549722825
2514	NC_022544	ATT	2	6	117028	117033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722825
2515	NC_022544	CAA	2	6	117065	117070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722825
2516	NC_022544	TTC	2	6	117085	117090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722825
2517	NC_022544	GGAA	2	8	117099	117106	50 %	0 %	50 %	0 %	549722825
2518	NC_022544	ATT	2	6	117133	117138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722825
2519	NC_022544	AT	3	6	117186	117191	50 %	50 %	0 %	0 %	549722825
2520	NC_022544	TCA	2	6	117204	117209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722825
2521	NC_022544	C	6	6	117215	117220	0 %	0 %	0 %	100 %	549722825
2522	NC_022544	CAG	2	6	117294	117299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722826
2523	NC_022544	TGC	2	6	117304	117309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722826
2524	NC_022544	GCG	2	6	117323	117328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722826
2525	NC_022544	GGC	2	6	117335	117340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722826
2526	NC_022544	AGA	2	6	117341	117346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722826
2527	NC_022544	CTT	2	6	117362	117367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722826
2528	NC_022544	GCG	2	6	117457	117462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722826
2529	NC_022544	CAA	2	6	117488	117493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722826
2530	NC_022544	GGT	2	6	117588	117593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722826
2531	NC_022544	GT	3	6	117652	117657	0 %	50 %	50 %	0 %	549722826
2532	NC_022544	GCC	2	6	117663	117668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722826
2533	NC_022544	ACA	2	6	117689	117694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549722826
2534	NC_022544	GAC	2	6	117715	117720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722826
2535	NC_022544	ACC	3	9	117763	117771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722826
2536	NC_022544	CGC	2	6	117827	117832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722826
2537	NC_022544	TCT	2	6	117928	117933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722826
2538	NC_022544	CAGCG	2	10	118110	118119	20 %	0 %	40 %	40 %	549722827
2539	NC_022544	ATCA	2	8	118151	118158	50 %	25 %	0 %	25 %	549722827
2540	NC_022544	GC	3	6	118237	118242	0 %	0 %	50 %	50 %	549722827
2541	NC_022544	GCCA	2	8	118244	118251	25 %	0 %	25 %	50 %	549722827
2542	NC_022544	GCG	2	6	118333	118338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722827
2543	NC_022544	CAG	2	6	118364	118369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722827
2544	NC_022544	CGA	2	6	118402	118407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722827
2545	NC_022544	GCCGG	2	10	118410	118419	0 %	0 %	60 %	40 %	549722827
2546	NC_022544	GCC	2	6	118457	118462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722827
2547	NC_022544	GGAC	2	8	118511	118518	25 %	0 %	50 %	25 %	549722827
2548	NC_022544	AC	3	6	118517	118522	50 %	0 %	0 %	50 %	549722827
2549	NC_022544	CGAGC	2	10	118535	118544	20 %	0 %	40 %	40 %	549722827
2550	NC_022544	TCC	2	6	118581	118586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549722827
2551	NC_022544	GCC	2	6	118598	118603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722827
2552	NC_022544	GCG	2	6	118644	118649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722827
2553	NC_022544	TGC	2	6	118686	118691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722827
2554	NC_022544	GTA	2	6	118749	118754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722827
2555	NC_022544	GCC	2	6	118769	118774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722827
2556	NC_022544	CGC	2	6	118811	118816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722827
2557	NC_022544	GGCG	2	8	118856	118863	0 %	0 %	75 %	25 %	549722827
2558	NC_022544	GCT	2	6	118874	118879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722827
2559	NC_022544	TCGCCG	2	12	118908	118919	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	549722827
2560	NC_022544	CAC	2	6	118928	118933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722827
2561	NC_022544	ATTTG	2	10	118978	118987	20 %	60 %	20 %	0 %	549722827
2562	NC_022544	GTCA	2	8	119006	119013	25 %	25 %	25 %	25 %	549722827
2563	NC_022544	GAC	2	6	119141	119146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722827
2564	NC_022544	TGC	2	6	119151	119156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722827
2565	NC_022544	CG	3	6	119166	119171	0 %	0 %	50 %	50 %	549722827
2566	NC_022544	CCG	2	6	119193	119198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722827
2567	NC_022544	GGTTCA	2	12	119209	119220	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	549722827
2568	NC_022544	GCG	2	6	119253	119258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722827
2569	NC_022544	AGT	2	6	119280	119285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722827
2570	NC_022544	ACC	2	6	119349	119354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722827
2571	NC_022544	GCTG	2	8	119533	119540	0 %	25 %	50 %	25 %	549722827
2572	NC_022544	TGT	2	6	119656	119661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722828
2573	NC_022544	CTG	2	6	119679	119684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722828
2574	NC_022544	GCG	2	6	119688	119693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722828
2575	NC_022544	GGC	2	6	119772	119777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722828
2576	NC_022544	CGG	2	6	119807	119812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722828
2577	NC_022544	GCG	2	6	119821	119826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722828
2578	NC_022544	CGA	2	6	119852	119857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722828
2579	NC_022544	GCA	2	6	119883	119888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722828
2580	NC_022544	GCC	2	6	119922	119927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722828
2581	NC_022544	GC	5	10	119983	119992	0 %	0 %	50 %	50 %	549722828
2582	NC_022544	GCG	2	6	120096	120101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722828
2583	NC_022544	CAC	2	6	120120	120125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722828
2584	NC_022544	GCT	2	6	120182	120187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722828
2585	NC_022544	CTGG	2	8	120189	120196	0 %	25 %	50 %	25 %	549722828
2586	NC_022544	TGC	2	6	120223	120228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722828
2587	NC_022544	CAC	2	6	120327	120332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722828
2588	NC_022544	CGC	2	6	120488	120493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722828
2589	NC_022544	CGG	2	6	120566	120571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722828
2590	NC_022544	TCA	2	6	120628	120633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722828
2591	NC_022544	AAG	2	6	120634	120639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549722828
2592	NC_022544	GGC	2	6	120646	120651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722828
2593	NC_022544	CGG	2	6	120706	120711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722828
2594	NC_022544	GTG	2	6	120727	120732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722828
2595	NC_022544	AGC	2	6	120739	120744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722828
2596	NC_022544	CGG	2	6	120779	120784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722828
2597	NC_022544	GCC	2	6	120855	120860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722828
2598	NC_022544	AGT	2	6	120872	120877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722828
2599	NC_022544	TCG	2	6	120913	120918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722828
2600	NC_022544	CGG	2	6	120929	120934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722828
2601	NC_022544	GCG	2	6	121078	121083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722828
2602	NC_022544	CG	3	6	121136	121141	0 %	0 %	50 %	50 %	549722828
2603	NC_022544	GAT	2	6	121142	121147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722828
2604	NC_022544	GTT	2	6	121158	121163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722828
2605	NC_022544	CTT	2	6	121184	121189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722828
2606	NC_022544	TGG	2	6	121214	121219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722828
2607	NC_022544	TCG	2	6	121225	121230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722828
2608	NC_022544	GC	3	6	121255	121260	0 %	0 %	50 %	50 %	549722828
2609	NC_022544	CAATTG	2	12	121286	121297	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549722828
2610	NC_022544	TCCA	2	8	121310	121317	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2611	NC_022544	AG	3	6	121342	121347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_022544	CAGG	2	8	121364	121371	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2613	NC_022544	AATGCT	2	12	121394	121405	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2614	NC_022544	TCA	2	6	121546	121551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2615	NC_022544	GTC	2	6	121582	121587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2616	NC_022544	TCT	2	6	121611	121616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2617	NC_022544	G	6	6	121626	121631	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_022544	T	7	7	121740	121746	0 %	100 %	0 %	0 %	549722829
2619	NC_022544	ATCG	2	8	121747	121754	25 %	25 %	25 %	25 %	549722829
2620	NC_022544	AT	3	6	121773	121778	50 %	50 %	0 %	0 %	549722829
2621	NC_022544	TAA	3	9	121812	121820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549722829
2622	NC_022544	TGTC	2	8	121833	121840	0 %	50 %	25 %	25 %	549722829
2623	NC_022544	AT	3	6	121850	121855	50 %	50 %	0 %	0 %	549722829
2624	NC_022544	CCG	2	6	121864	121869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722829
2625	NC_022544	TCA	2	6	121878	121883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722829
2626	NC_022544	GC	3	6	122014	122019	0 %	0 %	50 %	50 %	549722829
2627	NC_022544	ATC	2	6	122050	122055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722829
2628	NC_022544	CTG	2	6	122104	122109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722829
2629	NC_022544	GTT	2	6	122115	122120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722829
2630	NC_022544	TAAT	2	8	122138	122145	50 %	50 %	0 %	0 %	549722829
2631	NC_022544	CCG	2	6	122158	122163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722829
2632	NC_022544	TGCC	2	8	122184	122191	0 %	25 %	25 %	50 %	549722829
2633	NC_022544	CAG	2	6	122290	122295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722829
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2635	NC_022544	ATG	2	6	122495	122500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2636	NC_022544	TCA	2	6	122584	122589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2637	NC_022544	AC	3	6	122599	122604	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2638	NC_022544	CTG	2	6	122615	122620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722830
2639	NC_022544	CGCTGG	2	12	122688	122699	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	549722830
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2641	NC_022544	GCG	2	6	122757	122762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722830
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2643	NC_022544	TAT	2	6	122794	122799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549722830
2644	NC_022544	CTGG	2	8	122830	122837	0 %	25 %	50 %	25 %	549722830
2645	NC_022544	GCT	2	6	122893	122898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722830
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2650	NC_022544	GCT	3	9	123142	123150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722830
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2654	NC_022544	TGG	2	6	123303	123308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722830
2655	NC_022544	TA	3	6	123336	123341	50 %	50 %	0 %	0 %	549722830
2656	NC_022544	TAG	2	6	123466	123471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722831
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2662	NC_022544	GC	3	6	123694	123699	0 %	0 %	50 %	50 %	549722831
2663	NC_022544	GCC	2	6	123721	123726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722831
2664	NC_022544	TCA	2	6	123750	123755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549722831
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2666	NC_022544	TGC	2	6	123851	123856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722831
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2673	NC_022544	ATG	2	6	124081	124086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549722831
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2675	NC_022544	AGCAG	2	10	124159	124168	40 %	0 %	40 %	20 %	549722832
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2686	NC_022544	CGCC	2	8	124687	124694	0 %	0 %	25 %	75 %	549722832
2687	NC_022544	ACC	2	6	124782	124787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722832
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2692	NC_022544	GCGTCA	2	12	124888	124899	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549722832
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2696	NC_022544	GTG	2	6	125040	125045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722832
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2700	NC_022544	GCG	2	6	125193	125198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722832
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2703	NC_022544	A	6	6	125267	125272	100 %	0 %	0 %	0 %	549722832
2704	NC_022544	GCCA	2	8	125349	125356	25 %	0 %	25 %	50 %	549722832
2705	NC_022544	GCA	2	6	125434	125439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722832
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2713	NC_022544	TGC	2	6	125737	125742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549722833
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2718	NC_022544	CGG	2	6	125973	125978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722833
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2727	NC_022544	GCTT	2	8	126273	126280	0 %	50 %	25 %	25 %	549722833
2728	NC_022544	GCC	2	6	126340	126345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722833
2729	NC_022544	CGC	2	6	126372	126377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722833
2730	NC_022544	AGTTT	2	10	126389	126398	20 %	60 %	20 %	0 %	549722833
2731	NC_022544	CAG	2	6	126412	126417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722833
2732	NC_022544	TTG	2	6	126419	126424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549722833
2733	NC_022544	TTC	2	6	126455	126460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549722833
2734	NC_022544	AGC	2	6	126482	126487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549722833
2735	NC_022544	TCC	2	6	126497	126502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549722833
2736	NC_022544	CCA	2	6	126507	126512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549722833
2737	NC_022544	T	6	6	126547	126552	0 %	100 %	0 %	0 %	549722833
2738	NC_022544	CCG	2	6	126555	126560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549722833
2739	NC_022544	CGG	2	6	126576	126581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722833
2740	NC_022544	T	7	7	126661	126667	0 %	100 %	0 %	0 %	549722833
2741	NC_022544	GC	4	8	126769	126776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2742	NC_022544	TAGTG	2	10	126807	126816	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2743	NC_022544	TTG	2	6	126820	126825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2744	NC_022544	GCA	2	6	126830	126835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2745	NC_022544	GGC	2	6	126860	126865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549722834
2746	NC_022544	GTG	2	6	126952	126957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549722834
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2751	NC_022544	GC	3	6	127233	127238	0 %	0 %	50 %	50 %	549722834
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2992	NC_022544	CTTT	2	8	139463	139470	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2993	NC_022544	TTGTT	2	10	139527	139536	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2994	NC_022544	TCG	2	6	139553	139558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2995	NC_022544	CGG	2	6	139733	139738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2996	NC_022544	T	7	7	139750	139756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2997	NC_022544	T	6	6	139838	139843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2998	NC_022544	CTTG	2	8	139863	139870	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2999	NC_022544	TCC	2	6	139880	139885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3000	NC_022544	AAG	2	6	139930	139935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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