MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 101759

< Previous12...4243444546474849505152...203204Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23004	NC_022544	GCT	2	6	1075059	1075064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723673
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23116	NC_022544	A	6	6	1080162	1080167	100 %	0 %	0 %	0 %	549723676
23117	NC_022544	GGT	2	6	1080227	1080232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723676
23118	NC_022544	TGA	2	6	1080254	1080259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723676
23119	NC_022544	GACT	2	8	1080363	1080370	25 %	25 %	25 %	25 %	549723677
23120	NC_022544	GTG	2	6	1080376	1080381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723677
23121	NC_022544	A	6	6	1080426	1080431	100 %	0 %	0 %	0 %	549723677
23122	NC_022544	GTG	2	6	1080436	1080441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723677
23123	NC_022544	GGT	2	6	1080477	1080482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723677
23124	NC_022544	GGA	2	6	1080549	1080554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723677
23125	NC_022544	GGT	2	6	1080664	1080669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723678
23126	NC_022544	TGC	3	9	1080688	1080696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723678
23127	NC_022544	TGG	3	9	1080699	1080707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723678
23128	NC_022544	CCA	2	6	1080848	1080853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723678
23129	NC_022544	TGG	2	6	1080944	1080949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723678
23130	NC_022544	GTT	2	6	1081043	1081048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723678
23131	NC_022544	GAG	2	6	1081105	1081110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723678
23132	NC_022544	A	6	6	1081118	1081123	100 %	0 %	0 %	0 %	549723678
23133	NC_022544	ATT	2	6	1081153	1081158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723679
23134	NC_022544	A	6	6	1081167	1081172	100 %	0 %	0 %	0 %	549723679
23135	NC_022544	GAT	2	6	1081177	1081182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723679
23136	NC_022544	CCA	2	6	1081187	1081192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723679
23137	NC_022544	T	6	6	1081195	1081200	0 %	100 %	0 %	0 %	549723679
23138	NC_022544	GTC	2	6	1081205	1081210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723679
23139	NC_022544	GTG	2	6	1081216	1081221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723679
23140	NC_022544	GAG	2	6	1081222	1081227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723679
23141	NC_022544	GCGGTG	2	12	1081240	1081251	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	549723679
23142	NC_022544	CAT	2	6	1081419	1081424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723679
23143	NC_022544	GACA	2	8	1081538	1081545	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23144	NC_022544	ACA	2	6	1081603	1081608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723680
23145	NC_022544	ATA	2	6	1081642	1081647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723680
23146	NC_022544	AGA	2	6	1081706	1081711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723680
23147	NC_022544	TAA	2	6	1081712	1081717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723680
23148	NC_022544	TGA	2	6	1081724	1081729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723680
23149	NC_022544	CA	3	6	1081754	1081759	50 %	0 %	0 %	50 %	549723680
23150	NC_022544	CCGT	2	8	1081985	1081992	0 %	25 %	25 %	50 %	549723680
23151	NC_022544	ATT	2	6	1082223	1082228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723680
23152	NC_022544	ACA	2	6	1082235	1082240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723680
23153	NC_022544	T	7	7	1082312	1082318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23154	NC_022544	AAAG	2	8	1082339	1082346	75 %	0 %	25 %	0 %	549723681
23155	NC_022544	G	6	6	1082359	1082364	0 %	0 %	100 %	0 %	549723681
23156	NC_022544	ATGG	2	8	1082457	1082464	25 %	25 %	50 %	0 %	549723681
23157	NC_022544	ACG	2	6	1082466	1082471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723681
23158	NC_022544	CTGG	2	8	1082522	1082529	0 %	25 %	50 %	25 %	549723681
23159	NC_022544	CGCT	2	8	1082535	1082542	0 %	25 %	25 %	50 %	549723681
23160	NC_022544	TTC	2	6	1082555	1082560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723681
23161	NC_022544	TCAG	2	8	1082582	1082589	25 %	25 %	25 %	25 %	549723681
23162	NC_022544	AAGA	2	8	1082667	1082674	75 %	0 %	25 %	0 %	549723681
23163	NC_022544	AAT	2	6	1082729	1082734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723681
23164	NC_022544	CGG	2	6	1082771	1082776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23165	NC_022544	AGTG	2	8	1082822	1082829	25 %	25 %	50 %	0 %	549723682
23166	NC_022544	TTTC	2	8	1082836	1082843	0 %	75 %	0 %	25 %	549723682
23167	NC_022544	CTG	2	6	1082867	1082872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723682
23168	NC_022544	GAAA	2	8	1082923	1082930	75 %	0 %	25 %	0 %	549723682
23169	NC_022544	GAG	2	6	1083024	1083029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723682
23170	NC_022544	TCA	2	6	1083061	1083066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23173	NC_022544	CAG	2	6	1083140	1083145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723683
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23176	NC_022544	GCAG	2	8	1083353	1083360	25 %	0 %	50 %	25 %	549723683
23177	NC_022544	GGT	2	6	1083362	1083367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723683
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23179	NC_022544	GCT	2	6	1083534	1083539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723683
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23181	NC_022544	CGG	2	6	1083622	1083627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723683
23182	NC_022544	TGC	2	6	1083652	1083657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723683
23183	NC_022544	GGC	2	6	1083665	1083670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723683
23184	NC_022544	GCC	2	6	1083690	1083695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723683
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23187	NC_022544	CCGGG	2	10	1083851	1083860	0 %	0 %	60 %	40 %	549723683
23188	NC_022544	ATG	2	6	1083891	1083896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723683
23189	NC_022544	CGG	2	6	1083899	1083904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723683
23190	NC_022544	GCG	2	6	1083924	1083929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723683
23191	NC_022544	GAAA	2	8	1083965	1083972	75 %	0 %	25 %	0 %	549723683
23192	NC_022544	GAG	2	6	1083975	1083980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723683
23193	NC_022544	TCGC	2	8	1084053	1084060	0 %	25 %	25 %	50 %	549723683
23194	NC_022544	GCA	2	6	1084076	1084081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723683
23195	NC_022544	GGT	2	6	1084106	1084111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723683
23196	NC_022544	GCAG	2	8	1084133	1084140	25 %	0 %	50 %	25 %	549723683
23197	NC_022544	CAGT	2	8	1084188	1084195	25 %	25 %	25 %	25 %	549723683
23198	NC_022544	GAT	2	6	1084230	1084235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723683
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23200	NC_022544	TGC	2	6	1084337	1084342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723683
23201	NC_022544	CGGG	2	8	1084383	1084390	0 %	0 %	75 %	25 %	549723683
23202	NC_022544	GCG	2	6	1084446	1084451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723683
23203	NC_022544	CGGG	2	8	1084481	1084488	0 %	0 %	75 %	25 %	549723683
23204	NC_022544	A	6	6	1084504	1084509	100 %	0 %	0 %	0 %	549723683
23205	NC_022544	A	6	6	1084525	1084530	100 %	0 %	0 %	0 %	549723683
23206	NC_022544	CG	4	8	1084532	1084539	0 %	0 %	50 %	50 %	549723683
23207	NC_022544	TCC	2	6	1084566	1084571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549723683
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23210	NC_022544	CTG	2	6	1084632	1084637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723683
23211	NC_022544	GCAG	2	8	1084649	1084656	25 %	0 %	50 %	25 %	549723683
23212	NC_022544	AGA	2	6	1084669	1084674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723683
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23215	NC_022544	AACG	2	8	1084818	1084825	50 %	0 %	25 %	25 %	549723683
23216	NC_022544	A	6	6	1084830	1084835	100 %	0 %	0 %	0 %	549723683
23217	NC_022544	TAC	2	6	1084869	1084874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723683
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23220	NC_022544	GCC	2	6	1084941	1084946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723683
23221	NC_022544	A	6	6	1084966	1084971	100 %	0 %	0 %	0 %	549723683
23222	NC_022544	AGC	2	6	1084987	1084992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723683
23223	NC_022544	CAG	2	6	1085004	1085009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723683
23224	NC_022544	A	6	6	1085031	1085036	100 %	0 %	0 %	0 %	549723683
23225	NC_022544	CGG	2	6	1085041	1085046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723683
23226	NC_022544	GAA	2	6	1085150	1085155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723683
23227	NC_022544	CCAG	2	8	1085173	1085180	25 %	0 %	25 %	50 %	549723683
23228	NC_022544	GAA	2	6	1085190	1085195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723683
23229	NC_022544	GCA	3	9	1085207	1085215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723683
23230	NC_022544	AAC	2	6	1085302	1085307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723683
23231	NC_022544	AGC	2	6	1085311	1085316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723683
23232	NC_022544	TGC	2	6	1085441	1085446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723683
23233	NC_022544	G	6	6	1085501	1085506	0 %	0 %	100 %	0 %	549723683
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23235	NC_022544	CAG	2	6	1085710	1085715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723683
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23466	NC_022544	GGAT	2	8	1096558	1096565	25 %	25 %	50 %	0 %	549723692
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23472	NC_022544	GAT	2	6	1096856	1096861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23473	NC_022544	A	6	6	1096887	1096892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23474	NC_022544	TCA	2	6	1096931	1096936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23475	NC_022544	TCT	2	6	1096948	1096953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23476	NC_022544	GAC	2	6	1096980	1096985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23477	NC_022544	CCG	2	6	1096993	1096998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23478	NC_022544	GAT	2	6	1097031	1097036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23479	NC_022544	T	6	6	1097074	1097079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23480	NC_022544	CAT	2	6	1097118	1097123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723694
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23484	NC_022544	T	7	7	1097200	1097206	0 %	100 %	0 %	0 %	549723694
23485	NC_022544	GCCG	2	8	1097259	1097266	0 %	0 %	50 %	50 %	549723694
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23498	NC_022544	ATA	2	6	1097666	1097671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723694
23499	NC_022544	CAA	2	6	1097720	1097725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723694
23500	NC_022544	AAG	2	6	1097750	1097755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723694

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