MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 101759

< Previous12...3940414243444546474849...203204Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_022544	GGC	2	6	1002970	1002975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723609
21503	NC_022544	GCC	2	6	1002993	1002998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723609
21504	NC_022544	TGA	2	6	1003022	1003027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723609
21505	NC_022544	CTG	2	6	1003029	1003034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723609
21506	NC_022544	CGG	2	6	1003035	1003040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723609
21507	NC_022544	GGC	2	6	1003105	1003110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723609
21508	NC_022544	GTCC	2	8	1003127	1003134	0 %	25 %	25 %	50 %	549723609
21509	NC_022544	TGG	2	6	1003154	1003159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723609
21510	NC_022544	TAT	2	6	1003213	1003218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723609
21511	NC_022544	CG	3	6	1003245	1003250	0 %	0 %	50 %	50 %	549723609
21512	NC_022544	GAT	2	6	1003251	1003256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723609
21513	NC_022544	GCG	2	6	1003333	1003338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723609
21514	NC_022544	A	6	6	1003424	1003429	100 %	0 %	0 %	0 %	549723609
21515	NC_022544	TGCC	2	8	1003433	1003440	0 %	25 %	25 %	50 %	549723609
21516	NC_022544	GC	3	6	1003442	1003447	0 %	0 %	50 %	50 %	549723609
21517	NC_022544	GCG	2	6	1003519	1003524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723609
21518	NC_022544	CGG	2	6	1003541	1003546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723609
21519	NC_022544	ATT	2	6	1003552	1003557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723609
21520	NC_022544	CG	3	6	1003646	1003651	0 %	0 %	50 %	50 %	549723609
21521	NC_022544	GCG	2	6	1003706	1003711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723609
21522	NC_022544	CG	4	8	1003710	1003717	0 %	0 %	50 %	50 %	549723609
21523	NC_022544	TCG	2	6	1003979	1003984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723609
21524	NC_022544	TCG	2	6	1004005	1004010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723609
21525	NC_022544	CCT	2	6	1004078	1004083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549723609
21526	NC_022544	AAC	2	6	1004192	1004197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723609
21527	NC_022544	GGAC	2	8	1004209	1004216	25 %	0 %	50 %	25 %	549723609
21528	NC_022544	AAG	2	6	1004219	1004224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723609
21529	NC_022544	GAG	2	6	1004284	1004289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723609
21530	NC_022544	CCA	2	6	1004331	1004336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723609
21531	NC_022544	CGC	2	6	1004433	1004438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723609
21532	NC_022544	GATC	2	8	1004466	1004473	25 %	25 %	25 %	25 %	549723609
21533	NC_022544	GCC	2	6	1004605	1004610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723609
21534	NC_022544	CAA	2	6	1004661	1004666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723609
21535	NC_022544	CGC	2	6	1004726	1004731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723609
21536	NC_022544	ATG	2	6	1004734	1004739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723609
21537	NC_022544	GAC	2	6	1004823	1004828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723609
21538	NC_022544	T	6	6	1004927	1004932	0 %	100 %	0 %	0 %	549723610
21539	NC_022544	CCG	2	6	1005016	1005021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723610
21540	NC_022544	GCGG	2	8	1005035	1005042	0 %	0 %	75 %	25 %	549723610
21541	NC_022544	CTA	2	6	1005088	1005093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723610
21542	NC_022544	TC	3	6	1005094	1005099	0 %	50 %	0 %	50 %	549723610
21543	NC_022544	GCG	2	6	1005150	1005155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723610
21544	NC_022544	TGG	2	6	1005183	1005188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723610
21545	NC_022544	GC	3	6	1005243	1005248	0 %	0 %	50 %	50 %	549723610
21546	NC_022544	A	6	6	1005386	1005391	100 %	0 %	0 %	0 %	549723610
21547	NC_022544	GCTG	2	8	1005400	1005407	0 %	25 %	50 %	25 %	549723610
21548	NC_022544	CG	4	8	1005423	1005430	0 %	0 %	50 %	50 %	549723610
21549	NC_022544	GCC	2	6	1005474	1005479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723610
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21552	NC_022544	TGA	2	6	1005556	1005561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723611
21553	NC_022544	GGT	2	6	1005591	1005596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723611
21554	NC_022544	TCTGGC	2	12	1005605	1005616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723611
21555	NC_022544	TGA	2	6	1005619	1005624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723611
21556	NC_022544	GC	3	6	1005635	1005640	0 %	0 %	50 %	50 %	549723611
21557	NC_022544	GCA	2	6	1005647	1005652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723611
21558	NC_022544	TGC	2	6	1005715	1005720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723611
21559	NC_022544	GC	3	6	1005737	1005742	0 %	0 %	50 %	50 %	549723611
21560	NC_022544	T	6	6	1005807	1005812	0 %	100 %	0 %	0 %	549723611
21561	NC_022544	CGG	2	6	1005818	1005823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723611
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21563	NC_022544	GCC	2	6	1005857	1005862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723611
21564	NC_022544	CGT	2	6	1005905	1005910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723611
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21567	NC_022544	CTT	2	6	1005989	1005994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723611
21568	NC_022544	CTG	3	9	1006032	1006040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723611
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21570	NC_022544	TGG	2	6	1006102	1006107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723611
21571	NC_022544	TGG	2	6	1006120	1006125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723611
21572	NC_022544	CGA	2	6	1006147	1006152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723611
21573	NC_022544	CAG	2	6	1006167	1006172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723611
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21576	NC_022544	TGC	2	6	1006242	1006247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723611
21577	NC_022544	CT	3	6	1006293	1006298	0 %	50 %	0 %	50 %	549723611
21578	NC_022544	ATTG	2	8	1006328	1006335	25 %	50 %	25 %	0 %	549723611
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21580	NC_022544	AGA	2	6	1006500	1006505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21581	NC_022544	TAA	2	6	1006570	1006575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21582	NC_022544	AT	3	6	1006605	1006610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21583	NC_022544	AAATC	2	10	1006628	1006637	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21584	NC_022544	ATG	2	6	1006700	1006705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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21586	NC_022544	TTG	2	6	1006789	1006794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723612
21587	NC_022544	TTAA	2	8	1006930	1006937	50 %	50 %	0 %	0 %	549723612
21588	NC_022544	TAT	2	6	1006960	1006965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723612
21589	NC_022544	CGC	2	6	1006983	1006988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723612
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21591	NC_022544	GGT	2	6	1007076	1007081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723612
21592	NC_022544	CTG	2	6	1007131	1007136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723612
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21595	NC_022544	CCTT	2	8	1007168	1007175	0 %	50 %	0 %	50 %	549723612
21596	NC_022544	ATT	2	6	1007181	1007186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723612
21597	NC_022544	TGC	2	6	1007210	1007215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723612
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21599	NC_022544	TAT	2	6	1007367	1007372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723612
21600	NC_022544	GGC	2	6	1007595	1007600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723612
21601	NC_022544	GCG	2	6	1007629	1007634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723612
21602	NC_022544	GGCCTG	2	12	1007661	1007672	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	549723612
21603	NC_022544	ACC	2	6	1007687	1007692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723612
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21605	NC_022544	TGC	2	6	1007760	1007765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723612
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21607	NC_022544	CTG	2	6	1007794	1007799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723612
21608	NC_022544	TAT	2	6	1007802	1007807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723612
21609	NC_022544	TTTA	2	8	1007824	1007831	25 %	75 %	0 %	0 %	549723612
21610	NC_022544	CTG	2	6	1007833	1007838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723612
21611	NC_022544	AAT	2	6	1007952	1007957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21612	NC_022544	AAAAT	2	10	1007987	1007996	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21613	NC_022544	CTC	2	6	1008020	1008025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21614	NC_022544	TC	3	6	1008031	1008036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21615	NC_022544	ACA	2	6	1008141	1008146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723613
21616	NC_022544	TTA	2	6	1008162	1008167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723613
21617	NC_022544	TGT	2	6	1008187	1008192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723613
21618	NC_022544	TCT	2	6	1008225	1008230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723613
21619	NC_022544	CATTG	2	10	1008430	1008439	20 %	40 %	20 %	20 %	549723613
21620	NC_022544	CGT	2	6	1008484	1008489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723613
21621	NC_022544	TTGT	2	8	1008515	1008522	0 %	75 %	25 %	0 %	549723613
21622	NC_022544	GTT	2	6	1008566	1008571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723613
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21635	NC_022544	CTG	2	6	1009505	1009510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723613
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21650	NC_022544	CTGC	2	8	1010306	1010313	0 %	25 %	25 %	50 %	549723614
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21658	NC_022544	TG	3	6	1010745	1010750	0 %	50 %	50 %	0 %	549723615
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21668	NC_022544	AAT	2	6	1011175	1011180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21687	NC_022544	ATG	2	6	1012035	1012040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723616
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21691	NC_022544	ATA	2	6	1012098	1012103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723616
21692	NC_022544	TTTA	2	8	1012108	1012115	25 %	75 %	0 %	0 %	549723616
21693	NC_022544	TA	3	6	1012147	1012152	50 %	50 %	0 %	0 %	549723616
21694	NC_022544	T	6	6	1012188	1012193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21695	NC_022544	TAA	2	6	1012255	1012260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723617
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21703	NC_022544	CGA	2	6	1012638	1012643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723617
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21723	NC_022544	TGC	2	6	1013690	1013695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723617
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21726	NC_022544	TCA	2	6	1013929	1013934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723617
21727	NC_022544	GAT	2	6	1013975	1013980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723617
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21729	NC_022544	T	7	7	1014103	1014109	0 %	100 %	0 %	0 %	549723617
21730	NC_022544	GCC	2	6	1014167	1014172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723617
21731	NC_022544	CAA	2	6	1014217	1014222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723617
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21853	NC_022544	GC	3	6	1019609	1019614	0 %	0 %	50 %	50 %	549723621
21854	NC_022544	CTAT	2	8	1019617	1019624	25 %	50 %	0 %	25 %	549723621
21855	NC_022544	T	6	6	1019705	1019710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21856	NC_022544	T	6	6	1019747	1019752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21857	NC_022544	GAGTT	2	10	1019755	1019764	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
21858	NC_022544	CG	3	6	1019793	1019798	0 %	0 %	50 %	50 %	549723622
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21864	NC_022544	CGG	2	6	1020240	1020245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723622
21865	NC_022544	CCAG	2	8	1020272	1020279	25 %	0 %	25 %	50 %	549723622
21866	NC_022544	CTG	2	6	1020292	1020297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723622
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21886	NC_022544	GC	3	6	1021079	1021084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21887	NC_022544	TGA	2	6	1021134	1021139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21888	NC_022544	T	6	6	1021161	1021166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21889	NC_022544	ATA	2	6	1021167	1021172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21958	NC_022544	GCC	2	6	1024694	1024699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21959	NC_022544	AATC	2	8	1024703	1024710	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21960	NC_022544	GGA	2	6	1024744	1024749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21961	NC_022544	ATTG	2	8	1024767	1024774	25 %	50 %	25 %	0 %	549723626
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21964	NC_022544	A	6	6	1025062	1025067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21965	NC_022544	T	6	6	1025083	1025088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21966	NC_022544	T	6	6	1025147	1025152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21967	NC_022544	A	6	6	1025176	1025181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21968	NC_022544	ACG	2	6	1025276	1025281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21969	NC_022544	GTA	2	6	1025294	1025299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21970	NC_022544	TTTGC	2	10	1025377	1025386	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
21971	NC_022544	GC	3	6	1025405	1025410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21972	NC_022544	GCC	2	6	1025453	1025458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21973	NC_022544	AGGC	2	8	1025459	1025466	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21974	NC_022544	CGC	2	6	1025491	1025496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21975	NC_022544	AGG	2	6	1025502	1025507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21976	NC_022544	GTC	2	6	1025513	1025518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21977	NC_022544	CTG	2	6	1025589	1025594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21978	NC_022544	GT	3	6	1025633	1025638	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21979	NC_022544	GCA	2	6	1025731	1025736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21980	NC_022544	GCTTC	2	10	1025810	1025819	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21981	NC_022544	GCA	2	6	1025845	1025850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21982	NC_022544	AGG	2	6	1025888	1025893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21983	NC_022544	TGC	2	6	1025961	1025966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21984	NC_022544	GGC	2	6	1026046	1026051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21985	NC_022544	CTGCG	2	10	1026098	1026107	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21986	NC_022544	GGC	2	6	1026114	1026119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21987	NC_022544	GGA	2	6	1026133	1026138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21988	NC_022544	GAC	2	6	1026152	1026157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21989	NC_022544	TGC	2	6	1026181	1026186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21990	NC_022544	ATT	2	6	1026199	1026204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21991	NC_022544	CAGG	2	8	1026352	1026359	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21992	NC_022544	T	6	6	1026511	1026516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21993	NC_022544	CG	3	6	1026547	1026552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21994	NC_022544	CGG	2	6	1026686	1026691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21995	NC_022544	TTG	2	6	1026709	1026714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21996	NC_022544	GGC	2	6	1026731	1026736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21997	NC_022544	TTA	2	6	1026872	1026877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21998	NC_022544	ATC	2	6	1026941	1026946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21999	NC_022544	GGGC	2	8	1026948	1026955	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22000	NC_022544	CAG	2	6	1026967	1026972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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