MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 101759

< Previous12...3637383940414243444546...203204Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20122	NC_022544	TCT	2	6	939511	939516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723551
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20226	NC_022544	CAA	2	6	944340	944345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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20229	NC_022544	AG	3	6	944471	944476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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20240	NC_022544	T	6	6	945014	945019	0 %	100 %	0 %	0 %	549723557
20241	NC_022544	TCG	2	6	945076	945081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723557
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20364	NC_022544	GGA	2	6	950113	950118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723563
20365	NC_022544	CGA	2	6	950133	950138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723563
20366	NC_022544	ATCGG	2	10	950159	950168	20 %	20 %	40 %	20 %	549723563
20367	NC_022544	GAG	2	6	950201	950206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723563
20368	NC_022544	A	6	6	950310	950315	100 %	0 %	0 %	0 %	549723563
20369	NC_022544	TG	3	6	950322	950327	0 %	50 %	50 %	0 %	549723563
20370	NC_022544	CGC	2	6	950331	950336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723563
20371	NC_022544	GAT	2	6	950431	950436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723563
20372	NC_022544	GGC	2	6	950594	950599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723564
20373	NC_022544	GCG	2	6	950600	950605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723564
20374	NC_022544	CTG	2	6	950678	950683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723564
20375	NC_022544	CCG	2	6	950744	950749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723564
20376	NC_022544	CTG	2	6	950759	950764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723564
20377	NC_022544	T	6	6	950809	950814	0 %	100 %	0 %	0 %	549723564
20378	NC_022544	CGA	2	6	950824	950829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723564
20379	NC_022544	CTG	2	6	950887	950892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723564
20380	NC_022544	CTG	3	9	950894	950902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723564
20381	NC_022544	CTG	3	9	950957	950965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723564
20382	NC_022544	T	6	6	950992	950997	0 %	100 %	0 %	0 %	549723564
20383	NC_022544	AAC	2	6	951032	951037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723564
20384	NC_022544	ATT	2	6	951186	951191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723564
20385	NC_022544	TGG	2	6	951195	951200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723564
20386	NC_022544	T	6	6	951239	951244	0 %	100 %	0 %	0 %	549723564
20387	NC_022544	CAT	2	6	951247	951252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723564
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20391	NC_022544	TGC	3	9	951438	951446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723564
20392	NC_022544	A	6	6	951483	951488	100 %	0 %	0 %	0 %	549723564
20393	NC_022544	TCGC	2	8	951525	951532	0 %	25 %	25 %	50 %	549723565
20394	NC_022544	ATTCTG	2	12	951541	951552	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	549723565
20395	NC_022544	ATG	2	6	951685	951690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723565
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20397	NC_022544	GCG	2	6	951727	951732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723565
20398	NC_022544	GGT	2	6	951741	951746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723565
20399	NC_022544	TGC	2	6	951759	951764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723565
20400	NC_022544	GGT	2	6	951765	951770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723565
20401	NC_022544	CGC	2	6	951827	951832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723565
20402	NC_022544	GCT	4	12	951864	951875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723565
20403	NC_022544	GTG	2	6	951973	951978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723565
20404	NC_022544	GGC	2	6	952020	952025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723565
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20409	NC_022544	CCA	2	6	952172	952177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723565
20410	NC_022544	TCG	2	6	952268	952273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723565
20411	NC_022544	CG	3	6	952386	952391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20412	NC_022544	CAT	2	6	952400	952405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20413	NC_022544	CATT	2	8	952418	952425	25 %	50 %	0 %	25 %	549723566
20414	NC_022544	TCA	2	6	952448	952453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723566
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20419	NC_022544	ATT	2	6	952712	952717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723566
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20427	NC_022544	T	6	6	952931	952936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20428	NC_022544	AAC	2	6	953007	953012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723567
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20434	NC_022544	GGC	2	6	953339	953344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723567
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20437	NC_022544	TGCG	2	8	953412	953419	0 %	25 %	50 %	25 %	549723567
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20440	NC_022544	GC	3	6	953612	953617	0 %	0 %	50 %	50 %	549723567
20441	NC_022544	T	6	6	953658	953663	0 %	100 %	0 %	0 %	549723567
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20445	NC_022544	ATTT	2	8	954083	954090	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20446	NC_022544	ATA	2	6	954115	954120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20447	NC_022544	CAAT	2	8	954125	954132	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20448	NC_022544	ATT	2	6	954135	954140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20449	NC_022544	TA	3	6	954160	954165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20450	NC_022544	CAAAT	2	10	954180	954189	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20451	NC_022544	AAT	2	6	954194	954199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20452	NC_022544	ACT	2	6	954219	954224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20453	NC_022544	ATT	2	6	954229	954234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20454	NC_022544	GGT	2	6	954263	954268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20455	NC_022544	TGA	2	6	954516	954521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723568
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20462	NC_022544	TGA	2	6	955083	955088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723568
20463	NC_022544	TATATC	2	12	955163	955174	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	549723568
20464	NC_022544	TGC	2	6	955215	955220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723568
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20467	NC_022544	TTA	2	6	955319	955324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723568
20468	NC_022544	T	6	6	955380	955385	0 %	100 %	0 %	0 %	549723568
20469	NC_022544	CTG	2	6	955397	955402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723568
20470	NC_022544	TAT	2	6	955417	955422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723568
20471	NC_022544	CTT	2	6	955447	955452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723568
20472	NC_022544	CGG	2	6	955456	955461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723568
20473	NC_022544	G	6	6	955489	955494	0 %	0 %	100 %	0 %	549723568
20474	NC_022544	TTA	2	6	955506	955511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723568
20475	NC_022544	ATT	2	6	955532	955537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723568
20476	NC_022544	CGGTA	2	10	955546	955555	20 %	20 %	40 %	20 %	549723568
20477	NC_022544	AAG	2	6	955584	955589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723568
20478	NC_022544	TA	3	6	955708	955713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20479	NC_022544	TAT	2	6	955722	955727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723569
20480	NC_022544	TGT	2	6	955794	955799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723569
20481	NC_022544	A	6	6	955801	955806	100 %	0 %	0 %	0 %	549723569
20482	NC_022544	A	6	6	955903	955908	100 %	0 %	0 %	0 %	549723569
20483	NC_022544	TGT	2	6	955917	955922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723569
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