MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 101759

< Previous12...3334353637383940414243...203204Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_022544	CGC	2	6	861475	861480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723482
18502	NC_022544	GCA	2	6	861498	861503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723482
18503	NC_022544	TGG	2	6	861545	861550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723482
18504	NC_022544	GC	3	6	861584	861589	0 %	0 %	50 %	50 %	549723482
18505	NC_022544	CAT	2	6	861622	861627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723482
18506	NC_022544	GTTG	2	8	861636	861643	0 %	50 %	50 %	0 %	549723482
18507	NC_022544	ATG	2	6	861644	861649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723482
18508	NC_022544	GGGGC	2	10	861678	861687	0 %	0 %	80 %	20 %	549723482
18509	NC_022544	CTG	2	6	861690	861695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723482
18510	NC_022544	G	6	6	861701	861706	0 %	0 %	100 %	0 %	549723482
18511	NC_022544	TGG	2	6	861722	861727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723482
18512	NC_022544	GCG	2	6	861755	861760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723482
18513	NC_022544	TGCTC	2	10	861767	861776	0 %	40 %	20 %	40 %	549723482
18514	NC_022544	CTG	2	6	861796	861801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723482
18515	NC_022544	GCC	2	6	861837	861842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723482
18516	NC_022544	CAGGCG	2	12	861847	861858	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	549723482
18517	NC_022544	GGT	2	6	861895	861900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723482
18518	NC_022544	CGC	2	6	861918	861923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723482
18519	NC_022544	CAA	2	6	862051	862056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723482
18520	NC_022544	CGCC	2	8	862078	862085	0 %	0 %	25 %	75 %	549723482
18521	NC_022544	GC	3	6	862105	862110	0 %	0 %	50 %	50 %	549723482
18522	NC_022544	TTAACG	2	12	862117	862128	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549723482
18523	NC_022544	CTG	2	6	862159	862164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723482
18524	NC_022544	TGC	2	6	862169	862174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723482
18525	NC_022544	GCG	3	9	862202	862210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723483
18526	NC_022544	GGCCG	2	10	862214	862223	0 %	0 %	60 %	40 %	549723483
18527	NC_022544	GCA	2	6	862252	862257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723483
18528	NC_022544	GCT	2	6	862273	862278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723483
18529	NC_022544	GCC	2	6	862293	862298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723483
18530	NC_022544	GT	3	6	862308	862313	0 %	50 %	50 %	0 %	549723483
18531	NC_022544	TGC	2	6	862401	862406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723483
18532	NC_022544	GGC	2	6	862426	862431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723483
18533	NC_022544	CCTGG	2	10	862489	862498	0 %	20 %	40 %	40 %	549723483
18534	NC_022544	GTG	2	6	862516	862521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723483
18535	NC_022544	CGG	2	6	862570	862575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723483
18536	NC_022544	GTG	2	6	862577	862582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723483
18537	NC_022544	ACC	2	6	862589	862594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723483
18538	NC_022544	GGCG	2	8	862707	862714	0 %	0 %	75 %	25 %	549723483
18539	NC_022544	TACTGA	2	12	862949	862960	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549723484
18540	NC_022544	CAG	2	6	863108	863113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723484
18541	NC_022544	CGA	2	6	863186	863191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723484
18542	NC_022544	CGG	2	6	863209	863214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723484
18543	NC_022544	GCAG	2	8	863246	863253	25 %	0 %	50 %	25 %	549723484
18544	NC_022544	GCGG	2	8	863274	863281	0 %	0 %	75 %	25 %	549723484
18545	NC_022544	CT	3	6	863295	863300	0 %	50 %	0 %	50 %	549723484
18546	NC_022544	AGC	2	6	863335	863340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723484
18547	NC_022544	GTT	2	6	863355	863360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723484
18548	NC_022544	GGAT	2	8	863436	863443	25 %	25 %	50 %	0 %	549723484
18549	NC_022544	GCC	2	6	863459	863464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723484
18550	NC_022544	GC	3	6	863467	863472	0 %	0 %	50 %	50 %	549723484
18551	NC_022544	CGC	2	6	863499	863504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723484
18552	NC_022544	GGC	2	6	863561	863566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723484
18553	NC_022544	GACAG	2	10	863567	863576	40 %	0 %	40 %	20 %	549723484
18554	NC_022544	CTT	2	6	863627	863632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18555	NC_022544	CTG	2	6	863649	863654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18556	NC_022544	T	6	6	863655	863660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18557	NC_022544	AAT	2	6	863743	863748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18558	NC_022544	T	9	9	863768	863776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18559	NC_022544	GGC	2	6	863813	863818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18560	NC_022544	TA	3	6	863973	863978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18561	NC_022544	AAGG	2	8	863994	864001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18562	NC_022544	TCA	2	6	864024	864029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18563	NC_022544	A	6	6	864048	864053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18564	NC_022544	CTG	2	6	864081	864086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18565	NC_022544	T	6	6	864172	864177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18566	NC_022544	T	6	6	864187	864192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18567	NC_022544	CGT	2	6	864323	864328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723485
18568	NC_022544	GGA	2	6	864343	864348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723485
18569	NC_022544	GGC	2	6	864466	864471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723485
18570	NC_022544	CTA	2	6	864532	864537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723485
18571	NC_022544	ACT	2	6	864540	864545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723485
18572	NC_022544	GTG	3	9	864668	864676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723485
18573	NC_022544	ATG	2	6	864728	864733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723485
18574	NC_022544	GC	3	6	864766	864771	0 %	0 %	50 %	50 %	549723485
18575	NC_022544	GCG	2	6	864846	864851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723485
18576	NC_022544	GAC	2	6	864881	864886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723485
18577	NC_022544	TGA	2	6	864910	864915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723485
18578	NC_022544	CTAT	2	8	864984	864991	25 %	50 %	0 %	25 %	549723485
18579	NC_022544	CGC	2	6	865011	865016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723485
18580	NC_022544	AAT	2	6	865088	865093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723485
18581	NC_022544	GCT	2	6	865096	865101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723485
18582	NC_022544	AGC	2	6	865107	865112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723485
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18584	NC_022544	CGGGC	2	10	865207	865216	0 %	0 %	60 %	40 %	549723485
18585	NC_022544	CCG	2	6	865220	865225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723485
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18587	NC_022544	CTG	2	6	865259	865264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723485
18588	NC_022544	TGA	2	6	865270	865275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723485
18589	NC_022544	GC	3	6	865325	865330	0 %	0 %	50 %	50 %	549723485
18590	NC_022544	GAG	2	6	865397	865402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723485
18591	NC_022544	CTAT	2	8	865425	865432	25 %	50 %	0 %	25 %	549723485
18592	NC_022544	TGA	2	6	865474	865479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723485
18593	NC_022544	GGT	2	6	865480	865485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723485
18594	NC_022544	CGAC	2	8	865499	865506	25 %	0 %	25 %	50 %	549723485
18595	NC_022544	GCT	2	6	865510	865515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723485
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18598	NC_022544	GCGT	2	8	865674	865681	0 %	25 %	50 %	25 %	549723485
18599	NC_022544	ATC	2	6	865721	865726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723485
18600	NC_022544	TGG	2	6	865758	865763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723485
18601	NC_022544	CTG	2	6	865772	865777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723485
18602	NC_022544	TGG	2	6	865809	865814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723485
18603	NC_022544	GC	3	6	865879	865884	0 %	0 %	50 %	50 %	549723485
18604	NC_022544	AGC	2	6	865980	865985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723485
18605	NC_022544	A	6	6	866030	866035	100 %	0 %	0 %	0 %	549723485
18606	NC_022544	GCA	2	6	866155	866160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723485
18607	NC_022544	ATG	2	6	866186	866191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723485
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18609	NC_022544	GTT	2	6	866260	866265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723485
18610	NC_022544	AGTC	2	8	866356	866363	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18611	NC_022544	GAA	2	6	866450	866455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18612	NC_022544	CT	3	6	866492	866497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18613	NC_022544	A	8	8	866509	866516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18614	NC_022544	TAT	2	6	866524	866529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18615	NC_022544	CAT	2	6	866604	866609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18616	NC_022544	A	6	6	866617	866622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18617	NC_022544	GAC	2	6	866691	866696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18619	NC_022544	AATAA	2	10	866864	866873	80 %	20 %	0 %	0 %	549723486
18620	NC_022544	AGA	2	6	866956	866961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723486
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18622	NC_022544	TAG	2	6	867028	867033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723486
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18986	NC_022544	TCA	2	6	884328	884333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723504
18987	NC_022544	GCC	2	6	884354	884359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723504
18988	NC_022544	ACC	2	6	884437	884442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723504
18989	NC_022544	CGA	2	6	884464	884469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723504
18990	NC_022544	T	6	6	884501	884506	0 %	100 %	0 %	0 %	549723504
18991	NC_022544	TCA	2	6	884594	884599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723505
18992	NC_022544	GA	3	6	884799	884804	50 %	0 %	50 %	0 %	549723505
18993	NC_022544	GCT	2	6	884805	884810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723505
18994	NC_022544	AAAT	2	8	884817	884824	75 %	25 %	0 %	0 %	549723505
18995	NC_022544	CAG	2	6	884854	884859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723505
18996	NC_022544	GGCT	2	8	884921	884928	0 %	25 %	50 %	25 %	549723505
18997	NC_022544	AGTA	2	8	885033	885040	50 %	25 %	25 %	0 %	549723505
18998	NC_022544	GGC	2	6	885043	885048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723505
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19000	NC_022544	CG	3	6	885078	885083	0 %	0 %	50 %	50 %	549723505

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