MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 101759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_022544	GCA	3	9	817008	817016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723440
17502	NC_022544	GTC	2	6	817059	817064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723440
17503	NC_022544	GGGAT	2	10	817132	817141	20 %	20 %	60 %	0 %	549723440
17504	NC_022544	GCCT	2	8	817215	817222	0 %	25 %	25 %	50 %	549723440
17505	NC_022544	ATA	2	6	817239	817244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723440
17506	NC_022544	TGA	2	6	817302	817307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723441
17507	NC_022544	CCTG	2	8	817312	817319	0 %	25 %	25 %	50 %	549723441
17508	NC_022544	TTC	2	6	817339	817344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723441
17509	NC_022544	CAA	2	6	817345	817350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723441
17510	NC_022544	AACGGC	2	12	817415	817426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723441
17511	NC_022544	GCA	2	6	817462	817467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723441
17512	NC_022544	GCA	2	6	817471	817476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723441
17513	NC_022544	AAC	2	6	817478	817483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723441
17514	NC_022544	ACA	2	6	817626	817631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723441
17515	NC_022544	CGT	2	6	817646	817651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723441
17516	NC_022544	ACG	2	6	817749	817754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723441
17517	NC_022544	AGT	2	6	817898	817903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723442
17518	NC_022544	CAGC	2	8	817963	817970	25 %	0 %	25 %	50 %	549723442
17519	NC_022544	CAG	3	9	817985	817993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723442
17520	NC_022544	TGC	2	6	818091	818096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723442
17521	NC_022544	GGC	2	6	818117	818122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723442
17522	NC_022544	GCAGC	2	10	818123	818132	20 %	0 %	40 %	40 %	549723442
17523	NC_022544	CAG	2	6	818133	818138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723442
17524	NC_022544	GGC	2	6	818155	818160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723442
17525	NC_022544	CCCCG	2	10	818173	818182	0 %	0 %	20 %	80 %	549723442
17526	NC_022544	GAT	2	6	818282	818287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723442
17527	NC_022544	TCA	2	6	818310	818315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723442
17528	NC_022544	ATT	2	6	818352	818357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723442
17529	NC_022544	ACA	2	6	818376	818381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723442
17530	NC_022544	A	6	6	818387	818392	100 %	0 %	0 %	0 %	549723442
17531	NC_022544	CGC	2	6	818398	818403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723442
17532	NC_022544	TAT	2	6	818405	818410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723442
17533	NC_022544	GTA	2	6	818420	818425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723442
17534	NC_022544	A	6	6	818425	818430	100 %	0 %	0 %	0 %	549723442
17535	NC_022544	CAG	2	6	818525	818530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723442
17536	NC_022544	T	6	6	818623	818628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17537	NC_022544	CGT	2	6	818636	818641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17538	NC_022544	TTG	2	6	818680	818685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17539	NC_022544	AT	3	6	818707	818712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17540	NC_022544	GCC	2	6	818713	818718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17541	NC_022544	AAC	2	6	818736	818741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17542	NC_022544	CCA	2	6	818831	818836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17543	NC_022544	GGCGA	2	10	818899	818908	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17544	NC_022544	CAC	2	6	818926	818931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17545	NC_022544	GTA	2	6	818960	818965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17546	NC_022544	AGG	2	6	819005	819010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17547	NC_022544	CGG	2	6	819015	819020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17548	NC_022544	TCA	2	6	819031	819036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17549	NC_022544	CAC	2	6	819039	819044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17550	NC_022544	CCA	2	6	819117	819122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17551	NC_022544	CCA	2	6	819242	819247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17552	NC_022544	GGT	2	6	819256	819261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17553	NC_022544	GGCGA	2	10	819311	819320	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17554	NC_022544	CCA	2	6	819342	819347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17555	NC_022544	CCA	2	6	819452	819457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17556	NC_022544	A	6	6	819462	819467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17557	NC_022544	T	6	6	819483	819488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17558	NC_022544	GCG	2	6	819561	819566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17559	NC_022544	CCA	2	6	819607	819612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17560	NC_022544	A	6	6	819617	819622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17561	NC_022544	T	6	6	819638	819643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17562	NC_022544	GCGA	2	8	819733	819740	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17563	NC_022544	CCA	2	6	819761	819766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17564	NC_022544	GGC	2	6	819784	819789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17565	NC_022544	TGCGC	2	10	819851	819860	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17566	NC_022544	CGC	2	6	819910	819915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17567	NC_022544	ATT	2	6	819937	819942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17568	NC_022544	TTA	2	6	820008	820013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17569	NC_022544	GTT	2	6	820026	820031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17570	NC_022544	CCG	2	6	820103	820108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723443
17571	NC_022544	ACG	3	9	820125	820133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723443
17572	NC_022544	TGG	2	6	820191	820196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723443
17573	NC_022544	ACT	2	6	820200	820205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723443
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17575	NC_022544	CGG	2	6	820243	820248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723443
17576	NC_022544	CGC	2	6	820294	820299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723443
17577	NC_022544	GCT	2	6	820306	820311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723443
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17579	NC_022544	GCT	2	6	820490	820495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723443
17580	NC_022544	A	6	6	820572	820577	100 %	0 %	0 %	0 %	549723443
17581	NC_022544	GACA	2	8	820592	820599	50 %	0 %	25 %	25 %	549723443
17582	NC_022544	A	8	8	820702	820709	100 %	0 %	0 %	0 %	549723443
17583	NC_022544	CGC	2	6	820746	820751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723443
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17586	NC_022544	GGC	2	6	820804	820809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723443
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17588	NC_022544	GCA	2	6	820870	820875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723443
17589	NC_022544	GC	3	6	820941	820946	0 %	0 %	50 %	50 %	549723443
17590	NC_022544	GGCGC	2	10	821006	821015	0 %	0 %	60 %	40 %	549723443
17591	NC_022544	GCG	2	6	821033	821038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723443
17592	NC_022544	GA	3	6	821123	821128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17593	NC_022544	T	7	7	821134	821140	0 %	100 %	0 %	0 %	549723444
17594	NC_022544	TC	3	6	821191	821196	0 %	50 %	0 %	50 %	549723444
17595	NC_022544	ACT	2	6	821268	821273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723444
17596	NC_022544	T	6	6	821273	821278	0 %	100 %	0 %	0 %	549723444
17597	NC_022544	ATT	2	6	821306	821311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723444
17598	NC_022544	TGC	2	6	821343	821348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723444
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17601	NC_022544	GCTG	2	8	821433	821440	0 %	25 %	50 %	25 %	549723444
17602	NC_022544	ATGGC	2	10	821456	821465	20 %	20 %	40 %	20 %	549723444
17603	NC_022544	TG	3	6	821474	821479	0 %	50 %	50 %	0 %	549723444
17604	NC_022544	TGA	2	6	821493	821498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723444
17605	NC_022544	AT	3	6	821503	821508	50 %	50 %	0 %	0 %	549723444
17606	NC_022544	CG	3	6	821532	821537	0 %	0 %	50 %	50 %	549723444
17607	NC_022544	ATG	2	6	821624	821629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723444
17608	NC_022544	GAT	2	6	821647	821652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723444
17609	NC_022544	TGA	2	6	821655	821660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723444
17610	NC_022544	GTG	2	6	821714	821719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723444
17611	NC_022544	TTTGC	2	10	821723	821732	0 %	60 %	20 %	20 %	549723444
17612	NC_022544	GCC	2	6	821793	821798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723444
17613	NC_022544	GC	3	6	821811	821816	0 %	0 %	50 %	50 %	549723444
17614	NC_022544	CG	4	8	821829	821836	0 %	0 %	50 %	50 %	549723444
17615	NC_022544	TGA	2	6	821852	821857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723445
17616	NC_022544	AC	3	6	821902	821907	50 %	0 %	0 %	50 %	549723445
17617	NC_022544	CAG	2	6	821977	821982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723445
17618	NC_022544	CAT	2	6	821985	821990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723445
17619	NC_022544	GC	3	6	822135	822140	0 %	0 %	50 %	50 %	549723445
17620	NC_022544	AG	3	6	822214	822219	50 %	0 %	50 %	0 %	549723445
17621	NC_022544	GC	3	6	822320	822325	0 %	0 %	50 %	50 %	549723445
17622	NC_022544	T	7	7	822335	822341	0 %	100 %	0 %	0 %	549723445
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17624	NC_022544	CAT	2	6	822409	822414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723445
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17869	NC_022544	TGC	2	6	831602	831607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723454
17870	NC_022544	CCGCG	2	10	831642	831651	0 %	0 %	40 %	60 %	549723454
17871	NC_022544	TGA	2	6	831716	831721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723454
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17884	NC_022544	CGC	2	6	832151	832156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723455
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17983	NC_022544	GTG	2	6	837090	837095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17984	NC_022544	CTC	2	6	837204	837209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549723460
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17991	NC_022544	TCA	2	6	837808	837813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723460
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