MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 101759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_022544	CAC	2	6	748699	748704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723380
16002	NC_022544	TCT	2	6	748707	748712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723380
16003	NC_022544	ATG	2	6	748719	748724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723380
16004	NC_022544	GCA	2	6	748790	748795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723380
16005	NC_022544	GGA	2	6	748861	748866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723380
16006	NC_022544	CTGT	2	8	748871	748878	0 %	50 %	25 %	25 %	549723380
16007	NC_022544	GCG	2	6	748934	748939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723380
16008	NC_022544	CGC	2	6	749114	749119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16009	NC_022544	GCG	2	6	749125	749130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16010	NC_022544	T	6	6	749131	749136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_022544	T	6	6	749161	749166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16012	NC_022544	AATT	2	8	749175	749182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16013	NC_022544	ATT	2	6	749194	749199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16014	NC_022544	ATT	2	6	749213	749218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_022544	ATT	2	6	749256	749261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16016	NC_022544	TTTC	2	8	749288	749295	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16017	NC_022544	CAG	2	6	749316	749321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16018	NC_022544	ATT	2	6	749364	749369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16019	NC_022544	GTA	2	6	749428	749433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16020	NC_022544	T	6	6	749461	749466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16021	NC_022544	GCA	2	6	749485	749490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16022	NC_022544	GTA	2	6	749539	749544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723381
16023	NC_022544	CTGGCT	2	12	749547	749558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723381
16024	NC_022544	GTT	2	6	749592	749597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723381
16025	NC_022544	CGA	2	6	749624	749629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723381
16026	NC_022544	GGC	2	6	749643	749648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723381
16027	NC_022544	TAT	2	6	749652	749657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723381
16028	NC_022544	ACG	2	6	749875	749880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723381
16029	NC_022544	GC	4	8	749955	749962	0 %	0 %	50 %	50 %	549723381
16030	NC_022544	A	7	7	750156	750162	100 %	0 %	0 %	0 %	549723381
16031	NC_022544	GCG	2	6	750228	750233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723381
16032	NC_022544	GGC	2	6	750297	750302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723381
16033	NC_022544	CAC	2	6	750311	750316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723381
16034	NC_022544	GC	4	8	750334	750341	0 %	0 %	50 %	50 %	549723381
16035	NC_022544	ACG	2	6	750376	750381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723381
16036	NC_022544	CAG	2	6	750474	750479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723381
16037	NC_022544	GTC	2	6	750526	750531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723381
16038	NC_022544	TGG	2	6	750540	750545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723381
16039	NC_022544	TTC	2	6	750588	750593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723381
16040	NC_022544	GGGCT	2	10	750629	750638	0 %	20 %	60 %	20 %	549723381
16041	NC_022544	TAC	2	6	750705	750710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723381
16042	NC_022544	AGG	2	6	750769	750774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723381
16043	NC_022544	GGT	2	6	750849	750854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723381
16044	NC_022544	ACGTG	2	10	750878	750887	20 %	20 %	40 %	20 %	549723381
16045	NC_022544	A	7	7	750976	750982	100 %	0 %	0 %	0 %	549723382
16046	NC_022544	CCG	2	6	751004	751009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723382
16047	NC_022544	TCA	2	6	751027	751032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723382
16048	NC_022544	GAA	2	6	751042	751047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723382
16049	NC_022544	A	6	6	751144	751149	100 %	0 %	0 %	0 %	549723382
16050	NC_022544	GAA	2	6	751177	751182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723382
16051	NC_022544	CAG	2	6	751204	751209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723382
16052	NC_022544	ATA	2	6	751289	751294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723382
16053	NC_022544	CCAC	2	8	751318	751325	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16054	NC_022544	T	6	6	751349	751354	0 %	100 %	0 %	0 %	549723383
16055	NC_022544	CCA	2	6	751447	751452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723383
16056	NC_022544	GCC	2	6	751513	751518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723383
16057	NC_022544	CGC	2	6	751594	751599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723383
16058	NC_022544	A	6	6	751624	751629	100 %	0 %	0 %	0 %	549723383
16059	NC_022544	CAG	2	6	751642	751647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723383
16060	NC_022544	GCG	2	6	751676	751681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723383
16061	NC_022544	GGT	2	6	751705	751710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723383
16062	NC_022544	CGC	2	6	751773	751778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723383
16063	NC_022544	CG	3	6	751838	751843	0 %	0 %	50 %	50 %	549723383
16064	NC_022544	ATAAA	2	10	751889	751898	80 %	20 %	0 %	0 %	549723383
16065	NC_022544	TGG	2	6	751905	751910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723383
16066	NC_022544	CCA	2	6	751917	751922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723383
16067	NC_022544	TAA	2	6	751938	751943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723383
16068	NC_022544	ACG	2	6	752032	752037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723383
16069	NC_022544	CGT	2	6	752109	752114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723383
16070	NC_022544	CAA	2	6	752154	752159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723383
16071	NC_022544	CTG	2	6	752170	752175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723383
16072	NC_022544	CGC	2	6	752247	752252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723383
16073	NC_022544	TAA	2	6	752281	752286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723383
16074	NC_022544	A	6	6	752459	752464	100 %	0 %	0 %	0 %	549723383
16075	NC_022544	CCG	2	6	752514	752519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723383
16076	NC_022544	A	6	6	752521	752526	100 %	0 %	0 %	0 %	549723383
16077	NC_022544	A	6	6	752564	752569	100 %	0 %	0 %	0 %	549723383
16078	NC_022544	GC	3	6	752627	752632	0 %	0 %	50 %	50 %	549723383
16079	NC_022544	GT	4	8	752643	752650	0 %	50 %	50 %	0 %	549723383
16080	NC_022544	CAC	2	6	752832	752837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723384
16081	NC_022544	CAG	2	6	752853	752858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723384
16082	NC_022544	CTGC	2	8	752881	752888	0 %	25 %	25 %	50 %	549723384
16083	NC_022544	CAG	2	6	752889	752894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723384
16084	NC_022544	CAG	3	9	752922	752930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723384
16085	NC_022544	GC	3	6	752958	752963	0 %	0 %	50 %	50 %	549723384
16086	NC_022544	CCG	2	6	752982	752987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723384
16087	NC_022544	GGCCG	2	10	753009	753018	0 %	0 %	60 %	40 %	549723384
16088	NC_022544	A	6	6	753066	753071	100 %	0 %	0 %	0 %	549723384
16089	NC_022544	GGC	2	6	753126	753131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723384
16090	NC_022544	TGA	2	6	753163	753168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723384
16091	NC_022544	GCA	2	6	753179	753184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723384
16092	NC_022544	CCG	2	6	753226	753231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723384
16093	NC_022544	CGCC	2	8	753326	753333	0 %	0 %	25 %	75 %	549723384
16094	NC_022544	CAG	2	6	753381	753386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723384
16095	NC_022544	GCG	2	6	753422	753427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723384
16096	NC_022544	TAA	2	6	753462	753467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723384
16097	NC_022544	CAGCGC	2	12	753489	753500	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549723384
16098	NC_022544	CCCG	2	8	753511	753518	0 %	0 %	25 %	75 %	549723384
16099	NC_022544	GCG	2	6	753538	753543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723384
16100	NC_022544	GCG	2	6	753620	753625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723384
16101	NC_022544	GCAG	2	8	753641	753648	25 %	0 %	50 %	25 %	549723384
16102	NC_022544	AC	3	6	753765	753770	50 %	0 %	0 %	50 %	549723384
16103	NC_022544	TGC	2	6	753848	753853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723384
16104	NC_022544	CCT	2	6	753855	753860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549723385
16105	NC_022544	CG	3	6	753868	753873	0 %	0 %	50 %	50 %	549723385
16106	NC_022544	GGC	2	6	753874	753879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723385
16107	NC_022544	CAT	2	6	753964	753969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723385
16108	NC_022544	CAA	2	6	753978	753983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723385
16109	NC_022544	AGGT	2	8	754046	754053	25 %	25 %	50 %	0 %	549723385
16110	NC_022544	GTA	2	6	754084	754089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723385
16111	NC_022544	GCG	2	6	754092	754097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723385
16112	NC_022544	GC	3	6	754108	754113	0 %	0 %	50 %	50 %	549723385
16113	NC_022544	TCA	2	6	754154	754159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723385
16114	NC_022544	CAGC	2	8	754260	754267	25 %	0 %	25 %	50 %	549723385
16115	NC_022544	GC	3	6	754278	754283	0 %	0 %	50 %	50 %	549723385
16116	NC_022544	CGG	2	6	754294	754299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723385
16117	NC_022544	AAT	2	6	754327	754332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723385
16118	NC_022544	GCC	2	6	754368	754373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723385
16119	NC_022544	TCA	2	6	754412	754417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723385
16120	NC_022544	CCG	2	6	754484	754489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723385
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16122	NC_022544	CATC	2	8	754563	754570	25 %	25 %	0 %	50 %	549723385
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16127	NC_022544	GC	3	6	754885	754890	0 %	0 %	50 %	50 %	549723385
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16244	NC_022544	GCT	2	6	760277	760282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723392
16245	NC_022544	GGCG	2	8	760283	760290	0 %	0 %	75 %	25 %	549723392
16246	NC_022544	TC	3	6	760312	760317	0 %	50 %	0 %	50 %	549723392
16247	NC_022544	GGC	2	6	760403	760408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723392
16248	NC_022544	GGC	2	6	760449	760454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723392
16249	NC_022544	GTTA	2	8	760508	760515	25 %	50 %	25 %	0 %	549723392
16250	NC_022544	CTC	2	6	760583	760588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549723392
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16253	NC_022544	GTG	2	6	760812	760817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723392
16254	NC_022544	TTG	2	6	760867	760872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723392
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16257	NC_022544	ATC	2	6	760974	760979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723392
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16267	NC_022544	T	6	6	761418	761423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16268	NC_022544	GCGCT	2	10	761433	761442	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16269	NC_022544	CGG	2	6	761521	761526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723393
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16273	NC_022544	GTA	2	6	761732	761737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723393
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16275	NC_022544	AAAAT	2	10	761820	761829	80 %	20 %	0 %	0 %	549723393
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16278	NC_022544	TAT	2	6	761985	761990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16279	NC_022544	GC	3	6	762038	762043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16280	NC_022544	TTCAA	2	10	762062	762071	40 %	40 %	0 %	20 %	549723394
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16334	NC_022544	TTG	2	6	764490	764495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723395
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16350	NC_022544	CAG	2	6	765051	765056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723395
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16355	NC_022544	CGG	2	6	765231	765236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723395
16356	NC_022544	TGC	2	6	765261	765266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723395
16357	NC_022544	GTC	2	6	765435	765440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723395
16358	NC_022544	TCA	2	6	765481	765486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723395
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16360	NC_022544	TTC	2	6	765619	765624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16361	NC_022544	A	6	6	765628	765633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16362	NC_022544	A	7	7	765653	765659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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