MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 101759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_022544	GC	3	6	724483	724488	0 %	0 %	50 %	50 %	549723361
15502	NC_022544	CGG	2	6	724498	724503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723361
15503	NC_022544	TTG	2	6	724539	724544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723361
15504	NC_022544	AAT	2	6	724574	724579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723361
15505	NC_022544	AGTAA	2	10	724670	724679	60 %	20 %	20 %	0 %	549723361
15506	NC_022544	TCC	2	6	724680	724685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549723361
15507	NC_022544	GCG	2	6	724730	724735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723361
15508	NC_022544	CTT	2	6	724747	724752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723361
15509	NC_022544	GGCT	2	8	724818	724825	0 %	25 %	50 %	25 %	549723361
15510	NC_022544	GGCC	2	8	724845	724852	0 %	0 %	50 %	50 %	549723361
15511	NC_022544	GCG	3	9	724860	724868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723361
15512	NC_022544	TCAT	2	8	724911	724918	25 %	50 %	0 %	25 %	549723361
15513	NC_022544	CT	3	6	724938	724943	0 %	50 %	0 %	50 %	549723361
15514	NC_022544	ATA	2	6	724955	724960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723361
15515	NC_022544	CTGGC	2	10	724994	725003	0 %	20 %	40 %	40 %	549723361
15516	NC_022544	A	6	6	725007	725012	100 %	0 %	0 %	0 %	549723361
15517	NC_022544	GTT	2	6	725080	725085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723361
15518	NC_022544	A	6	6	725106	725111	100 %	0 %	0 %	0 %	549723361
15519	NC_022544	TCC	2	6	725145	725150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549723361
15520	NC_022544	GCG	2	6	725185	725190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723361
15521	NC_022544	TCA	3	9	725271	725279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723361
15522	NC_022544	GCG	2	6	725347	725352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723361
15523	NC_022544	GTA	2	6	725547	725552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723362
15524	NC_022544	ATA	2	6	725640	725645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723362
15525	NC_022544	CCA	2	6	725648	725653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723362
15526	NC_022544	GGT	2	6	725709	725714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723362
15527	NC_022544	AGC	2	6	725731	725736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723362
15528	NC_022544	CAG	2	6	725817	725822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723362
15529	NC_022544	CGA	2	6	725828	725833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723362
15530	NC_022544	TGG	2	6	725834	725839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723362
15531	NC_022544	CGG	2	6	725876	725881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723362
15532	NC_022544	CAC	2	6	725922	725927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723362
15533	NC_022544	CGC	2	6	726020	726025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723362
15534	NC_022544	CAG	3	9	726075	726083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723362
15535	NC_022544	CGC	2	6	726278	726283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723362
15536	NC_022544	GCA	2	6	726326	726331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723362
15537	NC_022544	TCT	2	6	726344	726349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723362
15538	NC_022544	CGG	2	6	726365	726370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723362
15539	NC_022544	GGCGAG	2	12	726405	726416	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	549723362
15540	NC_022544	TCA	2	6	726433	726438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723362
15541	NC_022544	CAAT	2	8	726451	726458	50 %	25 %	0 %	25 %	549723362
15542	NC_022544	AAT	3	9	726456	726464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723362
15543	NC_022544	GAA	2	6	726542	726547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15544	NC_022544	GC	3	6	726563	726568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15545	NC_022544	GC	3	6	726579	726584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15546	NC_022544	GAA	2	6	726647	726652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723363
15547	NC_022544	CTC	2	6	726653	726658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549723363
15548	NC_022544	CGA	2	6	726673	726678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723363
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15550	NC_022544	CAT	2	6	726749	726754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723363
15551	NC_022544	TTCG	2	8	726764	726771	0 %	50 %	25 %	25 %	549723363
15552	NC_022544	CATA	2	8	726860	726867	50 %	25 %	0 %	25 %	549723363
15553	NC_022544	GC	3	6	726868	726873	0 %	0 %	50 %	50 %	549723363
15554	NC_022544	GTT	2	6	726889	726894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723363
15555	NC_022544	CCG	2	6	726900	726905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723363
15556	NC_022544	TTG	2	6	726924	726929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723363
15557	NC_022544	CAG	2	6	726956	726961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723363
15558	NC_022544	GCG	2	6	726981	726986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723363
15559	NC_022544	GAT	2	6	727034	727039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723363
15560	NC_022544	T	7	7	727111	727117	0 %	100 %	0 %	0 %	549723363
15561	NC_022544	AAT	2	6	727127	727132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723363
15562	NC_022544	ACT	2	6	727224	727229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723363
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15564	NC_022544	T	6	6	727241	727246	0 %	100 %	0 %	0 %	549723363
15565	NC_022544	ACCAT	2	10	727283	727292	40 %	20 %	0 %	40 %	549723363
15566	NC_022544	TTC	2	6	727331	727336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723364
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15570	NC_022544	CAGCGC	2	12	727591	727602	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549723364
15571	NC_022544	AAT	2	6	727645	727650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723364
15572	NC_022544	TAG	2	6	727658	727663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723364
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15575	NC_022544	TGA	2	6	727926	727931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723364
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15578	NC_022544	GCC	2	6	728146	728151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723365
15579	NC_022544	CCA	2	6	728156	728161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723365
15580	NC_022544	TCA	2	6	728201	728206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723365
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15584	NC_022544	GCG	2	6	728362	728367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723365
15585	NC_022544	CAGA	2	8	728379	728386	50 %	0 %	25 %	25 %	549723365
15586	NC_022544	GAG	2	6	728392	728397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723365
15587	NC_022544	CAC	2	6	728469	728474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723365
15588	NC_022544	GAA	2	6	728487	728492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723365
15589	NC_022544	AGCC	2	8	728659	728666	25 %	0 %	25 %	50 %	549723365
15590	NC_022544	GGT	2	6	728673	728678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723365
15591	NC_022544	A	7	7	728701	728707	100 %	0 %	0 %	0 %	549723365
15592	NC_022544	ACAT	2	8	728729	728736	50 %	25 %	0 %	25 %	549723365
15593	NC_022544	A	8	8	728745	728752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15594	NC_022544	AGC	2	6	728757	728762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15595	NC_022544	TTG	2	6	728777	728782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15596	NC_022544	GTCCC	2	10	728870	728879	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
15597	NC_022544	TTTAGT	2	12	728881	728892	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	549723366
15598	NC_022544	GCA	2	6	729086	729091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723366
15599	NC_022544	GC	3	6	729160	729165	0 %	0 %	50 %	50 %	549723366
15600	NC_022544	CAG	2	6	729174	729179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723366
15601	NC_022544	CATC	2	8	729185	729192	25 %	25 %	0 %	50 %	549723366
15602	NC_022544	TAA	2	6	729254	729259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723366
15603	NC_022544	GCA	2	6	729296	729301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723366
15604	NC_022544	GTC	2	6	729313	729318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723366
15605	NC_022544	GAC	3	9	729327	729335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723366
15606	NC_022544	CGC	2	6	729371	729376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723366
15607	NC_022544	T	6	6	729378	729383	0 %	100 %	0 %	0 %	549723366
15608	NC_022544	CAG	2	6	729387	729392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723366
15609	NC_022544	CGA	3	9	729401	729409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723366
15610	NC_022544	GGC	2	6	729426	729431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723366
15611	NC_022544	GTT	2	6	729450	729455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723366
15612	NC_022544	T	6	6	729565	729570	0 %	100 %	0 %	0 %	549723366
15613	NC_022544	AGT	2	6	729593	729598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723366
15614	NC_022544	CTG	2	6	729621	729626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723366
15615	NC_022544	TAA	2	6	729634	729639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723366
15616	NC_022544	AGA	2	6	729651	729656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723366
15617	NC_022544	CGA	3	9	729668	729676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723366
15618	NC_022544	GC	3	6	729722	729727	0 %	0 %	50 %	50 %	549723366
15619	NC_022544	TCT	2	6	729730	729735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723366
15620	NC_022544	ATC	2	6	729814	729819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723366
15621	NC_022544	TGT	2	6	729851	729856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15622	NC_022544	TG	3	6	729887	729892	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15623	NC_022544	TTG	2	6	729914	729919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15624	NC_022544	TGC	2	6	729929	729934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15625	NC_022544	GAT	2	6	730011	730016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15628	NC_022544	GA	3	6	730149	730154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15629	NC_022544	CGT	2	6	730162	730167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723367
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15985	NC_022544	TGA	2	6	747769	747774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723380
15986	NC_022544	A	6	6	747879	747884	100 %	0 %	0 %	0 %	549723380
15987	NC_022544	CGG	2	6	747892	747897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723380
15988	NC_022544	GC	3	6	747922	747927	0 %	0 %	50 %	50 %	549723380
15989	NC_022544	CAT	2	6	747998	748003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723380
15990	NC_022544	CAA	2	6	748012	748017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723380
15991	NC_022544	GTG	2	6	748018	748023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723380
15992	NC_022544	CGT	2	6	748115	748120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723380
15993	NC_022544	ACA	2	6	748140	748145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723380
15994	NC_022544	CTG	2	6	748229	748234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723380
15995	NC_022544	ACA	2	6	748362	748367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723380
15996	NC_022544	CGCGC	2	10	748420	748429	0 %	0 %	40 %	60 %	549723380
15997	NC_022544	GATC	2	8	748567	748574	25 %	25 %	25 %	25 %	549723380
15998	NC_022544	GAA	2	6	748589	748594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723380
15999	NC_022544	AACA	2	8	748598	748605	75 %	0 %	0 %	25 %	549723380
16000	NC_022544	AAG	2	6	748629	748634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723380

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