MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 101759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_022544	CAT	2	6	701865	701870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723341
15003	NC_022544	CAG	2	6	701928	701933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723341
15004	NC_022544	T	7	7	701978	701984	0 %	100 %	0 %	0 %	549723341
15005	NC_022544	ATT	2	6	702004	702009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723342
15006	NC_022544	TCC	2	6	702012	702017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549723342
15007	NC_022544	ACC	2	6	702027	702032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723342
15008	NC_022544	GTT	2	6	702056	702061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723342
15009	NC_022544	ATG	2	6	702072	702077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723342
15010	NC_022544	GCC	2	6	702122	702127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723342
15011	NC_022544	GAT	2	6	702137	702142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723342
15012	NC_022544	TCA	2	6	702184	702189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723342
15013	NC_022544	CGC	2	6	702278	702283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723342
15014	NC_022544	GC	3	6	702295	702300	0 %	0 %	50 %	50 %	549723342
15015	NC_022544	GCCGT	2	10	702318	702327	0 %	20 %	40 %	40 %	549723342
15016	NC_022544	CGG	2	6	702398	702403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723342
15017	NC_022544	CGT	2	6	702481	702486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723342
15018	NC_022544	TAA	2	6	702487	702492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723342
15019	NC_022544	T	6	6	702584	702589	0 %	100 %	0 %	0 %	549723342
15020	NC_022544	CCAT	2	8	702682	702689	25 %	25 %	0 %	50 %	549723342
15021	NC_022544	CGAT	2	8	702699	702706	25 %	25 %	25 %	25 %	549723342
15022	NC_022544	AGA	2	6	702730	702735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723342
15023	NC_022544	CCG	2	6	702742	702747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723342
15024	NC_022544	T	6	6	702791	702796	0 %	100 %	0 %	0 %	549723342
15025	NC_022544	CCA	2	6	702833	702838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723342
15026	NC_022544	TGA	2	6	702868	702873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723342
15027	NC_022544	CG	3	6	702944	702949	0 %	0 %	50 %	50 %	549723342
15028	NC_022544	AGC	2	6	702978	702983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723342
15029	NC_022544	AAT	2	6	702988	702993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723342
15030	NC_022544	CGC	2	6	703060	703065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723342
15031	NC_022544	CCG	2	6	703090	703095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723342
15032	NC_022544	CG	3	6	703094	703099	0 %	0 %	50 %	50 %	549723342
15033	NC_022544	CTGC	2	8	703101	703108	0 %	25 %	25 %	50 %	549723342
15034	NC_022544	CAG	2	6	703109	703114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723342
15035	NC_022544	CTG	2	6	703127	703132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723342
15036	NC_022544	GCG	2	6	703174	703179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723342
15037	NC_022544	GTT	2	6	703214	703219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723342
15038	NC_022544	TAG	2	6	703266	703271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723342
15039	NC_022544	GGC	2	6	703304	703309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723342
15040	NC_022544	GTTT	2	8	703321	703328	0 %	75 %	25 %	0 %	549723342
15041	NC_022544	ATA	2	6	703409	703414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723342
15042	NC_022544	GCG	2	6	703415	703420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723342
15043	NC_022544	GC	3	6	703472	703477	0 %	0 %	50 %	50 %	549723342
15044	NC_022544	GTTT	2	8	703496	703503	0 %	75 %	25 %	0 %	549723342
15045	NC_022544	GC	3	6	703536	703541	0 %	0 %	50 %	50 %	549723342
15046	NC_022544	T	6	6	703544	703549	0 %	100 %	0 %	0 %	549723342
15047	NC_022544	GGC	2	6	703553	703558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723342
15048	NC_022544	TCG	3	9	703563	703571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723342
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15050	NC_022544	GATA	2	8	703648	703655	50 %	25 %	25 %	0 %	549723342
15051	NC_022544	TTCG	2	8	703739	703746	0 %	50 %	25 %	25 %	549723342
15052	NC_022544	CAG	2	6	703814	703819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723342
15053	NC_022544	GCT	2	6	703909	703914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15054	NC_022544	TCT	2	6	703918	703923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15055	NC_022544	TCAC	2	8	703937	703944	25 %	25 %	0 %	50 %	549723343
15056	NC_022544	TGGT	2	8	703956	703963	0 %	50 %	50 %	0 %	549723343
15057	NC_022544	GCC	2	6	704093	704098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723343
15058	NC_022544	GCG	2	6	704158	704163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723343
15059	NC_022544	CGG	3	9	704212	704220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723343
15060	NC_022544	ACG	2	6	704327	704332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723343
15061	NC_022544	GGC	2	6	704437	704442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723344
15062	NC_022544	TTC	2	6	704447	704452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723344
15063	NC_022544	CGA	2	6	704485	704490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723344
15064	NC_022544	GCA	2	6	704530	704535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723344
15065	NC_022544	CG	4	8	704543	704550	0 %	0 %	50 %	50 %	549723344
15066	NC_022544	CAC	2	6	704558	704563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723344
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15071	NC_022544	A	6	6	704764	704769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15072	NC_022544	CGG	2	6	704818	704823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15073	NC_022544	GTA	2	6	704832	704837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15074	NC_022544	GCG	2	6	704849	704854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15075	NC_022544	ATC	2	6	704898	704903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15077	NC_022544	GCG	2	6	705029	705034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15078	NC_022544	A	6	6	705037	705042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15085	NC_022544	T	6	6	705740	705745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15086	NC_022544	GC	3	6	705775	705780	0 %	0 %	50 %	50 %	549723346
15087	NC_022544	CG	3	6	705888	705893	0 %	0 %	50 %	50 %	549723346
15088	NC_022544	ATT	2	6	705937	705942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723346
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15092	NC_022544	TGGC	2	8	706151	706158	0 %	25 %	50 %	25 %	549723346
15093	NC_022544	TAA	2	6	706223	706228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723346
15094	NC_022544	CTG	2	6	706239	706244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723346
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15102	NC_022544	TGT	2	6	706657	706662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723346
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15108	NC_022544	CTG	2	6	707026	707031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723347
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15121	NC_022544	AGC	3	9	707736	707744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723348
15122	NC_022544	GCA	2	6	707761	707766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723348
15123	NC_022544	GC	3	6	707815	707820	0 %	0 %	50 %	50 %	549723348
15124	NC_022544	GCG	2	6	707874	707879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723348
15125	NC_022544	AGC	2	6	707931	707936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723348
15126	NC_022544	GCGCCA	2	12	707956	707967	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549723348
15127	NC_022544	ATAGCA	2	12	707981	707992	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	549723348
15128	NC_022544	CAG	2	6	707993	707998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723348
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15131	NC_022544	GTC	2	6	708182	708187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723348
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15134	NC_022544	TCAT	2	8	708219	708226	25 %	50 %	0 %	25 %	549723348
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15140	NC_022544	GC	3	6	708469	708474	0 %	0 %	50 %	50 %	549723348
15141	NC_022544	GTT	2	6	708478	708483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723348
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15149	NC_022544	GAA	2	6	708712	708717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723349
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15156	NC_022544	TCC	2	6	709096	709101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15157	NC_022544	CAA	2	6	709112	709117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723350
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15213	NC_022544	GCATA	2	10	711754	711763	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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15215	NC_022544	A	6	6	711921	711926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15216	NC_022544	A	8	8	711980	711987	100 %	0 %	0 %	0 %	549723351
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15222	NC_022544	TACC	2	8	712363	712370	25 %	25 %	0 %	50 %	549723352
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15225	NC_022544	TTGTGG	2	12	712528	712539	0 %	50 %	50 %	0 %	549723352
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15231	NC_022544	GCT	3	9	712730	712738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723352
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15233	NC_022544	GCG	2	6	712825	712830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723352
15234	NC_022544	TTCT	2	8	712840	712847	0 %	75 %	0 %	25 %	549723352
15235	NC_022544	ACG	2	6	712851	712856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723352
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15237	NC_022544	GAA	2	6	713028	713033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723352
15238	NC_022544	TGG	2	6	713167	713172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723352
15239	NC_022544	G	6	6	713174	713179	0 %	0 %	100 %	0 %	549723352
15240	NC_022544	TAC	2	6	713198	713203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723352
15241	NC_022544	TAA	2	6	713242	713247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723352
15242	NC_022544	TAA	2	6	713258	713263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723352
15243	NC_022544	ATG	2	6	713277	713282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723352
15244	NC_022544	ATATTG	2	12	713290	713301	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	549723352
15245	NC_022544	AGA	2	6	713402	713407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723352
15246	NC_022544	GCA	2	6	713468	713473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15247	NC_022544	A	7	7	713515	713521	100 %	0 %	0 %	0 %	549723353
15248	NC_022544	TGG	2	6	713538	713543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723353
15249	NC_022544	ATG	2	6	713545	713550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723353
15250	NC_022544	ATC	2	6	713563	713568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723353
15251	NC_022544	A	6	6	713716	713721	100 %	0 %	0 %	0 %	549723353
15252	NC_022544	GCG	2	6	713753	713758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723353
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15254	NC_022544	TTA	2	6	713803	713808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723353
15255	NC_022544	ATT	2	6	713827	713832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723353
15256	NC_022544	TGG	2	6	713873	713878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723353
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15258	NC_022544	GGCA	2	8	713967	713974	25 %	0 %	50 %	25 %	549723353
15259	NC_022544	TGG	2	6	713999	714004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723353
15260	NC_022544	TTA	2	6	714008	714013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723353
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15262	NC_022544	TTC	2	6	714156	714161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723353
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15264	NC_022544	GCG	2	6	714239	714244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723353
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15269	NC_022544	GGC	2	6	714357	714362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723353
15270	NC_022544	CGA	2	6	714365	714370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723353
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15272	NC_022544	A	7	7	714411	714417	100 %	0 %	0 %	0 %	549723353
15273	NC_022544	GCC	2	6	714442	714447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723353
15274	NC_022544	CGG	2	6	714465	714470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15275	NC_022544	ACG	2	6	714481	714486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15276	NC_022544	GTGA	2	8	714520	714527	25 %	25 %	50 %	0 %	549723354
15277	NC_022544	CT	3	6	714558	714563	0 %	50 %	0 %	50 %	549723354
15278	NC_022544	TC	3	6	714570	714575	0 %	50 %	0 %	50 %	549723354
15279	NC_022544	TCA	2	6	714640	714645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723354
15280	NC_022544	ACG	2	6	714647	714652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723354
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15282	NC_022544	A	6	6	714739	714744	100 %	0 %	0 %	0 %	549723354
15283	NC_022544	GC	4	8	714870	714877	0 %	0 %	50 %	50 %	549723354
15284	NC_022544	TTG	2	6	714987	714992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723354
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15290	NC_022544	GTC	2	6	715337	715342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723354
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15297	NC_022544	GTC	2	6	715545	715550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723354
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15299	NC_022544	CGGGA	2	10	715609	715618	20 %	0 %	60 %	20 %	549723354
15300	NC_022544	GCCA	2	8	715649	715656	25 %	0 %	25 %	50 %	549723354
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15311	NC_022544	GCTG	2	8	716314	716321	0 %	25 %	50 %	25 %	549723354
15312	NC_022544	ATT	2	6	716359	716364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723354
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15314	NC_022544	TAT	3	9	716510	716518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15315	NC_022544	TGA	2	6	716546	716551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723355
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15318	NC_022544	TGG	2	6	716633	716638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723355
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15320	NC_022544	CG	3	6	716702	716707	0 %	0 %	50 %	50 %	549723355
15321	NC_022544	AG	3	6	716748	716753	50 %	0 %	50 %	0 %	549723355
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15345	NC_022544	AG	3	6	717903	717908	50 %	0 %	50 %	0 %	549723356
15346	NC_022544	TA	3	6	717944	717949	50 %	50 %	0 %	0 %	549723356
15347	NC_022544	AT	4	8	717959	717966	50 %	50 %	0 %	0 %	549723356
15348	NC_022544	T	6	6	718055	718060	0 %	100 %	0 %	0 %	549723356
15349	NC_022544	T	6	6	718078	718083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15350	NC_022544	TAA	2	6	718088	718093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15351	NC_022544	TGT	2	6	718112	718117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15352	NC_022544	AT	3	6	718160	718165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15353	NC_022544	TAT	2	6	718176	718181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723357
15354	NC_022544	TCG	2	6	718306	718311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723357
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15357	NC_022544	TCG	2	6	718481	718486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723357
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15360	NC_022544	GGT	2	6	718513	718518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723357
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15362	NC_022544	CG	3	6	718627	718632	0 %	0 %	50 %	50 %	549723357
15363	NC_022544	TAT	2	6	718639	718644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723357
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15365	NC_022544	GCT	2	6	718722	718727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723357
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15367	NC_022544	ATG	2	6	718774	718779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723357
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15484	NC_022544	GCC	3	9	723732	723740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723360
15485	NC_022544	GCT	2	6	723808	723813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723360
15486	NC_022544	GCT	2	6	723859	723864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723360
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