MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 101759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_022544	GC	3	6	679614	679619	0 %	0 %	50 %	50 %	549723319
14502	NC_022544	AGA	2	6	679679	679684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723319
14503	NC_022544	ATA	2	6	679718	679723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723319
14504	NC_022544	AGT	2	6	679765	679770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14505	NC_022544	GGC	2	6	679808	679813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14506	NC_022544	ATG	2	6	679829	679834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14507	NC_022544	ATA	2	6	679991	679996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723320
14508	NC_022544	TGCGGC	2	12	680021	680032	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	549723320
14509	NC_022544	ATC	2	6	680063	680068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723320
14510	NC_022544	CGA	2	6	680166	680171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723320
14511	NC_022544	C	7	7	680347	680353	0 %	0 %	0 %	100 %	549723320
14512	NC_022544	GCG	2	6	680510	680515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723320
14513	NC_022544	TGGC	2	8	680571	680578	0 %	25 %	50 %	25 %	549723320
14514	NC_022544	GGC	2	6	680613	680618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723320
14515	NC_022544	TCG	2	6	680705	680710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723320
14516	NC_022544	GGC	2	6	680716	680721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723320
14517	NC_022544	CAGC	2	8	680742	680749	25 %	0 %	25 %	50 %	549723320
14518	NC_022544	ATG	2	6	680777	680782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723320
14519	NC_022544	A	6	6	680828	680833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14520	NC_022544	CAT	2	6	680858	680863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14521	NC_022544	CCA	2	6	680917	680922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723321
14522	NC_022544	GCC	2	6	680965	680970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723321
14523	NC_022544	AGT	2	6	680971	680976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723321
14524	NC_022544	CAG	2	6	681068	681073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723321
14525	NC_022544	GTT	2	6	681082	681087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723321
14526	NC_022544	GCA	2	6	681133	681138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723321
14527	NC_022544	ACCAGT	2	12	681192	681203	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	549723321
14528	NC_022544	GA	3	6	681223	681228	50 %	0 %	50 %	0 %	549723321
14529	NC_022544	ACC	2	6	681303	681308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723321
14530	NC_022544	TGT	2	6	681343	681348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723321
14531	NC_022544	CAG	2	6	681404	681409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723321
14532	NC_022544	TGA	2	6	681427	681432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723321
14533	NC_022544	CCA	2	6	681438	681443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723321
14534	NC_022544	CTAAG	2	10	681457	681466	40 %	20 %	20 %	20 %	549723321
14535	NC_022544	T	6	6	681516	681521	0 %	100 %	0 %	0 %	549723321
14536	NC_022544	CGC	2	6	681526	681531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723321
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14538	NC_022544	CAGC	2	8	681650	681657	25 %	0 %	25 %	50 %	549723321
14539	NC_022544	CAT	2	6	681758	681763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723321
14540	NC_022544	CCG	2	6	681777	681782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723321
14541	NC_022544	GCG	2	6	681785	681790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723321
14542	NC_022544	GCG	2	6	681823	681828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723321
14543	NC_022544	TGA	2	6	681838	681843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723321
14544	NC_022544	CCG	2	6	681858	681863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723321
14545	NC_022544	GGAG	2	8	681878	681885	25 %	0 %	75 %	0 %	549723321
14546	NC_022544	GCGT	2	8	681937	681944	0 %	25 %	50 %	25 %	549723321
14547	NC_022544	GCG	2	6	681977	681982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723321
14548	NC_022544	CCAG	2	8	682033	682040	25 %	0 %	25 %	50 %	549723321
14549	NC_022544	GTG	2	6	682044	682049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723321
14550	NC_022544	TGC	2	6	682141	682146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723321
14551	NC_022544	ATC	2	6	682218	682223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723321
14552	NC_022544	CGA	2	6	682225	682230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723321
14553	NC_022544	GCG	2	6	682255	682260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723321
14554	NC_022544	AAC	2	6	682284	682289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723321
14555	NC_022544	CAC	2	6	682301	682306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723321
14556	NC_022544	CAA	2	6	682316	682321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723321
14557	NC_022544	AT	3	6	682327	682332	50 %	50 %	0 %	0 %	549723321
14558	NC_022544	CAG	2	6	682434	682439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723322
14559	NC_022544	GCC	2	6	682527	682532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723322
14560	NC_022544	CTG	2	6	682533	682538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723322
14561	NC_022544	TAA	2	6	682539	682544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723322
14562	NC_022544	CTG	3	9	682554	682562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723322
14563	NC_022544	CCGCC	2	10	682580	682589	0 %	0 %	20 %	80 %	549723322
14564	NC_022544	GCGAC	2	10	682592	682601	20 %	0 %	40 %	40 %	549723322
14565	NC_022544	CAG	3	9	682626	682634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723322
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14569	NC_022544	GTT	2	6	682800	682805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723322
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14571	NC_022544	CGG	3	9	682844	682852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723322
14572	NC_022544	GCG	2	6	682870	682875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723322
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14577	NC_022544	GCT	2	6	682981	682986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723322
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14580	NC_022544	GC	3	6	683200	683205	0 %	0 %	50 %	50 %	549723322
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14583	NC_022544	TCAG	2	8	683315	683322	25 %	25 %	25 %	25 %	549723323
14584	NC_022544	CG	3	6	683339	683344	0 %	0 %	50 %	50 %	549723323
14585	NC_022544	CAG	2	6	683368	683373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723323
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14587	NC_022544	GGC	2	6	683400	683405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723323
14588	NC_022544	CCG	2	6	683424	683429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723323
14589	NC_022544	CAG	2	6	683524	683529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723323
14590	NC_022544	CGG	2	6	683633	683638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723323
14591	NC_022544	CCA	2	6	683670	683675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723323
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14593	NC_022544	GC	3	6	683717	683722	0 %	0 %	50 %	50 %	549723323
14594	NC_022544	CTTG	2	8	683726	683733	0 %	50 %	25 %	25 %	549723323
14595	NC_022544	TC	3	6	683734	683739	0 %	50 %	0 %	50 %	549723323
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14599	NC_022544	CGGT	2	8	683879	683886	0 %	25 %	50 %	25 %	549723324
14600	NC_022544	GC	3	6	683922	683927	0 %	0 %	50 %	50 %	549723324
14601	NC_022544	GCT	2	6	683966	683971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723324
14602	NC_022544	CAGC	2	8	683982	683989	25 %	0 %	25 %	50 %	549723324
14603	NC_022544	GGT	2	6	684064	684069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723324
14604	NC_022544	GCG	2	6	684108	684113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723324
14605	NC_022544	CGA	2	6	684114	684119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723324
14606	NC_022544	GCC	2	6	684131	684136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723324
14607	NC_022544	CGG	2	6	684141	684146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723324
14608	NC_022544	CCG	2	6	684158	684163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723324
14609	NC_022544	CGC	2	6	684168	684173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723324
14610	NC_022544	GC	3	6	684231	684236	0 %	0 %	50 %	50 %	549723324
14611	NC_022544	ACC	2	6	684242	684247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723324
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14615	NC_022544	CAG	2	6	684586	684591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723324
14616	NC_022544	TTTG	2	8	684634	684641	0 %	75 %	25 %	0 %	549723324
14617	NC_022544	CTT	2	6	684651	684656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723324
14618	NC_022544	GATCA	2	10	684667	684676	40 %	20 %	20 %	20 %	549723324
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14620	NC_022544	CCA	2	6	684765	684770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723324
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14992	NC_022544	CAT	2	6	701364	701369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723341
14993	NC_022544	CAGAC	2	10	701466	701475	40 %	0 %	20 %	40 %	549723341
14994	NC_022544	GCG	2	6	701536	701541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723341
14995	NC_022544	CAG	2	6	701544	701549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723341
14996	NC_022544	GGGC	2	8	701598	701605	0 %	0 %	75 %	25 %	549723341
14997	NC_022544	TAA	2	6	701618	701623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723341
14998	NC_022544	GC	3	6	701705	701710	0 %	0 %	50 %	50 %	549723341
14999	NC_022544	CG	3	6	701795	701800	0 %	0 %	50 %	50 %	549723341
15000	NC_022544	CAC	2	6	701817	701822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723341

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