MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 101759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_022544	CAGAC	2	10	635779	635788	40 %	0 %	20 %	40 %	549723279
13502	NC_022544	ATC	2	6	635821	635826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723279
13503	NC_022544	AGC	2	6	635878	635883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13504	NC_022544	CGG	2	6	635938	635943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723280
13505	NC_022544	CTG	2	6	636044	636049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723280
13506	NC_022544	CCG	2	6	636072	636077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723280
13507	NC_022544	CGA	2	6	636109	636114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723280
13508	NC_022544	CGG	2	6	636127	636132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723280
13509	NC_022544	CAC	2	6	636143	636148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723280
13510	NC_022544	T	6	6	636155	636160	0 %	100 %	0 %	0 %	549723280
13511	NC_022544	CCG	2	6	636190	636195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723280
13512	NC_022544	CGG	2	6	636274	636279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723280
13513	NC_022544	CGA	2	6	636292	636297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723280
13514	NC_022544	ACC	2	6	636336	636341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723280
13515	NC_022544	GCA	2	6	636349	636354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723280
13516	NC_022544	TTA	2	6	636419	636424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723281
13517	NC_022544	CGC	2	6	636453	636458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723281
13518	NC_022544	TGG	2	6	636461	636466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723281
13519	NC_022544	TCT	2	6	636493	636498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723281
13520	NC_022544	GCCA	2	8	636537	636544	25 %	0 %	25 %	50 %	549723281
13521	NC_022544	GTGACG	2	12	636555	636566	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549723281
13522	NC_022544	TTG	2	6	636589	636594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723281
13523	NC_022544	TGC	2	6	636596	636601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723281
13524	NC_022544	ACC	2	6	636622	636627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723281
13525	NC_022544	CTT	2	6	636629	636634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723281
13526	NC_022544	GCT	2	6	636677	636682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723281
13527	NC_022544	GTG	2	6	636685	636690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723281
13528	NC_022544	TCG	2	6	636733	636738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723281
13529	NC_022544	CAG	2	6	636744	636749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723281
13530	NC_022544	TAA	2	6	636761	636766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723281
13531	NC_022544	TGGC	2	8	636787	636794	0 %	25 %	50 %	25 %	549723281
13532	NC_022544	TTAT	2	8	636878	636885	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_022544	A	6	6	636976	636981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13534	NC_022544	ATG	2	6	637084	637089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723282
13535	NC_022544	CAC	2	6	637099	637104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723282
13536	NC_022544	TTTC	2	8	637125	637132	0 %	75 %	0 %	25 %	549723282
13537	NC_022544	CAG	2	6	637210	637215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723282
13538	NC_022544	TGG	2	6	637256	637261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723282
13539	NC_022544	GCG	2	6	637300	637305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723282
13540	NC_022544	CGA	2	6	637368	637373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723282
13541	NC_022544	AGA	2	6	637413	637418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723282
13542	NC_022544	CCA	2	6	637419	637424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723282
13543	NC_022544	CGTT	2	8	637448	637455	0 %	50 %	25 %	25 %	549723282
13544	NC_022544	CG	3	6	637488	637493	0 %	0 %	50 %	50 %	549723282
13545	NC_022544	CTT	2	6	637500	637505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723282
13546	NC_022544	CTGTA	2	10	637556	637565	20 %	40 %	20 %	20 %	549723282
13547	NC_022544	CTT	2	6	637587	637592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723282
13548	NC_022544	CGG	2	6	637593	637598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723282
13549	NC_022544	T	6	6	637603	637608	0 %	100 %	0 %	0 %	549723282
13550	NC_022544	TGGT	2	8	637675	637682	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13551	NC_022544	CAG	2	6	637700	637705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13552	NC_022544	GGA	2	6	637734	637739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13553	NC_022544	CT	3	6	637786	637791	0 %	50 %	0 %	50 %	549723283
13554	NC_022544	TTG	2	6	637933	637938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723283
13555	NC_022544	CAC	2	6	637975	637980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723283
13556	NC_022544	GCC	2	6	638020	638025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723283
13557	NC_022544	CAG	2	6	638060	638065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723283
13558	NC_022544	ATT	2	6	638129	638134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723283
13559	NC_022544	CTC	2	6	638136	638141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549723284
13560	NC_022544	GC	4	8	638150	638157	0 %	0 %	50 %	50 %	549723284
13561	NC_022544	AT	3	6	638182	638187	50 %	50 %	0 %	0 %	549723284
13562	NC_022544	CG	4	8	638207	638214	0 %	0 %	50 %	50 %	549723284
13563	NC_022544	TTG	2	6	638225	638230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723284
13564	NC_022544	CAGC	2	8	638234	638241	25 %	0 %	25 %	50 %	549723284
13565	NC_022544	TCG	2	6	638338	638343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723284
13566	NC_022544	GTT	2	6	638348	638353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723284
13567	NC_022544	GC	3	6	638406	638411	0 %	0 %	50 %	50 %	549723284
13568	NC_022544	TCA	2	6	638459	638464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723284
13569	NC_022544	GATC	2	8	638482	638489	25 %	25 %	25 %	25 %	549723284
13570	NC_022544	CCG	2	6	638618	638623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723284
13571	NC_022544	GGC	2	6	638628	638633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723284
13572	NC_022544	T	6	6	638682	638687	0 %	100 %	0 %	0 %	549723284
13573	NC_022544	GTCGC	2	10	638760	638769	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13574	NC_022544	ACTC	2	8	638836	638843	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13575	NC_022544	TG	3	6	638915	638920	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13576	NC_022544	TTA	2	6	638922	638927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13577	NC_022544	TGCGG	2	10	638955	638964	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13578	NC_022544	TGA	2	6	639044	639049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723285
13579	NC_022544	TGA	2	6	639074	639079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723285
13580	NC_022544	CGTG	2	8	639161	639168	0 %	25 %	50 %	25 %	549723285
13581	NC_022544	GGC	2	6	639185	639190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723285
13582	NC_022544	GC	3	6	639189	639194	0 %	0 %	50 %	50 %	549723285
13583	NC_022544	GCA	2	6	639254	639259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723285
13584	NC_022544	GCC	2	6	639296	639301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723285
13585	NC_022544	GCC	2	6	639370	639375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723286
13586	NC_022544	ATA	2	6	639392	639397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723286
13587	NC_022544	GC	3	6	639403	639408	0 %	0 %	50 %	50 %	549723286
13588	NC_022544	AAACA	2	10	639426	639435	80 %	0 %	0 %	20 %	549723286
13589	NC_022544	GCA	3	9	639520	639528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723286
13590	NC_022544	TCA	2	6	639568	639573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723286
13591	NC_022544	CCG	2	6	639714	639719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723287
13592	NC_022544	AT	3	6	639738	639743	50 %	50 %	0 %	0 %	549723287
13593	NC_022544	T	6	6	639761	639766	0 %	100 %	0 %	0 %	549723287
13594	NC_022544	GC	3	6	639812	639817	0 %	0 %	50 %	50 %	549723287
13595	NC_022544	CAG	2	6	639836	639841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723287
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13597	NC_022544	CGG	2	6	639867	639872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723287
13598	NC_022544	TA	3	6	639940	639945	50 %	50 %	0 %	0 %	549723287
13599	NC_022544	CAG	2	6	639986	639991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723287
13600	NC_022544	GCG	2	6	640048	640053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723287
13601	NC_022544	ATC	2	6	640131	640136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723287
13602	NC_022544	GTG	2	6	640137	640142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723287
13603	NC_022544	AGAC	2	8	640145	640152	50 %	0 %	25 %	25 %	549723287
13604	NC_022544	A	6	6	640222	640227	100 %	0 %	0 %	0 %	549723287
13605	NC_022544	GC	4	8	640235	640242	0 %	0 %	50 %	50 %	549723287
13606	NC_022544	CGG	2	6	640282	640287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723287
13607	NC_022544	TCG	2	6	640344	640349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723287
13608	NC_022544	GCGT	2	8	640423	640430	0 %	25 %	50 %	25 %	549723287
13609	NC_022544	CCT	2	6	640453	640458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549723287
13610	NC_022544	CCG	3	9	640488	640496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723287
13611	NC_022544	CGC	2	6	640520	640525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723287
13612	NC_022544	TGC	2	6	640539	640544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723287
13613	NC_022544	GCC	3	9	640560	640568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723287
13614	NC_022544	AGA	2	6	640676	640681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723287
13615	NC_022544	CG	3	6	640845	640850	0 %	0 %	50 %	50 %	549723288
13616	NC_022544	TAA	2	6	640869	640874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723288
13617	NC_022544	ACGG	2	8	640903	640910	25 %	0 %	50 %	25 %	549723288
13618	NC_022544	GGC	2	6	640927	640932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723288
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13620	NC_022544	CT	3	6	641039	641044	0 %	50 %	0 %	50 %	549723288
13621	NC_022544	AAT	2	6	641122	641127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723288
13622	NC_022544	T	6	6	641166	641171	0 %	100 %	0 %	0 %	549723288
13623	NC_022544	TGC	2	6	641235	641240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723288
13624	NC_022544	CGG	2	6	641325	641330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723288
13625	NC_022544	TGA	2	6	641390	641395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723288
13626	NC_022544	GCT	2	6	641425	641430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723288
13627	NC_022544	CGA	2	6	641442	641447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723288
13628	NC_022544	AAGGG	2	10	641468	641477	40 %	0 %	60 %	0 %	549723288
13629	NC_022544	TCCC	2	8	641510	641517	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13630	NC_022544	GAGG	2	8	641523	641530	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13631	NC_022544	ACGT	2	8	641571	641578	25 %	25 %	25 %	25 %	549723289
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13655	NC_022544	CTCCAG	2	12	642970	642981	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	549723289
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13678	NC_022544	AT	3	6	643937	643942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13679	NC_022544	TA	3	6	643952	643957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13680	NC_022544	ATA	2	6	643966	643971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13730	NC_022544	CGG	2	6	646287	646292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723292
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13732	NC_022544	AGA	2	6	646398	646403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723292
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13742	NC_022544	GAA	2	6	646754	646759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723292
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13983	NC_022544	ATT	2	6	656081	656086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13984	NC_022544	AAG	2	6	656103	656108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13985	NC_022544	GAA	2	6	656125	656130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13986	NC_022544	TG	3	6	656152	656157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13987	NC_022544	CAA	2	6	656179	656184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13988	NC_022544	TA	3	6	656209	656214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13989	NC_022544	GGA	2	6	656228	656233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13990	NC_022544	GATATG	2	12	656235	656246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723298
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13993	NC_022544	CAG	2	6	656412	656417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723298
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13999	NC_022544	CGCCA	2	10	656657	656666	20 %	0 %	20 %	60 %	549723298
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