MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 101759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_022544	TG	3	6	589733	589738	0 %	50 %	50 %	0 %	549723237
12502	NC_022544	GGC	2	6	589746	589751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723237
12503	NC_022544	TCA	2	6	589769	589774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723237
12504	NC_022544	CTG	3	9	589816	589824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723237
12505	NC_022544	AG	3	6	589891	589896	50 %	0 %	50 %	0 %	549723237
12506	NC_022544	TCT	2	6	589910	589915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723237
12507	NC_022544	AAT	2	6	589958	589963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723238
12508	NC_022544	T	6	6	589979	589984	0 %	100 %	0 %	0 %	549723238
12509	NC_022544	ATC	2	6	590035	590040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723238
12510	NC_022544	ATCCTG	2	12	590083	590094	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	549723238
12511	NC_022544	ATA	2	6	590101	590106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723238
12512	NC_022544	GGGC	2	8	590124	590131	0 %	0 %	75 %	25 %	549723238
12513	NC_022544	AAT	2	6	590177	590182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723238
12514	NC_022544	GAA	2	6	590189	590194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723238
12515	NC_022544	GGC	2	6	590274	590279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723238
12516	NC_022544	CAG	2	6	590293	590298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723238
12517	NC_022544	ATC	4	12	590318	590329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723238
12518	NC_022544	GCG	2	6	590351	590356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723238
12519	NC_022544	TAA	2	6	590359	590364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723238
12520	NC_022544	GC	3	6	590394	590399	0 %	0 %	50 %	50 %	549723238
12521	NC_022544	GGT	2	6	590479	590484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723238
12522	NC_022544	ATG	2	6	590501	590506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723238
12523	NC_022544	CCGCC	2	10	590562	590571	0 %	0 %	20 %	80 %	549723238
12524	NC_022544	AGAC	2	8	590605	590612	50 %	0 %	25 %	25 %	549723238
12525	NC_022544	AGC	2	6	590629	590634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723238
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12527	NC_022544	GCA	2	6	590759	590764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723238
12528	NC_022544	GCC	2	6	590833	590838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723238
12529	NC_022544	TTCG	2	8	590847	590854	0 %	50 %	25 %	25 %	549723238
12530	NC_022544	ATA	2	6	590857	590862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723238
12531	NC_022544	CGA	2	6	590925	590930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723238
12532	NC_022544	GGC	2	6	590932	590937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723238
12533	NC_022544	ACG	2	6	591028	591033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12534	NC_022544	AAAAT	2	10	591066	591075	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_022544	A	7	7	591097	591103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_022544	ATTT	2	8	591114	591121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_022544	TAAA	2	8	591151	591158	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12538	NC_022544	T	6	6	591163	591168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_022544	GTT	2	6	591195	591200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_022544	TAA	2	6	591214	591219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_022544	AT	3	6	591258	591263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_022544	TGCAAT	2	12	591292	591303	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12543	NC_022544	TGCAAT	2	12	591307	591318	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12544	NC_022544	ATT	2	6	591326	591331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_022544	GTT	2	6	591337	591342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12546	NC_022544	A	6	6	591361	591366	100 %	0 %	0 %	0 %	549723239
12547	NC_022544	ATT	2	6	591397	591402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723239
12548	NC_022544	TGAG	2	8	591413	591420	25 %	25 %	50 %	0 %	549723239
12549	NC_022544	TGA	2	6	591432	591437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723239
12550	NC_022544	ATG	2	6	591448	591453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723239
12551	NC_022544	GCT	2	6	591474	591479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723239
12552	NC_022544	GAA	2	6	591598	591603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723239
12553	NC_022544	GCA	2	6	591609	591614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723239
12554	NC_022544	AGC	2	6	591628	591633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723239
12555	NC_022544	GCG	2	6	591730	591735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723239
12556	NC_022544	TCGT	2	8	591759	591766	0 %	50 %	25 %	25 %	549723239
12557	NC_022544	TGA	2	6	591773	591778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723239
12558	NC_022544	TCT	2	6	591779	591784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723239
12559	NC_022544	CTG	2	6	591844	591849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723239
12560	NC_022544	CGC	2	6	591890	591895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723239
12561	NC_022544	CGG	2	6	592047	592052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723239
12562	NC_022544	GC	3	6	592058	592063	0 %	0 %	50 %	50 %	549723239
12563	NC_022544	GCC	2	6	592171	592176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723239
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12565	NC_022544	GCC	2	6	592264	592269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723239
12566	NC_022544	GGC	2	6	592327	592332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723239
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12569	NC_022544	GCG	2	6	592375	592380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723239
12570	NC_022544	GCT	2	6	592383	592388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723239
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12585	NC_022544	CATC	2	8	592840	592847	25 %	25 %	0 %	50 %	549723239
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12591	NC_022544	TCG	2	6	593064	593069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723240
12592	NC_022544	CTGG	2	8	593082	593089	0 %	25 %	50 %	25 %	549723240
12593	NC_022544	CTT	2	6	593102	593107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723240
12594	NC_022544	ATTA	2	8	593109	593116	50 %	50 %	0 %	0 %	549723240
12595	NC_022544	TCAA	2	8	593123	593130	50 %	25 %	0 %	25 %	549723240
12596	NC_022544	CTT	2	6	593140	593145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723240
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12598	NC_022544	GC	3	6	593246	593251	0 %	0 %	50 %	50 %	549723240
12599	NC_022544	CG	3	6	593380	593385	0 %	0 %	50 %	50 %	549723240
12600	NC_022544	GCG	2	6	593497	593502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723240
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12602	NC_022544	CCA	2	6	593574	593579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723240
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12605	NC_022544	GCC	2	6	593731	593736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723240
12606	NC_022544	GC	3	6	593747	593752	0 %	0 %	50 %	50 %	549723240
12607	NC_022544	T	6	6	593872	593877	0 %	100 %	0 %	0 %	549723240
12608	NC_022544	GGC	2	6	593947	593952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723240
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12610	NC_022544	TTG	2	6	593987	593992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723240
12611	NC_022544	GCG	2	6	594010	594015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723240
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12613	NC_022544	CGC	2	6	594143	594148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723240
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12615	NC_022544	AG	3	6	594276	594281	50 %	0 %	50 %	0 %	549723240
12616	NC_022544	ATCC	2	8	594297	594304	25 %	25 %	0 %	50 %	549723241
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12620	NC_022544	CGC	2	6	594601	594606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723241
12621	NC_022544	GAG	2	6	594636	594641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723241
12622	NC_022544	CGC	2	6	594668	594673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723241
12623	NC_022544	TGC	2	6	594737	594742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723241
12624	NC_022544	GACT	2	8	594743	594750	25 %	25 %	25 %	25 %	549723241
12625	NC_022544	GGC	2	6	594751	594756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723241
12626	NC_022544	GAC	2	6	594795	594800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723241
12627	NC_022544	GGC	2	6	594821	594826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723241
12628	NC_022544	T	7	7	594866	594872	0 %	100 %	0 %	0 %	549723241
12629	NC_022544	CGA	2	6	594898	594903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723241
12630	NC_022544	CGA	2	6	594984	594989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723241
12631	NC_022544	CTG	2	6	595020	595025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723241
12632	NC_022544	GCT	2	6	595055	595060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723241
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12634	NC_022544	GGC	2	6	595125	595130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723242
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12636	NC_022544	TGG	2	6	595327	595332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723242
12637	NC_022544	GCC	2	6	595394	595399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723242
12638	NC_022544	CGG	2	6	595432	595437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723242
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12640	NC_022544	TGGC	2	8	595520	595527	0 %	25 %	50 %	25 %	549723242
12641	NC_022544	GTC	2	6	595560	595565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723242
12642	NC_022544	GCG	2	6	595645	595650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723242
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12644	NC_022544	GATA	2	8	595697	595704	50 %	25 %	25 %	0 %	549723242
12645	NC_022544	GGC	3	9	595712	595720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723242
12646	NC_022544	CGGATG	2	12	595765	595776	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549723242
12647	NC_022544	CGC	2	6	595798	595803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723242
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12649	NC_022544	GC	3	6	595808	595813	0 %	0 %	50 %	50 %	549723242
12650	NC_022544	GC	3	6	595933	595938	0 %	0 %	50 %	50 %	549723242
12651	NC_022544	TGA	2	6	595949	595954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723242
12652	NC_022544	TCTG	2	8	595984	595991	0 %	50 %	25 %	25 %	549723242
12653	NC_022544	GGC	2	6	596003	596008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12654	NC_022544	GCC	2	6	596021	596026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12655	NC_022544	TTTA	2	8	596034	596041	25 %	75 %	0 %	0 %	549723243
12656	NC_022544	GA	3	6	596094	596099	50 %	0 %	50 %	0 %	549723243
12657	NC_022544	GACGT	2	10	596121	596130	20 %	20 %	40 %	20 %	549723243
12658	NC_022544	TCAGAT	2	12	596142	596153	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549723243
12659	NC_022544	ATC	2	6	596255	596260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723243
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12661	NC_022544	ACTG	2	8	596328	596335	25 %	25 %	25 %	25 %	549723243
12662	NC_022544	CG	3	6	596376	596381	0 %	0 %	50 %	50 %	549723243
12663	NC_022544	CCTGCT	2	12	596487	596498	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	549723243
12664	NC_022544	GC	5	10	596597	596606	0 %	0 %	50 %	50 %	549723243
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12667	NC_022544	CGT	2	6	596721	596726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723243
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12670	NC_022544	TCG	2	6	596789	596794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723243
12671	NC_022544	CAG	2	6	596803	596808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723243
12672	NC_022544	GAT	2	6	596872	596877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723243
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12674	NC_022544	CTG	2	6	596974	596979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723243
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12677	NC_022544	GCA	2	6	597054	597059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723243
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12688	NC_022544	ATT	2	6	597591	597596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723244
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12690	NC_022544	TGCG	2	8	597691	597698	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12691	NC_022544	CGA	2	6	597716	597721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12692	NC_022544	ATG	2	6	597786	597791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723245
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12700	NC_022544	GGC	2	6	597987	597992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723245
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12721	NC_022544	ATT	2	6	599084	599089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12722	NC_022544	CA	3	6	599093	599098	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12723	NC_022544	GT	3	6	599196	599201	0 %	50 %	50 %	0 %	549723247
12724	NC_022544	CG	3	6	599267	599272	0 %	0 %	50 %	50 %	549723247
12725	NC_022544	CGA	2	6	599327	599332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723247
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12728	NC_022544	ACCG	2	8	599555	599562	25 %	0 %	25 %	50 %	549723247
12729	NC_022544	AGC	2	6	599599	599604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723247
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12731	NC_022544	CG	4	8	599615	599622	0 %	0 %	50 %	50 %	549723247
12732	NC_022544	CGAGC	2	10	599687	599696	20 %	0 %	40 %	40 %	549723247
12733	NC_022544	CGG	3	9	599789	599797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723247
12734	NC_022544	GC	3	6	599848	599853	0 %	0 %	50 %	50 %	549723247
12735	NC_022544	ACT	2	6	599872	599877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723247
12736	NC_022544	ATGGTG	2	12	599892	599903	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	549723247
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12738	NC_022544	CTT	2	6	599936	599941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723247
12739	NC_022544	TAC	2	6	599964	599969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723247
12740	NC_022544	GC	4	8	600051	600058	0 %	0 %	50 %	50 %	549723247
12741	NC_022544	CGG	2	6	600112	600117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723247
12742	NC_022544	GCG	2	6	600118	600123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723247
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12744	NC_022544	CCG	2	6	600241	600246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723247
12745	NC_022544	CTG	2	6	600294	600299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723247
12746	NC_022544	GCG	2	6	600328	600333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723247
12747	NC_022544	GCG	3	9	600414	600422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723247
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12754	NC_022544	AC	4	8	600575	600582	50 %	0 %	0 %	50 %	549723248
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12812	NC_022544	GC	3	6	603700	603705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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12820	NC_022544	TAAT	2	8	603973	603980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12821	NC_022544	ATCT	2	8	603988	603995	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12822	NC_022544	ATA	2	6	604036	604041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12823	NC_022544	GT	4	8	604075	604082	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12824	NC_022544	CTA	2	6	604121	604126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723253
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12829	NC_022544	ATA	2	6	604487	604492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723253
12830	NC_022544	CCG	3	9	604592	604600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723253
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12834	NC_022544	AGGGA	2	10	604674	604683	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
12835	NC_022544	GAT	2	6	604731	604736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723254
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12842	NC_022544	CAG	2	6	605104	605109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723254
12843	NC_022544	ATTC	2	8	605227	605234	25 %	50 %	0 %	25 %	549723254
12844	NC_022544	T	6	6	605300	605305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12845	NC_022544	TTC	2	6	605340	605345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723255
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12847	NC_022544	G	7	7	605380	605386	0 %	0 %	100 %	0 %	549723255
12848	NC_022544	CG	3	6	605403	605408	0 %	0 %	50 %	50 %	549723255
12849	NC_022544	TTAT	2	8	605409	605416	25 %	75 %	0 %	0 %	549723255
12850	NC_022544	CGG	2	6	605421	605426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723255
12851	NC_022544	AGAA	2	8	605511	605518	75 %	0 %	25 %	0 %	549723255
12852	NC_022544	A	6	6	605517	605522	100 %	0 %	0 %	0 %	549723255
12853	NC_022544	CGC	2	6	605535	605540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723255
12854	NC_022544	TAT	2	6	605581	605586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723255
12855	NC_022544	GTCG	2	8	605653	605660	0 %	25 %	50 %	25 %	549723255
12856	NC_022544	A	6	6	605680	605685	100 %	0 %	0 %	0 %	549723255
12857	NC_022544	AACC	2	8	605809	605816	50 %	0 %	0 %	50 %	549723255
12858	NC_022544	TTA	2	6	605824	605829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723255
12859	NC_022544	TGA	2	6	605877	605882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723255
12860	NC_022544	GC	3	6	605922	605927	0 %	0 %	50 %	50 %	549723255
12861	NC_022544	AG	3	6	606004	606009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12862	NC_022544	GAA	2	6	606034	606039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723256
12863	NC_022544	AGC	2	6	606086	606091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723256
12864	NC_022544	GGC	2	6	606109	606114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723256
12865	NC_022544	CGG	2	6	606168	606173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723256
12866	NC_022544	ATC	2	6	606216	606221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723256
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12870	NC_022544	GC	3	6	606522	606527	0 %	0 %	50 %	50 %	549723256
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12873	NC_022544	ATTA	2	8	606578	606585	50 %	50 %	0 %	0 %	549723256
12874	NC_022544	ACAG	2	8	606608	606615	50 %	0 %	25 %	25 %	549723256
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12967	NC_022544	A	6	6	611478	611483	100 %	0 %	0 %	0 %	549723260
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12977	NC_022544	CAG	2	6	611812	611817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723260
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12980	NC_022544	TGC	2	6	611968	611973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723260
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12983	NC_022544	GCG	2	6	612114	612119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723260
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12986	NC_022544	TGGC	2	8	612237	612244	0 %	25 %	50 %	25 %	549723261
12987	NC_022544	ATAA	2	8	612246	612253	75 %	25 %	0 %	0 %	549723261
12988	NC_022544	CTG	2	6	612331	612336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723261
12989	NC_022544	A	8	8	612337	612344	100 %	0 %	0 %	0 %	549723261
12990	NC_022544	GA	3	6	612407	612412	50 %	0 %	50 %	0 %	549723261
12991	NC_022544	ATGA	2	8	612453	612460	50 %	25 %	25 %	0 %	549723261
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12994	NC_022544	CTC	2	6	612532	612537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12995	NC_022544	ATG	2	6	612547	612552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12996	NC_022544	AT	3	6	612558	612563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12997	NC_022544	CAT	2	6	612597	612602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12998	NC_022544	A	7	7	612615	612621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12999	NC_022544	ATT	2	6	612644	612649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13000	NC_022544	TACT	2	8	612691	612698	25 %	50 %	0 %	25 %	549723262

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