MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 101759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_022544	CGG	2	6	542032	542037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723196
11502	NC_022544	CGC	3	9	542044	542052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723196
11503	NC_022544	GCA	2	6	542057	542062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723196
11504	NC_022544	CGC	2	6	542077	542082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723196
11505	NC_022544	GGC	2	6	542126	542131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723196
11506	NC_022544	GC	3	6	542130	542135	0 %	0 %	50 %	50 %	549723196
11507	NC_022544	GC	4	8	542147	542154	0 %	0 %	50 %	50 %	549723196
11508	NC_022544	CAAAA	2	10	542165	542174	80 %	0 %	0 %	20 %	549723196
11509	NC_022544	A	6	6	542171	542176	100 %	0 %	0 %	0 %	549723196
11510	NC_022544	CG	4	8	542199	542206	0 %	0 %	50 %	50 %	549723196
11511	NC_022544	GC	3	6	542262	542267	0 %	0 %	50 %	50 %	549723196
11512	NC_022544	AAAG	2	8	542300	542307	75 %	0 %	25 %	0 %	549723196
11513	NC_022544	CCA	2	6	542326	542331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723196
11514	NC_022544	GTA	2	6	542337	542342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723196
11515	NC_022544	GTG	2	6	542355	542360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723196
11516	NC_022544	A	6	6	542398	542403	100 %	0 %	0 %	0 %	549723196
11517	NC_022544	GGC	2	6	542414	542419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723196
11518	NC_022544	GGC	2	6	542426	542431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723196
11519	NC_022544	GCG	2	6	542457	542462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723196
11520	NC_022544	CTTT	2	8	542475	542482	0 %	75 %	0 %	25 %	549723196
11521	NC_022544	TGG	2	6	542491	542496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723196
11522	NC_022544	GCG	2	6	542584	542589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723196
11523	NC_022544	GCA	2	6	542591	542596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723196
11524	NC_022544	ACG	2	6	542631	542636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723196
11525	NC_022544	GAT	2	6	542658	542663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723196
11526	NC_022544	CGC	2	6	542680	542685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723196
11527	NC_022544	ATT	2	6	542739	542744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723196
11528	NC_022544	ATA	2	6	542749	542754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723196
11529	NC_022544	TTC	2	6	542775	542780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723196
11530	NC_022544	AG	3	6	542798	542803	50 %	0 %	50 %	0 %	549723196
11531	NC_022544	AG	5	10	542852	542861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_022544	TGA	2	6	542893	542898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723197
11533	NC_022544	CAG	2	6	542907	542912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723197
11534	NC_022544	A	6	6	542920	542925	100 %	0 %	0 %	0 %	549723197
11535	NC_022544	GC	3	6	543007	543012	0 %	0 %	50 %	50 %	549723197
11536	NC_022544	GCC	2	6	543019	543024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723197
11537	NC_022544	CTG	2	6	543045	543050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723197
11538	NC_022544	GCG	2	6	543102	543107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723197
11539	NC_022544	CGC	2	6	543108	543113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723197
11540	NC_022544	AGA	2	6	543133	543138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723197
11541	NC_022544	GCC	2	6	543167	543172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723197
11542	NC_022544	GCG	2	6	543306	543311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723198
11543	NC_022544	GTG	2	6	543446	543451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723198
11544	NC_022544	CGC	2	6	543531	543536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723198
11545	NC_022544	GAT	2	6	543554	543559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723198
11546	NC_022544	A	6	6	543597	543602	100 %	0 %	0 %	0 %	549723198
11547	NC_022544	GGC	2	6	543725	543730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723198
11548	NC_022544	ACG	2	6	543752	543757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723198
11549	NC_022544	ATT	2	6	543788	543793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723198
11550	NC_022544	GGC	2	6	543809	543814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11551	NC_022544	TTG	2	6	543892	543897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_022544	TCAG	2	8	543936	543943	25 %	25 %	25 %	25 %	549723199
11553	NC_022544	TGA	2	6	543965	543970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723199
11554	NC_022544	GCG	2	6	544033	544038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723199
11555	NC_022544	TGA	2	6	544170	544175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723199
11556	NC_022544	CGTA	2	8	544323	544330	25 %	25 %	25 %	25 %	549723199
11557	NC_022544	AGGCGA	2	12	544380	544391	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	549723199
11558	NC_022544	GAA	2	6	544549	544554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723199
11559	NC_022544	CAA	2	6	544590	544595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723199
11560	NC_022544	GAC	2	6	544636	544641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723199
11561	NC_022544	CTG	2	6	544738	544743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723199
11562	NC_022544	GTAC	2	8	544806	544813	25 %	25 %	25 %	25 %	549723199
11563	NC_022544	TGAT	2	8	544880	544887	25 %	50 %	25 %	0 %	549723199
11564	NC_022544	GAC	2	6	545005	545010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723199
11565	NC_022544	AAG	2	6	545057	545062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723199
11566	NC_022544	CGG	2	6	545066	545071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723199
11567	NC_022544	AAG	2	6	545180	545185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723199
11568	NC_022544	A	6	6	545192	545197	100 %	0 %	0 %	0 %	549723199
11569	NC_022544	CTA	2	6	545199	545204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723199
11570	NC_022544	GCG	3	9	545224	545232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723199
11571	NC_022544	CTG	2	6	545254	545259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723199
11572	NC_022544	TGC	3	9	545279	545287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723199
11573	NC_022544	CGA	2	6	545301	545306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723199
11574	NC_022544	GAT	2	6	545310	545315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723199
11575	NC_022544	GTCG	2	8	545352	545359	0 %	25 %	50 %	25 %	549723199
11576	NC_022544	CGA	2	6	545400	545405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723199
11577	NC_022544	AAG	2	6	545414	545419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723199
11578	NC_022544	CTG	2	6	545461	545466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723199
11579	NC_022544	CAC	2	6	545526	545531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723199
11580	NC_022544	CGC	2	6	545571	545576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723199
11581	NC_022544	GCT	3	9	545691	545699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723199
11582	NC_022544	CCG	2	6	545754	545759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723199
11583	NC_022544	AGCGCC	2	12	545863	545874	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11584	NC_022544	T	6	6	545883	545888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_022544	ATA	2	6	545889	545894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_022544	GGC	2	6	545939	545944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11587	NC_022544	TGG	2	6	545966	545971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_022544	A	6	6	545990	545995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_022544	TAT	2	6	546030	546035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723200
11590	NC_022544	TCA	2	6	546080	546085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723200
11591	NC_022544	TGC	2	6	546125	546130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723200
11592	NC_022544	GC	3	6	546129	546134	0 %	0 %	50 %	50 %	549723200
11593	NC_022544	CTG	2	6	546268	546273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723200
11594	NC_022544	AAG	2	6	546314	546319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723200
11595	NC_022544	GTC	2	6	546389	546394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723200
11596	NC_022544	CGC	2	6	546402	546407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723200
11597	NC_022544	CCG	2	6	546439	546444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723200
11598	NC_022544	ACC	2	6	546484	546489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723200
11599	NC_022544	TGG	2	6	546527	546532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723200
11600	NC_022544	ATC	2	6	546536	546541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723200
11601	NC_022544	CGC	2	6	546551	546556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723200
11602	NC_022544	CTA	2	6	546564	546569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723200
11603	NC_022544	AGAA	2	8	546572	546579	75 %	0 %	25 %	0 %	549723200
11604	NC_022544	GC	3	6	546639	546644	0 %	0 %	50 %	50 %	549723200
11605	NC_022544	A	6	6	546653	546658	100 %	0 %	0 %	0 %	549723200
11606	NC_022544	T	6	6	546670	546675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_022544	CTG	2	6	546700	546705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11608	NC_022544	GGC	2	6	546757	546762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11609	NC_022544	GCA	2	6	546828	546833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11610	NC_022544	TTC	2	6	546839	546844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11611	NC_022544	CAA	2	6	546870	546875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11612	NC_022544	GGC	2	6	546891	546896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11613	NC_022544	CTG	2	6	546922	546927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723201
11614	NC_022544	GTG	2	6	547006	547011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723201
11615	NC_022544	CTG	2	6	547024	547029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723201
11616	NC_022544	TGG	2	6	547030	547035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723201
11617	NC_022544	GCT	2	6	547038	547043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723201
11618	NC_022544	CGC	2	6	547070	547075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723201
11619	NC_022544	ATCT	2	8	547095	547102	25 %	50 %	0 %	25 %	549723201
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11621	NC_022544	CGC	2	6	547118	547123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723201
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11864	NC_022544	CGC	3	9	558505	558513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723210
11865	NC_022544	CAG	2	6	558529	558534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723210
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11868	NC_022544	TGA	2	6	558638	558643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723210
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11884	NC_022544	TCT	2	6	559442	559447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723210
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11892	NC_022544	AGCC	2	8	559771	559778	25 %	0 %	25 %	50 %	549723210
11893	NC_022544	GTC	2	6	559792	559797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723210
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11903	NC_022544	TTC	2	6	560137	560142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723210
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11907	NC_022544	TCA	2	6	560454	560459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11953	NC_022544	C	6	6	562406	562411	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11954	NC_022544	TTA	2	6	562412	562417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11955	NC_022544	AAC	2	6	562451	562456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11969	NC_022544	TGC	2	6	563177	563182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723215
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11971	NC_022544	TCA	2	6	563201	563206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723215
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11976	NC_022544	TC	3	6	563409	563414	0 %	50 %	0 %	50 %	549723215
11977	NC_022544	CAAC	2	8	563559	563566	50 %	0 %	0 %	50 %	549723215
11978	NC_022544	AGC	3	9	563588	563596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723215
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11980	NC_022544	CCG	2	6	563642	563647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723215
11981	NC_022544	CGA	2	6	563684	563689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723215
11982	NC_022544	GAT	2	6	563730	563735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723215
11983	NC_022544	GATC	2	8	563757	563764	25 %	25 %	25 %	25 %	549723215
11984	NC_022544	TGT	2	6	563807	563812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723215
11985	NC_022544	CAGC	2	8	563816	563823	25 %	0 %	25 %	50 %	549723215
11986	NC_022544	CAT	2	6	563832	563837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723215
11987	NC_022544	TCA	2	6	563877	563882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723215
11988	NC_022544	GAT	2	6	563923	563928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11989	NC_022544	GAC	2	6	563955	563960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11990	NC_022544	GC	3	6	563976	563981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11991	NC_022544	AG	3	6	563991	563996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11992	NC_022544	GGC	2	6	564022	564027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723216
11993	NC_022544	CGG	3	9	564103	564111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723216
11994	NC_022544	CTT	2	6	564151	564156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723216
11995	NC_022544	GTTGC	2	10	564190	564199	0 %	40 %	40 %	20 %	549723216
11996	NC_022544	TGC	2	6	564231	564236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723216
11997	NC_022544	CCG	2	6	564262	564267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723216
11998	NC_022544	ATCCTG	2	12	564314	564325	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	549723216
11999	NC_022544	AG	3	6	564422	564427	50 %	0 %	50 %	0 %	549723216
12000	NC_022544	CCT	2	6	564472	564477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549723216

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