MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 101759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_022544	CGA	2	6	519506	519511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723174
11002	NC_022544	ATTGAT	2	12	519534	519545	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	549723174
11003	NC_022544	CGA	2	6	519566	519571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723174
11004	NC_022544	TGG	2	6	519628	519633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723174
11005	NC_022544	TTA	2	6	519669	519674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723174
11006	NC_022544	CT	3	6	519731	519736	0 %	50 %	0 %	50 %	549723174
11007	NC_022544	ATC	2	6	519739	519744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723174
11008	NC_022544	GC	3	6	519888	519893	0 %	0 %	50 %	50 %	549723174
11009	NC_022544	TGGCGC	2	12	519967	519978	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	549723174
11010	NC_022544	TGA	2	6	520013	520018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723174
11011	NC_022544	CAG	2	6	520059	520064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723174
11012	NC_022544	GGC	2	6	520070	520075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723174
11013	NC_022544	CAC	2	6	520088	520093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723174
11014	NC_022544	TGG	2	6	520096	520101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723174
11015	NC_022544	CAA	2	6	520188	520193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723174
11016	NC_022544	GGC	2	6	520199	520204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723174
11017	NC_022544	AGTT	2	8	520237	520244	25 %	50 %	25 %	0 %	549723174
11018	NC_022544	GAG	2	6	520248	520253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723174
11019	NC_022544	GCC	2	6	520257	520262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723174
11020	NC_022544	GAA	2	6	520272	520277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723174
11021	NC_022544	GCG	2	6	520287	520292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723174
11022	NC_022544	CAT	2	6	520325	520330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11023	NC_022544	CGT	2	6	520335	520340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11024	NC_022544	TTTC	2	8	520349	520356	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11025	NC_022544	CGC	2	6	520393	520398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11026	NC_022544	CTCG	2	8	520413	520420	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11027	NC_022544	AGA	2	6	520455	520460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_022544	GCG	2	6	520469	520474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11029	NC_022544	GGA	2	6	520546	520551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723175
11030	NC_022544	TTC	2	6	520567	520572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723175
11031	NC_022544	CGCGG	2	10	520646	520655	0 %	0 %	60 %	40 %	549723175
11032	NC_022544	CGA	2	6	520705	520710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723175
11033	NC_022544	ATC	2	6	520733	520738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723175
11034	NC_022544	TCG	2	6	520782	520787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723175
11035	NC_022544	AGC	2	6	520834	520839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723175
11036	NC_022544	CA	3	6	520854	520859	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11037	NC_022544	A	6	6	520873	520878	100 %	0 %	0 %	0 %	549723176
11038	NC_022544	GAT	2	6	520889	520894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723176
11039	NC_022544	GCT	2	6	520919	520924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723176
11040	NC_022544	CGG	2	6	520948	520953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723176
11041	NC_022544	ATG	2	6	520980	520985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723176
11042	NC_022544	CGG	2	6	521039	521044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723176
11043	NC_022544	GTG	2	6	521121	521126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723176
11044	NC_022544	T	6	6	521162	521167	0 %	100 %	0 %	0 %	549723176
11045	NC_022544	GAA	2	6	521192	521197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549723176
11046	NC_022544	CGG	2	6	521209	521214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723176
11047	NC_022544	GC	3	6	521293	521298	0 %	0 %	50 %	50 %	549723176
11048	NC_022544	CGG	2	6	521320	521325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723176
11049	NC_022544	GTG	2	6	521340	521345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723176
11050	NC_022544	CT	3	6	521355	521360	0 %	50 %	0 %	50 %	549723176
11051	NC_022544	GCG	2	6	521389	521394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723176
11052	NC_022544	CTG	2	6	521397	521402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723176
11053	NC_022544	GCT	2	6	521403	521408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723176
11054	NC_022544	GC	3	6	521413	521418	0 %	0 %	50 %	50 %	549723176
11055	NC_022544	TGG	2	6	521429	521434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723176
11056	NC_022544	GTG	2	6	521439	521444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723176
11057	NC_022544	CGC	2	6	521453	521458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723176
11058	NC_022544	GCTGG	2	10	521463	521472	0 %	20 %	60 %	20 %	549723176
11059	NC_022544	GAAG	2	8	521510	521517	50 %	0 %	50 %	0 %	549723176
11060	NC_022544	AGC	2	6	521621	521626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723176
11061	NC_022544	GTG	2	6	521646	521651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723176
11062	NC_022544	CCG	3	9	521656	521664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723176
11063	NC_022544	CTG	2	6	521715	521720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723176
11064	NC_022544	GTTGGC	2	12	521778	521789	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	549723176
11065	NC_022544	GC	3	6	521791	521796	0 %	0 %	50 %	50 %	549723176
11066	NC_022544	GAT	2	6	521868	521873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723176
11067	NC_022544	GCC	2	6	521940	521945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723176
11068	NC_022544	GCG	2	6	521956	521961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723176
11069	NC_022544	GTC	2	6	522030	522035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723176
11070	NC_022544	TTG	2	6	522055	522060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723176
11071	NC_022544	TTG	2	6	522082	522087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723176
11072	NC_022544	GCGCT	2	10	522184	522193	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11073	NC_022544	TCA	2	6	522228	522233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11074	NC_022544	CGC	2	6	522243	522248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11075	NC_022544	T	6	6	522260	522265	0 %	100 %	0 %	0 %	549723177
11076	NC_022544	GC	3	6	522311	522316	0 %	0 %	50 %	50 %	549723177
11077	NC_022544	CGC	2	6	522335	522340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723177
11078	NC_022544	CATT	2	8	522394	522401	25 %	50 %	0 %	25 %	549723177
11079	NC_022544	GGAA	2	8	522499	522506	50 %	0 %	50 %	0 %	549723177
11080	NC_022544	GCG	2	6	522601	522606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723177
11081	NC_022544	TTTC	2	8	522674	522681	0 %	75 %	0 %	25 %	549723177
11082	NC_022544	CGG	2	6	522687	522692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723177
11083	NC_022544	T	6	6	522767	522772	0 %	100 %	0 %	0 %	549723177
11084	NC_022544	CGG	2	6	522853	522858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723177
11085	NC_022544	GCA	2	6	522881	522886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723177
11086	NC_022544	GAAT	2	8	522945	522952	50 %	25 %	25 %	0 %	549723177
11087	NC_022544	GGC	2	6	522984	522989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723177
11088	NC_022544	CAC	2	6	523005	523010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723177
11089	NC_022544	CTT	2	6	523067	523072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723177
11090	NC_022544	T	6	6	523076	523081	0 %	100 %	0 %	0 %	549723177
11091	NC_022544	AAT	2	6	523090	523095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723177
11092	NC_022544	ATT	2	6	523104	523109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723177
11093	NC_022544	CATA	2	8	523122	523129	50 %	25 %	0 %	25 %	549723177
11094	NC_022544	CGG	2	6	523292	523297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11095	NC_022544	G	6	6	523296	523301	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11096	NC_022544	CTG	2	6	523308	523313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11097	NC_022544	TGA	2	6	523320	523325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_022544	TGAA	2	8	523336	523343	50 %	25 %	25 %	0 %	549723178
11099	NC_022544	GGC	2	6	523386	523391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723178
11100	NC_022544	CTA	2	6	523463	523468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723178
11101	NC_022544	GCC	2	6	523521	523526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723178
11102	NC_022544	GCTG	2	8	523563	523570	0 %	25 %	50 %	25 %	549723178
11103	NC_022544	GTAC	2	8	523603	523610	25 %	25 %	25 %	25 %	549723178
11104	NC_022544	CG	3	6	523674	523679	0 %	0 %	50 %	50 %	549723178
11105	NC_022544	TCC	2	6	523682	523687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549723178
11106	NC_022544	ATA	2	6	523709	523714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723178
11107	NC_022544	TATT	2	8	523721	523728	25 %	75 %	0 %	0 %	549723178
11108	NC_022544	TAA	2	6	523752	523757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723178
11109	NC_022544	GGC	2	6	523759	523764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723178
11110	NC_022544	CGG	2	6	523802	523807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723178
11111	NC_022544	GGT	2	6	523825	523830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723178
11112	NC_022544	CGA	3	9	523832	523840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723178
11113	NC_022544	TCT	2	6	523876	523881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723178
11114	NC_022544	ACC	2	6	523990	523995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723179
11115	NC_022544	CAC	2	6	524070	524075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723179
11116	NC_022544	TGC	2	6	524093	524098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723179
11117	NC_022544	CCG	2	6	524122	524127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723179
11118	NC_022544	CGC	2	6	524136	524141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723179
11119	NC_022544	CGA	2	6	524207	524212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723179
11120	NC_022544	ATA	2	6	524251	524256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723179
11121	NC_022544	G	6	6	524294	524299	0 %	0 %	100 %	0 %	549723179
11122	NC_022544	CAGGT	2	10	524447	524456	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11123	NC_022544	GGAA	2	8	524459	524466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11124	NC_022544	CCCA	2	8	524514	524521	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11125	NC_022544	CTG	2	6	524548	524553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11126	NC_022544	AAT	2	6	524726	524731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723180
11127	NC_022544	GCG	2	6	524734	524739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723180
11128	NC_022544	ACATCC	2	12	524790	524801	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	549723180
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11130	NC_022544	GC	3	6	524893	524898	0 %	0 %	50 %	50 %	549723180
11131	NC_022544	CAG	2	6	524972	524977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723180
11132	NC_022544	GATT	2	8	525028	525035	25 %	50 %	25 %	0 %	549723180
11133	NC_022544	TGT	2	6	525042	525047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723180
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11137	NC_022544	GCT	2	6	525224	525229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723180
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11142	NC_022544	GCT	2	6	525548	525553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723180
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11153	NC_022544	GCC	2	6	526242	526247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11154	NC_022544	TGTTA	2	10	526305	526314	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11155	NC_022544	CGT	2	6	526368	526373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723181
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11160	NC_022544	A	6	6	526741	526746	100 %	0 %	0 %	0 %	549723182
11161	NC_022544	AGGG	2	8	526776	526783	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11162	NC_022544	T	6	6	526791	526796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11163	NC_022544	GGCT	2	8	526803	526810	0 %	25 %	50 %	25 %	549723183
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11177	NC_022544	T	6	6	527443	527448	0 %	100 %	0 %	0 %	549723184
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11190	NC_022544	TGG	2	6	527950	527955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11194	NC_022544	GAG	2	6	528066	528071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11211	NC_022544	TCG	2	6	528931	528936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11214	NC_022544	TTAA	2	8	529059	529066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11218	NC_022544	A	6	6	529191	529196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11243	NC_022544	GCC	2	6	530113	530118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723187
11244	NC_022544	TGC	2	6	530122	530127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723187
11245	NC_022544	GCG	2	6	530205	530210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723187
11246	NC_022544	CAG	2	6	530242	530247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723187
11247	NC_022544	AAC	2	6	530273	530278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723187
11248	NC_022544	TCAA	2	8	530324	530331	50 %	25 %	0 %	25 %	549723187
11249	NC_022544	T	7	7	530456	530462	0 %	100 %	0 %	0 %	549723187
11250	NC_022544	TGCG	2	8	530618	530625	0 %	25 %	50 %	25 %	549723187
11251	NC_022544	TTGCG	2	10	530629	530638	0 %	40 %	40 %	20 %	549723187
11252	NC_022544	AAGA	2	8	530690	530697	75 %	0 %	25 %	0 %	549723187
11253	NC_022544	ACGA	2	8	530707	530714	50 %	0 %	25 %	25 %	549723187
11254	NC_022544	CGA	3	9	530730	530738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723187
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11258	NC_022544	TCG	2	6	530895	530900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723187
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11262	NC_022544	CCG	2	6	531027	531032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723187
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11265	NC_022544	CTT	2	6	531111	531116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723187
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11274	NC_022544	TAGCGG	2	12	531465	531476	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549723187
11275	NC_022544	GCTG	2	8	531524	531531	0 %	25 %	50 %	25 %	549723187
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11318	NC_022544	CGT	2	6	533673	533678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11338	NC_022544	ATT	2	6	534469	534474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11352	NC_022544	AGG	2	6	535318	535323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723190
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11356	NC_022544	CG	3	6	535479	535484	0 %	0 %	50 %	50 %	549723190
11357	NC_022544	GAAA	2	8	535494	535501	75 %	0 %	25 %	0 %	549723190
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11365	NC_022544	TAAA	2	8	535786	535793	75 %	25 %	0 %	0 %	549723190
11366	NC_022544	TGA	2	6	535810	535815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723190
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11368	NC_022544	TGA	2	6	535849	535854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723190
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11374	NC_022544	GCC	3	9	536112	536120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723190
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11463	NC_022544	CAG	2	6	540241	540246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723195
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11475	NC_022544	CGT	2	6	540941	540946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723196
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11483	NC_022544	GC	3	6	541236	541241	0 %	0 %	50 %	50 %	549723196
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11485	NC_022544	ACC	2	6	541356	541361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723196
11486	NC_022544	CG	3	6	541491	541496	0 %	0 %	50 %	50 %	549723196
11487	NC_022544	GTT	2	6	541502	541507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723196
11488	NC_022544	CTGA	2	8	541548	541555	25 %	25 %	25 %	25 %	549723196
11489	NC_022544	GCG	2	6	541570	541575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723196
11490	NC_022544	GAC	3	9	541623	541631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723196
11491	NC_022544	GGT	2	6	541655	541660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723196
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11493	NC_022544	GC	3	6	541707	541712	0 %	0 %	50 %	50 %	549723196
11494	NC_022544	GCT	2	6	541730	541735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723196
11495	NC_022544	CTG	2	6	541752	541757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723196
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