MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 101759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
100001	NC_022544	CTG	2	6	4728404	4728409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549727024
100002	NC_022544	CG	3	6	4728418	4728423	0 %	0 %	50 %	50 %	549727024
100003	NC_022544	GGC	2	6	4728467	4728472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549727024
100004	NC_022544	AAGCG	2	10	4728518	4728527	40 %	0 %	40 %	20 %	549727024
100005	NC_022544	CGT	2	6	4728535	4728540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549727024
100006	NC_022544	GCT	2	6	4728586	4728591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549727024
100007	NC_022544	CTTC	2	8	4728682	4728689	0 %	50 %	0 %	50 %	549727024
100008	NC_022544	CG	3	6	4728764	4728769	0 %	0 %	50 %	50 %	549727024
100009	NC_022544	GC	3	6	4728793	4728798	0 %	0 %	50 %	50 %	549727024
100010	NC_022544	ATC	2	6	4728812	4728817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549727024
100011	NC_022544	CAG	2	6	4728818	4728823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549727024
100012	NC_022544	TCGG	2	8	4728873	4728880	0 %	25 %	50 %	25 %	549727024
100013	NC_022544	CCAG	2	8	4728913	4728920	25 %	0 %	25 %	50 %	549727024
100014	NC_022544	TCTG	2	8	4728928	4728935	0 %	50 %	25 %	25 %	549727024
100015	NC_022544	CGCT	2	8	4729091	4729098	0 %	25 %	25 %	50 %	549727024
100016	NC_022544	AGC	2	6	4729101	4729106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549727024
100017	NC_022544	GCA	2	6	4729156	4729161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549727024
100018	NC_022544	TGC	2	6	4729164	4729169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549727024
100019	NC_022544	GGCT	2	8	4729191	4729198	0 %	25 %	50 %	25 %	549727024
100020	NC_022544	AGC	2	6	4729215	4729220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549727024
100021	NC_022544	GGC	2	6	4729231	4729236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549727024
100022	NC_022544	TTA	2	6	4729314	4729319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549727024
100023	NC_022544	AAT	2	6	4729325	4729330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549727024
100024	NC_022544	GGAATG	2	12	4729353	4729364	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	549727024
100025	NC_022544	CCA	2	6	4729378	4729383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549727024
100026	NC_022544	GC	3	6	4729402	4729407	0 %	0 %	50 %	50 %	549727024
100027	NC_022544	CGC	2	6	4729415	4729420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549727024
100028	NC_022544	GGC	2	6	4729458	4729463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549727024
100029	NC_022544	CGG	2	6	4729489	4729494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549727024
100030	NC_022544	A	6	6	4729591	4729596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100031	NC_022544	GCC	2	6	4729664	4729669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549727025
100032	NC_022544	CAG	2	6	4729738	4729743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549727025
100033	NC_022544	CCG	2	6	4729760	4729765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549727025
100034	NC_022544	CAGC	2	8	4729774	4729781	25 %	0 %	25 %	50 %	549727025
100035	NC_022544	CGAC	2	8	4729791	4729798	25 %	0 %	25 %	50 %	549727025
100036	NC_022544	GTT	2	6	4729858	4729863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549727025
100037	NC_022544	A	6	6	4729866	4729871	100 %	0 %	0 %	0 %	549727025
100038	NC_022544	AGA	3	9	4729961	4729969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549727025
100039	NC_022544	GAG	2	6	4729975	4729980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549727025
100040	NC_022544	GC	3	6	4730015	4730020	0 %	0 %	50 %	50 %	549727025
100041	NC_022544	GGTCG	2	10	4730033	4730042	0 %	20 %	60 %	20 %	549727025
100042	NC_022544	TCA	2	6	4730178	4730183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549727025
100043	NC_022544	CGC	2	6	4730209	4730214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549727025
100044	NC_022544	CCGCG	2	10	4730286	4730295	0 %	0 %	40 %	60 %	549727025
100045	NC_022544	CAG	3	9	4730317	4730325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549727025
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100047	NC_022544	GCG	2	6	4730399	4730404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549727025
100048	NC_022544	TAA	2	6	4730448	4730453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549727025
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100050	NC_022544	GTC	2	6	4730579	4730584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549727025
100051	NC_022544	CGG	2	6	4730642	4730647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549727025
100052	NC_022544	CCGC	2	8	4730693	4730700	0 %	0 %	25 %	75 %	549727025
100053	NC_022544	ACG	2	6	4730756	4730761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549727025
100054	NC_022544	ATG	2	6	4730765	4730770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549727025
100055	NC_022544	CGT	2	6	4730788	4730793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549727025
100056	NC_022544	GGC	2	6	4730800	4730805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549727025
100057	NC_022544	AAT	2	6	4730869	4730874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549727025
100058	NC_022544	A	6	6	4730884	4730889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100059	NC_022544	ATG	2	6	4730913	4730918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100060	NC_022544	CAGG	2	8	4730952	4730959	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100061	NC_022544	ACAG	2	8	4731024	4731031	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100062	NC_022544	TAA	2	6	4731179	4731184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100063	NC_022544	AGG	2	6	4731318	4731323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100064	NC_022544	GCA	2	6	4731331	4731336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100065	NC_022544	G	6	6	4731346	4731351	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
100066	NC_022544	A	6	6	4731365	4731370	100 %	0 %	0 %	0 %	549727026
100067	NC_022544	CGA	2	6	4731372	4731377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549727026
100068	NC_022544	ATG	2	6	4731390	4731395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549727026
100069	NC_022544	CCGC	2	8	4731429	4731436	0 %	0 %	25 %	75 %	549727026
100070	NC_022544	CTG	2	6	4731485	4731490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549727026
100071	NC_022544	GTTA	2	8	4731517	4731524	25 %	50 %	25 %	0 %	549727026
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100073	NC_022544	GA	3	6	4731647	4731652	50 %	0 %	50 %	0 %	549727026
100074	NC_022544	TGA	2	6	4731654	4731659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549727026
100075	NC_022544	AG	3	6	4731667	4731672	50 %	0 %	50 %	0 %	549727026
100076	NC_022544	GGA	2	6	4731727	4731732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549727026
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100079	NC_022544	CT	3	6	4731925	4731930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100080	NC_022544	GCCA	2	8	4731979	4731986	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100081	NC_022544	CTA	2	6	4731990	4731995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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100083	NC_022544	C	6	6	4732108	4732113	0 %	0 %	0 %	100 %	549727027
100084	NC_022544	GA	3	6	4732185	4732190	50 %	0 %	50 %	0 %	549727027
100085	NC_022544	GCTG	2	8	4732219	4732226	0 %	25 %	50 %	25 %	549727027
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100087	NC_022544	GCCA	2	8	4732265	4732272	25 %	0 %	25 %	50 %	549727027
100088	NC_022544	TG	3	6	4732317	4732322	0 %	50 %	50 %	0 %	549727027
100089	NC_022544	TCGC	2	8	4732329	4732336	0 %	25 %	25 %	50 %	549727027
100090	NC_022544	TAT	2	6	4732337	4732342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549727027
100091	NC_022544	CAT	2	6	4732412	4732417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549727027
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100093	NC_022544	GC	3	6	4732581	4732586	0 %	0 %	50 %	50 %	549727027
100094	NC_022544	TCC	2	6	4732616	4732621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549727027
100095	NC_022544	CAT	2	6	4732636	4732641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549727027
100096	NC_022544	CG	3	6	4732650	4732655	0 %	0 %	50 %	50 %	549727027
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100099	NC_022544	A	6	6	4732727	4732732	100 %	0 %	0 %	0 %	549727027
100100	NC_022544	TCG	2	6	4732764	4732769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549727027
100101	NC_022544	CGG	2	6	4732848	4732853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549727027
100102	NC_022544	GAAGGT	2	12	4732921	4732932	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	549727027
100103	NC_022544	GTC	2	6	4732972	4732977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549727027
100104	NC_022544	TGG	2	6	4733047	4733052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549727027
100105	NC_022544	CTT	2	6	4733077	4733082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549727027
100106	NC_022544	TTC	2	6	4733138	4733143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549727027
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100108	NC_022544	GCGGT	2	10	4733223	4733232	0 %	20 %	60 %	20 %	549727027
100109	NC_022544	CGG	2	6	4733335	4733340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549727027
100110	NC_022544	GTG	2	6	4733414	4733419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549727027
100111	NC_022544	CGC	2	6	4733420	4733425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549727027
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100113	NC_022544	TTGT	2	8	4733578	4733585	0 %	75 %	25 %	0 %	549727028
100114	NC_022544	ATG	2	6	4733596	4733601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549727028
100115	NC_022544	CATT	2	8	4733664	4733671	25 %	50 %	0 %	25 %	549727028
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100234	NC_022544	CG	3	6	4738632	4738637	0 %	0 %	50 %	50 %	549727034
100235	NC_022544	GGCG	2	8	4738655	4738662	0 %	0 %	75 %	25 %	549727034
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100283	NC_022544	AG	3	6	4741976	4741981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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100287	NC_022544	GGAT	2	8	4742056	4742063	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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100302	NC_022544	TGTA	2	8	4743225	4743232	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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100465	NC_022544	GAC	2	6	4750464	4750469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549727042
100466	NC_022544	GCC	2	6	4750523	4750528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549727042
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