MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 101759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
85501	NC_022544	GCG	2	6	4038715	4038720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726415
85502	NC_022544	ATG	2	6	4038738	4038743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549726415
85503	NC_022544	TGT	2	6	4038756	4038761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549726416
85504	NC_022544	ACC	2	6	4038788	4038793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549726416
85505	NC_022544	CCA	3	9	4038852	4038860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549726416
85506	NC_022544	ACA	2	6	4038969	4038974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549726416
85507	NC_022544	TGAA	2	8	4039076	4039083	50 %	25 %	25 %	0 %	549726416
85508	NC_022544	CA	3	6	4039384	4039389	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85509	NC_022544	TAA	2	6	4039525	4039530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85510	NC_022544	TCGAT	2	10	4039556	4039565	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
85511	NC_022544	CT	3	6	4039598	4039603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85512	NC_022544	AAG	2	6	4039614	4039619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85513	NC_022544	GAAAC	2	10	4039635	4039644	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
85514	NC_022544	AAC	2	6	4039666	4039671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85515	NC_022544	CGT	2	6	4039712	4039717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85516	NC_022544	T	8	8	4039717	4039724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85517	NC_022544	T	8	8	4039728	4039735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85518	NC_022544	TTTG	2	8	4039750	4039757	0 %	75 %	25 %	0 %	549726417
85519	NC_022544	TAA	2	6	4039761	4039766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549726417
85520	NC_022544	TC	3	6	4039896	4039901	0 %	50 %	0 %	50 %	549726417
85521	NC_022544	TGG	2	6	4039910	4039915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549726417
85522	NC_022544	CGG	2	6	4039972	4039977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726417
85523	NC_022544	GCA	2	6	4040274	4040279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726417
85524	NC_022544	CAG	2	6	4040296	4040301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726417
85525	NC_022544	CAGC	2	8	4040337	4040344	25 %	0 %	25 %	50 %	549726417
85526	NC_022544	GA	3	6	4040349	4040354	50 %	0 %	50 %	0 %	549726417
85527	NC_022544	TTG	2	6	4040357	4040362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549726417
85528	NC_022544	TAA	2	6	4040381	4040386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85529	NC_022544	GGGC	2	8	4040432	4040439	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
85530	NC_022544	AAGCG	2	10	4040440	4040449	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
85531	NC_022544	ACG	2	6	4040479	4040484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726418
85532	NC_022544	T	6	6	4040497	4040502	0 %	100 %	0 %	0 %	549726418
85533	NC_022544	CAG	2	6	4040512	4040517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726418
85534	NC_022544	TTCG	2	8	4040605	4040612	0 %	50 %	25 %	25 %	549726418
85535	NC_022544	GTT	2	6	4040673	4040678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549726418
85536	NC_022544	CTG	2	6	4040692	4040697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726418
85537	NC_022544	GCGA	2	8	4040698	4040705	25 %	0 %	50 %	25 %	549726418
85538	NC_022544	GAC	2	6	4040814	4040819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726418
85539	NC_022544	CGC	2	6	4040832	4040837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549726418
85540	NC_022544	GA	3	6	4040849	4040854	50 %	0 %	50 %	0 %	549726418
85541	NC_022544	CGG	2	6	4040883	4040888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726418
85542	NC_022544	CGTTCG	2	12	4040930	4040941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726418
85543	NC_022544	GC	3	6	4040965	4040970	0 %	0 %	50 %	50 %	549726418
85544	NC_022544	TCA	2	6	4040978	4040983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549726418
85545	NC_022544	CCA	2	6	4040985	4040990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549726418
85546	NC_022544	TCAG	2	8	4041011	4041018	25 %	25 %	25 %	25 %	549726418
85547	NC_022544	CCA	2	6	4041117	4041122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549726418
85548	NC_022544	CGG	2	6	4041171	4041176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726418
85549	NC_022544	CG	3	6	4041182	4041187	0 %	0 %	50 %	50 %	549726418
85550	NC_022544	GTA	2	6	4041236	4041241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549726418
85551	NC_022544	CG	3	6	4041306	4041311	0 %	0 %	50 %	50 %	549726418
85552	NC_022544	GAA	2	6	4041316	4041321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549726418
85553	NC_022544	ATCTGC	2	12	4041389	4041400	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	549726418
85554	NC_022544	TGG	2	6	4041417	4041422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549726418
85555	NC_022544	TCGA	2	8	4041518	4041525	25 %	25 %	25 %	25 %	549726418
85556	NC_022544	TTA	2	6	4041587	4041592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549726418
85557	NC_022544	CGG	2	6	4041751	4041756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726418
85558	NC_022544	GGC	2	6	4041771	4041776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726418
85559	NC_022544	GATG	2	8	4041817	4041824	25 %	25 %	50 %	0 %	549726418
85560	NC_022544	CCG	2	6	4041842	4041847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549726418
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85562	NC_022544	CG	3	6	4041916	4041921	0 %	0 %	50 %	50 %	549726418
85563	NC_022544	ATC	2	6	4042001	4042006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549726418
85564	NC_022544	CCTG	2	8	4042127	4042134	0 %	25 %	25 %	50 %	549726418
85565	NC_022544	ATCG	2	8	4042135	4042142	25 %	25 %	25 %	25 %	549726418
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85567	NC_022544	CCG	2	6	4042202	4042207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549726418
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85569	NC_022544	AAT	3	9	4042324	4042332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549726418
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85571	NC_022544	TTTA	2	8	4042476	4042483	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85572	NC_022544	TTA	2	6	4042507	4042512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85573	NC_022544	TAA	2	6	4042547	4042552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85574	NC_022544	AAC	2	6	4042654	4042659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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85576	NC_022544	ATTT	2	8	4042736	4042743	25 %	75 %	0 %	0 %	549726419
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85579	NC_022544	TAA	2	6	4043059	4043064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549726419
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85583	NC_022544	A	6	6	4043260	4043265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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85592	NC_022544	ATT	2	6	4043817	4043822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85593	NC_022544	TTG	2	6	4043839	4043844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85594	NC_022544	A	7	7	4043874	4043880	100 %	0 %	0 %	0 %	549726421
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85602	NC_022544	TGG	2	6	4044472	4044477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549726421
85603	NC_022544	CGG	2	6	4044482	4044487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726421
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85605	NC_022544	CG	3	6	4044519	4044524	0 %	0 %	50 %	50 %	549726421
85606	NC_022544	ATG	2	6	4044532	4044537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549726421
85607	NC_022544	TGA	2	6	4044686	4044691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549726421
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85619	NC_022544	GCC	2	6	4045153	4045158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549726422
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85651	NC_022544	CGG	2	6	4046754	4046759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726423
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85679	NC_022544	CA	3	6	4048008	4048013	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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85722	NC_022544	CG	3	6	4050341	4050346	0 %	0 %	50 %	50 %	549726425
85723	NC_022544	CTT	2	6	4050376	4050381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549726425
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85730	NC_022544	A	6	6	4050558	4050563	100 %	0 %	0 %	0 %	549726425
85731	NC_022544	CT	3	6	4050713	4050718	0 %	50 %	0 %	50 %	549726426
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85736	NC_022544	ACC	2	6	4050859	4050864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549726426
85737	NC_022544	ATT	2	6	4050904	4050909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549726426
85738	NC_022544	ACC	2	6	4051025	4051030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549726426
85739	NC_022544	TGG	2	6	4051070	4051075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549726426
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85741	NC_022544	TGG	2	6	4051103	4051108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549726426
85742	NC_022544	TCA	2	6	4051142	4051147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549726426
85743	NC_022544	ACCG	2	8	4051158	4051165	25 %	0 %	25 %	50 %	549726426
85744	NC_022544	CT	3	6	4051191	4051196	0 %	50 %	0 %	50 %	549726426
85745	NC_022544	TGACG	2	10	4051284	4051293	20 %	20 %	40 %	20 %	549726426
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85747	NC_022544	ATG	2	6	4051463	4051468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549726426
85748	NC_022544	TGC	2	6	4051478	4051483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726426
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85750	NC_022544	GTG	2	6	4051603	4051608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549726426
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85752	NC_022544	GGT	2	6	4051849	4051854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549726426
85753	NC_022544	TGA	2	6	4051886	4051891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549726426
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85758	NC_022544	CATG	2	8	4052058	4052065	25 %	25 %	25 %	25 %	549726426
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85760	NC_022544	CTT	2	6	4052217	4052222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549726427
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85763	NC_022544	TAA	2	6	4052297	4052302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549726427
85764	NC_022544	TTC	2	6	4052314	4052319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549726427
85765	NC_022544	GATC	2	8	4052381	4052388	25 %	25 %	25 %	25 %	549726427
85766	NC_022544	CTG	2	6	4052403	4052408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726427
85767	NC_022544	TCG	2	6	4052437	4052442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726427
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85771	NC_022544	TGA	2	6	4052563	4052568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549726427
85772	NC_022544	TGC	2	6	4052569	4052574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726427
85773	NC_022544	GCGTG	2	10	4052579	4052588	0 %	20 %	60 %	20 %	549726427
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85804	NC_022544	GCG	2	6	4053642	4053647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726428
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85807	NC_022544	GCCA	2	8	4053705	4053712	25 %	0 %	25 %	50 %	549726428
85808	NC_022544	CTG	2	6	4053715	4053720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726428
85809	NC_022544	GC	3	6	4053827	4053832	0 %	0 %	50 %	50 %	549726428
85810	NC_022544	TGG	2	6	4053862	4053867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549726428
85811	NC_022544	TCA	2	6	4054036	4054041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549726428
85812	NC_022544	TAA	2	6	4054047	4054052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549726428
85813	NC_022544	A	8	8	4054117	4054124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85814	NC_022544	GCA	2	6	4054214	4054219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726429
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85816	NC_022544	TGC	2	6	4054329	4054334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726429
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85818	NC_022544	GTTG	2	8	4054551	4054558	0 %	50 %	50 %	0 %	549726429
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85820	NC_022544	GGC	3	9	4054632	4054640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726429
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85822	NC_022544	ACT	2	6	4054663	4054668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549726429
85823	NC_022544	CTG	2	6	4054711	4054716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726429
85824	NC_022544	TGG	2	6	4054721	4054726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549726429
85825	NC_022544	CAT	2	6	4054728	4054733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549726429
85826	NC_022544	GCGT	2	8	4054769	4054776	0 %	25 %	50 %	25 %	549726429
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85830	NC_022544	TGC	2	6	4054935	4054940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726429
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85833	NC_022544	GC	3	6	4055051	4055056	0 %	0 %	50 %	50 %	549726429
85834	NC_022544	TTCCG	2	10	4055061	4055070	0 %	40 %	20 %	40 %	549726429
85835	NC_022544	CAG	2	6	4055101	4055106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726429
85836	NC_022544	CTA	2	6	4055120	4055125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549726430
85837	NC_022544	TC	3	6	4055168	4055173	0 %	50 %	0 %	50 %	549726430
85838	NC_022544	TTA	2	6	4055177	4055182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549726430
85839	NC_022544	TGAG	2	8	4055198	4055205	25 %	25 %	50 %	0 %	549726430
85840	NC_022544	GCG	2	6	4055227	4055232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726430
85841	NC_022544	GCG	2	6	4055351	4055356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726430
85842	NC_022544	CGA	2	6	4055412	4055417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726430
85843	NC_022544	CTG	3	9	4055473	4055481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726430
85844	NC_022544	ATG	2	6	4055545	4055550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549726430
85845	NC_022544	GGC	2	6	4055611	4055616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726430
85846	NC_022544	GCG	2	6	4055722	4055727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726430
85847	NC_022544	GGCT	2	8	4055741	4055748	0 %	25 %	50 %	25 %	549726430
85848	NC_022544	GGC	3	9	4055788	4055796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726430
85849	NC_022544	CGATG	2	10	4055859	4055868	20 %	20 %	40 %	20 %	549726430
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