MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 101759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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76002	NC_022544	CAG	2	6	3599728	3599733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726040
76003	NC_022544	AACTG	2	10	3599734	3599743	40 %	20 %	20 %	20 %	549726040
76004	NC_022544	TCG	2	6	3599892	3599897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726040
76005	NC_022544	CAA	2	6	3599902	3599907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549726040
76006	NC_022544	CAA	2	6	3599925	3599930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549726040
76007	NC_022544	CGA	2	6	3599931	3599936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726040
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76009	NC_022544	CGG	2	6	3600160	3600165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726040
76010	NC_022544	GAA	2	6	3600180	3600185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549726040
76011	NC_022544	AACG	2	8	3600223	3600230	50 %	0 %	25 %	25 %	549726040
76012	NC_022544	GCC	2	6	3600246	3600251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549726040
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76017	NC_022544	CGC	2	6	3600427	3600432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549726040
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76034	NC_022544	GCA	2	6	3601229	3601234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76035	NC_022544	TTG	2	6	3601334	3601339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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76037	NC_022544	ATC	2	6	3601470	3601475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76038	NC_022544	GGCAA	2	10	3601494	3601503	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
76039	NC_022544	T	6	6	3601620	3601625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76040	NC_022544	ATT	2	6	3601634	3601639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549726042
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76043	NC_022544	T	6	6	3601771	3601776	0 %	100 %	0 %	0 %	549726042
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76052	NC_022544	CTGG	2	8	3602053	3602060	0 %	25 %	50 %	25 %	549726042
76053	NC_022544	CAG	2	6	3602076	3602081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726042
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76055	NC_022544	GCT	2	6	3602108	3602113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726042
76056	NC_022544	GGC	3	9	3602190	3602198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726042
76057	NC_022544	CGT	2	6	3602220	3602225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726042
76058	NC_022544	CACC	2	8	3602231	3602238	25 %	0 %	0 %	75 %	549726042
76059	NC_022544	GCGTC	2	10	3602249	3602258	0 %	20 %	40 %	40 %	549726042
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76062	NC_022544	CAG	2	6	3602406	3602411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726042
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76104	NC_022544	A	6	6	3604043	3604048	100 %	0 %	0 %	0 %	549726045
76105	NC_022544	TCG	2	6	3604061	3604066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726045
76106	NC_022544	CAG	3	9	3604080	3604088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726045
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76118	NC_022544	CGG	2	6	3604685	3604690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726046
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76231	NC_022544	GC	3	6	3609726	3609731	0 %	0 %	50 %	50 %	549726049
76232	NC_022544	ATTC	2	8	3609824	3609831	25 %	50 %	0 %	25 %	549726049
76233	NC_022544	ATC	2	6	3609890	3609895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549726049
76234	NC_022544	TCCA	2	8	3609981	3609988	25 %	25 %	0 %	50 %	549726049
76235	NC_022544	GAC	2	6	3609998	3610003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726049
76236	NC_022544	CG	3	6	3610005	3610010	0 %	0 %	50 %	50 %	549726049
76237	NC_022544	TAT	2	6	3610053	3610058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549726049
76238	NC_022544	GCG	2	6	3610103	3610108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726049
76239	NC_022544	GTGC	2	8	3610117	3610124	0 %	25 %	50 %	25 %	549726049
76240	NC_022544	CG	3	6	3610184	3610189	0 %	0 %	50 %	50 %	549726049
76241	NC_022544	TGC	2	6	3610218	3610223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726049
76242	NC_022544	CG	3	6	3610297	3610302	0 %	0 %	50 %	50 %	549726049
76243	NC_022544	GCC	2	6	3610304	3610309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549726049
76244	NC_022544	CGG	2	6	3610333	3610338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726049
76245	NC_022544	CGC	2	6	3610395	3610400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549726049
76246	NC_022544	GCA	2	6	3610522	3610527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726049
76247	NC_022544	TGG	2	6	3610562	3610567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549726049
76248	NC_022544	CAC	2	6	3610579	3610584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549726049
76249	NC_022544	GCT	2	6	3610585	3610590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726049
76250	NC_022544	TC	3	6	3610719	3610724	0 %	50 %	0 %	50 %	549726049
76251	NC_022544	GCC	2	6	3610746	3610751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76252	NC_022544	ATATTG	2	12	3610810	3610821	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	549726050
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76254	NC_022544	GC	3	6	3610924	3610929	0 %	0 %	50 %	50 %	549726050
76255	NC_022544	CGC	2	6	3610942	3610947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549726050
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76260	NC_022544	GAC	2	6	3611057	3611062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726050
76261	NC_022544	CG	3	6	3611074	3611079	0 %	0 %	50 %	50 %	549726050
76262	NC_022544	CGA	2	6	3611090	3611095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726050
76263	NC_022544	TACCG	2	10	3611096	3611105	20 %	20 %	20 %	40 %	549726050
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76272	NC_022544	CG	3	6	3611554	3611559	0 %	0 %	50 %	50 %	549726051
76273	NC_022544	GAT	2	6	3611571	3611576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549726051
76274	NC_022544	TCG	2	6	3611627	3611632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726051
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76277	NC_022544	A	6	6	3611771	3611776	100 %	0 %	0 %	0 %	549726051
76278	NC_022544	GC	3	6	3611785	3611790	0 %	0 %	50 %	50 %	549726051
76279	NC_022544	AAGA	2	8	3611836	3611843	75 %	0 %	25 %	0 %	549726051
76280	NC_022544	AG	3	6	3611899	3611904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76281	NC_022544	CTG	2	6	3612052	3612057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726052
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76300	NC_022544	ATC	2	6	3613251	3613256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549726053
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76316	NC_022544	CAG	2	6	3613823	3613828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726053
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76320	NC_022544	CAG	2	6	3613967	3613972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726053
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76322	NC_022544	TGCG	2	8	3614001	3614008	0 %	25 %	50 %	25 %	549726053
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76326	NC_022544	CCAG	2	8	3614137	3614144	25 %	0 %	25 %	50 %	549726053
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76330	NC_022544	GAC	2	6	3614454	3614459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726053
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76332	NC_022544	CCAG	2	8	3614512	3614519	25 %	0 %	25 %	50 %	549726053
76333	NC_022544	CAG	2	6	3614525	3614530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726053
76334	NC_022544	GCA	2	6	3614548	3614553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726053
76335	NC_022544	AGT	2	6	3614579	3614584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549726053
76336	NC_022544	ATG	2	6	3614622	3614627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76337	NC_022544	ATT	2	6	3614638	3614643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76338	NC_022544	CGT	2	6	3614666	3614671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76339	NC_022544	A	7	7	3614686	3614692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76340	NC_022544	AG	3	6	3614696	3614701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76341	NC_022544	CAA	2	6	3614815	3614820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76342	NC_022544	ATA	2	6	3614837	3614842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76343	NC_022544	CCG	2	6	3614844	3614849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76344	NC_022544	AACC	2	8	3614929	3614936	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76345	NC_022544	A	6	6	3614939	3614944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76346	NC_022544	AT	4	8	3614962	3614969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76347	NC_022544	ACG	2	6	3615037	3615042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726054
76348	NC_022544	GAA	2	6	3615087	3615092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549726054
76349	NC_022544	GCGTG	2	10	3615119	3615128	0 %	20 %	60 %	20 %	549726054
76350	NC_022544	TAAC	2	8	3615130	3615137	50 %	25 %	0 %	25 %	549726054
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76352	NC_022544	CAC	2	6	3615212	3615217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549726054
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76470	NC_022544	GCGCG	2	10	3620867	3620876	0 %	0 %	60 %	40 %	549726058
76471	NC_022544	CG	3	6	3620885	3620890	0 %	0 %	50 %	50 %	549726058
76472	NC_022544	GGT	2	6	3621002	3621007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549726058
76473	NC_022544	GCT	2	6	3621059	3621064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726058
76474	NC_022544	ATG	2	6	3621090	3621095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549726058
76475	NC_022544	TCG	2	6	3621106	3621111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726058
76476	NC_022544	GGC	2	6	3621287	3621292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726058
76477	NC_022544	GCA	2	6	3621296	3621301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726058
76478	NC_022544	CGA	2	6	3621365	3621370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726058
76479	NC_022544	ATC	2	6	3621399	3621404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549726058
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76481	NC_022544	TCA	2	6	3621563	3621568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549726058
76482	NC_022544	TCG	2	6	3621607	3621612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726058
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76485	NC_022544	CGC	2	6	3621738	3621743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549726058
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76493	NC_022544	CTTT	2	8	3621941	3621948	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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76498	NC_022544	TTAA	2	8	3622045	3622052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76499	NC_022544	AAAT	2	8	3622102	3622109	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76500	NC_022544	TGT	2	6	3622205	3622210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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