MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 101759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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75002	NC_022544	TCT	2	6	3553789	3553794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549725994
75003	NC_022544	CAA	3	9	3553831	3553839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549725994
75004	NC_022544	GC	3	6	3553897	3553902	0 %	0 %	50 %	50 %	549725994
75005	NC_022544	ACC	2	6	3553995	3554000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549725995
75006	NC_022544	CAG	3	9	3554007	3554015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549725995
75007	NC_022544	TAC	2	6	3554037	3554042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549725995
75008	NC_022544	ACCTTT	2	12	3554220	3554231	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	549725995
75009	NC_022544	T	6	6	3554253	3554258	0 %	100 %	0 %	0 %	549725995
75010	NC_022544	TTC	2	6	3554304	3554309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549725995
75011	NC_022544	T	6	6	3554403	3554408	0 %	100 %	0 %	0 %	549725995
75012	NC_022544	GTA	2	6	3554416	3554421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549725995
75013	NC_022544	T	6	6	3554547	3554552	0 %	100 %	0 %	0 %	549725995
75014	NC_022544	CG	3	6	3554728	3554733	0 %	0 %	50 %	50 %	549725996
75015	NC_022544	GA	3	6	3554752	3554757	50 %	0 %	50 %	0 %	549725996
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75021	NC_022544	TCTTT	2	10	3555195	3555204	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
75022	NC_022544	CGT	2	6	3555232	3555237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75023	NC_022544	TGTCGC	2	12	3555238	3555249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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75030	NC_022544	CTG	2	6	3555372	3555377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549725997
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75042	NC_022544	CAT	2	6	3556108	3556113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549725998
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75045	NC_022544	A	8	8	3556290	3556297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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75052	NC_022544	CAA	2	6	3556703	3556708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549726000
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75117	NC_022544	CTT	2	6	3559525	3559530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549726001
75118	NC_022544	CAA	2	6	3559591	3559596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549726001
75119	NC_022544	AACG	2	8	3559634	3559641	50 %	0 %	25 %	25 %	549726001
75120	NC_022544	TTTG	2	8	3559661	3559668	0 %	75 %	25 %	0 %	549726001
75121	NC_022544	ACC	2	6	3559703	3559708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549726001
75122	NC_022544	GAT	2	6	3559796	3559801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549726001
75123	NC_022544	GATGC	2	10	3559805	3559814	20 %	20 %	40 %	20 %	549726001
75124	NC_022544	ACCAG	2	10	3559835	3559844	40 %	0 %	20 %	40 %	549726001
75125	NC_022544	AGT	2	6	3559850	3559855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549726001
75126	NC_022544	GCTCCT	2	12	3559882	3559893	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	549726001
75127	NC_022544	TCCA	2	8	3559896	3559903	25 %	25 %	0 %	50 %	549726001
75128	NC_022544	GTA	2	6	3559977	3559982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549726001
75129	NC_022544	AGTTA	2	10	3560087	3560096	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75130	NC_022544	TTG	2	6	3560178	3560183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549726002
75131	NC_022544	TGT	2	6	3560233	3560238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549726002
75132	NC_022544	GCA	2	6	3560241	3560246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726002
75133	NC_022544	GTTC	2	8	3560254	3560261	0 %	50 %	25 %	25 %	549726002
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75137	NC_022544	ACC	2	6	3560378	3560383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549726002
75138	NC_022544	CGG	2	6	3560388	3560393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726002
75139	NC_022544	GC	3	6	3560485	3560490	0 %	0 %	50 %	50 %	549726002
75140	NC_022544	GATT	2	8	3560498	3560505	25 %	50 %	25 %	0 %	549726002
75141	NC_022544	T	6	6	3560516	3560521	0 %	100 %	0 %	0 %	549726002
75142	NC_022544	CAG	2	6	3560555	3560560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726002
75143	NC_022544	CGA	2	6	3560610	3560615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726002
75144	NC_022544	GTT	2	6	3560635	3560640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75145	NC_022544	AGTTT	2	10	3560667	3560676	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75146	NC_022544	CTTA	2	8	3560700	3560707	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75147	NC_022544	GCTT	2	8	3560756	3560763	0 %	50 %	25 %	25 %	549726003
75148	NC_022544	GC	3	6	3560790	3560795	0 %	0 %	50 %	50 %	549726003
75149	NC_022544	GGATCA	2	12	3560847	3560858	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	549726003
75150	NC_022544	CAC	2	6	3560886	3560891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549726003
75151	NC_022544	T	6	6	3560962	3560967	0 %	100 %	0 %	0 %	549726003
75152	NC_022544	GTA	2	6	3560975	3560980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549726003
75153	NC_022544	TA	3	6	3560979	3560984	50 %	50 %	0 %	0 %	549726003
75154	NC_022544	TAA	2	6	3561133	3561138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75155	NC_022544	CA	3	6	3561147	3561152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75156	NC_022544	GAC	2	6	3561282	3561287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726004
75157	NC_022544	ACC	2	6	3561303	3561308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549726004
75158	NC_022544	TCT	2	6	3561328	3561333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549726004
75159	NC_022544	AGC	2	6	3561418	3561423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726004
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75161	NC_022544	AGGTA	2	10	3561489	3561498	40 %	20 %	40 %	0 %	549726004
75162	NC_022544	GCA	2	6	3561500	3561505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726004
75163	NC_022544	CAT	2	6	3561531	3561536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549726005
75164	NC_022544	GCG	2	6	3561573	3561578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726005
75165	NC_022544	TAA	2	6	3561727	3561732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549726005
75166	NC_022544	A	6	6	3561754	3561759	100 %	0 %	0 %	0 %	549726005
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75168	NC_022544	GCG	2	6	3561834	3561839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726005
75169	NC_022544	CAC	2	6	3561879	3561884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549726006
75170	NC_022544	GA	3	6	3561897	3561902	50 %	0 %	50 %	0 %	549726006
75171	NC_022544	GC	3	6	3561914	3561919	0 %	0 %	50 %	50 %	549726006
75172	NC_022544	TCA	2	6	3561988	3561993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549726006
75173	NC_022544	ATA	2	6	3561994	3561999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549726006
75174	NC_022544	CGA	2	6	3562003	3562008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726006
75175	NC_022544	GCC	2	6	3562012	3562017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549726006
75176	NC_022544	TGC	2	6	3562045	3562050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726006
75177	NC_022544	TCGC	2	8	3562090	3562097	0 %	25 %	25 %	50 %	549726006
75178	NC_022544	AGC	2	6	3562174	3562179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726006
75179	NC_022544	GCT	2	6	3562200	3562205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726006
75180	NC_022544	CTG	2	6	3562209	3562214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726006
75181	NC_022544	ATT	2	6	3562255	3562260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549726006
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75183	NC_022544	GT	3	6	3562314	3562319	0 %	50 %	50 %	0 %	549726007
75184	NC_022544	CTT	2	6	3562447	3562452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549726007
75185	NC_022544	GAG	2	6	3562494	3562499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549726007
75186	NC_022544	CGG	2	6	3562535	3562540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726007
75187	NC_022544	GCT	2	6	3562612	3562617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726007
75188	NC_022544	TCA	2	6	3562648	3562653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549726007
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75190	NC_022544	A	8	8	3562980	3562987	100 %	0 %	0 %	0 %	549726007
75191	NC_022544	ATT	2	6	3563032	3563037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75192	NC_022544	GAT	2	6	3563044	3563049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75193	NC_022544	CAAAT	2	10	3563177	3563186	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
75194	NC_022544	AT	3	6	3563198	3563203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75195	NC_022544	A	8	8	3563215	3563222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75196	NC_022544	CCG	2	6	3563223	3563228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75197	NC_022544	GCG	2	6	3563238	3563243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75198	NC_022544	T	6	6	3563258	3563263	0 %	100 %	0 %	0 %	549726008
75199	NC_022544	AGC	2	6	3563264	3563269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726008
75200	NC_022544	CAG	2	6	3563336	3563341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726008
75201	NC_022544	GCC	2	6	3563435	3563440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549726008
75202	NC_022544	CCAG	2	8	3563468	3563475	25 %	0 %	25 %	50 %	549726008
75203	NC_022544	CGC	2	6	3563509	3563514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549726008
75204	NC_022544	CAC	2	6	3563567	3563572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549726008
75205	NC_022544	CTT	2	6	3563608	3563613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549726008
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75207	NC_022544	AGC	2	6	3563735	3563740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726008
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75210	NC_022544	CGC	2	6	3563987	3563992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549726008
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75212	NC_022544	GTGC	2	8	3564013	3564020	0 %	25 %	50 %	25 %	549726008
75213	NC_022544	CAG	2	6	3564044	3564049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726008
75214	NC_022544	AAG	2	6	3564119	3564124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75215	NC_022544	TAT	2	6	3564170	3564175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75216	NC_022544	CTT	2	6	3564178	3564183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75217	NC_022544	CCG	2	6	3564261	3564266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75218	NC_022544	ACA	2	6	3564273	3564278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75219	NC_022544	CAT	2	6	3564289	3564294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549726009
75220	NC_022544	AGA	2	6	3564364	3564369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549726009
75221	NC_022544	ATC	2	6	3564420	3564425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549726009
75222	NC_022544	AGA	2	6	3564484	3564489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549726009
75223	NC_022544	CGC	4	12	3564492	3564503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549726009
75224	NC_022544	ATT	2	6	3564504	3564509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549726009
75225	NC_022544	A	7	7	3564516	3564522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75226	NC_022544	T	7	7	3564538	3564544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75227	NC_022544	GAT	2	6	3564551	3564556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75228	NC_022544	ATA	2	6	3564571	3564576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75229	NC_022544	GAC	2	6	3564688	3564693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75230	NC_022544	GCAGCC	2	12	3564705	3564716	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549726010
75231	NC_022544	ACC	3	9	3564723	3564731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549726010
75232	NC_022544	GCA	2	6	3564735	3564740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726010
75233	NC_022544	CGC	2	6	3564746	3564751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549726010
75234	NC_022544	CATGAC	2	12	3564770	3564781	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	549726010
75235	NC_022544	CAG	2	6	3564787	3564792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726010
75236	NC_022544	GTG	3	9	3564810	3564818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549726010
75237	NC_022544	GC	3	6	3564824	3564829	0 %	0 %	50 %	50 %	549726010
75238	NC_022544	TTC	3	9	3564852	3564860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549726010
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75240	NC_022544	TACCGG	2	12	3564969	3564980	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549726010
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75242	NC_022544	CGT	2	6	3565091	3565096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726010
75243	NC_022544	CCAGA	2	10	3565154	3565163	40 %	0 %	20 %	40 %	549726010
75244	NC_022544	GCG	2	6	3565196	3565201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549726010
75245	NC_022544	TCA	2	6	3565216	3565221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549726010
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75247	NC_022544	TCT	2	6	3565234	3565239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549726010
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75342	NC_022544	GGCG	2	8	3569290	3569297	0 %	0 %	75 %	25 %	549726014
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75347	NC_022544	CTG	2	6	3569567	3569572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726014
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75349	NC_022544	TGAT	2	8	3569634	3569641	25 %	50 %	25 %	0 %	549726014
75350	NC_022544	GTC	2	6	3569657	3569662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726014
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75352	NC_022544	GAC	2	6	3569699	3569704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726014
75353	NC_022544	AAC	2	6	3569822	3569827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549726014
75354	NC_022544	CAG	2	6	3569980	3569985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549726014
75355	NC_022544	ATGGC	2	10	3570071	3570080	20 %	20 %	40 %	20 %	549726014
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75357	NC_022544	GAT	2	6	3570106	3570111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549726014
75358	NC_022544	GC	3	6	3570214	3570219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75359	NC_022544	CAA	2	6	3570241	3570246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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75364	NC_022544	CGT	2	6	3570548	3570553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549726016
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75372	NC_022544	CT	3	6	3570935	3570940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75373	NC_022544	GAC	2	6	3570971	3570976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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75442	NC_022544	TTTG	2	8	3574698	3574705	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75443	NC_022544	ATTA	2	8	3574741	3574748	50 %	50 %	0 %	0 %	549726022
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75466	NC_022544	TGA	3	9	3575825	3575833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549726022
75467	NC_022544	CG	3	6	3575930	3575935	0 %	0 %	50 %	50 %	549726022
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75474	NC_022544	CGCT	2	8	3576329	3576336	0 %	25 %	25 %	50 %	549726022
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75500	NC_022544	CCG	2	6	3577910	3577915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549726023

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