MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. DT2

Total Repeats: 101759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_022544	GAC	2	6	327874	327879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723004
7002	NC_022544	CGC	2	6	327912	327917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723004
7003	NC_022544	TGGG	2	8	327996	328003	0 %	25 %	75 %	0 %	549723004
7004	NC_022544	GACT	2	8	328006	328013	25 %	25 %	25 %	25 %	549723004
7005	NC_022544	GCTG	2	8	328128	328135	0 %	25 %	50 %	25 %	549723004
7006	NC_022544	CTGG	2	8	328138	328145	0 %	25 %	50 %	25 %	549723004
7007	NC_022544	GGC	2	6	328153	328158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723004
7008	NC_022544	GCA	2	6	328159	328164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723004
7009	NC_022544	GCG	2	6	328183	328188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723004
7010	NC_022544	GGC	2	6	328191	328196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723004
7011	NC_022544	GTG	2	6	328243	328248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723004
7012	NC_022544	ACG	2	6	328270	328275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723004
7013	NC_022544	GTA	2	6	328325	328330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723004
7014	NC_022544	GCGT	2	8	328341	328348	0 %	25 %	50 %	25 %	549723004
7015	NC_022544	GGCA	2	8	328386	328393	25 %	0 %	50 %	25 %	549723004
7016	NC_022544	GCA	2	6	328417	328422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723004
7017	NC_022544	TGG	2	6	328458	328463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723004
7018	NC_022544	A	7	7	328467	328473	100 %	0 %	0 %	0 %	549723004
7019	NC_022544	GT	3	6	328599	328604	0 %	50 %	50 %	0 %	549723005
7020	NC_022544	ATCC	2	8	328609	328616	25 %	25 %	0 %	50 %	549723005
7021	NC_022544	AAC	2	6	328656	328661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723005
7022	NC_022544	A	7	7	328672	328678	100 %	0 %	0 %	0 %	549723005
7023	NC_022544	AGG	2	6	328778	328783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549723005
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7025	NC_022544	ACC	2	6	328893	328898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723005
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7027	NC_022544	GACT	2	8	328942	328949	25 %	25 %	25 %	25 %	549723006
7028	NC_022544	GT	3	6	329036	329041	0 %	50 %	50 %	0 %	549723006
7029	NC_022544	GCG	2	6	329049	329054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723006
7030	NC_022544	TGC	2	6	329114	329119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723006
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7033	NC_022544	CCA	2	6	329296	329301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549723006
7034	NC_022544	TGG	2	6	329432	329437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723006
7035	NC_022544	AACAA	2	10	329438	329447	80 %	0 %	0 %	20 %	549723006
7036	NC_022544	TGG	2	6	329512	329517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_022544	TTA	2	6	329570	329575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_022544	AATGC	2	10	329591	329600	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7039	NC_022544	TAA	2	6	329615	329620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_022544	ATA	2	6	329631	329636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_022544	TTAT	2	8	329654	329661	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_022544	TATGT	2	10	329675	329684	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_022544	TTC	2	6	329735	329740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7044	NC_022544	TATT	2	8	329811	329818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_022544	ATA	2	6	329866	329871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723007
7046	NC_022544	GAC	2	6	329891	329896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723007
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7052	NC_022544	CTG	2	6	330112	330117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723007
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7054	NC_022544	CGG	2	6	330200	330205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723007
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7056	NC_022544	TGG	2	6	330310	330315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723007
7057	NC_022544	TGG	2	6	330347	330352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723007
7058	NC_022544	CGG	2	6	330382	330387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723007
7059	NC_022544	GTG	2	6	330393	330398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723007
7060	NC_022544	CTG	2	6	330453	330458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723007
7061	NC_022544	GTG	2	6	330498	330503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723007
7062	NC_022544	TGG	2	6	330556	330561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723007
7063	NC_022544	TGATTT	2	12	330605	330616	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	549723007
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7071	NC_022544	CTG	2	6	331098	331103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723007
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7074	NC_022544	CCGC	2	8	331208	331215	0 %	0 %	25 %	75 %	549723007
7075	NC_022544	CCGGC	2	10	331267	331276	0 %	0 %	40 %	60 %	549723007
7076	NC_022544	CGGG	2	8	331304	331311	0 %	0 %	75 %	25 %	549723007
7077	NC_022544	TTGG	2	8	331324	331331	0 %	50 %	50 %	0 %	549723007
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7085	NC_022544	TGC	2	6	331597	331602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723007
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7089	NC_022544	TGG	2	6	331696	331701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723007
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7095	NC_022544	GGC	2	6	331983	331988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723007
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7098	NC_022544	CCTG	2	8	332098	332105	0 %	25 %	25 %	50 %	549723008
7099	NC_022544	GAAC	2	8	332153	332160	50 %	0 %	25 %	25 %	549723008
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7102	NC_022544	A	8	8	332246	332253	100 %	0 %	0 %	0 %	549723008
7103	NC_022544	CAGG	2	8	332291	332298	25 %	0 %	50 %	25 %	549723008
7104	NC_022544	ATG	2	6	332307	332312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723008
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7106	NC_022544	TGA	2	6	332440	332445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723008
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7108	NC_022544	AAT	2	6	332502	332507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723008
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7112	NC_022544	ATC	2	6	332597	332602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723009
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7118	NC_022544	CAGC	2	8	332887	332894	25 %	0 %	25 %	50 %	549723009
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7121	NC_022544	CA	3	6	332974	332979	50 %	0 %	0 %	50 %	549723009
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7123	NC_022544	TTGT	2	8	333038	333045	0 %	75 %	25 %	0 %	549723009
7124	NC_022544	CGG	2	6	333061	333066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723009
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7239	NC_022544	GATC	2	8	337464	337471	25 %	25 %	25 %	25 %	549723011
7240	NC_022544	TGT	2	6	337599	337604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549723011
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7242	NC_022544	CAG	2	6	337670	337675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549723011
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7373	NC_022544	TGA	2	6	344033	344038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723018
7374	NC_022544	TGG	2	6	344081	344086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723018
7375	NC_022544	GCGTG	2	10	344137	344146	0 %	20 %	60 %	20 %	549723018
7376	NC_022544	AGT	2	6	344173	344178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723018
7377	NC_022544	GGCA	2	8	344195	344202	25 %	0 %	50 %	25 %	549723018
7378	NC_022544	GTC	2	6	344243	344248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723018
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7380	NC_022544	CGCA	2	8	344383	344390	25 %	0 %	25 %	50 %	549723018
7381	NC_022544	ACA	2	6	344429	344434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549723018
7382	NC_022544	ACAG	2	8	344479	344486	50 %	0 %	25 %	25 %	549723018
7383	NC_022544	GTG	2	6	344489	344494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723018
7384	NC_022544	CGG	2	6	344700	344705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549723018
7385	NC_022544	G	6	6	344748	344753	0 %	0 %	100 %	0 %	549723018
7386	NC_022544	TC	3	6	344755	344760	0 %	50 %	0 %	50 %	549723018
7387	NC_022544	AC	4	8	344795	344802	50 %	0 %	0 %	50 %	549723018
7388	NC_022544	CCT	2	6	344837	344842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549723018
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7390	NC_022544	TAC	2	6	345012	345017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723018
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7392	NC_022544	ATG	2	6	345104	345109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723018
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7394	NC_022544	AAT	2	6	345262	345267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723018
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7397	NC_022544	TCAG	2	8	345344	345351	25 %	25 %	25 %	25 %	549723018
7398	NC_022544	GGT	3	9	345400	345408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723018
7399	NC_022544	GGT	2	6	345457	345462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723018
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7402	NC_022544	CA	3	6	345729	345734	50 %	0 %	0 %	50 %	549723018
7403	NC_022544	GTG	2	6	345748	345753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723018
7404	NC_022544	GGT	2	6	345768	345773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549723018
7405	NC_022544	TGA	2	6	345812	345817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723018
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7408	NC_022544	GA	3	6	346063	346068	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7409	NC_022544	CGC	2	6	346158	346163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723019
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7411	NC_022544	GATGG	2	10	346222	346231	20 %	20 %	60 %	0 %	549723019
7412	NC_022544	TGC	2	6	346325	346330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723019
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7415	NC_022544	T	6	6	346700	346705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7416	NC_022544	AAT	2	6	346734	346739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7417	NC_022544	TAT	2	6	346760	346765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7418	NC_022544	TTTG	2	8	346780	346787	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7419	NC_022544	GTTT	2	8	346832	346839	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7420	NC_022544	ATTT	2	8	346918	346925	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7421	NC_022544	T	6	6	346923	346928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7422	NC_022544	TGGC	2	8	347050	347057	0 %	25 %	50 %	25 %	549723020
7423	NC_022544	CTGG	2	8	347063	347070	0 %	25 %	50 %	25 %	549723020
7424	NC_022544	CTG	2	6	347081	347086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549723020
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7452	NC_022544	TAT	2	6	348336	348341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7453	NC_022544	GATG	2	8	348430	348437	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7454	NC_022544	T	6	6	348480	348485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7455	NC_022544	GAT	2	6	348491	348496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7462	NC_022544	TTACT	2	10	348738	348747	20 %	60 %	0 %	20 %	549723022
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7464	NC_022544	AGCT	2	8	348946	348953	25 %	25 %	25 %	25 %	549723022
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7477	NC_022544	ATG	2	6	349648	349653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723023
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7481	NC_022544	CAT	2	6	349923	349928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549723024
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7484	NC_022544	ATA	2	6	350012	350017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723024
7485	NC_022544	T	6	6	350069	350074	0 %	100 %	0 %	0 %	549723024
7486	NC_022544	CAGA	2	8	350079	350086	50 %	0 %	25 %	25 %	549723024
7487	NC_022544	TTA	2	6	350120	350125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549723024
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7489	NC_022544	T	6	6	350237	350242	0 %	100 %	0 %	0 %	549723024
7490	NC_022544	AAT	2	6	350272	350277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549723024
7491	NC_022544	CGC	2	6	350382	350387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549723024
7492	NC_022544	GTTGA	2	10	350453	350462	20 %	40 %	40 %	0 %	549723024
7493	NC_022544	CTT	2	6	350514	350519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549723024
7494	NC_022544	ATG	2	6	350558	350563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549723024
7495	NC_022544	TTTCA	2	10	350581	350590	20 %	60 %	0 %	20 %	549723024
7496	NC_022544	A	6	6	350668	350673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7497	NC_022544	A	6	6	350710	350715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7498	NC_022544	TCG	2	6	350748	350753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7499	NC_022544	AGATGA	2	12	350851	350862	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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